data_6GZ
#
_chem_comp.id 6GZ
_chem_comp.name
;(2R)-1-({3-bromo-4-[(2-methyl[1,1'-biphenyl]-3-yl)methoxy]phenyl}methyl)piperidine-2-carboxylic acid
;
_chem_comp.type NON-POLYMER
_chem_comp.pdbx_type HETAIN
_chem_comp.formula "C27 H28 Br N O3"
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ?
_chem_comp.pdbx_synonyms ?
_chem_comp.pdbx_formal_charge 0
_chem_comp.pdbx_initial_date 2016-04-08
_chem_comp.pdbx_modified_date 2016-04-22
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N
_chem_comp.pdbx_release_status REL
_chem_comp.pdbx_replaced_by ?
_chem_comp.pdbx_replaces ?
_chem_comp.formula_weight 494.420
_chem_comp.one_letter_code ?
_chem_comp.three_letter_code 6GZ
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ?
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details Corina
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 5J8O
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list ?
_chem_comp.pdbx_processing_site EBI
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.alt_atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.pdbx_align
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config
_chem_comp_atom.model_Cartn_x
_chem_comp_atom.model_Cartn_y
_chem_comp_atom.model_Cartn_z
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal
6GZ BR BR1 BR 0 0 N N N 3.159 36.901 24.947 0.914 -3.237 0.114 BR 6GZ 1
6GZ C16 C1 C 0 1 Y N N 3.015 37.315 23.102 1.372 -1.410 0.279 C16 6GZ 2
6GZ C15 C2 C 0 1 Y N N 1.844 37.701 22.458 2.698 -1.037 0.400 C15 6GZ 3
6GZ C7 C3 C 0 1 Y N N 1.861 37.963 21.077 3.033 0.298 0.520 C7 6GZ 4
6GZ C8 C4 C 0 1 N N N 0.613 38.412 20.377 4.479 0.702 0.652 C8 6GZ 5
6GZ N N1 N 0 1 N N N -0.350 37.302 20.173 5.047 0.933 -0.683 N 6GZ 6
6GZ C13 C5 C 0 1 N N R -1.777 37.732 20.418 6.306 1.683 -0.597 C13 6GZ 7
6GZ C14 C6 C 0 1 N N N -2.190 39.135 19.963 6.064 2.992 0.109 C14 6GZ 8
6GZ O2 O1 O 0 1 N N N -1.871 39.597 18.866 4.939 3.318 0.408 O2 6GZ 9
6GZ O1 O2 O 0 1 N N N -2.915 39.918 20.787 7.097 3.796 0.407 O1 6GZ 10
6GZ C12 C7 C 0 1 N N N -2.752 36.682 19.882 7.337 0.865 0.185 C12 6GZ 11
6GZ C11 C8 C 0 1 N N N -2.439 36.178 18.477 7.565 -0.472 -0.525 C11 6GZ 12
6GZ C10 C9 C 0 1 N N N -1.062 35.537 18.504 6.230 -1.212 -0.645 C10 6GZ 13
6GZ C9 C10 C 0 1 N N N -0.030 36.588 18.900 5.232 -0.334 -1.403 C9 6GZ 14
6GZ C6 C11 C 0 1 Y N N 3.024 37.845 20.336 2.045 1.265 0.520 C6 6GZ 15
6GZ C5 C12 C 0 1 Y N N 4.211 37.460 20.932 0.718 0.898 0.399 C5 6GZ 16
6GZ C4 C13 C 0 1 Y N N 4.241 37.182 22.306 0.379 -0.441 0.273 C4 6GZ 17
6GZ O O3 O 0 1 N N N 5.364 36.820 22.980 -0.926 -0.804 0.154 O 6GZ 18
6GZ C3 C14 C 0 1 N N N 6.612 37.275 22.481 -1.895 0.246 0.166 C3 6GZ 19
6GZ C2 C15 C 0 1 Y N N 7.780 37.001 23.358 -3.275 -0.343 0.024 C2 6GZ 20
6GZ C17 C16 C 0 1 Y N N 7.702 36.232 24.512 -3.433 -1.713 -0.091 C17 6GZ 21
6GZ C18 C17 C 0 1 Y N N 8.851 36.017 25.280 -4.696 -2.260 -0.221 C18 6GZ 22
6GZ C19 C18 C 0 1 Y N N 10.084 36.555 24.918 -5.808 -1.441 -0.237 C19 6GZ 23
6GZ C20 C19 C 0 1 Y N N 10.254 37.314 23.785 -5.655 -0.062 -0.121 C20 6GZ 24
6GZ C1 C20 C 0 1 Y N N 9.075 37.568 22.949 -4.379 0.484 0.015 C1 6GZ 25
6GZ C C21 C 0 1 N N N 9.230 38.377 21.708 -4.207 1.975 0.147 C 6GZ 26
6GZ C21 C22 C 0 1 Y N N 11.585 37.857 23.428 -6.846 0.824 -0.137 C21 6GZ 27
6GZ C26 C23 C 0 1 Y N N 12.652 37.015 23.189 -6.914 1.888 -1.033 C26 6GZ 28
6GZ C25 C24 C 0 1 Y N N 13.898 37.549 22.861 -8.024 2.708 -1.044 C25 6GZ 29
6GZ C24 C25 C 0 1 Y N N 14.074 38.902 22.782 -9.067 2.475 -0.167 C24 6GZ 30
6GZ C23 C26 C 0 1 Y N N 12.999 39.753 22.991 -9.005 1.420 0.726 C23 6GZ 31
6GZ C22 C27 C 0 1 Y N N 11.760 39.221 23.315 -7.902 0.590 0.740 C22 6GZ 32
6GZ H1 H1 H 0 1 N N N 0.925 37.799 23.017 3.472 -1.790 0.400 H1 6GZ 33
6GZ H2 H2 H 0 1 N N N 0.888 38.827 19.396 4.549 1.617 1.240 H2 6GZ 34
6GZ H3 H3 H 0 1 N N N 0.129 39.193 20.983 5.034 -0.093 1.150 H3 6GZ 35
6GZ H5 H5 H 0 1 N N N -1.908 37.726 21.510 6.683 1.877 -1.601 H5 6GZ 36
6GZ H6 H6 H 0 1 N N N -3.077 40.755 20.368 6.892 4.625 0.860 H6 6GZ 37
6GZ H7 H7 H 0 1 N N N -3.759 37.124 19.871 8.276 1.416 0.236 H7 6GZ 38
6GZ H8 H8 H 0 1 N N N -2.737 35.821 20.566 6.967 0.684 1.194 H8 6GZ 39
6GZ H9 H9 H 0 1 N N N -2.445 37.019 17.769 7.972 -0.291 -1.520 H9 6GZ 40
6GZ H10 H10 H 0 1 N N N -3.190 35.435 18.171 8.266 -1.076 0.052 H10 6GZ 41
6GZ H11 H11 H 0 1 N N N -1.052 34.717 19.237 6.378 -2.145 -1.187 H11 6GZ 42
6GZ H12 H12 H 0 1 N N N -0.820 35.141 17.507 5.842 -1.427 0.351 H12 6GZ 43
6GZ H13 H13 H 0 1 N N N 0.944 36.090 19.018 4.276 -0.852 -1.477 H13 6GZ 44
6GZ H14 H14 H 0 1 N N N 0.034 37.332 18.092 5.614 -0.131 -2.403 H14 6GZ 45
6GZ H15 H15 H 0 1 N N N 3.004 38.057 19.277 2.309 2.307 0.618 H15 6GZ 46
6GZ H16 H16 H 0 1 N N N 5.111 37.374 20.342 -0.054 1.654 0.399 H16 6GZ 47
6GZ H17 H17 H 0 1 N N N 6.791 36.785 21.513 -1.828 0.792 1.107 H17 6GZ 48
6GZ H18 H18 H 0 1 N N N 6.544 38.363 22.334 -1.704 0.926 -0.664 H18 6GZ 49
6GZ H19 H19 H 0 1 N N N 6.759 35.802 24.815 -2.566 -2.357 -0.080 H19 6GZ 50
6GZ H20 H20 H 0 1 N N N 8.781 35.419 26.176 -4.814 -3.330 -0.311 H20 6GZ 51
6GZ H21 H21 H 0 1 N N N 10.938 36.369 25.552 -6.794 -1.870 -0.339 H21 6GZ 52
6GZ H22 H22 H 0 1 N N N 9.066 39.440 21.940 -4.020 2.408 -0.836 H22 6GZ 53
6GZ H23 H23 H 0 1 N N N 10.245 38.241 21.306 -5.113 2.410 0.569 H23 6GZ 54
6GZ H24 H24 H 0 1 N N N 8.493 38.047 20.961 -3.362 2.187 0.803 H24 6GZ 55
6GZ H25 H25 H 0 1 N N N 12.522 35.945 23.256 -6.099 2.071 -1.719 H25 6GZ 56
6GZ H26 H26 H 0 1 N N N 14.730 36.888 22.668 -8.077 3.534 -1.738 H26 6GZ 57
6GZ H27 H27 H 0 1 N N N 15.049 39.308 22.557 -9.934 3.120 -0.178 H27 6GZ 58
6GZ H28 H28 H 0 1 N N N 13.126 40.822 22.902 -9.822 1.243 1.409 H28 6GZ 59
6GZ H29 H29 H 0 1 N N N 10.922 39.882 23.481 -7.855 -0.234 1.437 H29 6GZ 60
#
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
6GZ C11 C10 SING N N 1
6GZ C11 C12 SING N N 2
6GZ C10 C9 SING N N 3
6GZ O2 C14 DOUB N N 4
6GZ C9 N SING N N 5
6GZ C12 C13 SING N N 6
6GZ C14 C13 SING N N 7
6GZ C14 O1 SING N N 8
6GZ N C8 SING N N 9
6GZ N C13 SING N N 10
6GZ C6 C5 DOUB Y N 11
6GZ C6 C7 SING Y N 12
6GZ C8 C7 SING N N 13
6GZ C5 C4 SING Y N 14
6GZ C7 C15 DOUB Y N 15
6GZ C C1 SING N N 16
6GZ C4 O SING N N 17
6GZ C4 C16 DOUB Y N 18
6GZ C15 C16 SING Y N 19
6GZ C3 O SING N N 20
6GZ C3 C2 SING N N 21
6GZ C24 C25 DOUB Y N 22
6GZ C24 C23 SING Y N 23
6GZ C25 C26 SING Y N 24
6GZ C1 C2 DOUB Y N 25
6GZ C1 C20 SING Y N 26
6GZ C23 C22 DOUB Y N 27
6GZ C16 BR SING N N 28
6GZ C26 C21 DOUB Y N 29
6GZ C22 C21 SING Y N 30
6GZ C2 C17 SING Y N 31
6GZ C21 C20 SING N N 32
6GZ C20 C19 DOUB Y N 33
6GZ C17 C18 DOUB Y N 34
6GZ C19 C18 SING Y N 35
6GZ C15 H1 SING N N 36
6GZ C8 H2 SING N N 37
6GZ C8 H3 SING N N 38
6GZ C13 H5 SING N N 39
6GZ O1 H6 SING N N 40
6GZ C12 H7 SING N N 41
6GZ C12 H8 SING N N 42
6GZ C11 H9 SING N N 43
6GZ C11 H10 SING N N 44
6GZ C10 H11 SING N N 45
6GZ C10 H12 SING N N 46
6GZ C9 H13 SING N N 47
6GZ C9 H14 SING N N 48
6GZ C6 H15 SING N N 49
6GZ C5 H16 SING N N 50
6GZ C3 H17 SING N N 51
6GZ C3 H18 SING N N 52
6GZ C17 H19 SING N N 53
6GZ C18 H20 SING N N 54
6GZ C19 H21 SING N N 55
6GZ C H22 SING N N 56
6GZ C H23 SING N N 57
6GZ C H24 SING N N 58
6GZ C26 H25 SING N N 59
6GZ C25 H26 SING N N 60
6GZ C24 H27 SING N N 61
6GZ C23 H28 SING N N 62
6GZ C22 H29 SING N N 63
#
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id
_pdbx_chem_comp_descriptor.type
_pdbx_chem_comp_descriptor.program
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor
6GZ SMILES ACDLabs 12.01 "Brc2cc(CN1C(C(O)=O)CCCC1)ccc2OCc3cccc(c3C)c4ccccc4"
6GZ InChI InChI 1.03 "InChI=1S/C27H28BrNO3/c1-19-22(10-7-11-23(19)21-8-3-2-4-9-21)18-32-26-14-13-20(16-24(26)28)17-29-15-6-5-12-25(29)27(30)31/h2-4,7-11,13-14,16,25H,5-6,12,15,17-18H2,1H3,(H,30,31)/t25-/m1/s1"
6GZ InChIKey InChI 1.03 QRXBPPWUGITQLE-RUZDIDTESA-N
6GZ SMILES_CANONICAL CACTVS 3.385 "Cc1c(COc2ccc(CN3CCCC[C@@H]3C(O)=O)cc2Br)cccc1c4ccccc4"
6GZ SMILES CACTVS 3.385 "Cc1c(COc2ccc(CN3CCCC[CH]3C(O)=O)cc2Br)cccc1c4ccccc4"
6GZ SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.4 "Cc1c(cccc1c2ccccc2)COc3ccc(cc3Br)CN4CCCC[C@@H]4C(=O)O"
6GZ SMILES "OpenEye OEToolkits" 2.0.4 "Cc1c(cccc1c2ccccc2)COc3ccc(cc3Br)CN4CCCCC4C(=O)O"
#
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id
_pdbx_chem_comp_identifier.type
_pdbx_chem_comp_identifier.program
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier
6GZ "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs 12.01
;(2R)-1-({3-bromo-4-[(2-methyl[1,1'-biphenyl]-3-yl)methoxy]phenyl}methyl)piperidine-2-carboxylic acid
;
6GZ "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 2.0.4 "(2~{R})-1-[[3-bromanyl-4-[(2-methyl-3-phenyl-phenyl)methoxy]phenyl]methyl]piperidine-2-carboxylic acid"
#
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id
_pdbx_chem_comp_audit.action_type
_pdbx_chem_comp_audit.date
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site
6GZ "Create component" 2016-04-08 EBI
6GZ "Initial release" 2016-04-27 RCSB
#