data_8QA # _chem_comp.id 8QA _chem_comp.name "(2S)-2-azanyl-6-[(5-oxidanyl-5-oxidanylidene-pentanethioyl)amino]hexanoic acid" _chem_comp.type peptide-like _chem_comp.pdbx_type HETAIN _chem_comp.formula "C11 H20 N2 O4 S" _chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ? _chem_comp.pdbx_synonyms ? _chem_comp.pdbx_formal_charge 0 _chem_comp.pdbx_initial_date 2022-03-09 _chem_comp.pdbx_modified_date 2023-09-01 _chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N _chem_comp.pdbx_release_status REL _chem_comp.pdbx_replaced_by ? _chem_comp.pdbx_replaces ? _chem_comp.formula_weight 276.352 _chem_comp.one_letter_code ? _chem_comp.three_letter_code 8QA _chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ? _chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details Corina _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 7X3P _chem_comp.pdbx_subcomponent_list ? _chem_comp.pdbx_processing_site PDBJ # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.alt_atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.charge _chem_comp_atom.pdbx_align _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.model_Cartn_x _chem_comp_atom.model_Cartn_y _chem_comp_atom.model_Cartn_z _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal _chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id _chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id _chem_comp_atom.pdbx_ordinal 8QA N01 N1 N 0 1 N N N 8.320 -13.222 51.826 5.528 -1.502 0.841 N01 8QA 1 8QA C02 C1 C 0 1 N N S 7.773 -12.271 52.753 5.486 -0.452 -0.185 C02 8QA 2 8QA C03 C2 C 0 1 N N N 6.371 -12.745 53.094 6.744 0.375 -0.108 C03 8QA 3 8QA O04 O1 O 0 1 N N N 5.540 -13.092 52.289 7.408 0.373 0.901 O04 8QA 4 8QA C20 C14 C 0 1 N N N 7.756 -10.929 52.069 4.270 0.445 0.052 C20 8QA 5 8QA C21 C15 C 0 1 N N N 7.199 -9.862 53.029 2.990 -0.368 -0.149 C21 8QA 6 8QA C22 C16 C 0 1 N N N 7.319 -8.472 52.376 1.773 0.530 0.089 C22 8QA 7 8QA C23 C17 C 0 1 N N N 6.755 -7.422 53.348 0.493 -0.283 -0.112 C23 8QA 8 8QA N24 N4 N 0 1 N N N 6.832 -6.122 52.680 -0.672 0.576 0.115 N24 8QA 9 8QA C25 C18 C 0 1 N N N 6.700 -4.940 53.445 -1.916 0.071 -0.007 C25 8QA 10 8QA S26 S1 S 0 1 N N N 6.342 -4.961 55.008 -2.120 -1.465 -0.400 S26 8QA 11 8QA C27 C19 C 0 1 N N N 7.006 -3.665 52.671 -3.114 0.955 0.227 C27 8QA 12 8QA C28 C20 C 0 1 N N N 5.845 -2.690 52.740 -4.394 0.142 0.026 C28 8QA 13 8QA C29 C21 C 0 1 N N N 4.602 -3.306 52.088 -5.610 1.040 0.263 C29 8QA 14 8QA C30 C22 C 0 1 N N N 3.642 -2.137 52.044 -6.872 0.239 0.065 C30 8QA 15 8QA O31 O4 O 0 1 N N N 3.358 -1.554 53.136 -8.070 0.824 0.222 O31 8QA 16 8QA O32 O5 O 0 1 N N N 3.241 -1.750 50.915 -6.805 -0.929 -0.235 O32 8QA 17 8QA H1 H1 H 0 1 N N N 8.345 -14.127 52.252 5.596 -1.102 1.765 H1 8QA 18 8QA H2 H2 H 0 1 N N N 8.381 -12.218 53.668 5.413 -0.911 -1.171 H2 8QA 19 8QA H14 H14 H 0 1 N N N 8.780 -10.656 51.774 4.298 0.834 1.070 H14 8QA 20 8QA H15 H15 H 0 1 N N N 7.119 -10.983 51.174 4.288 1.276 -0.654 H15 8QA 21 8QA H16 H16 H 0 1 N N N 6.142 -10.077 53.243 2.962 -0.756 -1.167 H16 8QA 22 8QA H17 H17 H 0 1 N N N 7.773 -9.877 53.967 2.972 -1.198 0.558 H17 8QA 23 8QA H18 H18 H 0 1 N N N 8.376 -8.252 52.165 1.801 0.918 1.107 H18 8QA 24 8QA H19 H19 H 0 1 N N N 6.746 -8.453 51.437 1.791 1.360 -0.617 H19 8QA 25 8QA H20 H20 H 0 1 N N N 5.709 -7.658 53.591 0.465 -0.672 -1.130 H20 8QA 26 8QA H21 H21 H 0 1 N N N 7.352 -7.406 54.272 0.475 -1.113 0.594 H21 8QA 27 8QA H22 H22 H 0 1 N N N 6.977 -6.070 51.692 -0.548 1.508 0.353 H22 8QA 28 8QA H23 H23 H 0 1 N N N 7.198 -3.921 51.619 -3.086 1.344 1.245 H23 8QA 29 8QA H24 H24 H 0 1 N N N 7.900 -3.190 53.101 -3.096 1.786 -0.479 H24 8QA 30 8QA H25 H25 H 0 1 N N N 6.114 -1.765 52.209 -4.422 -0.246 -0.992 H25 8QA 31 8QA H26 H26 H 0 1 N N N 5.627 -2.458 53.793 -4.412 -0.688 0.732 H26 8QA 32 8QA H27 H27 H 0 1 N N N 4.199 -4.128 52.698 -5.582 1.428 1.281 H27 8QA 33 8QA H28 H28 H 0 1 N N N 4.825 -3.675 51.076 -5.593 1.870 -0.443 H28 8QA 34 8QA H29 H29 H 0 1 N N N 2.808 -0.800 52.959 -8.850 0.270 0.085 H29 8QA 35 8QA H3 H3 H 0 1 N Y N 7.748 -13.255 51.006 4.726 -2.111 0.769 H3 8QA 36 8QA OXT OXT O 0 1 N Y N 6.069 -12.795 54.503 7.126 1.115 -1.161 OXT 8QA 37 8QA HXT HXT H 0 1 N Y N 5.185 -13.120 54.626 7.939 1.629 -1.064 HXT 8QA 38 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal 8QA O32 C30 DOUB N N 1 8QA N01 C02 SING N N 2 8QA C30 C29 SING N N 3 8QA C30 O31 SING N N 4 8QA C20 C02 SING N N 5 8QA C20 C21 SING N N 6 8QA C29 C28 SING N N 7 8QA O04 C03 DOUB N N 8 8QA C22 C21 SING N N 9 8QA C22 C23 SING N N 10 8QA C27 C28 SING N N 11 8QA C27 C25 SING N N 12 8QA N24 C23 SING N N 13 8QA N24 C25 SING N N 14 8QA C02 C03 SING N N 15 8QA C25 S26 DOUB N N 16 8QA N01 H1 SING N N 17 8QA C02 H2 SING N N 18 8QA C20 H14 SING N N 19 8QA C20 H15 SING N N 20 8QA C21 H16 SING N N 21 8QA C21 H17 SING N N 22 8QA C22 H18 SING N N 23 8QA C22 H19 SING N N 24 8QA C23 H20 SING N N 25 8QA C23 H21 SING N N 26 8QA N24 H22 SING N N 27 8QA C27 H23 SING N N 28 8QA C27 H24 SING N N 29 8QA C28 H25 SING N N 30 8QA C28 H26 SING N N 31 8QA C29 H27 SING N N 32 8QA C29 H28 SING N N 33 8QA O31 H29 SING N N 34 8QA N01 H3 SING N N 35 8QA C03 OXT SING N N 36 8QA OXT HXT SING N N 37 # loop_ _pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id _pdbx_chem_comp_descriptor.type _pdbx_chem_comp_descriptor.program _pdbx_chem_comp_descriptor.program_version _pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor 8QA InChI InChI 1.03 "InChI=1S/C11H20N2O4S/c12-8(11(16)17)4-1-2-7-13-9(18)5-3-6-10(14)15/h8H,1-7,12H2,(H,13,18)(H,14,15)(H,16,17)/t8-/m0/s1" 8QA InChIKey InChI 1.03 MFVOLMDATMMURW-QMMMGPOBSA-N 8QA SMILES_CANONICAL CACTVS 3.385 "N[C@@H](CCCCNC(=S)CCCC(O)=O)C(O)=O" 8QA SMILES CACTVS 3.385 "N[CH](CCCCNC(=S)CCCC(O)=O)C(O)=O" 8QA SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "C(CCNC(=S)CCCC(=O)O)C[C@@H](C(=O)O)N" 8QA SMILES "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "C(CCNC(=S)CCCC(=O)O)CC(C(=O)O)N" # _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id 8QA _pdbx_chem_comp_identifier.type "SYSTEMATIC NAME" _pdbx_chem_comp_identifier.program "OpenEye OEToolkits" _pdbx_chem_comp_identifier.program_version 2.0.7 _pdbx_chem_comp_identifier.identifier "(2~{S})-2-azanyl-6-[(5-oxidanyl-5-oxidanylidene-pentanethioyl)amino]hexanoic acid" # loop_ _pdbx_chem_comp_audit.comp_id _pdbx_chem_comp_audit.action_type _pdbx_chem_comp_audit.date _pdbx_chem_comp_audit.processing_site 8QA "Create component" 2022-03-09 PDBJ 8QA "Initial release" 2023-09-06 RCSB #