data_8QI # _chem_comp.id 8QI _chem_comp.name "({(2S)-3-(2-amino-6-oxo-1,6-dihydro-9H-purin-9-yl)-2-[(2S)-2-hydroxy-2-phosphonoethoxy]propoxy}methyl)phosphonic acid" _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_type HETAIN _chem_comp.formula "C11 H19 N5 O10 P2" _chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ? _chem_comp.pdbx_synonyms ? _chem_comp.pdbx_formal_charge 0 _chem_comp.pdbx_initial_date 2021-09-24 _chem_comp.pdbx_modified_date 2022-02-25 _chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N _chem_comp.pdbx_release_status REL _chem_comp.pdbx_replaced_by ? _chem_comp.pdbx_replaces ? _chem_comp.formula_weight 443.244 _chem_comp.one_letter_code ? _chem_comp.three_letter_code 8QI _chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ? _chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details Corina _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 7SB7 _chem_comp.pdbx_subcomponent_list ? _chem_comp.pdbx_processing_site RCSB # # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.alt_atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.charge _chem_comp_atom.pdbx_align _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.model_Cartn_x _chem_comp_atom.model_Cartn_y _chem_comp_atom.model_Cartn_z _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal _chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id _chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id _chem_comp_atom.pdbx_ordinal 8QI C10 C1 C 0 1 N N N 21.454 -10.400 12.823 -0.902 -0.263 -0.633 C10 8QI 1 8QI C17 C2 C 0 1 N N N 22.994 -7.501 14.457 -1.605 2.092 0.255 C17 8QI 2 8QI C24 C3 C 0 1 Y N N 22.203 -5.583 11.693 2.914 2.802 1.074 C24 8QI 3 8QI C26 C4 C 0 1 Y N N 21.713 -5.908 9.617 4.173 1.171 0.400 C26 8QI 4 8QI C02 C5 C 0 1 N N N 20.350 -7.894 8.419 3.716 -0.812 -1.394 C02 8QI 5 8QI C05 C6 C 0 1 Y N N 21.194 -6.950 10.361 2.955 1.066 -0.283 C05 8QI 6 8QI C07 C7 C 0 1 N N N 21.171 -7.553 12.776 0.816 2.412 -0.275 C07 8QI 7 8QI C08 C8 C 0 1 N N S 22.389 -8.301 13.309 -0.181 1.657 0.607 C08 8QI 8 8QI C11 C9 C 0 1 N N S 20.524 -11.399 13.509 -0.710 -1.777 -0.746 C11 8QI 9 8QI C19 C10 C 0 1 N N N 25.125 -6.614 14.048 -3.894 1.817 0.912 C19 8QI 10 8QI C27 C11 C 0 1 N N N 21.510 -5.915 8.225 5.181 0.214 0.139 C27 8QI 11 8QI N01 N1 N 0 1 N N N 19.614 -8.965 7.776 3.482 -1.813 -2.302 N01 8QI 12 8QI N03 N2 N 0 1 N N N 20.835 -6.911 7.674 4.922 -0.762 -0.760 N03 8QI 13 8QI N04 N3 N 0 1 N N N 20.519 -7.923 9.729 2.772 0.072 -1.160 N04 8QI 14 8QI N06 N4 N 0 1 Y N N 21.520 -6.715 11.643 2.181 2.104 0.158 N06 8QI 15 8QI N25 N5 N 0 1 Y N N 22.332 -5.080 10.476 4.085 2.252 1.212 N25 8QI 16 8QI O09 O1 O 0 1 N N N 21.965 -9.539 13.801 -0.043 0.252 0.386 O09 8QI 17 8QI O12 O2 O 0 1 N N N 19.229 -10.872 13.579 0.626 -2.057 -1.168 O12 8QI 18 8QI O14 O3 O 0 1 N N N 21.736 -13.077 11.684 -0.676 -4.123 0.793 O14 8QI 19 8QI O15 O4 O 0 1 N N N 19.267 -13.036 11.676 -0.139 -1.916 1.894 O15 8QI 20 8QI O16 O5 O 0 1 N N N 20.463 -14.159 13.508 -2.552 -2.349 1.292 O16 8QI 21 8QI O18 O6 O 0 1 N N N 24.373 -7.717 14.469 -2.527 1.475 1.155 O18 8QI 22 8QI O21 O7 O 0 1 N N N 27.028 -5.123 15.380 -3.670 1.306 -1.734 O21 8QI 23 8QI O22 O8 O 0 1 N N N 25.624 -6.604 16.763 -4.369 -0.661 -0.315 O22 8QI 24 8QI O23 O9 O 0 1 N N N 24.670 -4.543 15.812 -6.029 1.310 -0.837 O23 8QI 25 8QI O28 O10 O 0 1 N N N 22.017 -4.883 7.424 6.256 0.268 0.710 O28 8QI 26 8QI P13 P1 P 0 1 N N N 20.499 -12.992 12.549 -1.009 -2.550 0.878 P13 8QI 27 8QI P20 P2 P 0 1 N N N 25.637 -5.676 15.572 -4.490 0.925 -0.562 P20 8QI 28 8QI H1 H1 H 0 1 N N N 22.279 -10.936 12.330 -0.658 0.206 -1.586 H1 8QI 29 8QI H2 H2 H 0 1 N N N 20.893 -9.822 12.074 -1.940 -0.047 -0.378 H2 8QI 30 8QI H3 H3 H 0 1 N N N 22.787 -6.430 14.312 -1.685 3.175 0.338 H3 8QI 31 8QI H4 H4 H 0 1 N N N 22.558 -7.833 15.411 -1.835 1.788 -0.766 H4 8QI 32 8QI H5 H5 H 0 1 N N N 22.597 -5.136 12.594 2.574 3.680 1.603 H5 8QI 33 8QI H6 H6 H 0 1 N N N 20.761 -6.920 13.577 0.686 2.106 -1.313 H6 8QI 34 8QI H7 H7 H 0 1 N N N 20.412 -8.284 12.461 0.640 3.484 -0.187 H7 8QI 35 8QI H8 H8 H 0 1 N N N 23.132 -8.418 12.507 0.019 1.881 1.655 H8 8QI 36 8QI H9 H9 H 0 1 N N N 20.916 -11.649 14.506 -1.413 -2.179 -1.475 H9 8QI 37 8QI H10 H10 H 0 1 N N N 26.015 -6.953 13.498 -4.497 1.537 1.775 H10 8QI 38 8QI H11 H11 H 0 1 N N N 24.516 -5.970 13.397 -3.975 2.891 0.744 H11 8QI 39 8QI H12 H12 H 0 1 N N N 19.241 -9.714 8.323 2.629 -1.862 -2.762 H12 8QI 40 8QI H13 H13 H 0 1 N N N 19.479 -8.954 6.785 4.169 -2.473 -2.485 H13 8QI 41 8QI H14 H14 H 0 1 N N N 20.689 -6.922 6.685 5.598 -1.429 -0.956 H14 8QI 42 8QI H15 H15 H 0 1 N N N 18.661 -11.347 12.984 1.306 -1.727 -0.565 H15 8QI 43 8QI H16 H16 H 0 1 N N N 21.481 -13.140 10.771 -0.813 -4.599 1.623 H16 8QI 44 8QI H17 H17 H 0 1 N N N 19.676 -14.669 13.357 -3.180 -2.740 0.669 H17 8QI 45 8QI H18 H18 H 0 1 N N N 26.494 -6.646 17.142 -4.882 -0.982 0.439 H18 8QI 46 8QI H19 H19 H 0 1 N N N 25.138 -3.717 15.792 -6.412 0.871 -1.608 H19 8QI 47 # # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal 8QI O28 C27 DOUB N N 1 8QI N03 C27 SING N N 2 8QI N03 C02 SING N N 3 8QI N01 C02 SING N N 4 8QI C27 C26 SING N N 5 8QI C02 N04 DOUB N N 6 8QI C26 C05 DOUB Y N 7 8QI C26 N25 SING Y N 8 8QI N04 C05 SING N N 9 8QI C05 N06 SING Y N 10 8QI N25 C24 DOUB Y N 11 8QI N06 C24 SING Y N 12 8QI N06 C07 SING N N 13 8QI O15 P13 DOUB N N 14 8QI O14 P13 SING N N 15 8QI P13 O16 SING N N 16 8QI P13 C11 SING N N 17 8QI C07 C08 SING N N 18 8QI C10 C11 SING N N 19 8QI C10 O09 SING N N 20 8QI C08 O09 SING N N 21 8QI C08 C17 SING N N 22 8QI C11 O12 SING N N 23 8QI C19 O18 SING N N 24 8QI C19 P20 SING N N 25 8QI C17 O18 SING N N 26 8QI O21 P20 DOUB N N 27 8QI P20 O23 SING N N 28 8QI P20 O22 SING N N 29 8QI C10 H1 SING N N 30 8QI C10 H2 SING N N 31 8QI C17 H3 SING N N 32 8QI C17 H4 SING N N 33 8QI C24 H5 SING N N 34 8QI C07 H6 SING N N 35 8QI C07 H7 SING N N 36 8QI C08 H8 SING N N 37 8QI C11 H9 SING N N 38 8QI C19 H10 SING N N 39 8QI C19 H11 SING N N 40 8QI N01 H12 SING N N 41 8QI N01 H13 SING N N 42 8QI N03 H14 SING N N 43 8QI O12 H15 SING N N 44 8QI O14 H16 SING N N 45 8QI O16 H17 SING N N 46 8QI O22 H18 SING N N 47 8QI O23 H19 SING N N 48 # # loop_ _pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id _pdbx_chem_comp_descriptor.type _pdbx_chem_comp_descriptor.program _pdbx_chem_comp_descriptor.program_version _pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor 8QI SMILES ACDLabs 12.01 "O=P(O)(O)COCC(OCC(O)P(=O)(O)O)Cn1cnc2c1N=C(N)NC2=O" 8QI InChI InChI 1.03 "InChI=1S/C11H19N5O10P2/c12-11-14-9-8(10(18)15-11)13-4-16(9)1-6(2-25-5-27(19,20)21)26-3-7(17)28(22,23)24/h4,6-7,17H,1-3,5H2,(H2,19,20,21)(H2,22,23,24)(H3,12,14,15,18)/t6-,7-/m0/s1" 8QI InChIKey InChI 1.03 BCERVIXRVPEQOK-BQBZGAKWSA-N 8QI SMILES_CANONICAL CACTVS 3.385 "NC1=Nc2n(C[C@@H](COC[P](O)(O)=O)OC[C@@H](O)[P](O)(O)=O)cnc2C(=O)N1" 8QI SMILES CACTVS 3.385 "NC1=Nc2n(C[CH](COC[P](O)(O)=O)OC[CH](O)[P](O)(O)=O)cnc2C(=O)N1" 8QI SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "c1nc2c(n1C[C@@H](COCP(=O)(O)O)OC[C@@H](O)P(=O)(O)O)N=C(NC2=O)N" 8QI SMILES "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "c1nc2c(n1CC(COCP(=O)(O)O)OCC(O)P(=O)(O)O)N=C(NC2=O)N" # # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier 8QI "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs 12.01 "({(2S)-3-(2-amino-6-oxo-1,6-dihydro-9H-purin-9-yl)-2-[(2S)-2-hydroxy-2-phosphonoethoxy]propoxy}methyl)phosphonic acid" 8QI "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "[(2~{S})-3-(2-azanyl-6-oxidanylidene-1~{H}-purin-9-yl)-2-[(2~{S})-2-oxidanyl-2-phosphono-ethoxy]propoxy]methylphosphonic acid" # # loop_ _pdbx_chem_comp_audit.comp_id _pdbx_chem_comp_audit.action_type _pdbx_chem_comp_audit.date _pdbx_chem_comp_audit.processing_site 8QI "Create component" 2021-09-24 RCSB 8QI "Initial release" 2022-03-02 RCSB ##