data_9AX
#
_chem_comp.id 9AX
_chem_comp.name "(2E)-3-methyl-5-[(1R,2S,8aS)-1,2,5,5-tetramethyl-1,2,3,5,6,7,8,8a-octahydronaphthalen-1-yl]pent-2-en-1-yl trihydrogen diphosphate"
_chem_comp.type NON-POLYMER
_chem_comp.pdbx_type HETAIN
_chem_comp.formula "C20 H36 O7 P2"
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ?
_chem_comp.pdbx_synonyms ?
_chem_comp.pdbx_formal_charge 0
_chem_comp.pdbx_initial_date 2018-02-26
_chem_comp.pdbx_modified_date 2018-03-09
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N
_chem_comp.pdbx_release_status REL
_chem_comp.pdbx_replaced_by ?
_chem_comp.pdbx_replaces TIP
_chem_comp.formula_weight 450.443
_chem_comp.one_letter_code ?
_chem_comp.three_letter_code 9AX
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ?
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details Corina
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 4KT8
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list ?
_chem_comp.pdbx_processing_site RCSB
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.alt_atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.pdbx_align
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config
_chem_comp_atom.model_Cartn_x
_chem_comp_atom.model_Cartn_y
_chem_comp_atom.model_Cartn_z
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal
9AX O1A O1 O 0 1 N N N 18.348 -13.516 0.054 -5.112 0.706 -1.648 O1A 9AX 1
9AX O2A O2 O 0 1 N N N 19.906 -11.524 0.435 -4.739 2.166 0.377 O2A 9AX 2
9AX O3A O3 O 0 1 N N N 17.456 -11.476 1.309 -5.493 -0.341 0.617 O3A 9AX 3
9AX O1B O4 O 0 1 N N N 18.292 -9.242 0.296 -7.591 -0.836 -0.696 O1B 9AX 4
9AX O2B O5 O 0 1 N N N 18.528 -9.665 2.798 -7.265 -2.085 1.473 O2B 9AX 5
9AX O3B O6 O 0 1 N N N 16.197 -9.268 1.760 -7.851 0.478 1.444 O3B 9AX 6
9AX O O7 O 0 1 N N N 19.207 -12.990 2.437 -3.073 0.228 -0.238 O 9AX 7
9AX C2 C1 C 0 1 N N N 15.479 -20.556 4.078 6.156 2.221 -0.125 C2 9AX 8
9AX C5 C2 C 0 1 N N N 16.867 -20.529 6.639 5.609 -0.464 0.666 C5 9AX 9
9AX C4 C3 C 0 1 N N N 16.047 -21.690 6.333 6.572 0.366 1.497 C4 9AX 10
9AX C6 C4 C 0 1 N N N 17.116 -20.222 8.023 5.701 -1.760 0.728 C6 9AX 11
9AX C7 C5 C 0 1 N N N 17.941 -19.173 8.463 4.810 -2.685 -0.051 C7 9AX 12
9AX PA P1 P 0 1 N N N 18.712 -12.438 1.012 -4.615 0.690 -0.254 PA 9AX 13
9AX PB P2 P 0 1 N N N 17.650 -9.884 1.470 -7.062 -0.699 0.679 PB 9AX 14
9AX C15 C6 C 0 1 N N N 20.318 -13.879 2.488 -2.058 0.878 -1.005 C15 9AX 15
9AX C14 C7 C 0 1 N N N 20.161 -14.730 3.749 -0.734 0.200 -0.763 C14 9AX 16
9AX C13 C8 C 0 1 N N N 20.493 -16.230 3.660 0.341 0.918 -0.550 C13 9AX 17
9AX C16 C9 C 0 1 N N N 20.979 -16.892 2.357 0.281 2.419 -0.676 C16 9AX 18
9AX C12 C10 C 0 1 N N N 20.333 -17.057 4.941 1.637 0.244 -0.180 C12 9AX 19
9AX C11 C11 C 0 1 N N N 19.309 -18.215 4.824 2.476 0.026 -1.441 C11 9AX 20
9AX C9 C12 C 0 1 N N R 18.311 -18.489 6.018 3.791 -0.661 -1.065 C9 9AX 21
9AX C20 C13 C 0 1 N N N 17.446 -17.194 6.193 4.584 -0.961 -2.338 C20 9AX 22
9AX C10 C14 C 0 1 N N S 17.444 -19.731 5.551 4.603 0.265 -0.177 C10 9AX 23
9AX C1 C15 C 0 1 N N N 16.322 -19.347 4.554 5.323 1.313 -1.031 C1 9AX 24
9AX C3 C16 C 0 1 N N N 15.852 -21.877 4.802 7.235 1.398 0.580 C3 9AX 25
9AX C18 C17 C 0 1 N N N 16.748 -22.966 6.841 5.807 1.083 2.611 C18 9AX 26
9AX C19 C18 C 0 1 N N N 14.672 -21.585 7.021 7.641 -0.542 2.109 C19 9AX 27
9AX C8 C19 C 0 1 N N S 19.009 -18.858 7.405 3.485 -1.973 -0.342 C8 9AX 28
9AX C17 C20 C 0 1 N N N 19.868 -17.725 8.018 2.608 -2.858 -1.230 C17 9AX 29
9AX H1 H1 H 0 1 N N N 20.164 -11.843 -0.422 -4.431 2.230 1.291 H1 9AX 30
9AX H2 H2 H 0 1 N N N 19.304 -9.160 2.585 -8.188 -2.363 1.549 H2 9AX 31
9AX H3 H3 H 0 1 N N N 16.005 -8.593 1.119 -7.555 0.624 2.352 H3 9AX 32
9AX H4 H4 H 0 1 N N N 14.417 -20.340 4.268 6.628 2.999 -0.726 H4 9AX 33
9AX H5 H5 H 0 1 N N N 15.638 -20.691 2.998 5.508 2.683 0.620 H5 9AX 34
9AX H6 H6 H 0 1 N N N 16.638 -20.837 8.771 6.454 -2.192 1.370 H6 9AX 35
9AX H7 H7 H 0 1 N N N 18.435 -19.468 9.401 5.294 -2.952 -0.990 H7 9AX 36
9AX H8 H8 H 0 1 N N N 17.327 -18.277 8.638 4.621 -3.586 0.532 H8 9AX 37
9AX H9 H9 H 0 1 N N N 20.325 -14.524 1.597 -2.308 0.819 -2.064 H9 9AX 38
9AX H10 H10 H 0 1 N N N 21.256 -13.307 2.534 -1.990 1.924 -0.706 H10 9AX 39
9AX H11 H11 H 0 1 N N N 19.826 -14.290 4.677 -0.671 -0.878 -0.766 H11 9AX 40
9AX H12 H12 H 0 1 N N N 21.152 -17.964 2.532 -0.067 2.848 0.264 H12 9AX 41
9AX H13 H13 H 0 1 N N N 20.215 -16.767 1.575 1.275 2.804 -0.905 H13 9AX 42
9AX H14 H14 H 0 1 N N N 21.917 -16.418 2.032 -0.407 2.690 -1.476 H14 9AX 43
9AX H15 H15 H 0 1 N N N 21.312 -17.487 5.199 2.187 0.874 0.518 H15 9AX 44
9AX H16 H16 H 0 1 N N N 20.004 -16.385 5.747 1.425 -0.718 0.287 H16 9AX 45
9AX H17 H17 H 0 1 N N N 18.696 -18.012 3.934 1.925 -0.603 -2.140 H17 9AX 46
9AX H18 H18 H 0 1 N N N 19.886 -19.139 4.670 2.689 0.988 -1.907 H18 9AX 47
9AX H19 H19 H 0 1 N N N 16.732 -17.338 7.018 4.795 -0.030 -2.863 H19 9AX 48
9AX H20 H20 H 0 1 N N N 18.103 -16.342 6.422 5.522 -1.451 -2.076 H20 9AX 49
9AX H21 H21 H 0 1 N N N 16.895 -16.993 5.262 4.000 -1.617 -2.984 H21 9AX 50
9AX H22 H22 H 0 1 N N N 18.133 -20.387 4.999 3.918 0.792 0.486 H22 9AX 51
9AX H23 H23 H 0 1 N N N 16.784 -18.877 3.674 4.588 1.911 -1.569 H23 9AX 52
9AX H24 H24 H 0 1 N N N 15.651 -18.626 5.045 5.977 0.813 -1.745 H24 9AX 53
9AX H25 H25 H 0 1 N N N 15.047 -22.608 4.637 7.845 0.885 -0.163 H25 9AX 54
9AX H26 H26 H 0 1 N N N 16.789 -22.261 4.373 7.867 2.059 1.174 H26 9AX 55
9AX H27 H27 H 0 1 N N N 16.912 -22.888 7.926 5.320 0.347 3.250 H27 9AX 56
9AX H28 H28 H 0 1 N N N 16.116 -23.841 6.628 6.501 1.678 3.204 H28 9AX 57
9AX H29 H29 H 0 1 N N N 17.716 -23.080 6.331 5.053 1.737 2.171 H29 9AX 58
9AX H30 H30 H 0 1 N N N 14.812 -21.453 8.104 8.190 -1.044 1.312 H30 9AX 59
9AX H31 H31 H 0 1 N N N 14.124 -20.722 6.614 8.330 0.057 2.704 H31 9AX 60
9AX H32 H32 H 0 1 N N N 14.098 -22.505 6.835 7.163 -1.287 2.746 H32 9AX 61
9AX H33 H33 H 0 1 N N N 19.641 -19.746 7.252 2.967 -1.764 0.594 H33 9AX 62
9AX H34 H34 H 0 1 N N N 20.306 -18.069 8.966 3.150 -3.109 -2.141 H34 9AX 63
9AX H35 H35 H 0 1 N N N 20.673 -17.456 7.318 2.355 -3.773 -0.693 H35 9AX 64
9AX H36 H36 H 0 1 N N N 19.235 -16.845 8.205 1.694 -2.323 -1.487 H36 9AX 65
#
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
9AX O1A PA DOUB N N 1
9AX O1B PB DOUB N N 2
9AX O2A PA SING N N 3
9AX PA O3A SING N N 4
9AX PA O SING N N 5
9AX O3A PB SING N N 6
9AX PB O3B SING N N 7
9AX PB O2B SING N N 8
9AX C16 C13 SING N N 9
9AX O C15 SING N N 10
9AX C15 C14 SING N N 11
9AX C13 C14 DOUB N E 12
9AX C13 C12 SING N N 13
9AX C2 C1 SING N N 14
9AX C2 C3 SING N N 15
9AX C1 C10 SING N N 16
9AX C3 C4 SING N N 17
9AX C11 C12 SING N N 18
9AX C11 C9 SING N N 19
9AX C10 C9 SING N N 20
9AX C10 C5 SING N N 21
9AX C9 C20 SING N N 22
9AX C9 C8 SING N N 23
9AX C4 C5 SING N N 24
9AX C4 C18 SING N N 25
9AX C4 C19 SING N N 26
9AX C5 C6 DOUB N N 27
9AX C8 C17 SING N N 28
9AX C8 C7 SING N N 29
9AX C6 C7 SING N N 30
9AX O2A H1 SING N N 31
9AX O2B H2 SING N N 32
9AX O3B H3 SING N N 33
9AX C2 H4 SING N N 34
9AX C2 H5 SING N N 35
9AX C6 H6 SING N N 36
9AX C7 H7 SING N N 37
9AX C7 H8 SING N N 38
9AX C15 H9 SING N N 39
9AX C15 H10 SING N N 40
9AX C14 H11 SING N N 41
9AX C16 H12 SING N N 42
9AX C16 H13 SING N N 43
9AX C16 H14 SING N N 44
9AX C12 H15 SING N N 45
9AX C12 H16 SING N N 46
9AX C11 H17 SING N N 47
9AX C11 H18 SING N N 48
9AX C20 H19 SING N N 49
9AX C20 H20 SING N N 50
9AX C20 H21 SING N N 51
9AX C10 H22 SING N N 52
9AX C1 H23 SING N N 53
9AX C1 H24 SING N N 54
9AX C3 H25 SING N N 55
9AX C3 H26 SING N N 56
9AX C18 H27 SING N N 57
9AX C18 H28 SING N N 58
9AX C18 H29 SING N N 59
9AX C19 H30 SING N N 60
9AX C19 H31 SING N N 61
9AX C19 H32 SING N N 62
9AX C8 H33 SING N N 63
9AX C17 H34 SING N N 64
9AX C17 H35 SING N N 65
9AX C17 H36 SING N N 66
#
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id
_pdbx_chem_comp_descriptor.type
_pdbx_chem_comp_descriptor.program
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor
9AX SMILES ACDLabs 12.01 "O=P(O)(OP(=O)(O)O)OC[C@H]=C(CCC2(C)C(CC=C1C(C)(C)CCCC12)C)C"
9AX InChI InChI 1.03 "InChI=1S/C20H36O7P2/c1-15(11-14-26-29(24,25)27-28(21,22)23)10-13-20(5)16(2)8-9-17-18(20)7-6-12-19(17,3)4/h9,11,16,18H,6-8,10,12-14H2,1-5H3,(H,24,25)(H2,21,22,23)/b15-11+/t16-,18+,20+/m0/s1"
9AX InChIKey InChI 1.03 BPSHPRCHMGHBGC-AHKHSGQUSA-N
9AX SMILES_CANONICAL CACTVS 3.385 "C[C@H]1CC=C2[C@@H](CCCC2(C)C)[C@]1(C)CCC(/C)=C/CO[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O"
9AX SMILES CACTVS 3.385 "C[CH]1CC=C2[CH](CCCC2(C)C)[C]1(C)CCC(C)=CCO[P](O)(=O)O[P](O)(O)=O"
9AX SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 "C[C@H]1CC=C2[C@H]([C@]1(C)CC/C(=C/COP(=O)(O)OP(=O)(O)O)/C)CCCC2(C)C"
9AX SMILES "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 "CC1CC=C2C(C1(C)CCC(=CCOP(=O)(O)OP(=O)(O)O)C)CCCC2(C)C"
#
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id
_pdbx_chem_comp_identifier.type
_pdbx_chem_comp_identifier.program
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier
9AX "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs 12.01 "(2E)-3-methyl-5-[(1R,2S,8aS)-1,2,5,5-tetramethyl-1,2,3,5,6,7,8,8a-octahydronaphthalen-1-yl]pent-2-en-1-yl trihydrogen diphosphate"
9AX "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 "[(~{E})-5-[(1~{R},2~{S},8~{a}~{S})-1,2,5,5-tetramethyl-2,3,6,7,8,8~{a}-hexahydronaphthalen-1-yl]-3-methyl-pent-2-enyl] phosphono hydrogen phosphate"
#
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id
_pdbx_chem_comp_audit.action_type
_pdbx_chem_comp_audit.date
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site
9AX "Create component" 2018-02-26 PDBJ
9AX "Initial release" 2018-03-14 RCSB
#