data_A1IUL # _chem_comp.id A1IUL _chem_comp.name "4-ethyl-~{N}-[[1-[[(2~{R})-1-(1~{H}-indol-3-yl)-4-[[2-(methylamino)-2-oxidanylidene-ethyl]amino]-4-oxidanylidene-butan-2-yl]carbamoyl]cyclopropyl]methyl]benzamide" _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_type HETAIN _chem_comp.formula "C29 H35 N5 O4" _chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ? _chem_comp.pdbx_synonyms ? _chem_comp.pdbx_formal_charge 0 _chem_comp.pdbx_initial_date 2024-11-20 _chem_comp.pdbx_modified_date 2025-08-22 _chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N _chem_comp.pdbx_release_status REL _chem_comp.pdbx_replaced_by ? _chem_comp.pdbx_replaces ? _chem_comp.formula_weight 517.619 _chem_comp.one_letter_code ? _chem_comp.three_letter_code A1IUL _chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ? _chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details Corina _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 9HGM _chem_comp.pdbx_subcomponent_list ? _chem_comp.pdbx_processing_site PDBE _chem_comp.pdbx_pcm ? # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.alt_atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.charge _chem_comp_atom.pdbx_align _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.pdbx_n_terminal_atom_flag _chem_comp_atom.pdbx_backbone_atom_flag _chem_comp_atom.pdbx_c_terminal_atom_flag _chem_comp_atom.model_Cartn_x _chem_comp_atom.model_Cartn_y _chem_comp_atom.model_Cartn_z _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal _chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id _chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id _chem_comp_atom.pdbx_ordinal A1IUL C10 C1 C 0 1 N N N N N N 46.860 67.075 65.632 -0.203 1.215 1.289 C10 A1IUL 1 A1IUL C11 C2 C 0 1 N N N N N N 46.171 67.392 66.954 0.493 0.808 2.562 C11 A1IUL 2 A1IUL C12 C3 C 0 1 N N N N N N 45.181 66.361 67.554 0.847 -0.677 2.674 C12 A1IUL 3 A1IUL C14 C4 C 0 1 N N N N N N 46.115 64.008 67.900 2.375 -2.256 1.621 C14 A1IUL 4 A1IUL C15 C5 C 0 1 Y N N N N N 46.551 62.918 68.853 3.373 -2.604 0.588 C15 A1IUL 5 A1IUL C16 C6 C 0 1 Y N N N N N 47.383 61.875 68.469 3.765 -1.653 -0.356 C16 A1IUL 6 A1IUL C17 C7 C 0 1 Y N N N N N 47.753 60.864 69.364 4.698 -1.984 -1.317 C17 A1IUL 7 A1IUL C18 C8 C 0 1 Y N N N N N 47.307 60.847 70.674 5.244 -3.255 -1.347 C18 A1IUL 8 A1IUL C19 C9 C 0 1 N N N N N N 47.707 59.759 71.626 6.262 -3.609 -2.401 C19 A1IUL 9 A1IUL C20 C10 C 0 1 N N N N N N 48.827 60.084 72.575 7.666 -3.294 -1.880 C20 A1IUL 10 A1IUL C21 C11 C 0 1 Y N N N N N 46.474 61.888 71.055 4.860 -4.201 -0.414 C21 A1IUL 11 A1IUL C22 C12 C 0 1 Y N N N N N 46.107 62.894 70.179 3.933 -3.882 0.555 C22 A1IUL 12 A1IUL C24 C13 C 0 1 N N N N N N 46.768 68.495 67.829 1.456 1.814 3.194 C24 A1IUL 13 A1IUL C25 C14 C 0 1 N N N N N N 45.570 68.801 66.982 0.100 1.539 3.847 C25 A1IUL 14 A1IUL C27 C15 C 0 1 N N N N N N 46.335 65.588 62.509 -2.391 3.228 0.137 C27 A1IUL 15 A1IUL C28 C16 C 0 1 Y N N N N N 45.490 64.382 62.286 -1.033 3.881 0.130 C28 A1IUL 16 A1IUL C29 C17 C 0 1 Y N N N N N 45.676 63.462 61.268 -0.310 4.233 1.205 C29 A1IUL 17 A1IUL C31 C18 C 0 1 Y N N N N N 43.892 62.706 62.440 0.941 4.821 -0.567 C31 A1IUL 18 A1IUL C32 C19 C 0 1 Y N N N N N 42.801 61.954 62.904 1.898 5.273 -1.470 C32 A1IUL 19 A1IUL C33 C20 C 0 1 Y N N N N N 42.141 62.416 64.017 1.671 5.152 -2.824 C33 A1IUL 20 A1IUL C01 C21 C 0 1 N N N N N N 54.302 61.203 65.917 -7.149 -5.244 -1.117 C01 A1IUL 21 A1IUL C03 C22 C 0 1 N N N N N N 51.874 61.857 65.503 -5.729 -3.291 -0.795 C03 A1IUL 22 A1IUL C04 C23 C 0 1 N N N N N N 50.525 62.270 66.167 -4.371 -2.647 -0.679 C04 A1IUL 23 A1IUL C06 C24 C 0 1 N N N N N N 49.239 63.903 64.694 -3.443 -0.423 -0.320 C06 A1IUL 24 A1IUL C07 C25 C 0 1 N N N N N N 48.034 64.098 63.768 -3.607 1.058 -0.090 C07 A1IUL 25 A1IUL C08 C26 C 0 1 N N R N N N 47.402 65.525 63.677 -2.228 1.711 0.028 C08 A1IUL 26 A1IUL C34 C27 C 0 1 Y N N N N N 42.563 63.605 64.650 0.497 4.584 -3.298 C34 A1IUL 27 A1IUL C35 C28 C 0 1 Y N N N N N 43.642 64.341 64.183 -0.455 4.130 -2.428 C35 A1IUL 28 A1IUL C36 C29 C 0 1 Y N N N N N 44.349 63.915 63.054 -0.247 4.245 -1.052 C36 A1IUL 29 A1IUL N02 N1 N 0 1 N N N N N N 52.947 61.595 66.380 -5.830 -4.618 -1.004 N02 A1IUL 30 A1IUL N05 N2 N 0 1 N N N N N N 49.403 62.602 65.264 -4.530 -1.208 -0.455 N05 A1IUL 31 A1IUL N09 N3 N 0 1 N N N N N N 46.761 65.845 64.973 -1.549 1.206 1.224 N09 A1IUL 32 A1IUL N13 N4 N 0 1 N N N N N N 45.704 65.273 68.384 1.837 -1.021 1.650 N13 A1IUL 33 A1IUL N30 N5 N 0 1 Y N N N N N 44.715 62.437 61.356 0.871 4.798 0.808 N30 A1IUL 34 A1IUL O23 O1 O 0 1 N N N N N N 46.065 63.785 66.712 2.039 -3.085 2.445 O23 A1IUL 35 A1IUL O26 O2 O 0 1 N N N N N N 47.515 67.972 65.113 0.448 1.557 0.324 O26 A1IUL 36 A1IUL O37 O3 O 0 1 N N N N N N 50.013 64.789 64.947 -2.333 -0.908 -0.383 O37 A1IUL 37 A1IUL O38 O4 O 0 1 N N N N N N 52.012 61.787 64.303 -6.731 -2.614 -0.700 O38 A1IUL 38 A1IUL H121 H1 H 0 0 N N N N N N 44.650 65.896 66.711 1.262 -0.877 3.662 H121 A1IUL 39 A1IUL H122 H2 H 0 0 N N N N N N 44.466 66.923 68.173 -0.051 -1.277 2.528 H122 A1IUL 40 A1IUL H161 H3 H 0 0 N N N N N N 47.754 61.843 67.455 3.339 -0.661 -0.334 H161 A1IUL 41 A1IUL H171 H4 H 0 0 N N N N N N 48.406 60.074 69.022 5.002 -1.249 -2.048 H171 A1IUL 42 A1IUL H192 H5 H 0 0 N N N N N N 48.015 58.888 71.029 6.190 -4.672 -2.633 H192 A1IUL 43 A1IUL H191 H6 H 0 0 N N N N N N 46.823 59.498 72.227 6.070 -3.027 -3.302 H191 A1IUL 44 A1IUL H203 H7 H 0 0 N N N N N N 49.028 59.214 73.218 7.858 -3.877 -0.979 H203 A1IUL 45 A1IUL H201 H8 H 0 0 N N N N N N 49.732 60.333 72.002 8.402 -3.550 -2.642 H201 A1IUL 46 A1IUL H202 H9 H 0 0 N N N N N N 48.541 60.943 73.200 7.738 -2.232 -1.648 H202 A1IUL 47 A1IUL H211 H10 H 0 0 N N N N N N 46.100 61.914 72.068 5.291 -5.192 -0.443 H211 A1IUL 48 A1IUL H221 H11 H 0 0 N N N N N N 45.459 63.684 70.529 3.637 -4.621 1.286 H221 A1IUL 49 A1IUL H241 H12 H 0 0 N N N N N N 46.666 68.442 68.923 2.343 1.419 3.690 H241 A1IUL 50 A1IUL H242 H13 H 0 0 N N N N N N 47.746 68.929 67.572 1.587 2.771 2.689 H242 A1IUL 51 A1IUL H251 H14 H 0 0 N N N N N N 44.592 68.971 67.456 -0.661 2.315 3.772 H251 A1IUL 52 A1IUL H252 H15 H 0 0 N N N N N N 45.671 69.458 66.106 0.095 0.963 4.773 H252 A1IUL 53 A1IUL H271 H16 H 0 0 N N N N N N 45.659 66.429 62.725 -2.906 3.473 1.066 H271 A1IUL 54 A1IUL H272 H17 H 0 0 N N N N N N 46.880 65.786 61.574 -2.974 3.593 -0.709 H272 A1IUL 55 A1IUL H291 H18 H 0 0 N N N N N N 46.448 63.522 60.515 -0.616 4.092 2.231 H291 A1IUL 56 A1IUL H321 H19 H 0 0 N N N N N N 42.492 61.047 62.405 2.814 5.717 -1.111 H321 A1IUL 57 A1IUL H331 H20 H 0 0 N N N N N N 41.297 61.868 64.409 2.415 5.504 -3.523 H331 A1IUL 58 A1IUL H011 H21 H 0 0 N N N N N N 54.959 61.056 66.787 -7.710 -5.079 -0.196 H011 A1IUL 59 A1IUL H012 H22 H 0 0 N N N N N N 54.237 60.266 65.344 -7.690 -4.803 -1.955 H012 A1IUL 60 A1IUL H013 H23 H 0 0 N N N N N N 54.714 61.997 65.277 -7.031 -6.314 -1.283 H013 A1IUL 61 A1IUL H041 H24 H 0 0 N N N N N N 50.720 63.154 66.792 -3.831 -3.088 0.159 H041 A1IUL 62 A1IUL H042 H25 H 0 0 N N N N N N 50.201 61.435 66.805 -3.811 -2.812 -1.599 H042 A1IUL 63 A1IUL H071 H26 H 0 0 N N N N N N 47.245 63.412 64.109 -4.147 1.498 -0.928 H071 A1IUL 64 A1IUL H072 H27 H 0 0 N N N N N N 48.352 63.816 62.753 -4.167 1.222 0.831 H072 A1IUL 65 A1IUL H081 H28 H 0 0 N N N N N N 48.199 66.253 63.463 -1.636 1.471 -0.855 H081 A1IUL 66 A1IUL H341 H29 H 0 0 N N N N N N 42.030 63.952 65.523 0.336 4.497 -4.362 H341 A1IUL 67 A1IUL H351 H30 H 0 0 N N N N N N 43.937 65.246 64.693 -1.366 3.689 -2.804 H351 A1IUL 68 A1IUL H021 H31 H 0 0 N N N N N N 52.787 61.677 67.364 -5.028 -5.160 -1.080 H021 A1IUL 69 A1IUL H051 H32 H 0 0 N N N N N N 48.735 61.891 65.044 -5.418 -0.820 -0.404 H051 A1IUL 70 A1IUL H091 H33 H 0 0 N N N N N N 46.217 65.129 65.410 -2.068 0.864 1.969 H091 A1IUL 71 A1IUL H131 H34 H 0 0 N N N N N N 45.776 65.437 69.368 2.105 -0.360 0.993 H131 A1IUL 72 A1IUL H301 H35 H 0 0 N N N N N N 44.639 61.651 60.743 1.557 5.133 1.406 H301 A1IUL 73 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal A1IUL N02 C01 SING N N 1 A1IUL C03 N02 SING N N 2 A1IUL N05 C04 SING N N 3 A1IUL C06 N05 SING N N 4 A1IUL C08 C07 SING N N 5 A1IUL C10 N09 SING N N 6 A1IUL N13 C12 SING N N 7 A1IUL C14 N13 SING N N 8 A1IUL C16 C15 DOUB Y N 9 A1IUL C17 C16 SING Y N 10 A1IUL C18 C17 DOUB Y N 11 A1IUL C20 C19 SING N N 12 A1IUL C19 C18 SING N N 13 A1IUL C21 C18 SING Y N 14 A1IUL C22 C21 DOUB Y N 15 A1IUL C15 C14 SING N N 16 A1IUL O23 C14 DOUB N N 17 A1IUL C12 C11 SING N N 18 A1IUL C24 C11 SING N N 19 A1IUL C25 C24 SING N N 20 A1IUL C11 C10 SING N N 21 A1IUL O26 C10 DOUB N N 22 A1IUL N09 C08 SING N N 23 A1IUL C27 C08 SING N N 24 A1IUL C28 C27 SING N N 25 A1IUL C29 C28 DOUB Y N 26 A1IUL N30 C29 SING Y N 27 A1IUL C31 N30 SING Y N 28 A1IUL C32 C31 DOUB Y N 29 A1IUL C33 C32 SING Y N 30 A1IUL C34 C33 DOUB Y N 31 A1IUL C35 C34 SING Y N 32 A1IUL C36 C35 DOUB Y N 33 A1IUL C07 C06 SING N N 34 A1IUL O37 C06 DOUB N N 35 A1IUL C04 C03 SING N N 36 A1IUL O38 C03 DOUB N N 37 A1IUL C11 C25 SING N N 38 A1IUL C15 C22 SING Y N 39 A1IUL C28 C36 SING Y N 40 A1IUL C31 C36 SING Y N 41 A1IUL C12 H121 SING N N 42 A1IUL C12 H122 SING N N 43 A1IUL C16 H161 SING N N 44 A1IUL C17 H171 SING N N 45 A1IUL C19 H192 SING N N 46 A1IUL C19 H191 SING N N 47 A1IUL C20 H203 SING N N 48 A1IUL C20 H201 SING N N 49 A1IUL C20 H202 SING N N 50 A1IUL C21 H211 SING N N 51 A1IUL C22 H221 SING N N 52 A1IUL C24 H241 SING N N 53 A1IUL C24 H242 SING N N 54 A1IUL C25 H251 SING N N 55 A1IUL C25 H252 SING N N 56 A1IUL C27 H271 SING N N 57 A1IUL C27 H272 SING N N 58 A1IUL C29 H291 SING N N 59 A1IUL C32 H321 SING N N 60 A1IUL C33 H331 SING N N 61 A1IUL C01 H011 SING N N 62 A1IUL C01 H012 SING N N 63 A1IUL C01 H013 SING N N 64 A1IUL C04 H041 SING N N 65 A1IUL C04 H042 SING N N 66 A1IUL C07 H071 SING N N 67 A1IUL C07 H072 SING N N 68 A1IUL C08 H081 SING N N 69 A1IUL C34 H341 SING N N 70 A1IUL C35 H351 SING N N 71 A1IUL N02 H021 SING N N 72 A1IUL N05 H051 SING N N 73 A1IUL N09 H091 SING N N 74 A1IUL N13 H131 SING N N 75 A1IUL N30 H301 SING N N 76 # loop_ _pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id _pdbx_chem_comp_descriptor.type _pdbx_chem_comp_descriptor.program _pdbx_chem_comp_descriptor.program_version _pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor A1IUL InChI InChI 1.06 "InChI=1S/C29H35N5O4/c1-3-19-8-10-20(11-9-19)27(37)33-18-29(12-13-29)28(38)34-22(15-25(35)32-17-26(36)30-2)14-21-16-31-24-7-5-4-6-23(21)24/h4-11,16,22,31H,3,12-15,17-18H2,1-2H3,(H,30,36)(H,32,35)(H,33,37)(H,34,38)/t22-/m1/s1" A1IUL InChIKey InChI 1.06 HVVBCHJCCVHPJR-JOCHJYFZSA-N A1IUL SMILES_CANONICAL CACTVS 3.385 "CCc1ccc(cc1)C(=O)NCC2(CC2)C(=O)N[C@@H](CC(=O)NCC(=O)NC)Cc3c[nH]c4ccccc34" A1IUL SMILES CACTVS 3.385 "CCc1ccc(cc1)C(=O)NCC2(CC2)C(=O)N[CH](CC(=O)NCC(=O)NC)Cc3c[nH]c4ccccc34" A1IUL SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "CCc1ccc(cc1)C(=O)NCC2(CC2)C(=O)N[C@H](Cc3c[nH]c4c3cccc4)CC(=O)NCC(=O)NC" A1IUL SMILES "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "CCc1ccc(cc1)C(=O)NCC2(CC2)C(=O)NC(Cc3c[nH]c4c3cccc4)CC(=O)NCC(=O)NC" # _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id A1IUL _pdbx_chem_comp_identifier.type "SYSTEMATIC NAME" _pdbx_chem_comp_identifier.program "OpenEye OEToolkits" _pdbx_chem_comp_identifier.program_version 2.0.7 _pdbx_chem_comp_identifier.identifier "4-ethyl-~{N}-[[1-[[(2~{R})-1-(1~{H}-indol-3-yl)-4-[[2-(methylamino)-2-oxidanylidene-ethyl]amino]-4-oxidanylidene-butan-2-yl]carbamoyl]cyclopropyl]methyl]benzamide" # loop_ _pdbx_chem_comp_audit.comp_id _pdbx_chem_comp_audit.action_type _pdbx_chem_comp_audit.date _pdbx_chem_comp_audit.processing_site A1IUL "Create component" 2024-11-20 PDBE A1IUL "Initial release" 2025-08-27 RCSB #