data_BYG
# 
_chem_comp.id                                    BYG 
_chem_comp.name                                  "L-gamma-glutamyl-S-{(4R)-4-[(6-hydroxyhexyl)sulfanyl]-7-nitro-4,5-dihydro-2,1,3-benzoxadiazol-4-yl}-L-cysteinylglycine" 
_chem_comp.type                                  NON-POLYMER 
_chem_comp.pdbx_type                             HETAIN 
_chem_comp.formula                               "C22 H32 N6 O10 S2" 
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id               ? 
_chem_comp.pdbx_synonyms                         ? 
_chem_comp.pdbx_formal_charge                    0 
_chem_comp.pdbx_initial_date                     2009-04-08 
_chem_comp.pdbx_modified_date                    2011-06-04 
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag                   N 
_chem_comp.pdbx_release_status                   REL 
_chem_comp.pdbx_replaced_by                      ? 
_chem_comp.pdbx_replaces                         ? 
_chem_comp.formula_weight                        604.654 
_chem_comp.one_letter_code                       ? 
_chem_comp.three_letter_code                     BYG 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details        ? 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details        Corina 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code        3GUR 
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list                ? 
_chem_comp.pdbx_processing_site                  PDBJ 
# 
loop_
_chem_comp_atom.comp_id 
_chem_comp_atom.atom_id 
_chem_comp_atom.alt_atom_id 
_chem_comp_atom.type_symbol 
_chem_comp_atom.charge 
_chem_comp_atom.pdbx_align 
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_atom.model_Cartn_x 
_chem_comp_atom.model_Cartn_y 
_chem_comp_atom.model_Cartn_z 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id 
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id 
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal 
BYG C1   C1   C 0  1 N N N 13.637 11.839 72.862 6.513  -3.287 2.614  C1   BYG 1  
BYG N1   N1   N 0  1 N N N 13.382 9.576  73.088 6.594  -1.714 0.764  N1   BYG 2  
BYG S1   S1   S 0  1 N N N 19.864 12.130 79.710 -1.903 2.580  -0.606 S1   BYG 3  
BYG C2   C2   C 0  1 N N N 15.154 12.670 80.483 0.314  -2.217 -2.158 C2   BYG 4  
BYG N2   N2   N 0  1 N N N 15.115 12.393 78.039 1.449  -1.172 -0.285 N2   BYG 5  
BYG O2   O2   O 0  1 N N N 15.737 13.662 81.264 1.402  -2.208 -2.695 O2   BYG 6  
BYG C3   C3   C 0  1 N N N 12.517 13.155 82.243 -1.929 -3.770 -4.654 C3   BYG 7  
BYG N3   N3   N 0  1 N N N 13.840 13.079 80.180 -0.752 -2.727 -2.806 N3   BYG 8  
BYG CI   CI   C 0  1 Y N N 20.637 9.779  76.643 -4.571 0.198  1.334  CI   BYG 9  
BYG CL   CL   C 0  1 Y N N 19.950 10.319 77.847 -3.645 0.691  0.293  CL   BYG 10 
BYG O11  O11  O 0  1 N N N 14.209 11.504 71.880 6.195  -3.594 3.882  O11  BYG 11 
BYG O12  O12  O 0  1 N N N 13.395 12.988 73.006 7.377  -3.908 2.042  O12  BYG 12 
BYG O31  O31  O 0  1 N N N 12.624 11.955 82.337 -2.908 -3.685 -3.950 O31  BYG 13 
BYG O32  O32  O 0  1 N N N 12.003 13.831 83.115 -2.029 -4.313 -5.878 O32  BYG 14 
BYG CA1  CA1  C 0  1 N N S 13.241 10.768 73.812 5.789  -2.173 1.904  CA1  BYG 15 
BYG NA1  NA1  N 0  1 Y N N 20.603 8.451  76.801 -5.572 -0.377 0.753  NA1  BYG 16 
BYG CA2  CA2  C 0  1 N N R 15.913 12.289 79.219 0.155  -1.660 -0.767 CA2  BYG 17 
BYG OA2  OA2  O 0  1 Y N N 19.985 8.187  78.039 -5.363 -0.280 -0.650 OA2  BYG 18 
BYG CA3  CA3  C 0  1 N N N 13.031 13.868 81.049 -0.598 -3.268 -4.159 CA3  BYG 19 
BYG NA3  NA3  N 0  1 Y N N 19.574 9.354  78.695 -4.134 0.402  -0.857 NA3  BYG 20 
BYG OA3  OA3  O 0  1 N N N 22.130 11.488 73.578 -4.685 -0.093 5.005  OA3  BYG 21 
BYG NA4  NA4  N 1  1 N N N 21.751 10.485 74.398 -4.968 -0.301 3.839  NA4  BYG 22 
BYG OA4  OA4  O -1 1 N N N 22.071 9.268  73.927 -5.838 -1.105 3.557  OA4  BYG 23 
BYG OA5  OA5  O 0  1 N N N 18.392 11.416 83.907 5.200  7.945  -1.522 OA5  BYG 24 
BYG CB1  CB1  C 0  1 N N N 14.025 10.543 75.086 4.437  -2.683 1.401  CB1  BYG 25 
BYG CB2  CB2  C 0  1 N N N 17.169 13.093 78.966 -0.849 -0.505 -0.792 CB2  BYG 26 
BYG CD1  CD1  C 0  1 N N N 14.401 11.348 77.403 2.318  -2.024 0.295  CD1  BYG 27 
BYG CE1  CE1  C 0  1 N N N 16.995 11.502 83.902 3.949  7.436  -1.988 CE1  BYG 28 
BYG OE1  OE1  O 0  1 N N N 15.096 10.174 77.449 2.027  -3.195 0.418  OE1  BYG 29 
BYG CE2  CE2  C 0  1 N N N 16.515 10.063 83.925 3.421  6.397  -0.997 CE2  BYG 30 
BYG CE3  CE3  C 0  1 N N N 16.801 9.298  82.642 2.081  5.851  -1.497 CE3  BYG 31 
BYG CE4  CE4  C 0  1 N N N 18.230 9.511  82.171 1.553  4.812  -0.506 CE4  BYG 32 
BYG CE5  CE5  C 0  1 N N N 18.304 10.239 80.841 0.213  4.266  -1.005 CE5  BYG 33 
BYG CE6  CE6  C 0  1 N N N 19.745 10.633 80.597 -0.315 3.227  -0.014 CE6  BYG 34 
BYG CF4  CF4  C 0  1 N N R 19.680 11.771 78.045 -2.364 1.389  0.683  CF4  BYG 35 
BYG CF5  CF5  C 0  1 N N N 20.347 12.529 76.998 -2.591 2.124  2.003  CF5  BYG 36 
BYG CF6  CF6  C 0  1 N N N 20.946 12.040 75.845 -3.301 1.308  3.035  CF6  BYG 37 
BYG CF7  CF7  C 0  1 N N N 21.139 10.727 75.588 -4.255 0.424  2.763  CF7  BYG 38 
BYG CG1  CG1  C 0  1 N N N 14.090 11.720 76.013 3.649  -1.522 0.790  CG1  BYG 39 
BYG SG2  SG2  S 0  1 N N N 18.017 12.317 77.666 -1.040 0.165  0.882  SG2  BYG 40 
BYG HN1  HN1  H 0  1 N N N 13.130 8.801  73.668 6.754  -2.465 0.109  HN1  BYG 41 
BYG HN1A HN1A H 0  0 N N N 12.784 9.600  72.287 6.161  -0.925 0.310  HN1A BYG 42 
BYG HN2  HN2  H 0  1 N N N 15.054 13.298 77.618 1.682  -0.236 -0.384 HN2  BYG 43 
BYG HN3  HN3  H 0  1 N N N 13.451 12.799 79.302 -1.622 -2.734 -2.377 HN3  BYG 44 
BYG HA1  HA1  H 0  1 N N N 12.247 11.080 74.164 5.631  -1.344 2.594  HA1  BYG 45 
BYG HA2  HA2  H 0  1 N N N 16.190 11.243 79.419 -0.209 -2.443 -0.101 HA2  BYG 46 
BYG HA3  HA3  H 0  1 N N N 12.164 14.220 80.471 0.117  -4.091 -4.141 HA3  BYG 47 
BYG HA3A HA3A H 0  0 N N N 13.643 14.712 81.401 -0.234 -2.486 -4.824 HA3A BYG 48 
BYG HOA5 HOA5 H 0  0 N N N 18.764 12.290 83.893 5.595  8.611  -2.103 HOA5 BYG 49 
BYG HB1  HB1  H 0  1 N N N 13.544 9.717  75.631 4.597  -3.451 0.645  HB1  BYG 50 
BYG HB1A HB1A H 0  0 N N N 15.056 10.287 74.801 3.875  -3.105 2.234  HB1A BYG 51 
BYG HB2  HB2  H 0  1 N N N 16.911 14.126 78.690 -0.485 0.278  -1.458 HB2  BYG 52 
BYG HB2A HB2A H 0  0 N N N 17.795 13.116 79.870 -1.812 -0.869 -1.150 HB2A BYG 53 
BYG HE1  HE1  H 0  1 N N N 16.631 12.054 84.781 3.233  8.253  -2.075 HE1  BYG 54 
BYG HE1A HE1A H 0  0 N N N 16.635 12.024 83.003 4.088  6.969  -2.964 HE1A BYG 55 
BYG HE2  HE2  H 0  1 N N N 17.027 9.547  84.751 4.137  5.579  -0.911 HE2  BYG 56 
BYG HE2A HE2A H 0  0 N N N 15.426 10.070 84.082 3.282  6.863  -0.022 HE2A BYG 57 
BYG HE3  HE3  H 0  1 N N N 16.646 8.225  82.828 1.365  6.668  -1.583 HE3  BYG 58 
BYG HE3A HE3A H 0  0 N N N 16.114 9.651  81.859 2.220  5.385  -2.472 HE3A BYG 59 
BYG HE4  HE4  H 0  1 N N N 18.759 10.111 82.926 2.269  3.995  -0.419 HE4  BYG 60 
BYG HE4A HE4A H 0  0 N N N 18.709 8.527  82.056 1.414  5.278  0.470  HE4A BYG 61 
BYG HE5  HE5  H 0  1 N N N 17.954 9.579  80.033 -0.503 5.083  -1.091 HE5  BYG 62 
BYG HE5A HE5A H 0  0 N N N 17.670 11.138 80.870 0.352  3.800  -1.980 HE5A BYG 63 
BYG HE6  HE6  H 0  1 N N N 20.235 9.838  80.015 -0.454 3.693  0.962  HE6  BYG 64 
BYG HE6A HE6A H 0  0 N N N 20.246 10.757 81.568 0.401  2.410  0.072  HE6A BYG 65 
BYG HF5  HF5  H 0  1 N N N 19.562 13.201 76.621 -1.623 2.426  2.404  HF5  BYG 66 
BYG HF5A HF5A H 0  0 N N N 21.168 13.037 77.525 -3.178 3.021  1.805  HF5A BYG 67 
BYG HF6  HF6  H 0  1 N N N 21.279 12.754 75.106 -3.020 1.446  4.069  HF6  BYG 68 
BYG HG1  HG1  H 0  1 N N N 14.878 12.398 75.654 3.489  -0.754 1.546  HG1  BYG 69 
BYG HG1A HG1A H 0  0 N N N 13.111 12.222 76.002 4.211  -1.100 -0.043 HG1A BYG 70 
BYG HO11 HO11 H 0  0 N N N 14.387 12.266 71.341 6.684  -4.319 4.295  HO11 BYG 71 
BYG HO32 HO32 H 0  0 N N N 11.724 13.269 83.829 -2.904 -4.621 -6.152 HO32 BYG 72 
# 
loop_
_chem_comp_bond.comp_id 
_chem_comp_bond.atom_id_1 
_chem_comp_bond.atom_id_2 
_chem_comp_bond.value_order 
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal 
BYG C1  O11  SING N N 1  
BYG C1  O12  DOUB N N 2  
BYG C1  CA1  SING N N 3  
BYG N1  CA1  SING N N 4  
BYG S1  CE6  SING N N 5  
BYG S1  CF4  SING N N 6  
BYG C2  O2   DOUB N N 7  
BYG C2  N3   SING N N 8  
BYG C2  CA2  SING N N 9  
BYG N2  CA2  SING N N 10 
BYG N2  CD1  SING N N 11 
BYG C3  O31  DOUB N N 12 
BYG C3  O32  SING N N 13 
BYG C3  CA3  SING N N 14 
BYG N3  CA3  SING N N 15 
BYG CI  CL   SING Y N 16 
BYG CI  NA1  DOUB Y N 17 
BYG CI  CF7  SING N N 18 
BYG CL  NA3  DOUB Y N 19 
BYG CL  CF4  SING N N 20 
BYG CA1 CB1  SING N N 21 
BYG NA1 OA2  SING Y N 22 
BYG CA2 CB2  SING N N 23 
BYG OA2 NA3  SING Y N 24 
BYG OA3 NA4  DOUB N N 25 
BYG NA4 OA4  SING N N 26 
BYG NA4 CF7  SING N N 27 
BYG OA5 CE1  SING N N 28 
BYG CB1 CG1  SING N N 29 
BYG CB2 SG2  SING N N 30 
BYG CD1 OE1  DOUB N N 31 
BYG CD1 CG1  SING N N 32 
BYG CE1 CE2  SING N N 33 
BYG CE2 CE3  SING N N 34 
BYG CE3 CE4  SING N N 35 
BYG CE4 CE5  SING N N 36 
BYG CE5 CE6  SING N N 37 
BYG CF4 CF5  SING N N 38 
BYG CF4 SG2  SING N N 39 
BYG CF5 CF6  SING N N 40 
BYG CF6 CF7  DOUB N N 41 
BYG N1  HN1  SING N N 42 
BYG N1  HN1A SING N N 43 
BYG N2  HN2  SING N N 44 
BYG N3  HN3  SING N N 45 
BYG CA1 HA1  SING N N 46 
BYG CA2 HA2  SING N N 47 
BYG CA3 HA3  SING N N 48 
BYG CA3 HA3A SING N N 49 
BYG OA5 HOA5 SING N N 50 
BYG CB1 HB1  SING N N 51 
BYG CB1 HB1A SING N N 52 
BYG CB2 HB2  SING N N 53 
BYG CB2 HB2A SING N N 54 
BYG CE1 HE1  SING N N 55 
BYG CE1 HE1A SING N N 56 
BYG CE2 HE2  SING N N 57 
BYG CE2 HE2A SING N N 58 
BYG CE3 HE3  SING N N 59 
BYG CE3 HE3A SING N N 60 
BYG CE4 HE4  SING N N 61 
BYG CE4 HE4A SING N N 62 
BYG CE5 HE5  SING N N 63 
BYG CE5 HE5A SING N N 64 
BYG CE6 HE6  SING N N 65 
BYG CE6 HE6A SING N N 66 
BYG CF5 HF5  SING N N 67 
BYG CF5 HF5A SING N N 68 
BYG CF6 HF6  SING N N 69 
BYG CG1 HG1  SING N N 70 
BYG CG1 HG1A SING N N 71 
BYG O11 HO11 SING N N 72 
BYG O32 HO32 SING N N 73 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id 
_pdbx_chem_comp_descriptor.type 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version 
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor 
BYG SMILES           ACDLabs              11.02 "O=C(O)C(N)CCC(=O)NC(C(=O)NCC(=O)O)CSC1(SCCCCCCO)c2nonc2C(=CC1)[N+]([O-])=O" 
BYG SMILES_CANONICAL CACTVS               3.352 "N[C@@H](CCC(=O)N[C@@H](CS[C@@]1(CC=C(c2nonc12)[N+]([O-])=O)SCCCCCCO)C(=O)NCC(O)=O)C(O)=O" 
BYG SMILES           CACTVS               3.352 "N[CH](CCC(=O)N[CH](CS[C]1(CC=C(c2nonc12)[N+]([O-])=O)SCCCCCCO)C(=O)NCC(O)=O)C(O)=O" 
BYG SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 1.7.0 "C1C=C(c2c(non2)[C@]1(SCCCCCCO)SC[C@@H](C(=O)NCC(=O)O)NC(=O)CC[C@@H](C(=O)O)N)[N+](=O)[O-]" 
BYG SMILES           "OpenEye OEToolkits" 1.7.0 "C1C=C(c2c(non2)C1(SCCCCCCO)SCC(C(=O)NCC(=O)O)NC(=O)CCC(C(=O)O)N)[N+](=O)[O-]" 
BYG InChI            InChI                1.03  
"InChI=1S/C22H32N6O10S2/c23-13(21(34)35)5-6-16(30)25-14(20(33)24-11-17(31)32)12-40-22(39-10-4-2-1-3-9-29)8-7-15(28(36)37)18-19(22)27-38-26-18/h7,13-14,29H,1-6,8-12,23H2,(H,24,33)(H,25,30)(H,31,32)(H,34,35)/t13-,14-,22+/m0/s1" 
BYG InChIKey         InChI                1.03  DZIARIAPFJPVSN-FBJOKTGGSA-N 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id 
_pdbx_chem_comp_identifier.type 
_pdbx_chem_comp_identifier.program 
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version 
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier 
BYG "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs              11.02 "L-gamma-glutamyl-S-{(4R)-4-[(6-hydroxyhexyl)sulfanyl]-7-nitro-4,5-dihydro-2,1,3-benzoxadiazol-4-yl}-L-cysteinylglycine"                                                        
BYG "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 1.6.1 "(2S)-2-azanyl-5-[[(2R)-1-(carboxymethylamino)-3-[[(4R)-4-(6-hydroxyhexylsulfanyl)-7-nitro-5H-2,1,3-benzoxadiazol-4-yl]sulfanyl]-1-oxo-propan-2-yl]amino]-5-oxo-pentanoic acid" 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id 
_pdbx_chem_comp_audit.action_type 
_pdbx_chem_comp_audit.date 
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site 
BYG "Create component"     2009-04-08 PDBJ 
BYG "Modify aromatic_flag" 2011-06-04 RCSB 
BYG "Modify descriptor"    2011-06-04 RCSB 
#