data_DOJ
#
_chem_comp.id DOJ
_chem_comp.name "N-{(3S,4S)-1-benzyl-3-[(1S)-1-hydroxyethoxy]piperidin-4-yl}-N'-[3-(trifluoromethyl)phenyl]urea"
_chem_comp.type NON-POLYMER
_chem_comp.pdbx_type HETAIN
_chem_comp.formula "C22 H26 F3 N3 O3"
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ?
_chem_comp.pdbx_synonyms ?
_chem_comp.pdbx_formal_charge 0
_chem_comp.pdbx_initial_date 2017-11-01
_chem_comp.pdbx_modified_date 2018-09-21
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N
_chem_comp.pdbx_release_status REL
_chem_comp.pdbx_replaced_by ?
_chem_comp.pdbx_replaces ?
_chem_comp.formula_weight 437.455
_chem_comp.one_letter_code ?
_chem_comp.three_letter_code DOJ
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ?
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details Corina
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 6BG3
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list ?
_chem_comp.pdbx_processing_site RCSB
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.alt_atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.pdbx_align
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config
_chem_comp_atom.model_Cartn_x
_chem_comp_atom.model_Cartn_y
_chem_comp_atom.model_Cartn_z
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal
DOJ FBC F1 F 0 1 N N N 14.826 -13.461 -2.699 -7.180 1.482 -1.306 FBC DOJ 1
DOJ CBB C1 C 0 1 N N N 14.694 -12.144 -2.490 -5.891 0.939 -1.349 CBB DOJ 2
DOJ FBD F2 F 0 1 N N N 14.711 -11.956 -1.150 -5.926 -0.295 -2.006 FBD DOJ 3
DOJ FBE F3 F 0 1 N N N 13.465 -11.801 -2.897 -5.041 1.811 -2.039 FBE DOJ 4
DOJ CAZ C2 C 0 1 Y N N 15.778 -11.381 -3.195 -5.380 0.746 0.055 CAZ DOJ 5
DOJ CBA C3 C 0 1 Y N N 15.758 -11.307 -4.594 -4.117 0.225 0.264 CBA DOJ 6
DOJ CAY C4 C 0 1 Y N N 16.772 -10.785 -2.460 -6.172 1.096 1.133 CAY DOJ 7
DOJ CAX C5 C 0 1 Y N N 17.772 -10.084 -3.146 -5.706 0.921 2.423 CAX DOJ 8
DOJ CAW C6 C 0 1 Y N N 17.757 -9.992 -4.543 -4.447 0.396 2.639 CAW DOJ 9
DOJ CAV C7 C 0 1 Y N N 16.749 -10.596 -5.243 -3.647 0.048 1.559 CAV DOJ 10
DOJ NAU N1 N 0 1 N N N 16.798 -10.482 -6.658 -2.369 -0.480 1.774 NAU DOJ 11
DOJ CAS C8 C 0 1 N N N 15.683 -10.726 -7.494 -1.374 -0.212 0.905 CAS DOJ 12
DOJ OAT O1 O 0 1 N N N 14.594 -11.004 -7.114 -1.560 0.565 -0.011 OAT DOJ 13
DOJ NAR N2 N 0 1 N N N 16.044 -10.628 -8.848 -0.173 -0.806 1.053 NAR DOJ 14
DOJ CAQ C9 C 0 1 N N S 14.913 -10.662 -9.817 0.909 -0.515 0.108 CAQ DOJ 15
DOJ CAE C10 C 0 1 N N S 15.135 -11.330 -11.022 1.892 -1.688 0.079 CAE DOJ 16
DOJ CAF C11 C 0 1 N N N 14.447 -10.978 -12.318 3.050 -1.353 -0.863 CAF DOJ 17
DOJ OAD O2 O 0 1 N N N 15.527 -12.709 -10.859 1.221 -2.861 -0.388 OAD DOJ 18
DOJ CAB C12 C 0 1 N N S 16.742 -13.306 -11.236 1.744 -4.080 0.144 CAB DOJ 19
DOJ OAC O3 O 0 1 N N N 16.694 -14.667 -10.972 3.084 -4.264 -0.317 OAC DOJ 20
DOJ CAA C13 C 0 1 N N N 17.859 -12.612 -10.448 0.879 -5.252 -0.322 CAA DOJ 21
DOJ CAP C14 C 0 1 N N N 14.516 -9.260 -10.038 1.648 0.751 0.551 CAP DOJ 22
DOJ CAO C15 C 0 1 N N N 13.346 -9.202 -11.034 2.814 1.016 -0.405 CAO DOJ 23
DOJ NAG N3 N 0 1 N N N 13.758 -9.683 -12.321 3.727 -0.136 -0.395 NAG DOJ 24
DOJ CAH C16 C 0 1 N N N 12.840 -9.589 -13.218 4.928 0.139 -1.195 CAH DOJ 25
DOJ CAI C17 C 0 1 Y N N 12.178 -8.206 -13.337 5.725 1.239 -0.542 CAI DOJ 26
DOJ CAJ C18 C 0 1 Y N N 10.881 -7.953 -12.800 6.697 0.929 0.390 CAJ DOJ 27
DOJ CAK C19 C 0 1 Y N N 10.312 -6.677 -12.903 7.428 1.938 0.989 CAK DOJ 28
DOJ CAL C20 C 0 1 Y N N 11.007 -5.661 -13.503 7.185 3.258 0.655 CAL DOJ 29
DOJ CAM C21 C 0 1 Y N N 12.309 -5.904 -14.042 6.213 3.568 -0.277 CAM DOJ 30
DOJ CAN C22 C 0 1 Y N N 12.858 -7.156 -13.951 5.487 2.558 -0.880 CAN DOJ 31
DOJ HBA1 H1 H 0 0 N N N 14.979 -11.799 -5.157 -3.497 -0.044 -0.578 HBA1 DOJ 32
DOJ HAY1 H2 H 0 0 N N N 16.783 -10.855 -1.382 -7.157 1.508 0.966 HAY1 DOJ 33
DOJ HAX1 H3 H 0 0 N N N 18.566 -9.608 -2.590 -6.328 1.195 3.263 HAX1 DOJ 34
DOJ HAW1 H4 H 0 0 N N N 18.533 -9.450 -5.062 -4.084 0.260 3.647 HAW1 DOJ 35
DOJ HAU1 H5 H 0 0 N N N 17.663 -10.216 -7.084 -2.199 -1.038 2.549 HAU1 DOJ 36
DOJ HAR1 H6 H 0 0 N N N 16.996 -10.541 -9.142 -0.025 -1.425 1.784 HAR1 DOJ 37
DOJ HAQ1 H7 H 0 0 N N N 14.073 -11.156 -9.306 0.492 -0.364 -0.888 HAQ1 DOJ 38
DOJ HAE1 H8 H 0 0 N N N 16.125 -10.912 -11.259 2.277 -1.865 1.083 HAE1 DOJ 39
DOJ HAF1 H9 H 0 0 N N N 13.704 -11.760 -12.534 3.760 -2.181 -0.875 HAF1 DOJ 40
DOJ HAF2 H10 H 0 0 N N N 15.206 -10.963 -13.114 2.665 -1.190 -1.869 HAF2 DOJ 41
DOJ HAB1 H11 H 0 0 N N N 16.924 -13.136 -12.307 1.738 -4.033 1.233 HAB1 DOJ 42
DOJ HAC1 H12 H 0 0 N N N 17.516 -15.069 -11.227 3.166 -4.315 -1.279 HAC1 DOJ 43
DOJ HAA3 H13 H 0 0 N N N 17.863 -11.538 -10.685 1.277 -6.182 0.084 HAA3 DOJ 44
DOJ HAA1 H14 H 0 0 N N N 17.687 -12.749 -9.370 -0.144 -5.111 0.030 HAA1 DOJ 45
DOJ HAA2 H15 H 0 0 N N N 18.829 -13.052 -10.723 0.885 -5.298 -1.411 HAA2 DOJ 46
DOJ HAP2 H16 H 0 0 N N N 15.370 -8.698 -10.444 0.962 1.598 0.532 HAP2 DOJ 47
DOJ HAP1 H17 H 0 0 N N N 14.205 -8.813 -9.082 2.029 0.615 1.563 HAP1 DOJ 48
DOJ HAO1 H18 H 0 0 N N N 13.003 -8.161 -11.129 2.429 1.166 -1.414 HAO1 DOJ 49
DOJ HAO2 H19 H 0 0 N N N 12.521 -9.827 -10.661 3.351 1.908 -0.084 HAO2 DOJ 50
DOJ HAH1 H21 H 0 0 N N N 12.055 -10.322 -12.980 5.537 -0.763 -1.257 HAH1 DOJ 51
DOJ HAH2 H22 H 0 0 N N N 13.289 -9.836 -14.191 4.635 0.448 -2.198 HAH2 DOJ 52
DOJ HAJ1 H23 H 0 0 N N N 10.336 -8.748 -12.312 6.886 -0.102 0.650 HAJ1 DOJ 53
DOJ HAK1 H24 H 0 0 N N N 9.323 -6.494 -12.508 8.187 1.696 1.717 HAK1 DOJ 54
DOJ HAL1 H25 H 0 0 N N N 10.571 -4.675 -13.569 7.756 4.047 1.123 HAL1 DOJ 55
DOJ HAM1 H26 H 0 0 N N N 12.857 -5.105 -14.518 6.027 4.599 -0.541 HAM1 DOJ 56
DOJ HAN1 H27 H 0 0 N N N 13.840 -7.333 -14.364 4.727 2.800 -1.608 HAN1 DOJ 57
#
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
DOJ CAM CAN DOUB Y N 1
DOJ CAM CAL SING Y N 2
DOJ CAN CAI SING Y N 3
DOJ CAL CAK DOUB Y N 4
DOJ CAI CAH SING N N 5
DOJ CAI CAJ DOUB Y N 6
DOJ CAH NAG SING N N 7
DOJ CAK CAJ SING Y N 8
DOJ NAG CAF SING N N 9
DOJ NAG CAO SING N N 10
DOJ CAF CAE SING N N 11
DOJ CAB OAC SING N N 12
DOJ CAB OAD SING N N 13
DOJ CAB CAA SING N N 14
DOJ CAO CAP SING N N 15
DOJ CAE OAD SING N N 16
DOJ CAE CAQ SING N N 17
DOJ CAP CAQ SING N N 18
DOJ CAQ NAR SING N N 19
DOJ NAR CAS SING N N 20
DOJ CAS OAT DOUB N N 21
DOJ CAS NAU SING N N 22
DOJ NAU CAV SING N N 23
DOJ CAV CBA DOUB Y N 24
DOJ CAV CAW SING Y N 25
DOJ CBA CAZ SING Y N 26
DOJ CAW CAX DOUB Y N 27
DOJ CAZ CBB SING N N 28
DOJ CAZ CAY DOUB Y N 29
DOJ CAX CAY SING Y N 30
DOJ FBE CBB SING N N 31
DOJ FBC CBB SING N N 32
DOJ CBB FBD SING N N 33
DOJ CBA HBA1 SING N N 34
DOJ CAY HAY1 SING N N 35
DOJ CAX HAX1 SING N N 36
DOJ CAW HAW1 SING N N 37
DOJ NAU HAU1 SING N N 38
DOJ NAR HAR1 SING N N 39
DOJ CAQ HAQ1 SING N N 40
DOJ CAE HAE1 SING N N 41
DOJ CAF HAF1 SING N N 42
DOJ CAF HAF2 SING N N 43
DOJ CAB HAB1 SING N N 44
DOJ OAC HAC1 SING N N 45
DOJ CAA HAA3 SING N N 46
DOJ CAA HAA1 SING N N 47
DOJ CAA HAA2 SING N N 48
DOJ CAP HAP2 SING N N 49
DOJ CAP HAP1 SING N N 50
DOJ CAO HAO1 SING N N 51
DOJ CAO HAO2 SING N N 52
DOJ CAH HAH1 SING N N 53
DOJ CAH HAH2 SING N N 54
DOJ CAJ HAJ1 SING N N 55
DOJ CAK HAK1 SING N N 56
DOJ CAL HAL1 SING N N 57
DOJ CAM HAM1 SING N N 58
DOJ CAN HAN1 SING N N 59
#
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id
_pdbx_chem_comp_descriptor.type
_pdbx_chem_comp_descriptor.program
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor
DOJ SMILES ACDLabs 12.01 "FC(F)(F)c1cccc(c1)NC(=O)NC2C(OC(O)C)CN(CC2)Cc3ccccc3"
DOJ InChI InChI 1.03 "InChI=1S/C22H26F3N3O3/c1-15(29)31-20-14-28(13-16-6-3-2-4-7-16)11-10-19(20)27-21(30)26-18-9-5-8-17(12-18)22(23,24)25/h2-9,12,15,19-20,29H,10-11,13-14H2,1H3,(H2,26,27,30)/t15-,19-,20-/m0/s1"
DOJ InChIKey InChI 1.03 KGJIMOVTOXSTNJ-YSSFQJQWSA-N
DOJ SMILES_CANONICAL CACTVS 3.385 "C[C@@H](O)O[C@H]1CN(CC[C@@H]1NC(=O)Nc2cccc(c2)C(F)(F)F)Cc3ccccc3"
DOJ SMILES CACTVS 3.385 "C[CH](O)O[CH]1CN(CC[CH]1NC(=O)Nc2cccc(c2)C(F)(F)F)Cc3ccccc3"
DOJ SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 "C[C@@H](O)O[C@H]1CN(CC[C@@H]1NC(=O)Nc2cccc(c2)C(F)(F)F)Cc3ccccc3"
DOJ SMILES "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 "CC(O)OC1CN(CCC1NC(=O)Nc2cccc(c2)C(F)(F)F)Cc3ccccc3"
#
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id
_pdbx_chem_comp_identifier.type
_pdbx_chem_comp_identifier.program
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier
DOJ "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs 12.01 "N-{(3S,4S)-1-benzyl-3-[(1S)-1-hydroxyethoxy]piperidin-4-yl}-N'-[3-(trifluoromethyl)phenyl]urea"
DOJ "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 "1-[(3~{S},4~{S})-3-[(1~{S})-1-oxidanylethoxy]-1-(phenylmethyl)piperidin-4-yl]-3-[3-(trifluoromethyl)phenyl]urea"
#
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id
_pdbx_chem_comp_audit.action_type
_pdbx_chem_comp_audit.date
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site
DOJ "Create component" 2017-11-01 RCSB
DOJ "Other modification" 2017-11-01 RCSB
DOJ "Initial release" 2018-09-26 RCSB
#