data_DOS
# 
_chem_comp.id                                    DOS 
_chem_comp.name                                  
;DELTA-BIS(2,2'-BIPYRIDINE)IMIDAZOLE OSMIUM (II)
;
_chem_comp.type                                  NON-POLYMER 
_chem_comp.pdbx_type                             HETAIN 
_chem_comp.formula                               "C23 H19 N6 Os" 
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id               ? 
_chem_comp.pdbx_synonyms                         ? 
_chem_comp.pdbx_formal_charge                    2 
_chem_comp.pdbx_initial_date                     2001-10-03 
_chem_comp.pdbx_modified_date                    2011-08-15 
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag                   N 
_chem_comp.pdbx_release_status                   REL 
_chem_comp.pdbx_replaced_by                      ? 
_chem_comp.pdbx_replaces                         ? 
_chem_comp.formula_weight                        569.667 
_chem_comp.one_letter_code                       ? 
_chem_comp.three_letter_code                     DOS 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details        ? 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details        Corina 
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag   N 
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code        1JZJ 
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list                ? 
_chem_comp.pdbx_processing_site                  RCSB 
# 
loop_
_chem_comp_atom.comp_id 
_chem_comp_atom.atom_id 
_chem_comp_atom.alt_atom_id 
_chem_comp_atom.type_symbol 
_chem_comp_atom.charge 
_chem_comp_atom.pdbx_align 
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag 
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_atom.model_Cartn_x 
_chem_comp_atom.model_Cartn_y 
_chem_comp_atom.model_Cartn_z 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal 
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id 
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id 
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal 
DOS OS  OS  OS 2 0 N N N 22.758 2.062  48.710 -0.001 0.001  -0.172 OS  DOS 1  
DOS N2  N2  N  0 1 Y N N 24.250 2.923  47.553 1.893  -0.867 -0.034 N2  DOS 2  
DOS C3  C3  C  0 1 Y N N 24.044 3.787  46.522 2.296  -2.056 -0.479 C3  DOS 3  
DOS C4  C4  C  0 1 Y N N 25.096 4.282  45.756 3.594  -2.489 -0.314 C4  DOS 4  
DOS C5  C5  C  0 1 Y N N 26.383 3.873  46.067 4.492  -1.657 0.333  C5  DOS 5  
DOS C6  C6  C  0 1 Y N N 26.602 3.006  47.106 4.049  -0.435 0.782  C6  DOS 6  
DOS C7  C7  C  0 1 Y N N 25.519 2.524  47.857 2.700  -0.040 0.588  C7  DOS 7  
DOS C8  C8  C  0 1 Y N N 25.630 1.597  48.982 2.172  1.262  1.080  C8  DOS 8  
DOS C9  C9  C  0 1 Y N N 26.854 1.075  49.440 2.986  2.206  1.758  C9  DOS 9  
DOS CG  CG  C  0 1 Y N N 22.591 3.475  51.561 -0.545 -0.933 -3.076 CG  DOS 10 
DOS C10 C10 C  0 1 Y N N 26.861 0.206  50.500 2.453  3.389  2.213  C10 DOS 11 
DOS C11 C11 C  0 1 Y N N 25.666 -0.146 51.107 1.107  3.634  2.001  C11 DOS 12 
DOS C12 C12 C  0 1 Y N N 24.476 0.390  50.630 0.364  2.688  1.330  C12 DOS 13 
DOS N13 N13 N  0 1 Y N N 24.458 1.251  49.575 0.907  1.556  0.890  N13 DOS 14 
DOS N26 N26 N  0 1 Y N N 22.429 0.446  47.469 -0.913 -1.568 0.864  N26 DOS 15 
DOS C27 C27 C  0 1 Y N N 23.005 0.262  46.263 -0.372 -2.711 1.281  C27 DOS 16 
DOS C28 C28 C  0 1 Y N N 22.770 -0.869 45.483 -1.117 -3.665 1.941  C28 DOS 17 
DOS C29 C29 C  0 1 Y N N 21.909 -1.835 45.982 -2.457 -3.411 2.176  C29 DOS 18 
DOS C30 C30 C  0 1 Y N N 21.317 -1.656 47.209 -2.987 -2.218 1.743  C30 DOS 19 
DOS C31 C31 C  0 1 Y N N 21.583 -0.498 47.961 -2.175 -1.273 1.064  C31 DOS 20 
DOS C32 C32 C  0 1 Y N N 21.008 -0.200 49.270 -2.702 0.036  0.589  C32 DOS 21 
DOS C33 C33 C  0 1 Y N N 20.115 -1.064 49.923 -4.048 0.434  0.796  C33 DOS 22 
DOS C34 C34 C  0 1 Y N N 19.614 -0.725 51.143 -4.495 1.652  0.341  C34 DOS 23 
DOS C35 C35 C  0 1 Y N N 19.994 0.473  51.725 -3.604 2.478  -0.322 C35 DOS 24 
DOS C36 C36 C  0 1 Y N N 20.883 1.302  51.048 -2.307 2.045  -0.492 C36 DOS 25 
DOS N37 N37 N  0 1 Y N N 21.390 0.963  49.825 -1.898 0.862  -0.040 N37 DOS 26 
DOS ND1 ND1 N  0 1 Y N N 23.036 3.464  50.255 0.008  0.013  -2.257 ND1 DOS 27 
DOS CD2 CD2 C  0 1 Y N N 22.810 4.582  52.303 -0.313 -0.536 -4.342 CD2 DOS 28 
DOS CE1 CE1 C  0 1 Y N N 23.563 4.678  50.257 0.559  0.956  -3.050 CE1 DOS 29 
DOS NE2 NE2 N  0 1 Y N N 23.468 5.360  51.384 0.359  0.624  -4.296 NE2 DOS 30 
DOS H3  H3  H  0 1 N N N 23.036 4.098  46.291 1.584  -2.698 -0.985 H3  DOS 31 
DOS H4  H4  H  0 1 N N N 24.914 4.967  44.941 3.901  -3.454 -0.682 H4  DOS 32 
DOS H5  H5  H  0 1 N N N 27.218 4.239  45.488 5.515  -1.959 0.485  H5  DOS 33 
DOS H6  H6  H  0 1 N N N 27.608 2.694  47.346 4.734  0.230  1.290  H6  DOS 34 
DOS H9  H9  H  0 1 N N N 27.780 1.357  48.960 4.034  1.992  1.918  H9  DOS 35 
DOS HG  HG  H  0 1 N N N 22.081 2.620  51.979 -1.064 -1.829 -2.768 HG  DOS 36 
DOS H10 H10 H  0 1 N N N 27.794 -0.202 50.860 3.072  4.108  2.723  H10 DOS 37 
DOS H11 H11 H  0 1 N N N 25.660 -0.830 51.943 0.650  4.546  2.348  H11 DOS 38 
DOS H12 H12 H  0 1 N N N 23.546 0.118  51.106 -0.690 2.870  1.154  H12 DOS 39 
DOS H27 H27 H  0 1 N N N 23.675 1.021  45.887 0.678  -2.898 1.089  H27 DOS 40 
DOS H28 H28 H  0 1 N N N 23.244 -0.989 44.520 -0.663 -4.587 2.264  H28 DOS 41 
DOS H29 H29 H  0 1 N N N 21.704 -2.726 45.407 -3.075 -4.133 2.683  H29 DOS 42 
DOS H30 H30 H  0 1 N N N 20.645 -2.407 47.597 -4.030 -1.998 1.922  H30 DOS 43 
DOS H33 H33 H  0 1 N N N 19.826 -1.995 49.459 -4.726 -0.226 1.320  H33 DOS 44 
DOS H34 H34 H  0 1 N N N 18.927 -1.384 51.652 -5.517 1.954  0.502  H34 DOS 45 
DOS H35 H35 H  0 1 N N N 19.606 0.760  52.691 -3.917 3.438  -0.697 H35 DOS 46 
DOS H36 H36 H  0 1 N N N 21.180 2.237  51.500 -1.600 2.685  -1.008 H36 DOS 47 
DOS HD2 HD2 H  0 1 N N N 22.543 4.794  53.328 -0.613 -1.061 -5.237 HD2 DOS 48 
DOS HE1 HE1 H  0 1 N N N 24.046 5.089  49.383 1.076  1.842  -2.710 HE1 DOS 49 
# 
loop_
_chem_comp_bond.comp_id 
_chem_comp_bond.atom_id_1 
_chem_comp_bond.atom_id_2 
_chem_comp_bond.value_order 
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag 
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config 
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal 
DOS OS  N13 SING N N 1  
DOS OS  N37 SING N N 2  
DOS OS  ND1 SING N N 3  
DOS N2  OS  SING N N 4  
DOS N2  C7  SING Y N 5  
DOS C3  N2  DOUB Y N 6  
DOS C4  C3  SING Y N 7  
DOS C4  C5  DOUB Y N 8  
DOS C5  C6  SING Y N 9  
DOS C6  C7  DOUB Y N 10 
DOS C7  C8  SING N N 11 
DOS C8  C9  DOUB Y N 12 
DOS C8  N13 SING Y N 13 
DOS C9  C10 SING Y N 14 
DOS CG  CD2 DOUB Y N 15 
DOS C10 C11 DOUB Y N 16 
DOS C12 C11 SING Y N 17 
DOS N13 C12 DOUB Y N 18 
DOS N26 OS  SING N N 19 
DOS N26 C31 SING Y N 20 
DOS C27 N26 DOUB Y N 21 
DOS C28 C27 SING Y N 22 
DOS C28 C29 DOUB Y N 23 
DOS C29 C30 SING Y N 24 
DOS C30 C31 DOUB Y N 25 
DOS C31 C32 SING N N 26 
DOS C32 N37 DOUB Y N 27 
DOS C32 C33 SING Y N 28 
DOS C33 C34 DOUB Y N 29 
DOS C34 C35 SING Y N 30 
DOS C36 C35 DOUB Y N 31 
DOS N37 C36 SING Y N 32 
DOS ND1 CG  SING Y N 33 
DOS ND1 CE1 SING Y N 34 
DOS CE1 NE2 DOUB Y N 35 
DOS NE2 CD2 SING Y N 36 
DOS C3  H3  SING N N 37 
DOS C4  H4  SING N N 38 
DOS C5  H5  SING N N 39 
DOS C6  H6  SING N N 40 
DOS C9  H9  SING N N 41 
DOS CG  HG  SING N N 42 
DOS C10 H10 SING N N 43 
DOS C11 H11 SING N N 44 
DOS C12 H12 SING N N 45 
DOS C27 H27 SING N N 46 
DOS C28 H28 SING N N 47 
DOS C29 H29 SING N N 48 
DOS C30 H30 SING N N 49 
DOS C33 H33 SING N N 50 
DOS C34 H34 SING N N 51 
DOS C35 H35 SING N N 52 
DOS C36 H36 SING N N 53 
DOS CD2 HD2 SING N N 54 
DOS CE1 HE1 SING N N 55 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id 
_pdbx_chem_comp_descriptor.type 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program 
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version 
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor 
DOS SMILES           ACDLabs              12.01 "n1ccn(c1)[Os+2]73(n4c(c2ccccn23)cccc4)n5ccccc5c6ccccn67"                                            
DOS InChI            InChI                1.03  "InChI=1S/2C10H8N2.C3H3N2.Os/c2*1-3-7-11-9(5-1)10-6-2-4-8-12-10;1-2-5-3-4-1;/h2*1-8H;1-3H;/q;;-1;+3" 
DOS InChIKey         InChI                1.03  LHAHECCJWGXHOW-UHFFFAOYSA-N                                                                          
DOS SMILES_CANONICAL CACTVS               3.370 "[Os++]|1|2(|n3ccccc3c4ccccn|14)(|n5ccccc5c6ccccn|26)n7ccnc7"                                        
DOS SMILES           CACTVS               3.370 "[Os++]|1|2(|n3ccccc3c4ccccn|14)(|n5ccccc5c6ccccn|26)n7ccnc7"                                        
DOS SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 1.7.2 "c1cn(cn1)[Os+2]23([N]4=C(C=CC=C4)C5=CC=CC=[N]52)[N]6=CC=CC=C6C7=CC=CC=[N]37"                        
DOS SMILES           "OpenEye OEToolkits" 1.7.2 "c1cn(cn1)[Os+2]23([N]4=C(C=CC=C4)C5=CC=CC=[N]52)[N]6=CC=CC=C6C7=CC=CC=[N]37"                        
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id 
_pdbx_chem_comp_identifier.type 
_pdbx_chem_comp_identifier.program 
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version 
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier 
DOS "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs 12.01 "bis(2,2'-bipyridine-kappa~2~N~1~,N~1'~)(1H-imidazol-1-yl)osmium(2+)" 
# 
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id 
_pdbx_chem_comp_audit.action_type 
_pdbx_chem_comp_audit.date 
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site 
DOS "Create component"   2001-10-03 RCSB 
DOS "Modify descriptor"  2011-06-04 RCSB 
DOS "Other modification" 2011-08-15 RCSB 
#