data_DQ0 # _chem_comp.id DQ0 _chem_comp.name "4-[3-[[2,6-bis(azanyl)-5-(3-chlorophenyl)pyrimidin-4-yl]methoxy]phenoxy]butanoic acid" _chem_comp.type NON-POLYMER _chem_comp.pdbx_type HETAIN _chem_comp.formula "C21 H21 Cl N4 O4" _chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ? _chem_comp.pdbx_synonyms ? _chem_comp.pdbx_formal_charge 0 _chem_comp.pdbx_initial_date 2019-08-21 _chem_comp.pdbx_modified_date 2019-11-29 _chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N _chem_comp.pdbx_release_status REL _chem_comp.pdbx_replaced_by ? _chem_comp.pdbx_replaces ? _chem_comp.formula_weight 428.869 _chem_comp.one_letter_code ? _chem_comp.three_letter_code DQ0 _chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ? _chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details Corina _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 6KOT _chem_comp.pdbx_subcomponent_list ? _chem_comp.pdbx_processing_site PDBJ # # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.alt_atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.charge _chem_comp_atom.pdbx_align _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.model_Cartn_x _chem_comp_atom.model_Cartn_y _chem_comp_atom.model_Cartn_z _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal _chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id _chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id _chem_comp_atom.pdbx_ordinal DQ0 C4 C1 C 0 1 Y N N 0.001 -6.053 57.306 2.883 -1.646 0.417 C4 DQ0 1 DQ0 C5 C2 C 0 1 Y N N -0.484 -5.177 58.294 3.667 -0.800 -0.363 C5 DQ0 2 DQ0 C6 C3 C 0 1 Y N N -1.353 -4.161 57.890 4.780 -1.349 -1.028 C6 DQ0 3 DQ0 N1 N1 N 0 1 Y N N -1.681 -4.004 56.576 5.037 -2.644 -0.887 N1 DQ0 4 DQ0 N3 N2 N 0 1 Y N N -0.351 -5.862 56.025 3.210 -2.925 0.510 N3 DQ0 5 DQ0 OBC O1 O 0 1 N N N 9.267 -2.042 58.353 -10.172 0.653 -0.479 OBC DQ0 6 DQ0 CBB C4 C 0 1 N N N 8.183 -2.615 58.150 -8.940 0.257 -0.835 CBB DQ0 7 DQ0 OBD O2 O 0 1 N N N 7.082 -2.059 57.920 -8.752 -0.223 -1.928 OBD DQ0 8 DQ0 CBA C5 C 0 1 N N N 8.225 -4.115 58.246 -7.792 0.410 0.129 CBA DQ0 9 DQ0 CAZ C6 C 0 1 N N N 7.866 -4.263 59.719 -6.509 -0.115 -0.519 CAZ DQ0 10 DQ0 CAY C7 C 0 1 N N N 6.446 -4.791 59.731 -5.343 0.040 0.460 CAY DQ0 11 DQ0 OAX O3 O 0 1 N N N 6.466 -5.760 58.666 -4.145 -0.449 -0.146 OAX DQ0 12 DQ0 CAV C8 C 0 1 Y N N 5.457 -6.652 58.711 -3.008 -0.384 0.596 CAV DQ0 13 DQ0 CAW C9 C 0 1 Y N N 4.164 -6.190 58.576 -1.808 -0.836 0.068 CAW DQ0 14 DQ0 CAU C10 C 0 1 Y N N 5.717 -8.018 58.882 -3.045 0.141 1.880 CAU DQ0 15 DQ0 CAT C11 C 0 1 Y N N 4.673 -8.932 58.909 -1.890 0.208 2.634 CAT DQ0 16 DQ0 CAS C12 C 0 1 Y N N 3.374 -8.462 58.768 -0.694 -0.247 2.113 CAS DQ0 17 DQ0 CAR C13 C 0 1 Y N N 3.109 -7.091 58.594 -0.650 -0.768 0.827 CAR DQ0 18 DQ0 OAK O4 O 0 1 N N N 1.833 -6.557 58.462 0.527 -1.211 0.313 OAK DQ0 19 DQ0 CAJ C14 C 0 1 N N N 0.867 -7.129 57.594 1.680 -1.110 1.151 CAJ DQ0 20 DQ0 C2 C15 C 0 1 Y N N -1.165 -4.869 55.653 4.261 -3.410 -0.134 C2 DQ0 21 DQ0 NAH N3 N 0 1 N N N -1.464 -4.745 54.376 4.565 -4.754 -0.007 NAH DQ0 22 DQ0 NAG N4 N 0 1 N N N -1.831 -3.344 58.815 5.592 -0.553 -1.816 NAG DQ0 23 DQ0 CAI C16 C 0 1 Y N N -0.170 -5.344 59.643 3.339 0.640 -0.491 CAI DQ0 24 DQ0 CAP C17 C 0 1 Y N N 0.593 -4.392 60.300 4.213 1.603 0.011 CAP DQ0 25 DQ0 CAO C18 C 0 1 Y N N 0.910 -4.515 61.646 3.902 2.944 -0.111 CAO DQ0 26 DQ0 CL CL CL 0 0 N N N 1.890 -3.170 62.437 4.989 4.145 0.513 CL DQ0 27 DQ0 CAN C19 C 0 1 Y N N 0.502 -5.625 62.352 2.725 3.330 -0.729 CAN DQ0 28 DQ0 CAM C20 C 0 1 Y N N -0.242 -6.606 61.722 1.855 2.377 -1.228 CAM DQ0 29 DQ0 CAL C21 C 0 1 Y N N -0.568 -6.468 60.359 2.158 1.036 -1.117 CAL DQ0 30 DQ0 H1 H1 H 0 1 N N N 9.142 -1.101 58.308 -10.877 0.535 -1.131 H1 DQ0 31 DQ0 H2 H2 H 0 1 N N N 7.483 -4.592 57.589 -7.667 1.462 0.381 H2 DQ0 32 DQ0 H3 H3 H 0 1 N N N 9.224 -4.516 58.022 -8.000 -0.159 1.035 H3 DQ0 33 DQ0 H4 H4 H 0 1 N N N 8.546 -4.973 60.212 -6.634 -1.168 -0.772 H4 DQ0 34 DQ0 H5 H5 H 0 1 N N N 7.920 -3.290 60.229 -6.301 0.454 -1.425 H5 DQ0 35 DQ0 H6 H6 H 0 1 N N N 5.722 -3.989 59.525 -5.219 1.093 0.712 H6 DQ0 36 DQ0 H7 H7 H 0 1 N N N 6.206 -5.264 60.695 -5.551 -0.528 1.366 H7 DQ0 37 DQ0 H8 H8 H 0 1 N N N 3.974 -5.133 58.457 -1.776 -1.242 -0.932 H8 DQ0 38 DQ0 H9 H9 H 0 1 N N N 6.735 -8.361 58.993 -3.979 0.498 2.289 H9 DQ0 39 DQ0 H10 H10 H 0 1 N N N 4.867 -9.987 59.037 -1.921 0.618 3.633 H10 DQ0 40 DQ0 H11 H11 H 0 1 N N N 2.552 -9.162 58.792 0.208 -0.194 2.704 H11 DQ0 41 DQ0 H12 H12 H 0 1 N N N 0.326 -7.946 58.093 1.521 -1.691 2.059 H12 DQ0 42 DQ0 H13 H13 H 0 1 N N N 1.340 -7.509 56.676 1.849 -0.066 1.412 H13 DQ0 43 DQ0 H14 H14 H 0 1 N N N -1.003 -5.462 53.854 4.011 -5.326 0.548 H14 DQ0 44 DQ0 H15 H15 H 0 1 N N N -2.453 -4.829 54.256 5.332 -5.124 -0.472 H15 DQ0 45 DQ0 H16 H16 H 0 1 N N N -2.421 -2.661 58.384 5.396 0.392 -1.914 H16 DQ0 46 DQ0 H17 H17 H 0 1 N N N -2.360 -3.869 59.482 6.356 -0.940 -2.271 H17 DQ0 47 DQ0 H18 H18 H 0 1 N N N 0.950 -3.533 59.751 5.131 1.302 0.493 H18 DQ0 48 DQ0 H19 H19 H 0 1 N N N 0.762 -5.729 63.395 2.486 4.379 -0.822 H19 DQ0 49 DQ0 H20 H20 H 0 1 N N N -0.572 -7.474 62.273 0.938 2.685 -1.709 H20 DQ0 50 DQ0 H21 H21 H 0 1 N N N -1.133 -7.244 59.864 1.480 0.294 -1.511 H21 DQ0 51 # # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal DQ0 NAH C2 SING N N 1 DQ0 C2 N3 DOUB Y N 2 DQ0 C2 N1 SING Y N 3 DQ0 N3 C4 SING Y N 4 DQ0 N1 C6 DOUB Y N 5 DQ0 C4 CAJ SING N N 6 DQ0 C4 C5 DOUB Y N 7 DQ0 CAJ OAK SING N N 8 DQ0 C6 C5 SING Y N 9 DQ0 C6 NAG SING N N 10 DQ0 OBD CBB DOUB N N 11 DQ0 CBB CBA SING N N 12 DQ0 CBB OBC SING N N 13 DQ0 CBA CAZ SING N N 14 DQ0 C5 CAI SING N N 15 DQ0 OAK CAR SING N N 16 DQ0 CAW CAR DOUB Y N 17 DQ0 CAW CAV SING Y N 18 DQ0 CAR CAS SING Y N 19 DQ0 OAX CAV SING N N 20 DQ0 OAX CAY SING N N 21 DQ0 CAV CAU DOUB Y N 22 DQ0 CAS CAT DOUB Y N 23 DQ0 CAU CAT SING Y N 24 DQ0 CAI CAP DOUB Y N 25 DQ0 CAI CAL SING Y N 26 DQ0 CAZ CAY SING N N 27 DQ0 CAP CAO SING Y N 28 DQ0 CAL CAM DOUB Y N 29 DQ0 CAO CAN DOUB Y N 30 DQ0 CAO CL SING N N 31 DQ0 CAM CAN SING Y N 32 DQ0 OBC H1 SING N N 33 DQ0 CBA H2 SING N N 34 DQ0 CBA H3 SING N N 35 DQ0 CAZ H4 SING N N 36 DQ0 CAZ H5 SING N N 37 DQ0 CAY H6 SING N N 38 DQ0 CAY H7 SING N N 39 DQ0 CAW H8 SING N N 40 DQ0 CAU H9 SING N N 41 DQ0 CAT H10 SING N N 42 DQ0 CAS H11 SING N N 43 DQ0 CAJ H12 SING N N 44 DQ0 CAJ H13 SING N N 45 DQ0 NAH H14 SING N N 46 DQ0 NAH H15 SING N N 47 DQ0 NAG H16 SING N N 48 DQ0 NAG H17 SING N N 49 DQ0 CAP H18 SING N N 50 DQ0 CAN H19 SING N N 51 DQ0 CAM H20 SING N N 52 DQ0 CAL H21 SING N N 53 # # loop_ _pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id _pdbx_chem_comp_descriptor.type _pdbx_chem_comp_descriptor.program _pdbx_chem_comp_descriptor.program_version _pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor DQ0 InChI InChI 1.03 "InChI=1S/C21H21ClN4O4/c22-14-5-1-4-13(10-14)19-17(25-21(24)26-20(19)23)12-30-16-7-2-6-15(11-16)29-9-3-8-18(27)28/h1-2,4-7,10-11H,3,8-9,12H2,(H,27,28)(H4,23,24,25,26)" DQ0 InChIKey InChI 1.03 CSFKBCPKDXDYEY-UHFFFAOYSA-N DQ0 SMILES_CANONICAL CACTVS 3.385 "Nc1nc(N)c(c(COc2cccc(OCCCC(O)=O)c2)n1)c3cccc(Cl)c3" DQ0 SMILES CACTVS 3.385 "Nc1nc(N)c(c(COc2cccc(OCCCC(O)=O)c2)n1)c3cccc(Cl)c3" DQ0 SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "c1cc(cc(c1)Cl)c2c(nc(nc2N)N)COc3cccc(c3)OCCCC(=O)O" DQ0 SMILES "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "c1cc(cc(c1)Cl)c2c(nc(nc2N)N)COc3cccc(c3)OCCCC(=O)O" # _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id DQ0 _pdbx_chem_comp_identifier.type "SYSTEMATIC NAME" _pdbx_chem_comp_identifier.program "OpenEye OEToolkits" _pdbx_chem_comp_identifier.program_version 2.0.7 _pdbx_chem_comp_identifier.identifier "4-[3-[[2,6-bis(azanyl)-5-(3-chlorophenyl)pyrimidin-4-yl]methoxy]phenoxy]butanoic acid" # # loop_ _pdbx_chem_comp_audit.comp_id _pdbx_chem_comp_audit.action_type _pdbx_chem_comp_audit.date _pdbx_chem_comp_audit.processing_site DQ0 "Create component" 2019-08-21 PDBJ DQ0 "Initial release" 2019-12-04 RCSB ##