data_DUE # _chem_comp.id DUE _chem_comp.name "(2~{S})-2-[[3-[[5-[4-(aminomethyl)phenyl]-1-benzofuran-7-yl]sulfonylamino]thiophen-2-yl]carbonylamino]-5-carbamimidamido-pentanoic acid" _chem_comp.type NON-POLYMER _chem_comp.pdbx_type HETAIN _chem_comp.formula "C26 H28 N6 O6 S2" _chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ? _chem_comp.pdbx_synonyms ? _chem_comp.pdbx_formal_charge 0 _chem_comp.pdbx_initial_date 2018-01-31 _chem_comp.pdbx_modified_date 2018-10-12 _chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N _chem_comp.pdbx_release_status REL _chem_comp.pdbx_replaced_by ? _chem_comp.pdbx_replaces ? _chem_comp.formula_weight 584.667 _chem_comp.one_letter_code ? _chem_comp.three_letter_code DUE _chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ? _chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details Corina _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 6FMC _chem_comp.pdbx_subcomponent_list ? _chem_comp.pdbx_processing_site EBI # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.alt_atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.charge _chem_comp_atom.pdbx_align _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.model_Cartn_x _chem_comp_atom.model_Cartn_y _chem_comp_atom.model_Cartn_z _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal _chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id _chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id _chem_comp_atom.pdbx_ordinal DUE S2 S1 S 0 1 Y N N 27.683 17.214 -12.633 2.891 2.505 -1.504 S2 DUE 1 DUE S1 S2 S 0 1 N N N 25.677 14.937 -16.801 -1.742 3.204 0.542 S1 DUE 2 DUE O6 O1 O 0 1 N N N 25.012 16.166 -17.280 -1.812 4.317 -0.338 O6 DUE 3 DUE O1 O2 O 0 1 N N N 25.068 13.717 -17.208 -2.458 3.135 1.767 O1 DUE 4 DUE C1 C1 C 0 1 Y N N 27.251 15.022 -17.507 -2.228 1.795 -0.398 C1 DUE 5 DUE C13 C2 C 0 1 Y N N 27.387 15.188 -18.902 -1.661 1.564 -1.647 C13 DUE 6 DUE O2 O3 O 0 1 Y N N 26.336 15.306 -19.799 -0.744 2.227 -2.382 O2 DUE 7 DUE C14 C3 C 0 1 Y N N 26.914 15.503 -21.130 -0.518 1.597 -3.548 C14 DUE 8 DUE C15 C4 C 0 1 Y N N 28.419 15.351 -21.013 -1.275 0.494 -3.631 C15 DUE 9 DUE C12 C5 C 0 1 Y N N 28.615 15.131 -19.505 -2.051 0.435 -2.386 C12 DUE 10 DUE C11 C6 C 0 1 Y N N 29.766 15.019 -18.753 -2.998 -0.448 -1.873 C11 DUE 11 DUE C3 C7 C 0 1 Y N N 29.728 14.917 -17.354 -3.555 -0.203 -0.625 C3 DUE 12 DUE C4 C8 C 0 1 Y N N 30.893 14.939 -16.519 -4.565 -1.137 -0.067 C4 DUE 13 DUE C10 C9 C 0 1 Y N N 30.930 15.607 -15.282 -4.956 -2.259 -0.794 C10 DUE 14 DUE C9 C10 C 0 1 Y N N 32.059 15.538 -14.474 -5.896 -3.123 -0.271 C9 DUE 15 DUE C7 C11 C 0 1 Y N N 33.123 14.679 -14.802 -6.449 -2.878 0.973 C7 DUE 16 DUE C8 C12 C 0 1 N N N 34.295 14.516 -13.838 -7.475 -3.825 1.539 C8 DUE 17 DUE N1 N1 N 0 1 N N N 35.631 14.892 -14.482 -6.799 -4.871 2.317 N1 DUE 18 DUE C6 C13 C 0 1 Y N N 33.046 14.008 -16.005 -6.064 -1.765 1.699 C6 DUE 19 DUE C5 C14 C 0 1 Y N N 31.948 14.106 -16.845 -5.121 -0.897 1.188 C5 DUE 20 DUE C2 C15 C 0 1 Y N N 28.476 14.922 -16.806 -3.163 0.922 0.108 C2 DUE 21 DUE N2 N2 N 0 1 N N N 25.707 14.998 -15.318 -0.142 3.010 0.924 N2 DUE 22 DUE C16 C16 C 0 1 Y N N 26.423 16.004 -14.535 0.818 3.000 -0.084 C16 DUE 23 DUE C19 C17 C 0 1 Y N N 26.869 17.212 -15.076 0.734 3.773 -1.226 C19 DUE 24 DUE C18 C18 C 0 1 Y N N 27.558 18.009 -14.139 1.749 3.632 -2.082 C18 DUE 25 DUE C17 C19 C 0 1 Y N N 26.822 15.844 -13.203 1.950 2.220 -0.047 C17 DUE 26 DUE C20 C20 C 0 1 N N N 26.510 14.744 -12.268 2.301 1.330 0.997 C20 DUE 27 DUE O5 O4 O 0 1 N N N 26.858 14.853 -11.074 1.572 1.210 1.965 O5 DUE 28 DUE N3 N3 N 0 1 N N N 25.972 13.641 -12.635 3.441 0.616 0.919 N3 DUE 29 DUE C21 C21 C 0 1 N N S 25.511 12.552 -11.853 3.804 -0.305 1.999 C21 DUE 30 DUE C26 C22 C 0 1 N N N 26.556 11.455 -12.041 4.523 0.454 3.085 C26 DUE 31 DUE O4 O5 O 0 1 N N N 27.402 11.310 -11.169 4.953 -0.190 4.181 O4 DUE 32 DUE O3 O6 O 0 1 N N N 26.506 10.761 -13.118 4.713 1.641 2.969 O3 DUE 33 DUE C22 C23 C 0 1 N N N 24.101 12.062 -12.110 4.720 -1.400 1.449 C22 DUE 34 DUE C23 C24 C 0 1 N N N 23.694 11.016 -11.002 3.950 -2.248 0.436 C23 DUE 35 DUE C24 C25 C 0 1 N N N 23.215 11.765 -9.733 4.866 -3.343 -0.114 C24 DUE 36 DUE N4 N4 N 0 1 N N N 22.933 10.768 -8.674 4.128 -4.156 -1.084 N4 DUE 37 DUE C25 C26 C 0 1 N N N 22.371 11.068 -7.541 4.750 -5.208 -1.714 C25 DUE 38 DUE N6 N5 N 0 1 N N N 22.188 10.123 -6.629 4.057 -5.970 -2.625 N6 DUE 39 DUE N5 N6 N 0 1 N N N 21.909 12.322 -7.281 5.996 -5.482 -1.449 N5 DUE 40 DUE H1 H1 H 0 1 N N N 26.366 15.718 -22.035 0.173 1.931 -4.307 H1 DUE 41 DUE H2 H2 H 0 1 N N N 29.165 15.388 -21.793 -1.307 -0.210 -4.450 H2 DUE 42 DUE H3 H3 H 0 1 N N N 30.722 15.010 -19.255 -3.297 -1.316 -2.442 H3 DUE 43 DUE H4 H4 H 0 1 N N N 30.073 16.179 -14.957 -4.525 -2.451 -1.766 H4 DUE 44 DUE H5 H5 H 0 1 N N N 32.120 16.150 -13.586 -6.201 -3.993 -0.834 H5 DUE 45 DUE H6 H6 H 0 1 N N N 34.128 15.164 -12.965 -8.160 -3.276 2.185 H6 DUE 46 DUE H7 H7 H 0 1 N N N 34.342 13.466 -13.512 -8.035 -4.284 0.724 H7 DUE 47 DUE H8 H8 H 0 1 N N N 36.368 14.771 -13.817 -7.466 -5.520 2.708 H8 DUE 48 DUE H9 H9 H 0 1 N N N 35.796 14.304 -15.274 -6.112 -5.352 1.756 H9 DUE 49 DUE H11 H11 H 0 1 N N N 33.874 13.382 -16.304 -6.499 -1.578 2.670 H11 DUE 50 DUE H12 H12 H 0 1 N N N 31.916 13.530 -17.758 -4.817 -0.031 1.757 H12 DUE 51 DUE H13 H13 H 0 1 N N N 28.416 14.842 -15.731 -3.595 1.104 1.080 H13 DUE 52 DUE H14 H14 H 0 1 N N N 24.751 15.070 -15.035 0.126 2.903 1.850 H14 DUE 53 DUE H15 H15 H 0 1 N N N 26.704 17.504 -16.102 -0.093 4.443 -1.413 H15 DUE 54 DUE H16 H16 H 0 1 N N N 27.954 18.992 -14.346 1.835 4.162 -3.019 H16 DUE 55 DUE H17 H17 H 0 1 N N N 25.860 13.531 -13.623 4.022 0.712 0.148 H17 DUE 56 DUE H18 H18 H 0 1 N N N 25.555 12.851 -10.795 2.901 -0.758 2.409 H18 DUE 57 DUE H19 H19 H 0 1 N N N 27.999 10.615 -11.419 5.409 0.338 4.851 H19 DUE 58 DUE H20 H20 H 0 1 N N N 23.406 12.914 -12.081 5.581 -0.942 0.961 H20 DUE 59 DUE H21 H21 H 0 1 N N N 24.054 11.584 -13.100 5.062 -2.033 2.268 H21 DUE 60 DUE H22 H22 H 0 1 N N N 22.881 10.379 -11.380 3.089 -2.706 0.925 H22 DUE 61 DUE H23 H23 H 0 1 N N N 24.563 10.390 -10.752 3.608 -1.615 -0.383 H23 DUE 62 DUE H24 H24 H 0 1 N N N 24.000 12.456 -9.392 5.726 -2.886 -0.603 H24 DUE 63 DUE H25 H25 H 0 1 N N N 22.301 12.333 -9.961 5.207 -3.976 0.705 H25 DUE 64 DUE H26 H26 H 0 1 N N N 23.188 9.815 -8.839 3.200 -3.952 -1.282 H26 DUE 65 DUE H27 H27 H 0 1 N N N 21.719 10.339 -5.772 3.130 -5.766 -2.823 H27 DUE 66 DUE H28 H28 H 0 1 N N N 22.519 9.194 -6.798 4.496 -6.712 -3.069 H28 DUE 67 DUE H29 H29 H 0 1 N N N 21.465 12.380 -6.387 6.435 -6.224 -1.893 H29 DUE 68 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal DUE C14 C15 DOUB Y N 1 DUE C14 O2 SING Y N 2 DUE C15 C12 SING Y N 3 DUE O2 C13 SING Y N 4 DUE C12 C13 DOUB Y N 5 DUE C12 C11 SING Y N 6 DUE C13 C1 SING Y N 7 DUE C11 C3 DOUB Y N 8 DUE C1 C2 DOUB Y N 9 DUE C1 S1 SING N N 10 DUE C3 C2 SING Y N 11 DUE C3 C4 SING N N 12 DUE O6 S1 DOUB N N 13 DUE O1 S1 DOUB N N 14 DUE C5 C4 DOUB Y N 15 DUE C5 C6 SING Y N 16 DUE S1 N2 SING N N 17 DUE C4 C10 SING Y N 18 DUE C6 C7 DOUB Y N 19 DUE N2 C16 SING N N 20 DUE C10 C9 DOUB Y N 21 DUE C19 C16 SING Y N 22 DUE C19 C18 DOUB Y N 23 DUE C7 C9 SING Y N 24 DUE C7 C8 SING N N 25 DUE C16 C17 DOUB Y N 26 DUE N1 C8 SING N N 27 DUE C18 S2 SING Y N 28 DUE C17 S2 SING Y N 29 DUE C17 C20 SING N N 30 DUE O3 C26 DOUB N N 31 DUE N3 C20 SING N N 32 DUE N3 C21 SING N N 33 DUE C20 O5 DOUB N N 34 DUE C22 C21 SING N N 35 DUE C22 C23 SING N N 36 DUE C26 C21 SING N N 37 DUE C26 O4 SING N N 38 DUE C23 C24 SING N N 39 DUE C24 N4 SING N N 40 DUE N4 C25 SING N N 41 DUE C25 N5 DOUB N N 42 DUE C25 N6 SING N N 43 DUE C14 H1 SING N N 44 DUE C15 H2 SING N N 45 DUE C11 H3 SING N N 46 DUE C10 H4 SING N N 47 DUE C9 H5 SING N N 48 DUE C8 H6 SING N N 49 DUE C8 H7 SING N N 50 DUE N1 H8 SING N N 51 DUE N1 H9 SING N N 52 DUE C6 H11 SING N N 53 DUE C5 H12 SING N N 54 DUE C2 H13 SING N N 55 DUE N2 H14 SING N N 56 DUE C19 H15 SING N N 57 DUE C18 H16 SING N N 58 DUE N3 H17 SING N N 59 DUE C21 H18 SING N N 60 DUE O4 H19 SING N N 61 DUE C22 H20 SING N N 62 DUE C22 H21 SING N N 63 DUE C23 H22 SING N N 64 DUE C23 H23 SING N N 65 DUE C24 H24 SING N N 66 DUE C24 H25 SING N N 67 DUE N4 H26 SING N N 68 DUE N6 H27 SING N N 69 DUE N6 H28 SING N N 70 DUE N5 H29 SING N N 71 # loop_ _pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id _pdbx_chem_comp_descriptor.type _pdbx_chem_comp_descriptor.program _pdbx_chem_comp_descriptor.program_version _pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor DUE InChI InChI 1.03 "InChI=1S/C26H28N6O6S2/c27-14-15-3-5-16(6-4-15)18-12-17-7-10-38-22(17)21(13-18)40(36,37)32-19-8-11-39-23(19)24(33)31-20(25(34)35)2-1-9-30-26(28)29/h3-8,10-13,20,32H,1-2,9,14,27H2,(H,31,33)(H,34,35)(H4,28,29,30)/t20-/m0/s1" DUE InChIKey InChI 1.03 PVMUKISUHFBKET-FQEVSTJZSA-N DUE SMILES_CANONICAL CACTVS 3.385 "NCc1ccc(cc1)c2cc3ccoc3c(c2)[S](=O)(=O)Nc4ccsc4C(=O)N[C@@H](CCCNC(N)=N)C(O)=O" DUE SMILES CACTVS 3.385 "NCc1ccc(cc1)c2cc3ccoc3c(c2)[S](=O)(=O)Nc4ccsc4C(=O)N[CH](CCCNC(N)=N)C(O)=O" DUE SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 "[H]/N=C(/N)\NCCC[C@@H](C(=O)O)NC(=O)c1c(ccs1)NS(=O)(=O)c2cc(cc3c2occ3)c4ccc(cc4)CN" DUE SMILES "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 "c1cc(ccc1CN)c2cc3ccoc3c(c2)S(=O)(=O)Nc4ccsc4C(=O)NC(CCCNC(=N)N)C(=O)O" # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier DUE "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 "(2~{S})-2-[[3-[[5-[4-(aminomethyl)phenyl]-1-benzofuran-7-yl]sulfonylamino]thiophen-2-yl]carbonylamino]-5-carbamimidamido-pentanoic acid" # loop_ _pdbx_chem_comp_audit.comp_id _pdbx_chem_comp_audit.action_type _pdbx_chem_comp_audit.date _pdbx_chem_comp_audit.processing_site DUE "Create component" 2018-01-31 EBI DUE "Initial release" 2018-10-17 RCSB #