data_EVT
#
_chem_comp.id EVT
_chem_comp.name "(2~{S})-2-[[(4~{S})-4-(hexadecanoylamino)-5-oxidanyl-5-oxidanylidene-pentanoyl]amino]pentanedioic acid"
_chem_comp.type NON-POLYMER
_chem_comp.pdbx_type HETAIN
_chem_comp.formula "C26 H46 N2 O8"
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ?
_chem_comp.pdbx_synonyms ?
_chem_comp.pdbx_formal_charge 0
_chem_comp.pdbx_initial_date 2018-04-25
_chem_comp.pdbx_modified_date 2024-09-27
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N
_chem_comp.pdbx_release_status REL
_chem_comp.pdbx_replaced_by ?
_chem_comp.pdbx_replaces ?
_chem_comp.formula_weight 514.652
_chem_comp.one_letter_code ?
_chem_comp.three_letter_code EVT
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ?
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag Y
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details Corina
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 6GDZ
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list ?
_chem_comp.pdbx_processing_site EBI
_chem_comp.pdbx_pcm Y
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.alt_atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.pdbx_align
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config
_chem_comp_atom.pdbx_backbone_atom_flag
_chem_comp_atom.pdbx_n_terminal_atom_flag
_chem_comp_atom.pdbx_c_terminal_atom_flag
_chem_comp_atom.model_Cartn_x
_chem_comp_atom.model_Cartn_y
_chem_comp_atom.model_Cartn_z
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal
EVT C7 C1 C 0 1 N N N N N N -23.948 17.714 9.890 6.280 0.324 -0.388 C7 EVT 1
EVT C9 C2 C 0 1 N N N N N N -25.448 17.771 10.038 4.977 0.837 0.169 C9 EVT 2
EVT C10 C3 C 0 1 N N N N N N -26.149 16.794 9.059 4.916 2.357 0.005 C10 EVT 3
EVT C11 C4 C 0 1 N N S N N N -27.655 16.651 9.407 3.593 2.878 0.570 C11 EVT 4
EVT C12 C5 C 0 1 N N N N N N -29.995 13.893 8.142 0.112 1.702 -0.503 C12 EVT 5
EVT C13 C6 C 0 1 N N N N N N -31.440 13.539 8.596 -1.158 1.671 0.350 C13 EVT 6
EVT C14 C7 C 0 1 N N N N N N -32.370 14.780 8.568 -2.319 1.127 -0.485 C14 EVT 7
EVT O8 O1 O 0 1 N N N N N N -23.347 16.862 10.525 7.081 1.098 -0.869 O8 EVT 8
EVT C15 C8 C 0 1 N N N N N N -33.710 14.498 9.296 -3.589 1.096 0.368 C15 EVT 9
EVT N6 N1 N 0 1 N N N N N N -23.312 18.595 9.084 6.558 -0.994 -0.346 N6 EVT 10
EVT C16 C9 C 0 1 N N N N N N -34.611 15.760 9.328 -4.751 0.551 -0.467 C16 EVT 11
EVT C17 C10 C 0 1 N N N N N N -35.913 15.526 10.135 -6.021 0.520 0.386 C17 EVT 12
EVT C18 C11 C 0 1 N N N N N N -36.725 16.843 10.245 -7.182 -0.024 -0.448 C18 EVT 13
EVT C19 C12 C 0 1 N N N N N N -38.034 16.695 11.066 -8.452 -0.055 0.404 C19 EVT 14
EVT C20 C13 C 0 1 N N N N N N -37.780 16.256 12.535 -9.613 -0.600 -0.430 C20 EVT 15
EVT C21 C14 C 0 1 N N N N N N -38.982 16.610 13.452 -10.883 -0.631 0.423 C21 EVT 16
EVT C22 C15 C 0 1 N N N N N N -38.723 16.186 14.923 -12.044 -1.176 -0.412 C22 EVT 17
EVT C23 C16 C 0 1 N N N N N N -28.352 17.981 9.276 3.584 4.384 0.521 C23 EVT 18
EVT O24 O2 O 0 1 N N N N N N -28.445 18.492 8.129 2.736 4.963 -0.116 O24 EVT 19
EVT N25 N2 N 0 1 N N N N N N -28.339 15.685 8.551 2.481 2.357 -0.228 N25 EVT 20
EVT C26 C17 C 0 1 N N N N N N -29.315 14.888 9.053 1.255 2.239 0.319 C26 EVT 21
EVT O26 O3 O 0 1 N N N N N N -28.815 18.525 10.315 4.518 5.083 1.185 O26 EVT 22
EVT O27 O4 O 0 1 N N N N N N -29.668 14.933 10.221 1.073 2.564 1.473 O27 EVT 23
EVT C29 C18 C 0 1 N N N N N N -39.854 16.678 15.868 -13.314 -1.207 0.441 C29 EVT 24
EVT C30 C19 C 0 1 N N N N N N -39.560 16.419 17.372 -14.476 -1.751 -0.394 C30 EVT 25
EVT C31 C20 C 0 1 N N N N N N -39.734 14.934 17.779 -15.746 -1.782 0.459 C31 EVT 26
EVT C32 C21 C 0 1 N N N N N N -39.334 14.703 19.259 -16.907 -2.327 -0.375 C32 EVT 27
EVT C33 C22 C 0 1 N N N N N N -19.258 20.238 6.616 8.808 -3.865 1.953 C33 EVT 28
EVT O34 O5 O 0 1 N N N N N N -19.056 19.626 5.580 8.845 -4.887 1.310 O34 EVT 29
EVT C35 C23 C 0 1 N N N N N N -19.757 19.464 7.817 8.452 -2.564 1.281 C35 EVT 30
EVT C36 C24 C 0 1 N N N N N N -21.301 19.520 7.904 8.186 -2.814 -0.205 C36 EVT 31
EVT C37 C25 C 0 1 N N S N N N -21.852 18.601 9.032 7.825 -1.493 -0.888 C37 EVT 32
EVT C38 C26 C 0 1 N N N N N N -21.345 19.028 10.386 7.683 -1.717 -2.371 C38 EVT 33
EVT O39 O6 O 0 1 N N N N N N -20.960 18.137 11.191 8.725 -2.175 -3.083 O39 EVT 34
EVT O40 O7 O 0 1 N N N N N N -21.330 20.257 10.661 6.633 -1.483 -2.920 O40 EVT 35
EVT H93 H1 H 0 1 N N N N N N -25.790 18.795 9.828 4.147 0.380 -0.368 H93 EVT 36
EVT H92 H2 H 0 1 N N N N N N -25.717 17.499 11.069 4.909 0.583 1.227 H92 EVT 37
EVT H103 H3 H 0 0 N N N N N N -25.668 15.807 9.128 5.746 2.815 0.543 H103 EVT 38
EVT H102 H4 H 0 0 N N N N N N -26.051 17.179 8.033 4.984 2.611 -1.053 H102 EVT 39
EVT H11 H5 H 0 1 N N N N N N -27.730 16.320 10.453 3.484 2.548 1.604 H11 EVT 40
EVT H122 H6 H 0 0 N N N N N N -29.398 12.970 8.124 0.348 0.693 -0.839 H122 EVT 41
EVT H123 H7 H 0 0 N N N N N N -30.041 14.320 7.129 -0.047 2.346 -1.368 H123 EVT 42
EVT H133 H8 H 0 0 N N N N N N -31.848 12.772 7.921 -0.999 1.028 1.215 H133 EVT 43
EVT H132 H9 H 0 0 N N N N N N -31.405 13.143 9.622 -1.395 2.681 0.686 H132 EVT 44
EVT H143 H10 H 0 0 N N N N N N -31.862 15.619 9.065 -2.478 1.770 -1.350 H143 EVT 45
EVT H142 H11 H 0 0 N N N N N N -32.580 15.047 7.522 -2.083 0.117 -0.821 H142 EVT 46
EVT H153 H12 H 0 0 N N N N N N -34.241 13.692 8.769 -3.431 0.452 1.233 H153 EVT 47
EVT H152 H13 H 0 0 N N N N N N -33.497 14.183 10.328 -3.826 2.105 0.704 H152 EVT 48
EVT H6 H14 H 0 1 N N N N N N -23.838 19.238 8.527 5.920 -1.612 0.042 H6 EVT 49
EVT H163 H15 H 0 0 N N N N N N -34.050 16.585 9.791 -4.910 1.195 -1.332 H163 EVT 50
EVT H162 H16 H 0 0 N N N N N N -34.877 16.032 8.296 -4.514 -0.458 -0.803 H162 EVT 51
EVT H173 H17 H 0 0 N N N N N N -36.523 14.765 9.626 -5.862 -0.123 1.251 H173 EVT 52
EVT H172 H18 H 0 0 N N N N N N -35.655 15.174 11.145 -6.257 1.530 0.723 H172 EVT 53
EVT H183 H19 H 0 0 N N N N N N -36.094 17.602 10.730 -7.341 0.619 -1.314 H183 EVT 54
EVT H182 H20 H 0 0 N N N N N N -36.986 17.177 9.230 -6.945 -1.034 -0.785 H182 EVT 55
EVT H193 H21 H 0 0 N N N N N N -38.555 17.664 11.074 -8.293 -0.699 1.270 H193 EVT 56
EVT H192 H22 H 0 0 N N N N N N -38.670 15.941 10.579 -8.688 0.954 0.741 H192 EVT 57
EVT H203 H23 H 0 0 N N N N N N -37.620 15.168 12.560 -9.772 0.043 -1.295 H203 EVT 58
EVT H202 H24 H 0 0 N N N N N N -36.881 16.768 12.910 -9.377 -1.609 -0.766 H202 EVT 59
EVT H213 H25 H 0 0 N N N N N N -39.149 17.697 13.418 -10.724 -1.275 1.288 H213 EVT 60
EVT H212 H26 H 0 0 N N N N N N -39.878 16.089 13.083 -11.120 0.379 0.759 H212 EVT 61
EVT H223 H27 H 0 0 N N N N N N -38.668 15.089 14.974 -12.203 -0.532 -1.277 H223 EVT 62
EVT H222 H28 H 0 0 N N N N N N -37.767 16.617 15.256 -11.808 -2.185 -0.748 H222 EVT 63
EVT H25 H29 H 0 1 N N N N N N -28.086 15.611 7.587 2.628 2.096 -1.151 H25 EVT 64
EVT H1 H30 H 0 1 N N N N N N -29.226 19.350 10.085 4.472 6.047 1.123 H1 EVT 65
EVT H293 H31 H 0 0 N N N N N N -39.986 17.760 15.720 -13.156 -1.850 1.306 H293 EVT 66
EVT H292 H32 H 0 0 N N N N N N -40.784 16.155 15.600 -13.551 -0.197 0.777 H292 EVT 67
EVT H303 H33 H 0 0 N N N N N N -38.523 16.721 17.583 -14.634 -1.108 -1.259 H303 EVT 68
EVT H302 H34 H 0 0 N N N N N N -40.249 17.030 17.974 -14.239 -2.761 -0.730 H302 EVT 69
EVT H313 H35 H 0 0 N N N N N N -40.787 14.647 17.644 -15.587 -2.426 1.324 H313 EVT 70
EVT H312 H36 H 0 0 N N N N N N -39.098 14.309 17.135 -15.982 -0.773 0.795 H312 EVT 71
EVT H321 H37 H 0 0 N N N N N N -39.469 13.642 19.514 -17.066 -1.683 -1.241 H321 EVT 72
EVT H323 H38 H 0 0 N N N N N N -38.280 14.983 19.402 -16.670 -3.336 -0.712 H323 EVT 73
EVT H322 H39 H 0 0 N N N N N N -39.969 15.321 19.911 -17.812 -2.349 0.232 H322 EVT 74
EVT H353 H41 H 0 0 N N N N N N -19.439 18.415 7.728 7.557 -2.148 1.745 H353 EVT 75
EVT H352 H42 H 0 0 N N N N N N -19.328 19.901 8.731 9.278 -1.861 1.389 H352 EVT 76
EVT H363 H43 H 0 0 N N N N N N -21.608 20.556 8.108 9.080 -3.230 -0.669 H363 EVT 77
EVT H362 H44 H 0 0 N N N N N N -21.723 19.195 6.942 7.360 -3.517 -0.313 H362 EVT 78
EVT H37 H45 H 0 1 N N N N N N -21.497 17.579 8.836 8.612 -0.762 -0.704 H37 EVT 79
EVT H3 H46 H 0 1 N N N N N N -20.672 18.543 12.000 8.586 -2.303 -4.031 H3 EVT 80
EVT OXT O8 O 0 1 N Y N N N N ? ? ? 9.083 -3.888 3.267 OXT EVT 81
EVT H2 H47 H 0 1 N N N N N N ? ? ? 9.306 -4.745 3.654 H2 EVT 82
#
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
EVT O34 C33 DOUB N N 1
EVT C33 C35 SING N N 2
EVT C35 C36 SING N N 3
EVT C36 C37 SING N N 4
EVT O24 C23 DOUB N N 5
EVT C12 C13 SING N N 6
EVT C12 C26 SING N N 7
EVT N25 C26 SING N N 8
EVT N25 C11 SING N N 9
EVT C14 C13 SING N N 10
EVT C14 C15 SING N N 11
EVT C37 N6 SING N N 12
EVT C37 C38 SING N N 13
EVT C26 O27 DOUB N N 14
EVT C10 C11 SING N N 15
EVT C10 C9 SING N N 16
EVT N6 C7 SING N N 17
EVT C23 C11 SING N N 18
EVT C23 O26 SING N N 19
EVT C15 C16 SING N N 20
EVT C16 C17 SING N N 21
EVT C7 C9 SING N N 22
EVT C7 O8 DOUB N N 23
EVT C17 C18 SING N N 24
EVT C18 C19 SING N N 25
EVT C38 O40 DOUB N N 26
EVT C38 O39 SING N N 27
EVT C19 C20 SING N N 28
EVT C20 C21 SING N N 29
EVT C21 C22 SING N N 30
EVT C22 C29 SING N N 31
EVT C29 C30 SING N N 32
EVT C30 C31 SING N N 33
EVT C31 C32 SING N N 34
EVT C9 H93 SING N N 35
EVT C9 H92 SING N N 36
EVT C10 H103 SING N N 37
EVT C10 H102 SING N N 38
EVT C11 H11 SING N N 39
EVT C12 H122 SING N N 40
EVT C12 H123 SING N N 41
EVT C13 H133 SING N N 42
EVT C13 H132 SING N N 43
EVT C14 H143 SING N N 44
EVT C14 H142 SING N N 45
EVT C15 H153 SING N N 46
EVT C15 H152 SING N N 47
EVT N6 H6 SING N N 48
EVT C16 H163 SING N N 49
EVT C16 H162 SING N N 50
EVT C17 H173 SING N N 51
EVT C17 H172 SING N N 52
EVT C18 H183 SING N N 53
EVT C18 H182 SING N N 54
EVT C19 H193 SING N N 55
EVT C19 H192 SING N N 56
EVT C20 H203 SING N N 57
EVT C20 H202 SING N N 58
EVT C21 H213 SING N N 59
EVT C21 H212 SING N N 60
EVT C22 H223 SING N N 61
EVT C22 H222 SING N N 62
EVT N25 H25 SING N N 63
EVT O26 H1 SING N N 64
EVT C29 H293 SING N N 65
EVT C29 H292 SING N N 66
EVT C30 H303 SING N N 67
EVT C30 H302 SING N N 68
EVT C31 H313 SING N N 69
EVT C31 H312 SING N N 70
EVT C32 H321 SING N N 71
EVT C32 H323 SING N N 72
EVT C32 H322 SING N N 73
EVT C35 H353 SING N N 74
EVT C35 H352 SING N N 75
EVT C36 H363 SING N N 76
EVT C36 H362 SING N N 77
EVT C37 H37 SING N N 78
EVT O39 H3 SING N N 79
EVT C33 OXT SING N N 80
EVT OXT H2 SING N N 81
#
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id
_pdbx_chem_comp_descriptor.type
_pdbx_chem_comp_descriptor.program
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor
EVT InChI InChI 1.03 "InChI=1S/C26H46N2O8/c1-2-3-4-5-6-7-8-9-10-11-12-13-14-15-22(29)27-20(25(33)34)16-18-23(30)28-21(26(35)36)17-19-24(31)32/h20-21H,2-19H2,1H3,(H,27,29)(H,28,30)(H,31,32)(H,33,34)(H,35,36)/t20-,21-/m0/s1"
EVT InChIKey InChI 1.03 JFNZOURGWMREOJ-SFTDATJTSA-N
EVT SMILES_CANONICAL CACTVS 3.385 "CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)N[C@@H](CCC(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O)C(O)=O"
EVT SMILES CACTVS 3.385 "CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)N[CH](CCC(=O)N[CH](CCC(O)=O)C(O)=O)C(O)=O"
EVT SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 "CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)N[C@@H](CCC(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)C(=O)O"
EVT SMILES "OpenEye OEToolkits" 2.0.6 "CCCCCCCCCCCCCCCC(=O)NC(CCC(=O)NC(CCC(=O)O)C(=O)O)C(=O)O"
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_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id EVT
_pdbx_chem_comp_identifier.type "SYSTEMATIC NAME"
_pdbx_chem_comp_identifier.program "OpenEye OEToolkits"
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version 2.0.6
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier "(2~{S})-2-[[(4~{S})-4-(hexadecanoylamino)-5-oxidanyl-5-oxidanylidene-pentanoyl]amino]pentanedioic acid"
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loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id
_pdbx_chem_comp_audit.action_type
_pdbx_chem_comp_audit.date
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site
EVT "Create component" 2018-04-25 EBI
EVT "Initial release" 2018-06-20 RCSB
EVT "Modify PCM" 2024-09-27 PDBE
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_pdbx_chem_comp_pcm.pcm_id 1
_pdbx_chem_comp_pcm.comp_id EVT
_pdbx_chem_comp_pcm.modified_residue_id LYS
_pdbx_chem_comp_pcm.type None
_pdbx_chem_comp_pcm.category Lipid/lipid-like
_pdbx_chem_comp_pcm.position "Amino-acid side chain"
_pdbx_chem_comp_pcm.polypeptide_position "Any position"
_pdbx_chem_comp_pcm.comp_id_linking_atom C33
_pdbx_chem_comp_pcm.modified_residue_id_linking_atom NZ
_pdbx_chem_comp_pcm.uniprot_specific_ptm_accession ?
_pdbx_chem_comp_pcm.uniprot_generic_ptm_accession ?
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