data_FA5
#
_chem_comp.id FA5
_chem_comp.name "ADENOSINE-5'-[PHENYLALANINYL-PHOSPHATE]"
_chem_comp.type "RNA LINKING"
_chem_comp.pdbx_type ATOMN
_chem_comp.formula "C19 H23 N6 O8 P"
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ?
_chem_comp.pdbx_synonyms ?
_chem_comp.pdbx_formal_charge 0
_chem_comp.pdbx_initial_date 2001-07-20
_chem_comp.pdbx_modified_date 2011-06-04
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N
_chem_comp.pdbx_release_status REL
_chem_comp.pdbx_replaced_by ?
_chem_comp.pdbx_replaces ?
_chem_comp.formula_weight 494.395
_chem_comp.one_letter_code N
_chem_comp.three_letter_code FA5
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ?
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details ?
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 1JJC
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list ?
_chem_comp.pdbx_processing_site RCSB
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.alt_atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.pdbx_align
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config
_chem_comp_atom.model_Cartn_x
_chem_comp_atom.model_Cartn_y
_chem_comp_atom.model_Cartn_z
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal
FA5 C C C 0 1 N N N 17.687 63.435 18.954 1.153 0.335 4.206 C FA5 1
FA5 O O O 0 1 N N N 17.355 62.297 19.340 1.901 1.270 4.367 O FA5 2
FA5 CA CA C 0 1 N N S 19.160 63.812 18.924 0.347 -0.193 5.364 CA FA5 3
FA5 N N N 0 1 N N N 20.012 62.848 19.593 1.086 0.026 6.615 N FA5 4
FA5 CB CB C 0 1 N N N 19.551 63.979 17.445 -0.993 0.538 5.428 CB FA5 5
FA5 CG CG C 0 1 Y N N 20.843 64.664 17.202 -1.799 0.010 6.587 CG FA5 6
FA5 CD1 CD1 C 0 1 Y N N 20.936 66.079 17.212 -1.683 0.595 7.834 CD1 FA5 7
FA5 CD2 CD2 C 0 1 Y N N 22.035 63.925 16.963 -2.659 -1.056 6.401 CD2 FA5 8
FA5 CE1 CE1 C 0 1 Y N N 22.170 66.720 16.992 -2.422 0.110 8.897 CE1 FA5 9
FA5 CE2 CE2 C 0 1 Y N N 23.259 64.572 16.746 -3.395 -1.544 7.465 CE2 FA5 10
FA5 CZ CZ C 0 1 Y N N 23.346 65.974 16.757 -3.278 -0.959 8.712 CZ FA5 11
FA5 P P P 0 1 N N S 15.237 63.945 18.572 1.901 0.332 1.757 P FA5 12
FA5 OP1 O1P O 0 1 N N N 14.922 63.403 19.924 1.552 1.750 1.520 OP1 FA5 13
FA5 OP2 O2P O 0 1 N N N 14.341 65.027 18.092 3.470 0.214 2.097 OP2 FA5 14
FA5 OP3 O3P O 0 1 N Y N 16.773 64.499 18.496 1.040 -0.232 2.995 OP3 FA5 15
FA5 "O5'" O5* O 0 1 N N N 15.194 62.746 17.445 1.572 -0.528 0.437 "O5'" FA5 16
FA5 "C5'" C5* C 0 1 N N N 15.546 63.006 16.043 2.362 0.018 -0.620 "C5'" FA5 17
FA5 "C4'" C4* C 0 1 N N R 14.570 62.296 15.048 2.095 -0.759 -1.910 "C4'" FA5 18
FA5 "O4'" O4* O 0 1 N N N 13.830 61.264 15.813 0.712 -0.630 -2.281 "O4'" FA5 19
FA5 "C3'" C3* C 0 1 N N S 13.475 63.201 14.461 2.938 -0.172 -3.059 "C3'" FA5 20
FA5 "O3'" O3* O 0 1 N N N 13.905 63.926 13.302 3.823 -1.158 -3.594 "O3'" FA5 21
FA5 "C2'" C2* C 0 1 N N R 12.255 62.276 14.238 1.886 0.246 -4.120 "C2'" FA5 22
FA5 "O2'" O2* O 0 1 N N N 11.982 61.954 12.856 2.335 -0.078 -5.438 "O2'" FA5 23
FA5 "C1'" C1* C 0 1 N N R 12.539 61.052 15.164 0.662 -0.617 -3.724 "C1'" FA5 24
FA5 N9 N9 N 0 1 Y N N 11.513 60.832 16.279 -0.581 -0.001 -4.192 N9 FA5 25
FA5 C8 C8 C 0 1 Y N N 11.398 61.525 17.325 -1.304 0.951 -3.538 C8 FA5 26
FA5 N7 N7 N 0 1 Y N N 10.441 61.135 18.285 -2.352 1.273 -4.240 N7 FA5 27
FA5 C5 C5 C 0 1 Y N N 9.818 60.104 17.552 -2.368 0.549 -5.385 C5 FA5 28
FA5 C6 C6 C 0 1 Y N N 8.664 59.211 17.797 -3.228 0.471 -6.493 C6 FA5 29
FA5 N6 N6 N 0 1 N N N 7.931 59.274 18.951 -4.362 1.260 -6.566 N6 FA5 30
FA5 N1 N1 N 0 1 Y N N 8.319 58.278 16.819 -2.927 -0.378 -7.470 N1 FA5 31
FA5 C2 C2 C 0 1 Y N N 9.107 58.188 15.488 -1.847 -1.135 -7.409 C2 FA5 32
FA5 N3 N3 N 0 1 Y N N 10.142 58.991 15.328 -1.013 -1.096 -6.391 N3 FA5 33
FA5 C4 C4 C 0 1 Y N N 10.454 59.899 16.317 -1.229 -0.273 -5.370 C4 FA5 34
FA5 HA HA H 0 1 N N N 19.309 64.760 19.490 0.173 -1.260 5.228 HA FA5 35
FA5 HN1 1HN H 0 1 N N N 21.000 63.100 19.572 1.224 1.022 6.699 HN1 FA5 36
FA5 HN2 2HN H 0 1 N N N 19.869 61.912 19.212 0.470 -0.245 7.367 HN2 FA5 37
FA5 HB1 1HB H 0 1 N N N 19.541 62.988 16.932 -0.819 1.606 5.564 HB1 FA5 38
FA5 HB2 2HB H 0 1 N N N 18.733 64.495 16.889 -1.541 0.375 4.500 HB2 FA5 39
FA5 HD1 HD1 H 0 1 N N N 20.035 66.689 17.393 -1.014 1.430 7.978 HD1 FA5 40
FA5 HD2 HD2 H 0 1 N N N 22.009 62.822 16.945 -2.750 -1.513 5.427 HD2 FA5 41
FA5 HE1 HE1 H 0 1 N N N 22.216 67.822 17.003 -2.331 0.566 9.871 HE1 FA5 42
FA5 HE2 HE2 H 0 1 N N N 24.165 63.970 16.564 -4.063 -2.380 7.321 HE2 FA5 43
FA5 HZ HZ H 0 1 N N N 24.312 66.476 16.585 -3.855 -1.339 9.543 HZ FA5 44
FA5 HOP2 2HOP H 0 0 N N N 14.541 65.372 17.230 3.655 -0.723 2.244 HOP2 FA5 45
FA5 "H5'" 1H5* H 0 1 N N N 15.605 64.100 15.838 2.099 1.065 -0.766 "H5'" FA5 46
FA5 "H5''" 2H5* H 0 0 N N N 16.605 62.729 15.835 3.418 -0.058 -0.361 "H5''" FA5 47
FA5 "H4'" H4* H 0 1 N N N 15.206 61.920 14.213 2.345 -1.810 -1.768 "H4'" FA5 48
FA5 "H3'" H3* H 0 1 N N N 13.202 64.029 15.155 3.499 0.696 -2.715 "H3'" FA5 49
FA5 "HO'3" 3HO* H 0 0 N N N 13.228 64.485 12.939 4.275 -0.749 -4.345 "HO'3" FA5 50
FA5 "H2'" H2* H 0 1 N N N 11.296 62.777 14.506 1.654 1.309 -4.042 "H2'" FA5 51
FA5 "HO2'" 2HO* H 0 0 N N N 11.232 61.386 12.719 3.094 0.491 -5.623 "HO2'" FA5 52
FA5 "H1'" H1* H 0 1 N N N 12.502 60.155 14.502 0.762 -1.628 -4.121 "H1'" FA5 53
FA5 H8 H8 H 0 1 N N N 12.073 62.394 17.394 -1.046 1.376 -2.580 H8 FA5 54
FA5 H61 1H6 H 0 1 N N N 7.135 58.658 19.119 -4.948 1.197 -7.336 H61 FA5 55
FA5 H62 2H6 H 0 1 N N N 7.609 60.235 19.063 -4.571 1.877 -5.846 H62 FA5 56
FA5 H2 H2 H 0 1 N N N 8.924 57.528 14.623 -1.640 -1.812 -8.225 H2 FA5 57
#
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
FA5 C O DOUB N N 1
FA5 C CA SING N N 2
FA5 C OP3 SING N N 3
FA5 CA N SING N N 4
FA5 CA CB SING N N 5
FA5 CA HA SING N N 6
FA5 N HN1 SING N N 7
FA5 N HN2 SING N N 8
FA5 CB CG SING N N 9
FA5 CB HB1 SING N N 10
FA5 CB HB2 SING N N 11
FA5 CG CD1 DOUB Y N 12
FA5 CG CD2 SING Y N 13
FA5 CD1 CE1 SING Y N 14
FA5 CD1 HD1 SING N N 15
FA5 CD2 CE2 DOUB Y N 16
FA5 CD2 HD2 SING N N 17
FA5 CE1 CZ DOUB Y N 18
FA5 CE1 HE1 SING N N 19
FA5 CE2 CZ SING Y N 20
FA5 CE2 HE2 SING N N 21
FA5 CZ HZ SING N N 22
FA5 P OP1 DOUB N N 23
FA5 P OP2 SING N N 24
FA5 P OP3 SING N N 25
FA5 P "O5'" SING N N 26
FA5 OP2 HOP2 SING N N 27
FA5 "O5'" "C5'" SING N N 28
FA5 "C5'" "C4'" SING N N 29
FA5 "C5'" "H5'" SING N N 30
FA5 "C5'" "H5''" SING N N 31
FA5 "C4'" "O4'" SING N N 32
FA5 "C4'" "C3'" SING N N 33
FA5 "C4'" "H4'" SING N N 34
FA5 "O4'" "C1'" SING N N 35
FA5 "C3'" "O3'" SING N N 36
FA5 "C3'" "C2'" SING N N 37
FA5 "C3'" "H3'" SING N N 38
FA5 "O3'" "HO'3" SING N N 39
FA5 "C2'" "O2'" SING N N 40
FA5 "C2'" "C1'" SING N N 41
FA5 "C2'" "H2'" SING N N 42
FA5 "O2'" "HO2'" SING N N 43
FA5 "C1'" N9 SING N N 44
FA5 "C1'" "H1'" SING N N 45
FA5 N9 C8 SING Y N 46
FA5 N9 C4 SING Y N 47
FA5 C8 N7 DOUB Y N 48
FA5 C8 H8 SING N N 49
FA5 N7 C5 SING Y N 50
FA5 C5 C6 SING Y N 51
FA5 C5 C4 DOUB Y N 52
FA5 C6 N6 SING N N 53
FA5 C6 N1 DOUB Y N 54
FA5 N6 H61 SING N N 55
FA5 N6 H62 SING N N 56
FA5 N1 C2 SING Y N 57
FA5 C2 N3 DOUB Y N 58
FA5 C2 H2 SING N N 59
FA5 N3 C4 SING Y N 60
#
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id
_pdbx_chem_comp_descriptor.type
_pdbx_chem_comp_descriptor.program
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor
FA5 SMILES ACDLabs 10.04 "O=C(OP(=O)(O)OCC3OC(n2cnc1c(ncnc12)N)C(O)C3O)C(N)Cc4ccccc4"
FA5 SMILES_CANONICAL CACTVS 3.341 "N[C@@H](Cc1ccccc1)C(=O)O[P@](O)(=O)OC[C@H]2O[C@H]([C@H](O)[C@@H]2O)n3cnc4c(N)ncnc34"
FA5 SMILES CACTVS 3.341 "N[CH](Cc1ccccc1)C(=O)O[P](O)(=O)OC[CH]2O[CH]([CH](O)[CH]2O)n3cnc4c(N)ncnc34"
FA5 SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 1.5.0 "c1ccc(cc1)C[C@@H](C(=O)O[P@@](=O)(O)OC[C@@H]2[C@H]([C@H]([C@@H](O2)n3cnc4c3ncnc4N)O)O)N"
FA5 SMILES "OpenEye OEToolkits" 1.5.0 "c1ccc(cc1)CC(C(=O)OP(=O)(O)OCC2C(C(C(O2)n3cnc4c3ncnc4N)O)O)N"
FA5 InChI InChI 1.03
"InChI=1S/C19H23N6O8P/c20-11(6-10-4-2-1-3-5-10)19(28)33-34(29,30)31-7-12-14(26)15(27)18(32-12)25-9-24-13-16(21)22-8-23-17(13)25/h1-5,8-9,11-12,14-15,18,26-27H,6-7,20H2,(H,29,30)(H2,21,22,23)/t11-,12+,14+,15+,18+/m0/s1"
FA5 InChIKey InChI 1.03 ZFNOOEXYTZPIQS-URQYDQELSA-N
#
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id
_pdbx_chem_comp_identifier.type
_pdbx_chem_comp_identifier.program
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier
FA5 "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs 10.04 "5'-O-[(S)-{[(2S)-2-amino-3-phenylpropanoyl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]adenosine"
FA5 "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 1.5.0 "[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-dihydroxy-oxolan-2-yl]methoxy-hydroxy-phosphoryl] (2S)-2-amino-3-phenyl-propanoate"
#
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id
_pdbx_chem_comp_audit.action_type
_pdbx_chem_comp_audit.date
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site
FA5 "Create component" 2001-07-20 RCSB
FA5 "Modify descriptor" 2011-06-04 RCSB
#