data_INI # _chem_comp.id INI _chem_comp.name "5-NITRO-6-RIBITYL-AMINO-2,4(1H,3H)-PYRIMIDINEDIONE" _chem_comp.type NON-POLYMER _chem_comp.pdbx_type HETAIN _chem_comp.formula "C9 H14 N4 O8" _chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ? _chem_comp.pdbx_synonyms ? _chem_comp.pdbx_formal_charge 0 _chem_comp.pdbx_initial_date 1999-07-08 _chem_comp.pdbx_modified_date 2011-06-04 _chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N _chem_comp.pdbx_release_status REL _chem_comp.pdbx_replaced_by ? _chem_comp.pdbx_replaces ? _chem_comp.formula_weight 306.229 _chem_comp.one_letter_code ? _chem_comp.three_letter_code INI _chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ? _chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details ? _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 1RVV _chem_comp.pdbx_subcomponent_list ? _chem_comp.pdbx_processing_site EBI # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.alt_atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.charge _chem_comp_atom.pdbx_align _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.model_Cartn_x _chem_comp_atom.model_Cartn_y _chem_comp_atom.model_Cartn_z _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal _chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id _chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id _chem_comp_atom.pdbx_ordinal INI N1 N1 N 0 1 Y N N 21.519 37.436 -33.872 1.581 0.187 -1.842 N1 INI 1 INI C2 C2 C 0 1 Y N N 20.140 37.550 -33.944 2.140 0.233 -3.060 C2 INI 2 INI O2 O2 O 0 1 N N N 19.685 38.533 -34.567 3.345 0.369 -3.145 O2 INI 3 INI N3 N3 N 0 1 Y N N 19.425 36.578 -33.338 1.422 0.140 -4.191 N3 INI 4 INI C4 C4 C 0 1 Y N N 19.966 35.493 -32.682 0.082 -0.011 -4.152 C4 INI 5 INI O4 O4 O 0 1 N N N 19.133 34.729 -32.168 -0.564 -0.094 -5.178 O4 INI 6 INI C5 C5 C 0 1 Y N N 21.477 35.370 -32.673 -0.579 -0.073 -2.834 C5 INI 7 INI N5 N5 N 1 1 N N N 22.026 34.161 -32.131 -1.894 -0.222 -2.733 N5 INI 8 INI O51 O51 O -1 1 N N N 21.309 33.263 -31.808 -2.672 -0.445 -3.894 O51 INI 9 INI O52 O52 O 0 1 N N N 23.233 34.085 -31.993 -2.430 -0.166 -1.641 O52 INI 10 INI C6 C6 C 0 1 Y N N 22.214 36.325 -33.423 0.238 0.030 -1.681 C6 INI 11 INI N7 N7 N 0 1 N N N 23.519 36.191 -33.849 -0.305 -0.019 -0.445 N7 INI 12 INI C8 C8 C 0 1 N N N 24.495 36.724 -32.813 0.560 -0.030 0.735 C8 INI 13 INI C9 C9 C 0 1 N N S 25.014 38.200 -33.127 -0.300 -0.089 1.999 C9 INI 14 INI O9 O9 O 0 1 N N N 23.863 39.013 -33.273 -1.156 1.054 2.046 O9 INI 15 INI C10 C10 C 0 1 N N S 26.047 38.636 -34.269 0.603 -0.101 3.232 C10 INI 16 INI O10 O10 O 0 1 N N N 25.455 38.497 -35.544 1.459 -1.244 3.185 O10 INI 17 INI C11 C11 C 0 1 N N R 27.649 38.202 -34.285 -0.257 -0.160 4.496 C11 INI 18 INI O11 O11 O 0 1 N N N 27.575 37.434 -33.065 -1.113 0.983 4.543 O11 INI 19 INI C12 C12 C 0 1 N N N 28.961 39.100 -34.021 0.646 -0.171 5.730 C12 INI 20 INI O12 O12 O 0 1 N N N 28.507 40.446 -34.135 -0.157 -0.226 6.909 O12 INI 21 INI HN1 HN1 H 0 1 N N N 21.847 38.226 -33.317 2.148 0.258 -1.057 HN1 INI 22 INI HN3 HN3 H 0 1 N N N 18.409 36.669 -33.378 1.873 0.183 -5.049 HN3 INI 23 INI HN7 HN7 H 0 1 N N N 23.662 36.628 -34.759 -1.269 -0.048 -0.340 HN7 INI 24 INI H81 1H8 H 0 1 N N N 24.053 36.670 -31.790 1.165 0.875 0.751 H81 INI 25 INI H82 2H8 H 0 1 N N N 25.352 36.023 -32.681 1.212 -0.902 0.699 H82 INI 26 INI H9 H9 H 0 1 N N N 25.704 38.310 -32.258 -0.906 -0.995 1.983 H9 INI 27 INI HO9 HO9 H 0 1 N N N 24.172 39.891 -33.459 -0.582 1.832 2.058 HO9 INI 28 INI H10 H10 H 0 1 N N N 26.212 39.688 -33.938 1.209 0.805 3.248 H10 INI 29 INI HO1 HO1 H 0 1 N N N 26.068 38.755 -36.221 0.885 -2.022 3.173 HO1 INI 30 INI H11 H11 H 0 1 N N N 27.858 37.905 -35.339 -0.863 -1.066 4.480 H11 INI 31 INI HO2 HO2 H 0 1 N N N 28.491 37.185 -33.074 -0.539 1.761 4.555 HO2 INI 32 INI H121 1H12 H 0 0 N N N 29.478 38.875 -33.059 1.252 0.734 5.745 H121 INI 33 INI H122 2H12 H 0 0 N N N 29.821 38.853 -34.686 1.299 -1.044 5.694 H122 INI 34 INI HO3 HO3 H 0 1 N N N 29.280 40.975 -33.979 0.449 -0.232 7.662 HO3 INI 35 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal INI N1 C2 SING Y N 1 INI N1 C6 SING Y N 2 INI N1 HN1 SING N N 3 INI C2 O2 DOUB N N 4 INI C2 N3 SING Y N 5 INI N3 C4 SING Y N 6 INI N3 HN3 SING N N 7 INI C4 O4 DOUB N N 8 INI C4 C5 SING Y N 9 INI C5 N5 SING N N 10 INI C5 C6 DOUB Y N 11 INI N5 O51 SING N N 12 INI N5 O52 DOUB N N 13 INI C6 N7 SING N N 14 INI N7 C8 SING N N 15 INI N7 HN7 SING N N 16 INI C8 C9 SING N N 17 INI C8 H81 SING N N 18 INI C8 H82 SING N N 19 INI C9 O9 SING N N 20 INI C9 C10 SING N N 21 INI C9 H9 SING N N 22 INI O9 HO9 SING N N 23 INI C10 O10 SING N N 24 INI C10 C11 SING N N 25 INI C10 H10 SING N N 26 INI O10 HO1 SING N N 27 INI C11 O11 SING N N 28 INI C11 C12 SING N N 29 INI C11 H11 SING N N 30 INI O11 HO2 SING N N 31 INI C12 O12 SING N N 32 INI C12 H121 SING N N 33 INI C12 H122 SING N N 34 INI O12 HO3 SING N N 35 # loop_ _pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id _pdbx_chem_comp_descriptor.type _pdbx_chem_comp_descriptor.program _pdbx_chem_comp_descriptor.program_version _pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor INI SMILES ACDLabs 10.04 "O=C1NC(NCC(O)C(O)C(O)CO)=C(C(=O)N1)[N+]([O-])=O" INI SMILES_CANONICAL CACTVS 3.341 "OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)CNC1=C(C(=O)NC(=O)N1)[N+]([O-])=O" INI SMILES CACTVS 3.341 "OC[CH](O)[CH](O)[CH](O)CNC1=C(C(=O)NC(=O)N1)[N+]([O-])=O" INI SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 1.5.0 "C([C@@H]([C@@H]([C@@H](CO)O)O)O)NC1=C(C(=O)NC(=O)N1)[N+](=O)[O-]" INI SMILES "OpenEye OEToolkits" 1.5.0 "C(C(C(C(CO)O)O)O)NC1=C(C(=O)NC(=O)N1)[N+](=O)[O-]" INI InChI InChI 1.03 "InChI=1S/C9H14N4O8/c14-2-4(16)6(17)3(15)1-10-7-5(13(20)21)8(18)12-9(19)11-7/h3-4,6,14-17H,1-2H2,(H3,10,11,12,18,19)/t3-,4+,6-/m0/s1" INI InChIKey InChI 1.03 KSKGHNZSCSCHEQ-RPDRRWSUSA-N # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier INI "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs 10.04 "1-deoxy-1-[(5-nitro-2,6-dioxo-1,2,3,6-tetrahydropyrimidin-4-yl)amino]-D-ribitol" INI "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 1.5.0 "5-nitro-6-[[(2S,3S,4R)-2,3,4,5-tetrahydroxypentyl]amino]-1H-pyrimidine-2,4-dione" # loop_ _pdbx_chem_comp_audit.comp_id _pdbx_chem_comp_audit.action_type _pdbx_chem_comp_audit.date _pdbx_chem_comp_audit.processing_site INI "Create component" 1999-07-08 EBI INI "Modify descriptor" 2011-06-04 RCSB #