data_IYI # _chem_comp.id IYI _chem_comp.name "[9-[2-carboxy-5-[2-[2-[5-(trifluoromethylsulfonylamino)pentoxy]ethoxy]ethylcarbamoyl]phenyl]-6-(dimethylamino)xanthen-3-ylidene]-dimethyl-azanium" _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_type HETAIN _chem_comp.formula "C35 H42 F3 N4 O8 S" _chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ? _chem_comp.pdbx_synonyms ? _chem_comp.pdbx_formal_charge 1 _chem_comp.pdbx_initial_date 2022-04-20 _chem_comp.pdbx_modified_date 2023-02-17 _chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N _chem_comp.pdbx_release_status REL _chem_comp.pdbx_replaced_by ? _chem_comp.pdbx_replaces ? _chem_comp.formula_weight 735.790 _chem_comp.one_letter_code ? _chem_comp.three_letter_code IYI _chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ? _chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details Corina _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 7ZIY _chem_comp.pdbx_subcomponent_list ? _chem_comp.pdbx_processing_site PDBE # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.alt_atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.charge _chem_comp_atom.pdbx_align _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.model_Cartn_x _chem_comp_atom.model_Cartn_y _chem_comp_atom.model_Cartn_z _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal _chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id _chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id _chem_comp_atom.pdbx_ordinal IYI N1 N1 N 0 1 N N N 12.311 16.400 -3.035 -9.784 0.726 -0.798 N1 IYI 1 IYI C7 C1 C 0 1 N N N 11.460 17.668 0.431 -7.178 -1.783 0.331 C7 IYI 2 IYI C8 C2 C 0 1 N N N 11.632 16.707 -0.720 -7.979 -0.917 -0.642 C8 IYI 3 IYI N2 N2 N 1 1 N N N 19.857 7.366 11.236 3.562 5.637 -1.181 N2 IYI 4 IYI C9 C3 C 0 1 N N N 12.126 17.398 -1.974 -9.017 -0.104 0.134 C9 IYI 5 IYI O1 O1 O 0 1 N N N 14.738 18.250 4.875 -1.656 -4.906 -0.851 O1 IYI 6 IYI C1 C4 C 0 1 N N N 16.683 17.270 5.903 0.238 -4.439 -2.277 C1 IYI 7 IYI O5 O2 O 0 1 N N N 15.921 9.941 12.079 7.088 2.570 -0.505 O5 IYI 8 IYI C5 C5 C 0 1 N N N 11.439 17.835 2.894 -5.339 -3.463 0.529 C5 IYI 9 IYI C6 C6 C 0 1 N N N 11.092 16.975 1.714 -6.140 -2.596 -0.445 C6 IYI 10 IYI N3 N3 N 0 1 N N N 11.730 12.189 12.591 10.774 -0.391 0.133 N3 IYI 11 IYI C4 C7 C 0 1 N N N 12.974 19.395 3.701 -3.563 -5.070 0.624 C4 IYI 12 IYI O4 O3 O 0 1 N N N 14.669 15.877 -2.502 -11.666 2.121 -1.459 O4 IYI 13 IYI C3 C8 C 0 1 N N N 13.439 18.844 5.026 -2.567 -5.831 -0.253 C3 IYI 14 IYI O3 O4 O 0 1 N N N 13.664 15.019 -4.593 -11.947 0.359 0.256 O3 IYI 15 IYI C2 C9 C 0 1 N N N 15.252 17.732 6.086 -0.678 -5.517 -1.695 C2 IYI 16 IYI N N4 N 0 1 N N N 17.223 16.811 7.175 0.999 -3.808 -1.196 N IYI 17 IYI C C10 C 0 1 N N N 17.133 15.528 7.537 1.875 -2.823 -1.475 C IYI 18 IYI O O5 O 0 1 N N N 16.509 14.704 6.877 2.035 -2.458 -2.623 O IYI 19 IYI C10 C11 C 0 1 N N N 14.311 17.517 -4.474 -10.700 2.605 0.981 C10 IYI 20 IYI C11 C12 C 0 1 Y N N 17.774 15.134 8.830 2.644 -2.185 -0.382 C11 IYI 21 IYI C12 C13 C 0 1 Y N N 17.262 13.999 9.449 3.546 -1.164 -0.671 C12 IYI 22 IYI C13 C14 C 0 1 Y N N 17.768 13.556 10.678 4.268 -0.564 0.359 C13 IYI 23 IYI C14 C15 C 0 1 N N N 17.153 12.345 11.281 5.224 0.518 0.061 C14 IYI 24 IYI C15 C16 C 0 1 Y N N 15.829 12.335 11.701 6.672 0.279 0.080 C15 IYI 25 IYI C16 C17 C 0 1 Y N N 15.041 13.481 11.676 7.175 -0.993 0.384 C16 IYI 26 IYI C17 C18 C 0 1 Y N N 13.693 13.432 11.976 8.521 -1.206 0.400 C17 IYI 27 IYI C18 C19 C 0 1 Y N N 15.228 11.139 12.084 7.554 1.338 -0.209 C18 IYI 28 IYI C19 C20 C 0 1 N N N 17.250 9.932 11.687 5.768 2.854 -0.540 C19 IYI 29 IYI C20 C21 C 0 1 N N N 17.911 11.095 11.291 4.779 1.816 -0.252 C20 IYI 30 IYI C21 C22 C 0 1 N N N 19.246 10.989 10.895 3.400 2.113 -0.289 C21 IYI 31 IYI C22 C23 C 0 1 N N N 19.886 9.760 10.875 2.988 3.365 -0.593 C22 IYI 32 IYI C23 C24 C 0 1 N N N 19.216 8.592 11.255 3.970 4.409 -0.883 C23 IYI 33 IYI C24 C25 C 0 1 N N N 19.151 6.160 11.609 4.544 6.684 -1.471 C24 IYI 34 IYI C25 C26 C 0 1 N N N 21.305 7.283 11.255 2.130 5.944 -1.219 C25 IYI 35 IYI C26 C27 C 0 1 N N N 17.879 8.698 11.663 5.349 4.115 -0.845 C26 IYI 36 IYI C27 C28 C 0 1 Y N N 13.881 11.089 12.413 8.921 1.104 -0.189 C27 IYI 37 IYI C28 C29 C 0 1 Y N N 13.092 12.241 12.344 9.403 -0.161 0.114 C28 IYI 38 IYI C29 C30 C 0 1 N N N 11.127 10.967 13.056 11.704 0.701 -0.167 C29 IYI 39 IYI C30 C31 C 0 1 N N N 10.984 13.428 12.757 11.289 -1.724 0.453 C30 IYI 40 IYI C31 C32 C 0 1 Y N N 18.829 14.259 11.277 4.081 -0.998 1.688 C31 IYI 41 IYI C32 C33 C 0 1 N N N 19.489 13.878 12.555 4.842 -0.368 2.787 C32 IYI 42 IYI C33 C34 C 0 1 Y N N 19.351 15.387 10.636 3.176 -2.020 1.962 C33 IYI 43 IYI C34 C35 C 0 1 Y N N 18.828 15.819 9.429 2.460 -2.606 0.937 C34 IYI 44 IYI F F1 F 0 1 N N N 13.377 17.894 -5.303 -11.831 3.265 1.474 F IYI 45 IYI F1 F2 F 0 1 N N N 14.562 18.510 -3.632 -9.813 3.540 0.439 F1 IYI 46 IYI F2 F3 F 0 1 N N N 15.402 17.234 -5.160 -10.072 1.914 2.023 F2 IYI 47 IYI O2 O6 O 0 1 N N N 12.763 18.333 2.780 -4.370 -4.222 -0.196 O2 IYI 48 IYI O6 O7 O 0 1 N N N 18.697 13.608 13.539 4.661 -0.783 4.056 O6 IYI 49 IYI O7 O8 O 0 1 N N N 20.705 13.828 12.651 5.630 0.524 2.547 O7 IYI 50 IYI S S1 S 0 1 N N N 13.747 16.026 -3.585 -11.201 1.430 -0.308 S IYI 51 IYI H1 H1 H 0 1 N N N 11.785 16.725 -3.821 -9.460 0.867 -1.702 H1 IYI 52 IYI H2 H2 H 0 1 N N N 12.405 18.210 0.582 -6.672 -1.144 1.055 H2 IYI 53 IYI H3 H3 H 0 1 N N N 10.664 18.384 0.176 -7.853 -2.461 0.855 H3 IYI 54 IYI H4 H4 H 0 1 N N N 10.662 16.234 -0.935 -7.304 -0.239 -1.166 H4 IYI 55 IYI H5 H5 H 0 1 N N N 12.360 15.935 -0.431 -8.485 -1.556 -1.366 H5 IYI 56 IYI H6 H6 H 0 1 N N N 13.085 17.896 -1.766 -8.511 0.536 0.857 H6 IYI 57 IYI H7 H7 H 0 1 N N N 11.387 18.146 -2.297 -9.692 -0.781 0.657 H7 IYI 58 IYI H8 H8 H 0 1 N N N 16.709 16.444 5.177 0.927 -4.894 -2.989 H8 IYI 59 IYI H9 H9 H 0 1 N N N 17.291 18.107 5.529 -0.365 -3.686 -2.785 H9 IYI 60 IYI H10 H10 H 0 1 N N N 10.738 18.681 2.943 -4.833 -2.824 1.252 H10 IYI 61 IYI H11 H11 H 0 1 N N N 11.356 17.237 3.813 -6.014 -4.140 1.052 H11 IYI 62 IYI H12 H12 H 0 1 N N N 10.011 16.773 1.719 -6.646 -3.236 -1.168 H12 IYI 63 IYI H13 H13 H 0 1 N N N 11.643 16.025 1.784 -5.465 -1.919 -0.968 H13 IYI 64 IYI H14 H14 H 0 1 N N N 13.739 20.077 3.301 -4.201 -5.781 1.150 H14 IYI 65 IYI H15 H15 H 0 1 N N N 12.032 19.945 3.845 -3.020 -4.464 1.349 H15 IYI 66 IYI H16 H16 H 0 1 N N N 13.493 19.660 5.762 -3.106 -6.367 -1.034 H16 IYI 67 IYI H17 H17 H 0 1 N N N 12.727 18.082 5.375 -2.013 -6.542 0.360 H17 IYI 68 IYI H18 H18 H 0 1 N N N 15.221 18.516 6.857 -0.085 -6.222 -1.112 H18 IYI 69 IYI H19 H19 H 0 1 N N N 14.635 16.879 6.405 -1.178 -6.047 -2.506 H19 IYI 70 IYI H20 H20 H 0 1 N N N 17.668 17.465 7.786 0.871 -4.099 -0.280 H20 IYI 71 IYI H21 H21 H 0 1 N N N 16.462 13.450 8.975 3.685 -0.837 -1.691 H21 IYI 72 IYI H22 H22 H 0 1 N N N 15.492 14.428 11.417 6.497 -1.804 0.606 H22 IYI 73 IYI H23 H23 H 0 1 N N N 13.101 14.334 11.923 8.908 -2.187 0.635 H23 IYI 74 IYI H24 H24 H 0 1 N N N 19.787 11.876 10.601 2.675 1.342 -0.076 H24 IYI 75 IYI H25 H25 H 0 1 N N N 20.918 9.703 10.561 1.933 3.594 -0.622 H25 IYI 76 IYI H26 H26 H 0 1 N N N 18.067 6.339 11.559 4.026 7.617 -1.692 H26 IYI 77 IYI H27 H27 H 0 1 N N N 19.421 5.348 10.917 5.192 6.825 -0.606 H27 IYI 78 IYI H28 H28 H 0 1 N N N 19.429 5.875 12.635 5.145 6.390 -2.332 H28 IYI 79 IYI H29 H29 H 0 1 N N N 21.613 6.227 11.235 1.802 6.271 -0.232 H29 IYI 80 IYI H30 H30 H 0 1 N N N 21.713 7.800 10.374 1.948 6.737 -1.944 H30 IYI 81 IYI H31 H31 H 0 1 N N N 21.687 7.759 12.170 1.575 5.052 -1.509 H31 IYI 82 IYI H32 H32 H 0 1 N N N 17.336 7.813 11.960 6.072 4.889 -1.059 H32 IYI 83 IYI H33 H33 H 0 1 N N N 13.439 10.154 12.724 9.610 1.906 -0.410 H33 IYI 84 IYI H34 H34 H 0 1 N N N 10.047 11.120 13.194 12.728 0.334 -0.103 H34 IYI 85 IYI H35 H35 H 0 1 N N N 11.293 10.171 12.315 11.513 1.075 -1.173 H35 IYI 86 IYI H36 H36 H 0 1 N N N 11.582 10.676 14.014 11.561 1.507 0.553 H36 IYI 87 IYI H37 H37 H 0 1 N N N 9.925 13.197 12.944 11.444 -1.805 1.529 H37 IYI 88 IYI H38 H38 H 0 1 N N N 11.393 13.991 13.609 10.570 -2.478 0.132 H38 IYI 89 IYI H39 H39 H 0 1 N N N 11.071 14.033 11.843 12.236 -1.882 -0.064 H39 IYI 90 IYI H40 H40 H 0 1 N N N 20.171 15.927 11.087 3.031 -2.353 2.978 H40 IYI 91 IYI H41 H41 H 0 1 N N N 19.241 16.694 8.949 1.756 -3.395 1.156 H41 IYI 92 IYI H42 H42 H 0 1 N N N 19.210 13.377 14.305 5.181 -0.341 4.741 H42 IYI 93 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal IYI F C10 SING N N 1 IYI F2 C10 SING N N 2 IYI O3 S DOUB N N 3 IYI C10 F1 SING N N 4 IYI C10 S SING N N 5 IYI S N1 SING N N 6 IYI S O4 DOUB N N 7 IYI N1 C9 SING N N 8 IYI C9 C8 SING N N 9 IYI C8 C7 SING N N 10 IYI C7 C6 SING N N 11 IYI C6 C5 SING N N 12 IYI O2 C5 SING N N 13 IYI O2 C4 SING N N 14 IYI C4 C3 SING N N 15 IYI O1 C3 SING N N 16 IYI O1 C2 SING N N 17 IYI C1 C2 SING N N 18 IYI C1 N SING N N 19 IYI O C DOUB N N 20 IYI N C SING N N 21 IYI C C11 SING N N 22 IYI C11 C34 DOUB Y N 23 IYI C11 C12 SING Y N 24 IYI C34 C33 SING Y N 25 IYI C12 C13 DOUB Y N 26 IYI C33 C31 DOUB Y N 27 IYI C13 C31 SING Y N 28 IYI C13 C14 SING N N 29 IYI C22 C21 DOUB N N 30 IYI C22 C23 SING N N 31 IYI C21 C20 SING N N 32 IYI N2 C25 SING N N 33 IYI N2 C23 DOUB N N 34 IYI N2 C24 SING N N 35 IYI C23 C26 SING N N 36 IYI C31 C32 SING N N 37 IYI C14 C20 DOUB N N 38 IYI C14 C15 SING N N 39 IYI C20 C19 SING N N 40 IYI C26 C19 DOUB N N 41 IYI C16 C15 SING Y N 42 IYI C16 C17 DOUB Y N 43 IYI C19 O5 SING N N 44 IYI C15 C18 DOUB Y N 45 IYI C17 C28 SING Y N 46 IYI O5 C18 SING N N 47 IYI C18 C27 SING Y N 48 IYI C28 C27 DOUB Y N 49 IYI C28 N3 SING N N 50 IYI C32 O7 DOUB N N 51 IYI C32 O6 SING N N 52 IYI N3 C30 SING N N 53 IYI N3 C29 SING N N 54 IYI N1 H1 SING N N 55 IYI C7 H2 SING N N 56 IYI C7 H3 SING N N 57 IYI C8 H4 SING N N 58 IYI C8 H5 SING N N 59 IYI C9 H6 SING N N 60 IYI C9 H7 SING N N 61 IYI C1 H8 SING N N 62 IYI C1 H9 SING N N 63 IYI C5 H10 SING N N 64 IYI C5 H11 SING N N 65 IYI C6 H12 SING N N 66 IYI C6 H13 SING N N 67 IYI C4 H14 SING N N 68 IYI C4 H15 SING N N 69 IYI C3 H16 SING N N 70 IYI C3 H17 SING N N 71 IYI C2 H18 SING N N 72 IYI C2 H19 SING N N 73 IYI N H20 SING N N 74 IYI C12 H21 SING N N 75 IYI C16 H22 SING N N 76 IYI C17 H23 SING N N 77 IYI C21 H24 SING N N 78 IYI C22 H25 SING N N 79 IYI C24 H26 SING N N 80 IYI C24 H27 SING N N 81 IYI C24 H28 SING N N 82 IYI C25 H29 SING N N 83 IYI C25 H30 SING N N 84 IYI C25 H31 SING N N 85 IYI C26 H32 SING N N 86 IYI C27 H33 SING N N 87 IYI C29 H34 SING N N 88 IYI C29 H35 SING N N 89 IYI C29 H36 SING N N 90 IYI C30 H37 SING N N 91 IYI C30 H38 SING N N 92 IYI C30 H39 SING N N 93 IYI C33 H40 SING N N 94 IYI C34 H41 SING N N 95 IYI O6 H42 SING N N 96 # loop_ _pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id _pdbx_chem_comp_descriptor.type _pdbx_chem_comp_descriptor.program _pdbx_chem_comp_descriptor.program_version _pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor IYI InChI InChI 1.06 "InChI=1S/C35H41F3N4O8S/c1-41(2)24-9-12-27-30(21-24)50-31-22-25(42(3)4)10-13-28(31)32(27)29-20-23(8-11-26(29)34(44)45)33(43)39-15-17-49-19-18-48-16-7-5-6-14-40-51(46,47)35(36,37)38/h8-13,20-22,40H,5-7,14-19H2,1-4H3,(H-,39,43,44,45)/p+1" IYI InChIKey InChI 1.06 QNUHBXCAJKIQSP-UHFFFAOYSA-O IYI SMILES_CANONICAL CACTVS 3.385 "CN(C)c1ccc2c(OC3=CC(C=CC3=C2c4cc(ccc4C(O)=O)C(=O)NCCOCCOCCCCCN[S](=O)(=O)C(F)(F)F)=[N+](C)C)c1" IYI SMILES CACTVS 3.385 "CN(C)c1ccc2c(OC3=CC(C=CC3=C2c4cc(ccc4C(O)=O)C(=O)NCCOCCOCCCCCN[S](=O)(=O)C(F)(F)F)=[N+](C)C)c1" IYI SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "CN(C)c1ccc2c(c1)OC3=CC(=[N+](C)C)C=CC3=C2c4cc(ccc4C(=O)O)C(=O)NCCOCCOCCCCCNS(=O)(=O)C(F)(F)F" IYI SMILES "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "CN(C)c1ccc2c(c1)OC3=CC(=[N+](C)C)C=CC3=C2c4cc(ccc4C(=O)O)C(=O)NCCOCCOCCCCCNS(=O)(=O)C(F)(F)F" # _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id IYI _pdbx_chem_comp_identifier.type "SYSTEMATIC NAME" _pdbx_chem_comp_identifier.program "OpenEye OEToolkits" _pdbx_chem_comp_identifier.program_version 2.0.7 _pdbx_chem_comp_identifier.identifier "[9-[2-carboxy-5-[2-[2-[5-(trifluoromethylsulfonylamino)pentoxy]ethoxy]ethylcarbamoyl]phenyl]-6-(dimethylamino)xanthen-3-ylidene]-dimethyl-azanium" # loop_ _pdbx_chem_comp_audit.comp_id _pdbx_chem_comp_audit.action_type _pdbx_chem_comp_audit.date _pdbx_chem_comp_audit.processing_site IYI "Create component" 2022-04-20 PDBE IYI "Modify descriptor" 2022-08-22 RCSB IYI "Initial release" 2023-02-22 RCSB #