data_KUN # _chem_comp.id KUN _chem_comp.name "(E,4S)-4-[[5-[2-[2,6-bis(azanyl)-4-oxidanylidene-1H-pyrimidin-5-yl]ethanoylamino]-3-fluoranyl-pyridin-2-yl]carbonylamino]pent-2-enedioic acid" _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_type HETAIN _chem_comp.formula "C17 H18 F N7 O7" _chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ? _chem_comp.pdbx_synonyms TH9619 _chem_comp.pdbx_formal_charge 0 _chem_comp.pdbx_initial_date 2019-06-27 _chem_comp.pdbx_modified_date 2023-04-04 _chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N _chem_comp.pdbx_release_status REL _chem_comp.pdbx_replaced_by ? _chem_comp.pdbx_replaces ? _chem_comp.formula_weight 451.366 _chem_comp.one_letter_code ? _chem_comp.three_letter_code KUN _chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ? _chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details Corina _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 6S4F _chem_comp.pdbx_subcomponent_list ? _chem_comp.pdbx_processing_site PDBE # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.alt_atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.charge _chem_comp_atom.pdbx_align _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.model_Cartn_x _chem_comp_atom.model_Cartn_y _chem_comp_atom.model_Cartn_z _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal _chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id _chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id _chem_comp_atom.pdbx_ordinal KUN C13 C1 C 0 1 Y N N 49.960 -12.714 2.862 0.463 -1.290 -0.494 C13 KUN 1 KUN C15 C2 C 0 1 Y N N 48.494 -12.721 2.793 1.592 -0.740 0.119 C15 KUN 2 KUN C17 C3 C 0 1 Y N N 48.320 -11.227 4.579 0.310 0.208 1.787 C17 KUN 3 KUN C21 C4 C 0 1 N N S 45.357 -14.315 1.166 5.345 -0.659 -0.472 C21 KUN 4 KUN C22 C5 C 0 1 N N N 44.939 -15.677 1.888 6.285 0.473 -0.054 C22 KUN 5 KUN C24 C6 C 0 1 N N N 45.697 -18.217 2.605 6.718 2.908 -0.243 C24 KUN 6 KUN N01 N1 N 0 1 N N N 57.091 -9.029 9.197 -8.486 0.714 -2.214 N01 KUN 7 KUN C02 C7 C 0 1 N N N 55.726 -9.143 8.779 -7.523 0.591 -1.248 C02 KUN 8 KUN N03 N2 N 0 1 N N N 54.883 -10.019 9.416 -7.264 -0.634 -0.715 N03 KUN 9 KUN C04 C8 C 0 1 N N N 53.547 -10.109 9.044 -6.304 -0.777 0.252 C04 KUN 10 KUN N05 N3 N 0 1 N N N 52.822 -10.944 9.732 -6.038 -2.013 0.794 N05 KUN 11 KUN C06 C9 C 0 1 N N N 53.014 -9.366 8.037 -5.615 0.325 0.670 C06 KUN 12 KUN C07 C10 C 0 1 N N N 51.612 -9.445 7.569 -4.551 0.207 1.731 C07 KUN 13 KUN C08 C11 C 0 1 N N N 51.315 -10.376 6.446 -3.202 0.060 1.076 C08 KUN 14 KUN O09 O1 O 0 1 N N N 52.180 -11.182 6.139 -3.113 0.052 -0.133 O09 KUN 15 KUN N10 N4 N 0 1 N N N 50.141 -10.299 5.776 -2.095 -0.063 1.834 N10 KUN 16 KUN C11 C12 C 0 1 Y N N 49.699 -11.111 4.761 -0.861 -0.308 1.232 C11 KUN 17 KUN C12 C13 C 0 1 Y N N 50.508 -11.892 3.899 -0.784 -1.071 0.071 C12 KUN 18 KUN F14 F1 F 0 1 N N N 50.724 -13.400 2.053 0.585 -2.019 -1.625 F14 KUN 19 KUN N16 N5 N 0 1 Y N N 47.759 -11.975 3.649 1.476 -0.017 1.228 N16 KUN 20 KUN C18 C14 C 0 1 N N N 47.712 -13.542 1.813 2.927 -0.964 -0.472 C18 KUN 21 KUN O19 O2 O 0 1 N N N 48.383 -14.137 0.980 3.040 -1.625 -1.487 O19 KUN 22 KUN N20 N6 N 0 1 N N N 46.332 -13.608 1.955 4.021 -0.437 0.114 N20 KUN 23 KUN C23 C15 C 0 1 N N N 45.865 -16.931 1.588 5.793 1.792 -0.655 C23 KUN 24 KUN O25 O3 O 0 1 N N N 46.301 -18.197 3.715 6.482 4.163 -0.655 O25 KUN 25 KUN O26 O4 O 0 1 N N N 44.968 -19.200 2.241 7.673 2.672 0.459 O26 KUN 26 KUN C27 C16 C 0 1 N N N 44.174 -13.221 1.000 5.895 -1.975 0.016 C27 KUN 27 KUN O28 O5 O 0 1 N N N 43.569 -13.148 -0.086 5.248 -2.656 0.775 O28 KUN 28 KUN O29 O6 O 0 1 N N N 43.925 -12.456 1.959 7.105 -2.389 -0.393 O29 KUN 29 KUN C30 C17 C 0 1 N N N 53.897 -8.452 7.349 -5.914 1.574 0.092 C30 KUN 30 KUN O31 O7 O 0 1 N N N 53.572 -7.737 6.383 -5.308 2.576 0.445 O31 KUN 31 KUN N32 N7 N 0 1 N N N 55.246 -8.355 7.745 -6.861 1.659 -0.856 N32 KUN 32 KUN H1 H1 H 0 1 N N N 47.673 -10.670 5.240 0.257 0.800 2.688 H1 KUN 33 KUN H2 H2 H 0 1 N N N 45.756 -14.551 0.169 5.263 -0.681 -1.559 H2 KUN 34 KUN H3 H3 H 0 1 N N N 44.951 -15.501 2.974 6.298 0.552 1.033 H3 KUN 35 KUN H4 H4 H 0 1 N N N 57.701 -8.379 8.742 -8.976 -0.068 -2.513 H4 KUN 36 KUN H5 H5 H 0 1 N N N 57.435 -9.599 9.943 -8.678 1.584 -2.600 H5 KUN 37 KUN H6 H6 H 0 1 N N N 53.392 -11.391 10.422 -6.532 -2.792 0.491 H6 KUN 38 KUN H7 H7 H 0 1 N N N 52.080 -10.448 10.183 -5.357 -2.106 1.478 H7 KUN 39 KUN H9 H9 H 0 1 N N N 51.314 -8.436 7.248 -4.558 1.102 2.353 H9 KUN 40 KUN H10 H10 H 0 1 N N N 50.995 -9.754 8.426 -4.752 -0.668 2.351 H10 KUN 41 KUN H11 H11 H 0 1 N N N 49.523 -9.564 6.053 -2.155 0.020 2.799 H11 KUN 42 KUN H12 H12 H 0 1 N N N 51.580 -11.866 4.029 -1.675 -1.483 -0.380 H12 KUN 43 KUN H13 H13 H 0 1 N N N 45.959 -13.085 2.721 3.931 0.090 0.923 H13 KUN 44 KUN H14 H14 H 0 1 N N N 45.641 -17.278 0.568 5.780 1.713 -1.742 H14 KUN 45 KUN H15 H15 H 0 1 N N N 46.118 -18.999 4.190 7.103 4.845 -0.365 H15 KUN 46 KUN H16 H16 H 0 1 N N N 43.234 -11.853 1.712 7.416 -3.239 -0.053 H16 KUN 47 KUN H17 H17 H 0 1 N N N 55.233 -10.597 10.153 -7.761 -1.409 -1.021 H17 KUN 48 KUN H8 H8 H 0 1 N N N 43.917 -15.928 1.569 7.291 0.262 -0.415 H8 KUN 49 KUN H18 H18 H 0 1 N N N 46.911 -16.596 1.640 4.786 2.003 -0.293 H18 KUN 50 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal KUN O28 C27 DOUB N N 1 KUN O19 C18 DOUB N N 2 KUN C27 C21 SING N N 3 KUN C27 O29 SING N N 4 KUN C21 C22 SING N N 5 KUN C21 N20 SING N N 6 KUN C23 C22 SING N N 7 KUN C23 C24 SING N N 8 KUN C18 N20 SING N N 9 KUN C18 C15 SING N N 10 KUN F14 C13 SING N N 11 KUN O26 C24 DOUB N N 12 KUN C24 O25 SING N N 13 KUN C15 C13 DOUB Y N 14 KUN C15 N16 SING Y N 15 KUN C13 C12 SING Y N 16 KUN N16 C17 DOUB Y N 17 KUN C12 C11 DOUB Y N 18 KUN C17 C11 SING Y N 19 KUN C11 N10 SING N N 20 KUN N10 C08 SING N N 21 KUN O09 C08 DOUB N N 22 KUN O31 C30 DOUB N N 23 KUN C08 C07 SING N N 24 KUN C30 N32 SING N N 25 KUN C30 C06 SING N N 26 KUN C07 C06 SING N N 27 KUN N32 C02 DOUB N N 28 KUN C06 C04 DOUB N N 29 KUN C02 N01 SING N N 30 KUN C02 N03 SING N N 31 KUN C04 N03 SING N N 32 KUN C04 N05 SING N N 33 KUN C17 H1 SING N N 34 KUN C21 H2 SING N N 35 KUN C22 H3 SING N N 36 KUN N01 H4 SING N N 37 KUN N01 H5 SING N N 38 KUN N05 H6 SING N N 39 KUN N05 H7 SING N N 40 KUN C07 H9 SING N N 41 KUN C07 H10 SING N N 42 KUN N10 H11 SING N N 43 KUN C12 H12 SING N N 44 KUN N20 H13 SING N N 45 KUN C23 H14 SING N N 46 KUN O25 H15 SING N N 47 KUN O29 H16 SING N N 48 KUN N03 H17 SING N N 49 KUN C22 H8 SING N N 50 KUN C23 H18 SING N N 51 # loop_ _pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id _pdbx_chem_comp_descriptor.type _pdbx_chem_comp_descriptor.program _pdbx_chem_comp_descriptor.program_version _pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor KUN InChI InChI 1.06 "InChI=1S/C17H18FN7O7/c18-8-3-6(22-10(26)4-7-13(19)24-17(20)25-14(7)29)5-21-12(8)15(30)23-9(16(31)32)1-2-11(27)28/h3,5,9H,1-2,4H2,(H,22,26)(H,23,30)(H,27,28)(H,31,32)(H5,19,20,24,25,29)/t9-/m0/s1" KUN InChIKey InChI 1.06 ALGPVOJFIGPPPX-VIFPVBQESA-N KUN SMILES_CANONICAL CACTVS 3.385 "NC1=NC(=O)C(=C(N)N1)CC(=O)Nc2cnc(c(F)c2)C(=O)N[C@@H](CCC(O)=O)C(O)=O" KUN SMILES CACTVS 3.385 "NC1=NC(=O)C(=C(N)N1)CC(=O)Nc2cnc(c(F)c2)C(=O)N[CH](CCC(O)=O)C(O)=O" KUN SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "c1c(cnc(c1F)C(=O)N[C@@H](CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)CC2=C(NC(=NC2=O)N)N" KUN SMILES "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "c1c(cnc(c1F)C(=O)NC(CCC(=O)O)C(=O)O)NC(=O)CC2=C(NC(=NC2=O)N)N" # _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id KUN _pdbx_chem_comp_identifier.type "SYSTEMATIC NAME" _pdbx_chem_comp_identifier.program "OpenEye OEToolkits" _pdbx_chem_comp_identifier.program_version 2.0.7 _pdbx_chem_comp_identifier.identifier "(2~{S})-2-[[5-[2-[2,6-bis(azanyl)-4-oxidanylidene-1~{H}-pyrimidin-5-yl]ethanoylamino]-3-fluoranyl-pyridin-2-yl]carbonylamino]pentanedioic acid" # loop_ _pdbx_chem_comp_audit.comp_id _pdbx_chem_comp_audit.action_type _pdbx_chem_comp_audit.date _pdbx_chem_comp_audit.processing_site KUN "Create component" 2019-06-27 PDBE KUN "Modify synonyms" 2020-06-05 PDBE KUN "Initial release" 2021-07-07 RCSB KUN "Modify aromatic_flag" 2022-05-05 PDBE KUN "Modify descriptor" 2022-08-22 RCSB KUN "Modify coordinates" 2023-04-04 PDBE #