data_NOM
#

_chem_comp.id                                   NOM
_chem_comp.name                                 "7-HYDROXY-5-METHYL-3,3A,5,11B-TETRAHYDRO-1,4-DIOXA-CYCLOPENTA[A]ANTHRACENE-2,6,11-TRIONE"
_chem_comp.type                                 NON-POLYMER
_chem_comp.pdbx_type                            HETAIN
_chem_comp.formula                              "C16 H12 O6"
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id              ?
_chem_comp.pdbx_synonyms                        "NANAOMYCIN D"
_chem_comp.pdbx_formal_charge                   0
_chem_comp.pdbx_initial_date                    2002-12-10
_chem_comp.pdbx_modified_date                   2020-06-17
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag                  N
_chem_comp.pdbx_release_status                  REL
_chem_comp.pdbx_replaced_by                     ?
_chem_comp.pdbx_replaces                        ?
_chem_comp.formula_weight                       300.263
_chem_comp.one_letter_code                      ?
_chem_comp.three_letter_code                    NOM
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details       ?
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag  N
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details       ?
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag  N
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code       1N5V
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list               ?
_chem_comp.pdbx_processing_site                 RCSB
#   #
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.alt_atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.pdbx_align
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config
_chem_comp_atom.model_Cartn_x
_chem_comp_atom.model_Cartn_y
_chem_comp_atom.model_Cartn_z
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal
NOM  C1    C1    C  0  1  Y  N  N  49.688  37.069  10.110  -3.995   2.147   0.199  C1    NOM   1  
NOM  C2    C2    C  0  1  Y  N  N  49.017  38.049  10.821  -2.631   2.342   0.029  C2    NOM   2  
NOM  C3    C3    C  0  1  Y  N  N  48.061  37.670  11.757  -1.784   1.248  -0.082  C3    NOM   3  
NOM  C4    C4    C  0  1  Y  N  N  47.752  36.328  12.020  -2.308  -0.056  -0.018  C4    NOM   4  
NOM  C5    C5    C  0  1  Y  N  N  48.453  35.367  11.293  -3.683  -0.239   0.151  C5    NOM   5  
NOM  C6    C6    C  0  1  Y  N  N  49.422  35.731  10.362  -4.518   0.873   0.259  C6    NOM   6  
NOM  C10   C10   C  0  1  N  N  N  47.347  38.664  12.497  -0.292   1.467  -0.290  C10   NOM   7  
NOM  C9    C9    C  0  1  N  N  N  46.357  38.302  13.468   0.555   0.267  -0.385  C9    NOM   8  
NOM  C8    C8    C  0  1  N  N  N  46.041  36.958  13.745   0.056  -1.006  -0.311  C8    NOM   9  
NOM  C7    C7    C  0  1  N  N  N  46.765  35.958  12.996  -1.400  -1.208  -0.132  C7    NOM  10  
NOM  O3    O3    O  0  1  N  N  N  46.477  34.799  13.240  -1.849  -2.337  -0.078  O3    NOM  11  
NOM  O4    O4    O  0  1  N  N  N  47.544  39.866  12.337   0.152   2.596  -0.358  O4    NOM  12  
NOM  O2    O2    O  0  1  N  N  N  48.171  34.033  11.486  -4.202  -1.490   0.211  O2    NOM  13  
NOM  C13   C13   C  0  1  N  N  R  45.718  39.342  14.143   2.026   0.373  -0.586  C13   NOM  14  
NOM  C14   C14   C  0  1  N  N  S  44.416  38.926  14.870   2.662  -0.881   0.089  C14   NOM  15  
NOM  O1    O1    O  0  1  N  N  N  44.374  37.651  15.422   2.287  -1.976  -0.715  O1    NOM  16  
NOM  C11   C11   C  0  1  N  N  S  45.077  36.662  14.689   0.920  -2.237  -0.392  C11   NOM  17  
NOM  C12   C12   C  0  1  N  N  N  44.378  35.330  14.774   0.869  -2.955   0.959  C12   NOM  18  
NOM  C15   C15   C  0  1  N  N  N  43.994  40.072  15.763   4.133  -0.444   0.057  C15   NOM  19  
NOM  C16   C16   C  0  1  N  N  N  44.769  41.271  15.151   4.007   1.055   0.336  C16   NOM  20  
NOM  O5    O5    O  0  1  N  N  N  44.493  42.408  15.562   4.883   1.761   0.777  O5    NOM  21  
NOM  O6    O6    O  0  1  N  N  N  45.630  41.034  14.292   2.755   1.465   0.008  O6    NOM  22  
NOM  HC1   HC1   H  0  1  N  N  N  50.431  37.353   9.346  -4.652   3.000   0.285  HC1   NOM  23  
NOM  HC2   HC2   H  0  1  N  N  N  49.241  39.115  10.645  -2.230   3.344  -0.017  HC2   NOM  24  
NOM  HC6   HC6   H  0  1  N  N  N  49.984  34.952   9.819  -5.582   0.735   0.389  HC6   NOM  25  
NOM  HO2   HO2   H  0  1  N  N  N  48.649  33.378  10.991  -4.195  -1.751   1.142  HO2   NOM  26  
NOM  HC13  HC13  H  0  0  N  N  N  46.816  39.391  13.958   2.247   0.331  -1.652  HC13  NOM  27  
NOM  HC14  HC14  H  0  0  N  N  N  43.626  38.764  14.100   2.310  -1.006   1.113  HC14  NOM  28  
NOM  HC11  HC11  H  0  0  N  N  N  46.100  36.553  15.118   0.505  -2.901  -1.150  HC11  NOM  29  
NOM  H121  1H12  H  0  0  N  N  N  45.168  34.547  14.851   1.280  -2.305   1.731  H121  NOM  30  
NOM  H122  2H12  H  0  0  N  N  N  43.600  35.091  15.536  -0.165  -3.199   1.202  H122  NOM  31  
NOM  H123  3H12  H  0  0  N  N  N  43.933  35.126  13.772   1.456  -3.872   0.905  H123  NOM  32  
NOM  H151  1H15  H  0  0  N  N  N  44.166  39.907  16.852   4.707  -0.942   0.839  H151  NOM  33  
NOM  H152  2H15  H  0  0  N  N  N  42.892  40.219  15.850   4.574  -0.625  -0.924  H152  NOM  34  
#   #
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
NOM  C1   C2    DOUB  Y  N   1  
NOM  C1   C6    SING  Y  N   2  
NOM  C1   HC1   SING  N  N   3  
NOM  C2   C3    SING  Y  N   4  
NOM  C2   HC2   SING  N  N   5  
NOM  C3   C4    DOUB  Y  N   6  
NOM  C3   C10   SING  N  N   7  
NOM  C4   C5    SING  Y  N   8  
NOM  C4   C7    SING  N  N   9  
NOM  C5   C6    DOUB  Y  N  10  
NOM  C5   O2    SING  N  N  11  
NOM  C6   HC6   SING  N  N  12  
NOM  C10  C9    SING  N  N  13  
NOM  C10  O4    DOUB  N  N  14  
NOM  C9   C8    DOUB  N  N  15  
NOM  C9   C13   SING  N  N  16  
NOM  C8   C7    SING  N  N  17  
NOM  C8   C11   SING  N  N  18  
NOM  C7   O3    DOUB  N  N  19  
NOM  O2   HO2   SING  N  N  20  
NOM  C13  C14   SING  N  N  21  
NOM  C13  O6    SING  N  N  22  
NOM  C13  HC13  SING  N  N  23  
NOM  C14  O1    SING  N  N  24  
NOM  C14  C15   SING  N  N  25  
NOM  C14  HC14  SING  N  N  26  
NOM  O1   C11   SING  N  N  27  
NOM  C11  C12   SING  N  N  28  
NOM  C11  HC11  SING  N  N  29  
NOM  C12  H121  SING  N  N  30  
NOM  C12  H122  SING  N  N  31  
NOM  C12  H123  SING  N  N  32  
NOM  C15  C16   SING  N  N  33  
NOM  C15  H151  SING  N  N  34  
NOM  C15  H152  SING  N  N  35  
NOM  C16  O5    DOUB  N  N  36  
NOM  C16  O6    SING  N  N  37  
#   #
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id
_pdbx_chem_comp_descriptor.type
_pdbx_chem_comp_descriptor.program
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor
NOM  SMILES            ACDLabs               10.04  "O=C1C3=C(C(=O)c2c1cccc2O)C(OC4CC(=O)OC34)C"  
NOM  SMILES_CANONICAL  CACTVS                3.341  "C[C@@H]1O[C@H]2CC(=O)O[C@@H]2C3=C1C(=O)c4c(O)cccc4C3=O"  
NOM  SMILES            CACTVS                3.341  "C[CH]1O[CH]2CC(=O)O[CH]2C3=C1C(=O)c4c(O)cccc4C3=O"  
NOM  SMILES_CANONICAL  "OpenEye OEToolkits"  1.5.0  "C[C@H]1C2=C(C3[C@@H](O1)CC(=O)O3)C(=O)c4cccc(c4C2=O)O"  
NOM  SMILES            "OpenEye OEToolkits"  1.5.0  "CC1C2=C(C3C(O1)CC(=O)O3)C(=O)c4cccc(c4C2=O)O"  
NOM  InChI             InChI                 1.03   "InChI=1S/C16H12O6/c1-6-11-13(16-9(21-6)5-10(18)22-16)14(19)7-3-2-4-8(17)12(7)15(11)20/h2-4,6,9,16-17H,5H2,1H3/t6-,9-,16-/m0/s1"  
NOM  InChIKey          InChI                 1.03   XUWPJKDMEZSVTP-UOSCCXBLSA-N  
#
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id          NOM
_pdbx_chem_comp_identifier.type             "SYSTEMATIC NAME"
_pdbx_chem_comp_identifier.program          ACDLabs
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version  10.04
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier       "(3aS,5S,11bR)-7-hydroxy-5-methyl-3,3a,5,11b-tetrahydro-2H-benzo[g]furo[3,2-c]isochromene-2,6,11-trione"
#   #
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id
_pdbx_chem_comp_audit.action_type
_pdbx_chem_comp_audit.date
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site
NOM  "Create component"   2002-12-10  RCSB  
NOM  "Modify descriptor"  2011-06-04  RCSB  
NOM  "Modify synonyms"    2020-06-05  PDBE  
#
_pdbx_chem_comp_synonyms.ordinal     1
_pdbx_chem_comp_synonyms.comp_id     NOM
_pdbx_chem_comp_synonyms.name        "NANAOMYCIN D"
_pdbx_chem_comp_synonyms.provenance  ?
_pdbx_chem_comp_synonyms.type        ?
##