data_Q1Z
#
_chem_comp.id Q1Z
_chem_comp.name "(3~{R})-3-methyl-2-oxidanylidene-pentanedioic acid"
_chem_comp.type non-polymer
_chem_comp.pdbx_type HETAIN
_chem_comp.formula "C6 H8 O5"
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ?
_chem_comp.pdbx_synonyms ?
_chem_comp.pdbx_formal_charge 0
_chem_comp.pdbx_initial_date 2020-05-06
_chem_comp.pdbx_modified_date 2021-03-12
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N
_chem_comp.pdbx_release_status REL
_chem_comp.pdbx_replaced_by ?
_chem_comp.pdbx_replaces ?
_chem_comp.formula_weight 160.125
_chem_comp.one_letter_code ?
_chem_comp.three_letter_code Q1Z
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ?
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details Corina
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 6YYV
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list ?
_chem_comp.pdbx_processing_site PDBE
# #
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.alt_atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.pdbx_align
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config
_chem_comp_atom.model_Cartn_x
_chem_comp_atom.model_Cartn_y
_chem_comp_atom.model_Cartn_z
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal
Q1Z C01 C1 C 0 1 N N N -10.361 8.001 -14.742 1.167 -0.491 0.115 C01 Q1Z 1
Q1Z C02 C2 C 0 1 N N R -10.823 8.076 -13.224 -0.151 0.240 0.100 C02 Q1Z 2
Q1Z C03 C3 C 0 1 N N N -10.541 9.550 -12.553 -1.288 -0.765 -0.098 C03 Q1Z 3
Q1Z C04 C4 C 0 1 N N N -12.307 7.533 -13.122 -0.343 0.973 1.429 C04 Q1Z 4
Q1Z C05 C5 C 0 1 N N N -9.087 8.441 -15.106 2.420 0.223 -0.262 C05 Q1Z 5
Q1Z C06 C6 C 0 1 N N N -10.814 9.537 -11.069 -2.593 -0.024 -0.236 C06 Q1Z 6
Q1Z O01 O1 O 0 1 N N N -11.046 7.483 -15.626 1.209 -1.654 0.438 O01 Q1Z 7
Q1Z O02 O2 O 0 1 N N N -8.722 8.410 -16.309 2.379 1.393 -0.581 O02 Q1Z 8
Q1Z O03 O3 O 0 1 N N N -8.113 8.920 -14.316 3.597 -0.429 -0.248 O03 Q1Z 9
Q1Z O04 O4 O 0 1 N N N -10.671 8.483 -10.512 -3.735 -0.705 -0.419 O04 Q1Z 10
Q1Z O05 O5 O 0 1 N N N -11.057 10.758 -10.602 -2.612 1.183 -0.183 O05 Q1Z 11
Q1Z H01 H1 H 0 1 N N N -10.191 7.366 -12.670 -0.157 0.961 -0.718 H01 Q1Z 12
Q1Z H02 H2 H 0 1 N N N -9.489 9.825 -12.722 -1.104 -1.349 -0.999 H02 Q1Z 13
Q1Z H03 H3 H 0 1 N N N -11.196 10.293 -13.032 -1.338 -1.431 0.763 H03 Q1Z 14
Q1Z H04 H4 H 0 1 N N N -12.643 7.578 -12.076 0.468 1.689 1.569 H04 Q1Z 15
Q1Z H05 H5 H 0 1 N N N -12.968 8.152 -13.746 -1.296 1.502 1.417 H05 Q1Z 16
Q1Z H06 H6 H 0 1 N N N -12.341 6.491 -13.474 -0.337 0.252 2.246 H06 Q1Z 17
Q1Z H1 H7 H 0 1 N N N -7.353 9.133 -14.844 4.382 0.076 -0.500 H1 Q1Z 18
Q1Z H2 H8 H 0 1 N N N -10.757 8.606 -9.574 -4.547 -0.187 -0.503 H2 Q1Z 19
# #
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
Q1Z O02 C05 DOUB N N 1
Q1Z O01 C01 DOUB N N 2
Q1Z C05 C01 SING N N 3
Q1Z C05 O03 SING N N 4
Q1Z C01 C02 SING N N 5
Q1Z C02 C04 SING N N 6
Q1Z C02 C03 SING N N 7
Q1Z C03 C06 SING N N 8
Q1Z C06 O05 DOUB N N 9
Q1Z C06 O04 SING N N 10
Q1Z C02 H01 SING N N 11
Q1Z C03 H02 SING N N 12
Q1Z C03 H03 SING N N 13
Q1Z C04 H04 SING N N 14
Q1Z C04 H05 SING N N 15
Q1Z C04 H06 SING N N 16
Q1Z O03 H1 SING N N 17
Q1Z O04 H2 SING N N 18
# #
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id
_pdbx_chem_comp_descriptor.type
_pdbx_chem_comp_descriptor.program
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor
Q1Z InChI InChI 1.03 "InChI=1S/C6H8O5/c1-3(2-4(7)8)5(9)6(10)11/h3H,2H2,1H3,(H,7,8)(H,10,11)/t3-/m1/s1"
Q1Z InChIKey InChI 1.03 BJQIUPTURRAODO-GSVOUGTGSA-N
Q1Z SMILES_CANONICAL CACTVS 3.385 "C[C@H](CC(O)=O)C(=O)C(O)=O"
Q1Z SMILES CACTVS 3.385 "C[CH](CC(O)=O)C(=O)C(O)=O"
Q1Z SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "C[C@H](CC(=O)O)C(=O)C(=O)O"
Q1Z SMILES "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "CC(CC(=O)O)C(=O)C(=O)O"
#
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id Q1Z
_pdbx_chem_comp_identifier.type "SYSTEMATIC NAME"
_pdbx_chem_comp_identifier.program "OpenEye OEToolkits"
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version 2.0.7
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier "(3~{R})-3-methyl-2-oxidanylidene-pentanedioic acid"
# #
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id
_pdbx_chem_comp_audit.action_type
_pdbx_chem_comp_audit.date
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site
Q1Z "Create component" 2020-05-06 PDBE
Q1Z "Initial release" 2021-03-17 RCSB
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