data_SEI
#
_chem_comp.id SEI
_chem_comp.name "1-{3-METHYL-2-[4-(MORPHOLINE-4-CARBONYL)-BENZOYLAMINO]-BUTYRYL}-PYRROLIDINE-2-CARBOXYLIC ACID (3,3,4,4,4-PENTAFLUORO-1-ISOPROPYL-2-OXO-BUTYL)-AMIDE"
_chem_comp.type NON-POLYMER
_chem_comp.pdbx_type HETAIN
_chem_comp.formula "C29 H37 F5 N4 O6"
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ?
_chem_comp.pdbx_synonyms "MDL 101,146"
_chem_comp.pdbx_formal_charge 0
_chem_comp.pdbx_initial_date 1999-07-08
_chem_comp.pdbx_modified_date 2024-09-27
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N
_chem_comp.pdbx_release_status REL
_chem_comp.pdbx_replaced_by ?
_chem_comp.pdbx_replaces ?
_chem_comp.formula_weight 632.619
_chem_comp.one_letter_code ?
_chem_comp.three_letter_code SEI
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ?
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details ?
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 1B0E
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list ?
_chem_comp.pdbx_processing_site EBI
_chem_comp.pdbx_pcm Y
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.alt_atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
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_chem_comp_atom.pdbx_align
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config
_chem_comp_atom.pdbx_backbone_atom_flag
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_chem_comp_atom.pdbx_c_terminal_atom_flag
_chem_comp_atom.model_Cartn_x
_chem_comp_atom.model_Cartn_y
_chem_comp_atom.model_Cartn_z
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal
SEI C2 C2 C 0 1 N N N N N N 1.080 86.943 25.185 -2.575 -0.657 -10.540 C2 SEI 1
SEI C3 C3 C 0 1 N N N N N N 2.519 86.775 24.704 -1.904 0.631 -10.054 C3 SEI 2
SEI C15 C15 C 0 1 N N N N N N 4.127 84.990 24.074 -0.002 0.746 -8.500 C15 SEI 3
SEI C19 C19 C 0 1 Y N N N N N 4.828 80.815 23.241 1.624 0.274 -4.598 C19 SEI 4
SEI C20 C20 C 0 1 Y N N N N N 3.672 81.451 22.670 2.438 0.105 -5.718 C20 SEI 5
SEI C21 C21 C 0 1 Y N N N N N 3.388 82.790 22.998 1.911 0.258 -6.982 C21 SEI 6
SEI C22 C22 C 0 1 Y N N N N N 4.277 83.510 23.854 0.563 0.581 -7.142 C22 SEI 7
SEI C27 C27 C 0 1 N N N N N N 5.098 79.408 22.898 2.190 0.110 -3.240 C27 SEI 8
SEI C30 C30 C 0 1 N N N N N N 7.627 77.788 21.087 2.491 1.457 -0.315 C30 SEI 9
SEI C31 C31 C 0 1 N N N N N N 6.839 78.484 19.970 1.337 2.458 -0.233 C31 SEI 10
SEI C35 C35 C 0 1 N N N N N N 8.075 76.399 20.626 3.111 1.280 1.071 C35 SEI 11
SEI O1 O1 O 0 1 N N N N N N 0.235 85.826 24.866 -3.486 -1.127 -9.548 O1 SEI 12
SEI N4 N4 N 0 1 N N N N N N 3.014 85.382 24.792 -1.266 0.355 -8.755 N4 SEI 13
SEI C5 C5 C 0 1 N N N N N N 2.178 84.466 25.591 -2.060 -0.370 -7.749 C5 SEI 14
SEI C6 C6 C 0 1 N N N N N N 0.769 84.494 25.012 -2.719 -1.570 -8.429 C6 SEI 15
SEI O16 O16 O 0 1 N N N N N N 4.961 85.804 23.657 0.673 1.234 -9.384 O16 SEI 16
SEI C17 C17 C 0 1 Y N N N N N 5.379 82.841 24.479 -0.250 0.749 -6.021 C17 SEI 17
SEI C18 C18 C 0 1 Y N N N N N 5.671 81.506 24.152 0.274 0.591 -4.757 C18 SEI 18
SEI N28 N28 N 0 1 N N N N N N 6.396 79.033 22.847 1.403 0.272 -2.157 N28 SEI 19
SEI C29 C29 C 0 1 N N S N N N 6.753 77.679 22.367 1.963 0.110 -0.813 C29 SEI 20
SEI C40 C40 C 0 1 N N N N N N 7.527 76.937 23.472 0.891 -0.385 0.120 C40 SEI 21
SEI O42 O42 O 0 1 N N N N N N 8.730 77.161 23.661 -0.242 0.033 0.020 O42 SEI 22
SEI C44 C44 C 0 1 N N S N N N 7.502 75.178 25.186 0.278 -1.773 2.117 C44 SEI 23
SEI C45 C45 C 0 1 N N N N N N 5.315 75.751 24.122 2.490 -1.973 1.228 C45 SEI 24
SEI C46 C46 C 0 1 N N N N N N 5.049 74.751 25.231 2.163 -3.289 1.976 C46 SEI 25
SEI C47 C47 C 0 1 N N N N N N 6.379 74.370 25.818 1.045 -2.825 2.947 C47 SEI 26
SEI C52 C52 C 0 1 N N N N N N 8.490 74.290 24.426 -0.142 -0.629 3.004 C52 SEI 27
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SEI C61 C61 C 0 1 N N N N N N 11.912 73.766 24.292 -2.660 0.894 4.344 C61 SEI 32
SEI C62 C62 C 0 1 N N N N N N 12.336 74.419 25.599 -3.753 -0.169 4.238 C62 SEI 33
SEI C66 C66 C 0 1 N N N N N N 11.862 74.794 23.181 -3.125 2.012 5.280 C66 SEI 34
SEI C71 C71 C 0 1 N N N N N N 10.733 71.600 24.884 -1.644 -0.251 6.295 C71 SEI 35
SEI C73 C73 C 0 1 N N N N N N 9.357 70.655 24.878 -0.964 0.393 7.475 C73 SEI 36
SEI O74 O74 O 0 1 N N N N N N 11.858 71.094 24.863 -2.398 -1.179 6.465 O74 SEI 37
SEI F75 F75 F 0 1 N N N N N N 9.201 69.668 25.846 -1.342 1.737 7.553 F75 SEI 38
SEI F76 F76 F 0 1 N N N N N N 8.263 71.453 24.919 -1.342 -0.266 8.649 F76 SEI 39
SEI C77 C77 C 0 1 N N N N N N 9.279 69.831 23.611 0.553 0.299 7.303 C77 SEI 40
SEI F78 F78 F 0 1 N N N N N N 9.572 70.664 22.594 1.184 0.897 8.399 F78 SEI 41
SEI F79 F79 F 0 1 N N N N N N 10.195 68.882 23.721 0.931 -1.045 7.225 F79 SEI 42
SEI F80 F80 F 0 1 N N N N N N 8.053 69.266 23.461 0.931 0.959 6.129 F80 SEI 43
SEI O81 O81 O 0 1 N N N N N N 4.180 78.624 22.658 3.364 -0.171 -3.101 O81 SEI 44
SEI H21 1H2 H 0 1 N N N N N N 1.052 87.159 26.278 -3.116 -0.458 -11.465 H21 SEI 45
SEI H22 2H2 H 0 1 N N N N N N 0.642 87.892 24.796 -1.813 -1.416 -10.722 H22 SEI 46
SEI H31 1H3 H 0 1 N N N N N N 2.637 87.170 23.668 -2.654 1.414 -9.936 H31 SEI 47
SEI H32 2H3 H 0 1 N N N N N N 3.200 87.470 25.247 -1.151 0.949 -10.774 H32 SEI 48
SEI H201 1H20 H 0 0 N N N N N N 3.002 80.911 21.979 3.482 -0.144 -5.595 H201 SEI 49
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SEI H351 1H35 H 0 0 N N N N N N 8.647 75.893 21.437 2.333 1.013 1.786 H351 SEI 55
SEI H352 2H35 H 0 0 N N N N N N 7.218 75.780 20.271 3.860 0.488 1.036 H352 SEI 56
SEI H353 3H35 H 0 0 N N N N N N 8.651 76.441 19.672 3.584 2.212 1.380 H353 SEI 57
SEI H51 1H5 H 0 1 N N N N N N 2.600 83.435 25.650 -1.411 -0.714 -6.944 H51 SEI 58
SEI H52 2H5 H 0 1 N N N N N N 2.202 84.698 26.681 -2.827 0.291 -7.347 H52 SEI 59
SEI H61 1H6 H 0 1 N N N N N N 0.081 83.856 25.615 -3.372 -2.077 -7.719 H61 SEI 60
SEI H62 2H6 H 0 1 N N N N N N 0.729 83.943 24.043 -1.947 -2.260 -8.768 H62 SEI 61
SEI H171 1H17 H 0 0 N N N N N N 6.009 83.359 25.220 -1.294 1.000 -6.145 H171 SEI 62
SEI H182 2H18 H 0 0 N N N N N N 6.546 81.009 24.602 -0.355 0.721 -3.890 H182 SEI 63
SEI H281 1H28 H 0 0 N N N N N N 7.070 79.734 23.154 0.466 0.497 -2.268 H281 SEI 64
SEI H291 1H29 H 0 0 N N N N N N 5.824 77.112 22.121 2.780 -0.610 -0.845 H291 SEI 65
SEI H441 1H44 H 0 0 N N N N N N 8.108 75.724 25.945 -0.598 -2.229 1.659 H441 SEI 66
SEI H451 1H45 H 0 0 N N N N N N 4.994 75.406 23.111 2.928 -2.190 0.253 H451 SEI 67
SEI H452 2H45 H 0 0 N N N N N N 4.662 76.654 24.157 3.168 -1.358 1.820 H452 SEI 68
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SEI H462 2H46 H 0 0 N N N N N N 4.454 73.871 24.891 3.031 -3.653 2.526 H462 SEI 70
SEI H471 1H47 H 0 0 N N N N N N 6.565 73.273 25.739 0.394 -3.658 3.213 H471 SEI 71
SEI H472 2H47 H 0 0 N N N N N N 6.380 74.461 26.929 1.474 -2.369 3.839 H472 SEI 72
SEI H531 1H53 H 0 0 N N N N N N 9.691 74.315 26.071 -1.302 -1.746 4.216 H531 SEI 73
SEI H591 1H59 H 0 0 N N N N N N 9.984 72.894 23.470 -0.590 1.008 4.932 H591 SEI 74
SEI H611 1H61 H 0 0 N N N N N N 12.671 72.990 24.037 -2.458 1.308 3.356 H611 SEI 75
SEI H621 1H62 H 0 0 N N N N N N 13.324 74.925 25.499 -4.663 0.281 3.841 H621 SEI 76
SEI H622 2H62 H 0 0 N N N N N N 11.555 75.118 25.978 -3.422 -0.966 3.572 H622 SEI 77
SEI H623 3H62 H 0 0 N N N N N N 12.334 73.687 26.440 -3.955 -0.583 5.227 H623 SEI 78
SEI H661 1H66 H 0 0 N N N N N N 12.850 75.300 23.081 -3.285 1.606 6.279 H661 SEI 79
SEI H662 2H66 H 0 0 N N N N N N 11.522 74.349 22.216 -2.364 2.791 5.322 H662 SEI 80
SEI H663 3H66 H 0 0 N N N N N N 11.032 75.524 23.326 -4.057 2.435 4.906 H663 SEI 81
#
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
SEI C2 C3 SING N N 1
SEI C2 O1 SING N N 2
SEI C2 H21 SING N N 3
SEI C2 H22 SING N N 4
SEI C3 N4 SING N N 5
SEI C3 H31 SING N N 6
SEI C3 H32 SING N N 7
SEI C15 C22 SING N N 8
SEI C15 N4 SING N N 9
SEI C15 O16 DOUB N N 10
SEI C19 C20 DOUB Y N 11
SEI C19 C27 SING N N 12
SEI C19 C18 SING Y N 13
SEI C20 C21 SING Y N 14
SEI C20 H201 SING N N 15
SEI C21 C22 DOUB Y N 16
SEI C21 H211 SING N N 17
SEI C22 C17 SING Y N 18
SEI C27 N28 SING N N 19
SEI C27 O81 DOUB N N 20
SEI C30 C31 SING N N 21
SEI C30 C35 SING N N 22
SEI C30 C29 SING N N 23
SEI C30 H301 SING N N 24
SEI C31 H311 SING N N 25
SEI C31 H312 SING N N 26
SEI C31 H313 SING N N 27
SEI C35 H351 SING N N 28
SEI C35 H352 SING N N 29
SEI C35 H353 SING N N 30
SEI O1 C6 SING N N 31
SEI N4 C5 SING N N 32
SEI C5 C6 SING N N 33
SEI C5 H51 SING N N 34
SEI C5 H52 SING N N 35
SEI C6 H61 SING N N 36
SEI C6 H62 SING N N 37
SEI C17 C18 DOUB Y N 38
SEI C17 H171 SING N N 39
SEI C18 H182 SING N N 40
SEI N28 C29 SING N N 41
SEI N28 H281 SING N N 42
SEI C29 C40 SING N N 43
SEI C29 H291 SING N N 44
SEI C40 O42 DOUB N N 45
SEI C40 N54 SING N N 46
SEI C44 C47 SING N N 47
SEI C44 C52 SING N N 48
SEI C44 N54 SING N N 49
SEI C44 H441 SING N N 50
SEI C45 C46 SING N N 51
SEI C45 N54 SING N N 52
SEI C45 H451 SING N N 53
SEI C45 H452 SING N N 54
SEI C46 C47 SING N N 55
SEI C46 H461 SING N N 56
SEI C46 H462 SING N N 57
SEI C47 H471 SING N N 58
SEI C47 H472 SING N N 59
SEI C52 N53 SING N N 60
SEI C52 O58 DOUB N N 61
SEI N53 C59 SING N N 62
SEI N53 H531 SING N N 63
SEI C59 C61 SING N N 64
SEI C59 C71 SING N N 65
SEI C59 H591 SING N N 66
SEI C61 C62 SING N N 67
SEI C61 C66 SING N N 68
SEI C61 H611 SING N N 69
SEI C62 H621 SING N N 70
SEI C62 H622 SING N N 71
SEI C62 H623 SING N N 72
SEI C66 H661 SING N N 73
SEI C66 H662 SING N N 74
SEI C66 H663 SING N N 75
SEI C71 C73 SING N N 76
SEI C71 O74 DOUB N N 77
SEI C73 F75 SING N N 78
SEI C73 F76 SING N N 79
SEI C73 C77 SING N N 80
SEI C77 F78 SING N N 81
SEI C77 F79 SING N N 82
SEI C77 F80 SING N N 83
#
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id
_pdbx_chem_comp_descriptor.type
_pdbx_chem_comp_descriptor.program
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor
SEI SMILES ACDLabs 10.04 "O=C(c2ccc(C(=O)NC(C(=O)N1C(C(=O)NC(C(=O)C(F)(F)C(F)(F)F)C(C)C)CCC1)C(C)C)cc2)N3CCOCC3"
SEI SMILES_CANONICAL CACTVS 3.341 "CC(C)[C@H](NC(=O)c1ccc(cc1)C(=O)N2CCOCC2)C(=O)N3CCC[C@H]3C(=O)N[C@@H](C(C)C)C(=O)C(F)(F)C(F)(F)F"
SEI SMILES CACTVS 3.341 "CC(C)[CH](NC(=O)c1ccc(cc1)C(=O)N2CCOCC2)C(=O)N3CCC[CH]3C(=O)N[CH](C(C)C)C(=O)C(F)(F)C(F)(F)F"
SEI SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 1.5.0 "CC(C)[C@@H](C(=O)C(C(F)(F)F)(F)F)NC(=O)[C@@H]1CCCN1C(=O)[C@H](C(C)C)NC(=O)c2ccc(cc2)C(=O)N3CCOCC3"
SEI SMILES "OpenEye OEToolkits" 1.5.0 "CC(C)C(C(=O)C(C(F)(F)F)(F)F)NC(=O)C1CCCN1C(=O)C(C(C)C)NC(=O)c2ccc(cc2)C(=O)N3CCOCC3"
SEI InChI InChI 1.03 "InChI=1S/C29H37F5N4O6/c1-16(2)21(23(39)28(30,31)29(32,33)34)35-25(41)20-6-5-11-38(20)27(43)22(17(3)4)36-24(40)18-7-9-19(10-8-18)26(42)37-12-14-44-15-13-37/h7-10,16-17,20-22H,5-6,11-15H2,1-4H3,(H,35,41)(H,36,40)/t20-,21-,22-/m0/s1"
SEI InChIKey InChI 1.03 XQAMVCHQGHAELT-FKBYEOEOSA-N
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SEI "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs 10.04 "N-{[4-(morpholin-4-ylcarbonyl)phenyl]carbonyl}-L-valyl-N-[(1S)-3,3,4,4,4-pentafluoro-1-(1-methylethyl)-2-oxobutyl]-L-prolinamide"
SEI "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 1.5.0 "(2S)-1-[(2S)-3-methyl-2-[(4-morpholin-4-ylcarbonylphenyl)carbonylamino]butanoyl]-N-[(3S)-5,5,6,6,6-pentafluoro-2-methyl-4-oxo-hexan-3-yl]pyrrolidine-2-carboxamide"
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_pdbx_chem_comp_audit.processing_site
SEI "Create component" 1999-07-08 EBI
SEI "Modify descriptor" 2011-06-04 RCSB
SEI "Modify synonyms" 2021-03-13 RCSB
SEI "Modify PCM" 2024-09-27 PDBE
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_pdbx_chem_comp_synonyms.ordinal 1
_pdbx_chem_comp_synonyms.comp_id SEI
_pdbx_chem_comp_synonyms.name "MDL 101,146"
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_pdbx_chem_comp_pcm.comp_id SEI
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_pdbx_chem_comp_pcm.position "Amino-acid side chain"
_pdbx_chem_comp_pcm.polypeptide_position "Any position"
_pdbx_chem_comp_pcm.comp_id_linking_atom C71
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