data_TUD
#
_chem_comp.id TUD
_chem_comp.name "TAUROCHENODEOXYCHOLIC ACID"
_chem_comp.type NON-POLYMER
_chem_comp.pdbx_type HETAIN
_chem_comp.formula "C26 H45 N O6 S"
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ?
_chem_comp.pdbx_synonyms "2-(((3ALPHA,5BETA,7ALPHA)-3,7-DIHYDROXY-24-OXOCHOLAN-24-YL)AMINO)ETHANESULFONIC ACID; TAUROCHENODEOXYCHOLATE"
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_chem_comp.pdbx_replaced_by ?
_chem_comp.pdbx_replaces ?
_chem_comp.formula_weight 499.704
_chem_comp.one_letter_code ?
_chem_comp.three_letter_code TUD
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ?
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details ?
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 2B01
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list ?
_chem_comp.pdbx_processing_site RCSB
# #
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.alt_atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
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_chem_comp_atom.model_Cartn_x
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_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal
TUD C1 C1 C 0 1 N N N 37.126 16.624 17.719 -6.649 1.950 0.314 C1 TUD 1
TUD C2 C2 C 0 1 N N N 37.968 16.699 19.076 -7.041 1.632 -1.130 C2 TUD 2
TUD C3 C3 C 0 1 N N R 37.276 17.669 20.080 -7.952 0.403 -1.152 C3 TUD 3
TUD O3 O3 O 0 1 N N N 38.067 17.728 21.304 -8.318 0.104 -2.501 O3 TUD 4
TUD C4 C4 C 0 1 N N N 37.125 19.123 19.482 -7.212 -0.792 -0.548 C4 TUD 5
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TUD C7 C7 C 0 1 N N R 37.388 21.151 16.889 -4.817 -1.954 0.683 C7 TUD 8
TUD O7 O7 O 0 1 N N N 38.378 21.541 17.895 -5.179 -2.250 -0.667 O7 TUD 9
TUD C8 C8 C 0 1 N N R 38.081 20.168 15.830 -3.906 -0.726 0.709 C8 TUD 10
TUD C9 C9 C 0 1 N N S 38.331 18.708 16.506 -4.638 0.483 0.106 C9 TUD 11
TUD C10 C10 C 0 1 N N S 36.914 18.056 17.048 -5.907 0.755 0.916 C10 TUD 12
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TUD C12 C12 C 0 1 N N N 40.368 18.523 15.025 -2.428 1.457 -0.642 C12 TUD 14
TUD C13 C13 C 0 1 N N R 40.174 19.935 14.257 -1.746 0.274 0.012 C13 TUD 15
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TUD C15 C15 C 0 1 N N N 39.333 22.213 14.557 -1.746 -2.097 0.344 C15 TUD 17
TUD C16 C16 C 0 1 N N N 40.544 22.156 13.533 -0.385 -1.732 -0.308 C16 TUD 18
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TUD C18 C18 C 0 1 N N N 39.281 19.566 12.928 -1.593 0.529 1.512 C18 TUD 20
TUD C19 C19 C 0 1 N N N 35.818 17.722 15.921 -5.512 1.075 2.359 C19 TUD 21
TUD C20 C20 C 0 1 N N R 42.422 20.327 12.774 0.749 0.481 0.141 C20 TUD 22
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TUD C22 C22 C 0 1 N N N 43.692 21.293 12.704 2.069 -0.037 -0.432 C22 TUD 24
TUD C23 C23 C 0 1 N N N 44.597 21.715 13.969 3.236 0.554 0.361 C23 TUD 25
TUD O25 O25 O 0 1 N N N 46.411 22.890 12.985 4.531 -0.717 -1.148 O25 TUD 26
TUD C24 C24 C 0 1 N N N 45.471 22.899 13.956 4.537 0.045 -0.204 C24 TUD 27
TUD N26 N26 N 0 1 N N N 45.393 23.858 14.755 5.707 0.435 0.339 N26 TUD 28
TUD C25 C25 C 0 1 N N N 46.316 24.993 14.667 6.971 -0.061 -0.210 C25 TUD 29
TUD C26 C26 C 0 1 N N N 45.872 26.248 15.456 8.139 0.531 0.583 C26 TUD 30
TUD S27 S27 S 0 1 N N N 46.703 27.430 15.456 9.704 -0.083 -0.097 S27 TUD 31
TUD O28 O28 O 0 1 N N N 45.993 28.448 16.280 9.971 0.471 -1.378 O28 TUD 32
TUD O29 O29 O 0 1 N N N 48.011 27.052 16.023 9.891 -1.464 0.183 O29 TUD 33
TUD O30 O30 O 0 1 N N N 46.897 27.969 14.068 10.750 0.584 0.784 O30 TUD 34
TUD H11 1H1 H 0 1 N N N 36.133 16.218 17.963 -6.001 2.826 0.329 H11 TUD 35
TUD H12 2H1 H 0 1 N N N 37.669 15.984 17.008 -7.547 2.152 0.898 H12 TUD 36
TUD H21 1H2 H 0 1 N N N 38.979 17.070 18.854 -6.144 1.429 -1.714 H21 TUD 37
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TUD H41 1H4 H 0 1 N N N 38.126 19.518 19.255 -6.314 -0.996 -1.132 H41 TUD 41
TUD H42 2H4 H 0 1 N N N 36.617 19.763 20.218 -7.861 -1.668 -0.563 H42 TUD 42
TUD H5 H5 H 0 1 N N N 35.269 18.749 18.445 -7.717 -0.269 1.480 H5 TUD 43
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TUD H8 H8 H 0 1 N N N 37.411 20.034 14.968 -3.615 -0.505 1.736 H8 TUD 48
TUD H9 H9 H 0 1 N N N 38.984 18.801 17.386 -4.921 0.231 -0.916 H9 TUD 49
TUD H111 1H11 H 0 0 N N N 38.419 17.567 14.506 -4.287 2.529 -0.430 H111 TUD 50
TUD H112 2H11 H 0 0 N N N 39.278 16.751 15.791 -3.549 2.035 1.107 H112 TUD 51
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TUD H122 2H12 H 0 0 N N N 40.893 18.733 15.968 -1.794 2.343 -0.597 H122 TUD 53
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TUD H151 1H15 H 0 0 N N N 39.372 23.073 15.242 -2.100 -3.063 -0.017 H151 TUD 55
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TUD H181 1H18 H 0 0 N N N 39.625 18.608 12.510 -2.564 0.782 1.939 H181 TUD 60
TUD H182 2H18 H 0 0 N N N 39.400 20.359 12.175 -1.206 -0.367 1.996 H182 TUD 61
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TUD H191 1H19 H 0 0 N N N 36.070 16.767 15.436 -6.408 1.279 2.945 H191 TUD 63
TUD H192 2H19 H 0 0 N N N 35.810 18.524 15.169 -4.983 0.223 2.788 H192 TUD 64
TUD H193 3H19 H 0 0 N N N 34.824 17.646 16.386 -4.862 1.950 2.373 H193 TUD 65
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TUD H211 1H21 H 0 0 N N N 42.288 18.194 13.223 0.701 2.213 -1.139 H211 TUD 67
TUD H212 2H21 H 0 0 N N N 43.960 18.850 13.245 -0.283 2.362 0.337 H212 TUD 68
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TUD H221 1H22 H 0 0 N N N 43.214 22.252 12.457 2.095 -1.124 -0.360 H221 TUD 70
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TUD H231 1H23 H 0 0 N N N 45.322 20.889 14.024 3.210 1.642 0.289 H231 TUD 72
TUD H232 2H23 H 0 0 N N N 43.886 21.887 14.791 3.153 0.257 1.406 H232 TUD 73
TUD H26 H26 H 0 1 N N N 44.689 23.850 15.466 5.712 1.044 1.094 H26 TUD 74
TUD H251 1H25 H 0 0 N N N 46.355 25.285 13.607 6.997 -1.148 -0.138 H251 TUD 75
TUD H252 2H25 H 0 0 N N N 47.287 24.669 15.070 7.055 0.236 -1.255 H252 TUD 76
TUD H261 1H26 H 0 0 N N N 45.890 25.917 16.505 8.113 1.618 0.511 H261 TUD 77
TUD H262 2H26 H 0 0 N N N 44.906 26.553 15.027 8.055 0.233 1.628 H262 TUD 78
TUD H30 H30 H 0 1 N N N 46.938 28.918 14.099 11.614 0.290 0.464 H30 TUD 79
# #
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
TUD C1 C2 SING N N 1
TUD C1 C10 SING N N 2
TUD C1 H11 SING N N 3
TUD C1 H12 SING N N 4
TUD C2 C3 SING N N 5
TUD C2 H21 SING N N 6
TUD C2 H22 SING N N 7
TUD C3 O3 SING N N 8
TUD C3 C4 SING N N 9
TUD C3 H3 SING N N 10
TUD O3 HO3 SING N N 11
TUD C4 C5 SING N N 12
TUD C4 H41 SING N N 13
TUD C4 H42 SING N N 14
TUD C5 C6 SING N N 15
TUD C5 C10 SING N N 16
TUD C5 H5 SING N N 17
TUD C6 C7 SING N N 18
TUD C6 H61 SING N N 19
TUD C6 H62 SING N N 20
TUD C7 O7 SING N N 21
TUD C7 C8 SING N N 22
TUD C7 H7 SING N N 23
TUD O7 HO7 SING N N 24
TUD C8 C9 SING N N 25
TUD C8 C14 SING N N 26
TUD C8 H8 SING N N 27
TUD C9 C10 SING N N 28
TUD C9 C11 SING N N 29
TUD C9 H9 SING N N 30
TUD C10 C19 SING N N 31
TUD C11 C12 SING N N 32
TUD C11 H111 SING N N 33
TUD C11 H112 SING N N 34
TUD C12 C13 SING N N 35
TUD C12 H121 SING N N 36
TUD C12 H122 SING N N 37
TUD C13 C14 SING N N 38
TUD C13 C17 SING N N 39
TUD C13 C18 SING N N 40
TUD C14 C15 SING N N 41
TUD C14 H14 SING N N 42
TUD C15 C16 SING N N 43
TUD C15 H151 SING N N 44
TUD C15 H152 SING N N 45
TUD C16 C17 SING N N 46
TUD C16 H161 SING N N 47
TUD C16 H162 SING N N 48
TUD C17 C20 SING N N 49
TUD C17 H17 SING N N 50
TUD C18 H181 SING N N 51
TUD C18 H182 SING N N 52
TUD C18 H183 SING N N 53
TUD C19 H191 SING N N 54
TUD C19 H192 SING N N 55
TUD C19 H193 SING N N 56
TUD C20 C21 SING N N 57
TUD C20 C22 SING N N 58
TUD C20 H20 SING N N 59
TUD C21 H211 SING N N 60
TUD C21 H212 SING N N 61
TUD C21 H213 SING N N 62
TUD C22 C23 SING N N 63
TUD C22 H221 SING N N 64
TUD C22 H222 SING N N 65
TUD C23 C24 SING N N 66
TUD C23 H231 SING N N 67
TUD C23 H232 SING N N 68
TUD O25 C24 DOUB N N 69
TUD C24 N26 SING N N 70
TUD N26 C25 SING N N 71
TUD N26 H26 SING N N 72
TUD C25 C26 SING N N 73
TUD C25 H251 SING N N 74
TUD C25 H252 SING N N 75
TUD C26 S27 SING N N 76
TUD C26 H261 SING N N 77
TUD C26 H262 SING N N 78
TUD S27 O28 DOUB N N 79
TUD S27 O29 DOUB N N 80
TUD S27 O30 SING N N 81
TUD O30 H30 SING N N 82
# #
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id
_pdbx_chem_comp_descriptor.type
_pdbx_chem_comp_descriptor.program
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor
TUD SMILES ACDLabs 10.04 "O=S(=O)(O)CCNC(=O)CCC(C4C3(C(C1C(C2(C(CC1O)CC(O)CC2)C)CC3)CC4)C)C"
TUD SMILES_CANONICAL CACTVS 3.341 "C[C@H](CCC(=O)NCC[S](O)(=O)=O)[C@H]1CC[C@H]2[C@@H]3[C@H](O)C[C@@H]4C[C@H](O)CC[C@]4(C)[C@H]3CC[C@]12C"
TUD SMILES CACTVS 3.341 "C[CH](CCC(=O)NCC[S](O)(=O)=O)[CH]1CC[CH]2[CH]3[CH](O)C[CH]4C[CH](O)CC[C]4(C)[CH]3CC[C]12C"
TUD SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 1.5.0 "C[C@H](CCC(=O)NCCS(=O)(=O)O)[C@H]1CC[C@@H]2[C@@]1(CC[C@H]3[C@H]2[C@@H](C[C@H]4[C@@]3(CC[C@H](C4)O)C)O)C"
TUD SMILES "OpenEye OEToolkits" 1.5.0 "CC(CCC(=O)NCCS(=O)(=O)O)C1CCC2C1(CCC3C2C(CC4C3(CCC(C4)O)C)O)C"
TUD InChI InChI 1.03 "InChI=1S/C26H45NO6S/c1-16(4-7-23(30)27-12-13-34(31,32)33)19-5-6-20-24-21(9-11-26(19,20)3)25(2)10-8-18(28)14-17(25)15-22(24)29/h16-22,24,28-29H,4-15H2,1-3H3,(H,27,30)(H,31,32,33)/t16-,17+,18-,19-,20+,21+,22-,24+,25+,26-/m1/s1"
TUD InChIKey InChI 1.03 BHTRKEVKTKCXOH-BJLOMENOSA-N
# #
loop_
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id
_pdbx_chem_comp_identifier.type
_pdbx_chem_comp_identifier.program
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier
TUD "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs 10.04 "2-{[(3beta,5beta,7alpha,14beta,17alpha)-3,7-dihydroxy-24-oxocholan-24-yl]amino}ethanesulfonic acid"
TUD "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 1.5.0 "2-[[(4R)-4-[(3R,5S,7R,8R,9S,10S,13R,14S,17R)-3,7-dihydroxy-10,13-dimethyl-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthren-17-yl]pentanoyl]amino]ethanesulfonic acid"
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_pdbx_chem_comp_audit.processing_site
TUD "Create component" 2005-09-22 RCSB
TUD "Modify descriptor" 2011-06-04 RCSB
TUD "Modify synonyms" 2020-06-05 PDBE
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1 TUD "2-(((3ALPHA,5BETA,7ALPHA)-3,7-DIHYDROXY-24-OXOCHOLAN-24-YL)AMINO)ETHANESULFONIC ACID" ? ?
2 TUD TAUROCHENODEOXYCHOLATE ? ?
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