data_VED # _chem_comp.id VED _chem_comp.name "3-[3-(carboxymethyl)-6-(3-methoxyphenyl)-1-benzofuran-2-yl]benzoic acid" _chem_comp.type non-polymer _chem_comp.pdbx_type HETAIN _chem_comp.formula "C24 H18 O6" _chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ? _chem_comp.pdbx_synonyms ? _chem_comp.pdbx_formal_charge 0 _chem_comp.pdbx_initial_date 2020-08-04 _chem_comp.pdbx_modified_date 2021-08-06 _chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N _chem_comp.pdbx_release_status REL _chem_comp.pdbx_replaced_by ? _chem_comp.pdbx_replaces ? _chem_comp.formula_weight 402.396 _chem_comp.one_letter_code ? _chem_comp.three_letter_code VED _chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ? _chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details Corina _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 6XT3 _chem_comp.pdbx_subcomponent_list ? _chem_comp.pdbx_processing_site RCSB # # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.alt_atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.charge _chem_comp_atom.pdbx_align _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.model_Cartn_x _chem_comp_atom.model_Cartn_y _chem_comp_atom.model_Cartn_z _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal _chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id _chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id _chem_comp_atom.pdbx_ordinal VED C10 C1 C 0 1 Y N N 21.693 -5.492 0.751 -5.138 1.281 0.040 C10 VED 1 VED C17 C2 C 0 1 Y N N 19.419 -11.471 4.263 1.760 0.853 0.320 C17 VED 2 VED C20 C3 C 0 1 Y N N 17.497 -14.646 5.238 5.331 -0.233 -0.044 C20 VED 3 VED C21 C4 C 0 1 Y N N 17.282 -15.599 6.243 6.598 0.318 -0.143 C21 VED 4 VED C24 C5 C 0 1 Y N N 17.770 -15.366 7.537 6.760 1.696 -0.113 C24 VED 5 VED C26 C6 C 0 1 Y N N 18.655 -13.226 6.743 4.393 1.983 0.114 C26 VED 6 VED C28 C7 C 0 1 Y N N 17.686 -11.534 2.078 1.452 -1.920 0.258 C28 VED 7 VED C02 C8 C 0 1 N N N 17.244 -8.408 -0.151 -2.262 -3.011 -0.878 C02 VED 8 VED C03 C9 C 0 1 N N N 18.650 -9.099 -0.151 -1.799 -2.670 0.515 C03 VED 9 VED C04 C10 C 0 1 Y N N 19.181 -9.522 1.170 -1.104 -1.333 0.500 C04 VED 10 VED C05 C11 C 0 1 Y N N 20.268 -8.958 1.788 -1.684 -0.112 0.592 C05 VED 11 VED C06 C12 C 0 1 Y N N 21.219 -7.842 1.437 -3.136 0.130 0.728 C06 VED 12 VED C07 C13 C 0 1 Y N N 22.612 -8.058 1.437 -3.877 -0.571 1.683 C07 VED 13 VED C08 C14 C 0 1 Y N N 23.515 -7.037 1.111 -5.233 -0.346 1.811 C08 VED 14 VED C09 C15 C 0 1 Y N N 23.065 -5.756 0.767 -5.866 0.573 0.998 C09 VED 15 VED C11 C16 C 0 1 N N N 21.191 -4.060 0.366 -5.817 2.269 -0.825 C11 VED 16 VED C14 C17 C 0 1 Y N N 20.809 -6.541 1.082 -3.769 1.059 -0.095 C14 VED 17 VED C16 C18 C 0 1 Y N N 19.551 -10.584 3.169 0.489 0.308 0.414 C16 VED 18 VED C18 C19 C 0 1 Y N N 18.385 -12.426 4.286 2.863 0.016 0.191 C18 VED 19 VED C19 C20 C 0 1 Y N N 18.176 -13.432 5.422 4.222 0.599 0.085 C19 VED 20 VED C23 C21 C 0 1 N N N 17.138 -17.620 4.916 8.959 0.146 -0.366 C23 VED 21 VED C25 C22 C 0 1 Y N N 18.456 -14.166 7.771 5.659 2.523 0.015 C25 VED 22 VED C27 C23 C 0 1 Y N N 17.536 -12.418 3.146 2.698 -1.372 0.162 C27 VED 23 VED C29 C24 C 0 1 Y N N 18.700 -10.578 2.042 0.335 -1.091 0.377 C29 VED 24 VED O01 O1 O 0 1 N N N 16.432 -8.761 -1.057 -2.049 -2.247 -1.790 O01 VED 25 VED O12 O2 O 0 1 N N N 20.256 -3.968 -0.476 -5.182 2.884 -1.658 O12 VED 26 VED O13 O3 O 0 1 N N N 21.715 -3.062 0.890 -7.139 2.486 -0.690 O13 VED 27 VED O15 O4 O 0 1 Y N N 20.516 -9.593 3.020 -0.740 0.848 0.543 O15 VED 28 VED O22 O5 O 0 1 N N N 16.594 -16.767 5.936 7.683 -0.491 -0.269 O22 VED 29 VED O30 O6 O 0 1 N N N 16.988 -7.562 0.709 -2.911 -4.164 -1.106 O30 VED 30 VED H171 H1 H 0 0 N N N 20.116 -11.415 5.086 1.892 1.925 0.342 H171 VED 31 VED H201 H2 H 0 0 N N N 17.113 -14.861 4.252 5.203 -1.305 -0.071 H201 VED 32 VED H241 H3 H 0 0 N N N 17.622 -16.087 8.327 7.749 2.124 -0.190 H241 VED 33 VED H261 H4 H 0 0 N N N 19.191 -12.315 6.967 3.536 2.631 0.215 H261 VED 34 VED H281 H5 H 0 0 N N N 16.994 -11.592 1.251 1.330 -2.993 0.235 H281 VED 35 VED H032 H6 H 0 0 N N N 18.582 -9.995 -0.786 -2.660 -2.624 1.183 H032 VED 36 VED H031 H7 H 0 0 N N N 19.370 -8.392 -0.590 -1.108 -3.435 0.866 H031 VED 37 VED H071 H8 H 0 0 N N N 22.993 -9.035 1.695 -3.387 -1.291 2.322 H071 VED 38 VED H081 H9 H 0 0 N N N 24.575 -7.241 1.125 -5.800 -0.891 2.551 H081 VED 39 VED H091 H10 H 0 0 N N N 23.772 -4.979 0.516 -6.927 0.744 1.104 H091 VED 40 VED H141 H11 H 0 0 N N N 19.749 -6.333 1.062 -3.201 1.603 -0.835 H141 VED 41 VED H233 H12 H 0 0 N N N 16.488 -18.498 4.786 8.975 0.796 -1.241 H233 VED 42 VED H231 H13 H 0 0 N N N 17.198 -17.065 3.968 9.138 0.739 0.530 H231 VED 43 VED H232 H14 H 0 0 N N N 18.145 -17.950 5.212 9.736 -0.612 -0.462 H232 VED 44 VED H251 H15 H 0 0 N N N 18.839 -13.959 8.759 5.791 3.595 0.039 H251 VED 45 VED H271 H16 H 0 0 N N N 16.730 -13.136 3.105 3.562 -2.014 0.070 H271 VED 46 VED H1 H17 H 0 1 N N N 21.302 -2.275 0.555 -7.539 3.142 -1.278 H1 VED 47 VED H2 H18 H 0 1 N N N 16.106 -7.233 0.578 -3.188 -4.339 -2.016 H2 VED 48 # # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal VED O01 C02 DOUB N N 1 VED O12 C11 DOUB N N 2 VED C03 C02 SING N N 3 VED C03 C04 SING N N 4 VED C02 O30 SING N N 5 VED C11 C10 SING N N 6 VED C11 O13 SING N N 7 VED C10 C09 DOUB Y N 8 VED C10 C14 SING Y N 9 VED C09 C08 SING Y N 10 VED C14 C06 DOUB Y N 11 VED C08 C07 DOUB Y N 12 VED C04 C05 DOUB Y N 13 VED C04 C29 SING Y N 14 VED C07 C06 SING Y N 15 VED C06 C05 SING N N 16 VED C05 O15 SING Y N 17 VED C29 C28 DOUB Y N 18 VED C29 C16 SING Y N 19 VED C28 C27 SING Y N 20 VED O15 C16 SING Y N 21 VED C27 C18 DOUB Y N 22 VED C16 C17 DOUB Y N 23 VED C17 C18 SING Y N 24 VED C18 C19 SING N N 25 VED C23 O22 SING N N 26 VED C20 C19 DOUB Y N 27 VED C20 C21 SING Y N 28 VED C19 C26 SING Y N 29 VED O22 C21 SING N N 30 VED C21 C24 DOUB Y N 31 VED C26 C25 DOUB Y N 32 VED C24 C25 SING Y N 33 VED C17 H171 SING N N 34 VED C20 H201 SING N N 35 VED C24 H241 SING N N 36 VED C26 H261 SING N N 37 VED C28 H281 SING N N 38 VED C03 H032 SING N N 39 VED C03 H031 SING N N 40 VED C07 H071 SING N N 41 VED C08 H081 SING N N 42 VED C09 H091 SING N N 43 VED C14 H141 SING N N 44 VED C23 H233 SING N N 45 VED C23 H231 SING N N 46 VED C23 H232 SING N N 47 VED C25 H251 SING N N 48 VED C27 H271 SING N N 49 VED O13 H1 SING N N 50 VED O30 H2 SING N N 51 # # loop_ _pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id _pdbx_chem_comp_descriptor.type _pdbx_chem_comp_descriptor.program _pdbx_chem_comp_descriptor.program_version _pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor VED SMILES ACDLabs 12.01 "c4(cccc(c2c(CC(O)=O)c1ccc(cc1o2)c3cc(ccc3)OC)c4)C(O)=O" VED InChI InChI 1.03 "InChI=1S/C24H18O6/c1-29-18-7-3-4-14(11-18)15-8-9-19-20(13-22(25)26)23(30-21(19)12-15)16-5-2-6-17(10-16)24(27)28/h2-12H,13H2,1H3,(H,25,26)(H,27,28)" VED InChIKey InChI 1.03 OXXURMYRXBYXOG-UHFFFAOYSA-N VED SMILES_CANONICAL CACTVS 3.385 "COc1cccc(c1)c2ccc3c(CC(O)=O)c(oc3c2)c4cccc(c4)C(O)=O" VED SMILES CACTVS 3.385 "COc1cccc(c1)c2ccc3c(CC(O)=O)c(oc3c2)c4cccc(c4)C(O)=O" VED SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "COc1cccc(c1)c2ccc3c(c2)oc(c3CC(=O)O)c4cccc(c4)C(=O)O" VED SMILES "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "COc1cccc(c1)c2ccc3c(c2)oc(c3CC(=O)O)c4cccc(c4)C(=O)O" # # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier VED "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs 12.01 "3-[3-(carboxymethyl)-6-(3-methoxyphenyl)-1-benzofuran-2-yl]benzoic acid" VED "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "3-[3-(2-hydroxy-2-oxoethyl)-6-(3-methoxyphenyl)-1-benzofuran-2-yl]benzoic acid" # # loop_ _pdbx_chem_comp_audit.comp_id _pdbx_chem_comp_audit.action_type _pdbx_chem_comp_audit.date _pdbx_chem_comp_audit.processing_site VED "Create component" 2020-08-04 RCSB VED "Initial release" 2021-08-11 RCSB ##