data_YQ1
#
_chem_comp.id YQ1
_chem_comp.name "1-(tripentyl-$l^{4}-azanyl)pentane"
_chem_comp.type non-polymer
_chem_comp.pdbx_type HETAIN
_chem_comp.formula "C20 H44 N"
_chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id ?
_chem_comp.pdbx_synonyms ?
_chem_comp.pdbx_formal_charge 0
_chem_comp.pdbx_initial_date 2021-03-22
_chem_comp.pdbx_modified_date 2022-09-16
_chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N
_chem_comp.pdbx_release_status REL
_chem_comp.pdbx_replaced_by ?
_chem_comp.pdbx_replaces ?
_chem_comp.formula_weight 298.570
_chem_comp.one_letter_code ?
_chem_comp.three_letter_code YQ1
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ?
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details Corina
_chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag Y
_chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 5BKJ
_chem_comp.pdbx_subcomponent_list ?
_chem_comp.pdbx_processing_site RCSB
#
loop_
_chem_comp_atom.comp_id
_chem_comp_atom.atom_id
_chem_comp_atom.alt_atom_id
_chem_comp_atom.type_symbol
_chem_comp_atom.charge
_chem_comp_atom.pdbx_align
_chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag
_chem_comp_atom.pdbx_stereo_config
_chem_comp_atom.model_Cartn_x
_chem_comp_atom.model_Cartn_y
_chem_comp_atom.model_Cartn_z
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal
_chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id
_chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id
_chem_comp_atom.pdbx_ordinal
YQ1 N01 N1 N 0 1 N N N 132.007 131.996 103.327 ? ? ? N01 YQ1 1
YQ1 C01 C1 C 0 1 N N N 130.924 131.471 102.486 ? ? ? C01 YQ1 2
YQ1 C02 C2 C 0 1 N N N 129.809 130.922 103.378 ? ? ? C02 YQ1 3
YQ1 C03 C3 C 0 1 N N N 128.678 130.374 102.503 ? ? ? C03 YQ1 4
YQ1 C04 C4 C 0 1 N N N 127.563 129.826 103.396 ? ? ? C04 YQ1 5
YQ1 C05 C5 C 0 1 N N N 126.433 129.279 102.520 ? ? ? C05 YQ1 6
YQ1 C06 C6 C 0 1 N N N 133.078 132.523 102.470 ? ? ? C06 YQ1 7
YQ1 C07 C7 C 0 1 N N N 134.208 133.069 103.345 ? ? ? C07 YQ1 8
YQ1 C08 C8 C 0 1 N N N 135.323 133.619 102.453 ? ? ? C08 YQ1 9
YQ1 C09 C9 C 0 1 N N N 136.453 134.166 103.328 ? ? ? C09 YQ1 10
YQ1 C10 C10 C 0 1 N N N 137.569 134.714 102.436 ? ? ? C10 YQ1 11
YQ1 C11 C11 C 0 1 N N N 131.488 133.073 104.180 ? ? ? C11 YQ1 12
YQ1 C12 C12 C 0 1 N N N 130.933 134.196 103.302 ? ? ? C12 YQ1 13
YQ1 C13 C13 C 0 1 N N N 130.392 135.318 104.190 ? ? ? C13 YQ1 14
YQ1 C14 C14 C 0 1 N N N 129.839 136.441 103.312 ? ? ? C14 YQ1 15
YQ1 C15 C15 C 0 1 N N N 129.297 137.563 104.201 ? ? ? C15 YQ1 16
YQ1 C16 C16 C 0 1 N N N 132.541 130.918 104.169 ? ? ? C16 YQ1 17
YQ1 C17 C17 C 0 1 N N N 133.082 129.797 103.281 ? ? ? C17 YQ1 18
YQ1 C18 C18 C 0 1 N N N 133.636 128.673 104.159 ? ? ? C18 YQ1 19
YQ1 C19 C19 C 0 1 N N N 134.177 127.551 103.270 ? ? ? C19 YQ1 20
YQ1 C20 C20 C 0 1 N N N 134.733 126.427 104.147 ? ? ? C20 YQ1 21
YQ1 H1 H1 H 0 1 N N N 130.525 132.279 101.855 ? ? ? H1 YQ1 22
YQ1 H2 H2 H 0 1 N N N 131.313 130.665 101.847 ? ? ? H2 YQ1 23
YQ1 H3 H3 H 0 1 N N N 130.208 130.114 104.009 ? ? ? H3 YQ1 24
YQ1 H4 H4 H 0 1 N N N 129.420 131.728 104.017 ? ? ? H4 YQ1 25
YQ1 H5 H5 H 0 1 N N N 128.279 131.181 101.871 ? ? ? H5 YQ1 26
YQ1 H6 H6 H 0 1 N N N 129.066 129.567 101.864 ? ? ? H6 YQ1 27
YQ1 H7 H7 H 0 1 N N N 127.962 129.018 104.027 ? ? ? H7 YQ1 28
YQ1 H8 H8 H 0 1 N N N 127.174 130.633 104.035 ? ? ? H8 YQ1 29
YQ1 H9 H9 H 0 1 N N N 125.630 128.884 103.160 ? ? ? H9 YQ1 30
YQ1 H10 H10 H 0 1 N N N 126.035 130.087 101.889 ? ? ? H10 YQ1 31
YQ1 H11 H11 H 0 1 N N N 126.822 128.473 101.881 ? ? ? H11 YQ1 32
YQ1 H12 H12 H 0 1 N N N 133.466 131.717 101.830 ? ? ? H12 YQ1 33
YQ1 H13 H13 H 0 1 N N N 132.679 133.331 101.839 ? ? ? H13 YQ1 34
YQ1 H14 H14 H 0 1 N N N 134.607 132.260 103.975 ? ? ? H14 YQ1 35
YQ1 H15 H15 H 0 1 N N N 133.819 133.875 103.985 ? ? ? H15 YQ1 36
YQ1 H16 H16 H 0 1 N N N 134.923 134.427 101.823 ? ? ? H16 YQ1 37
YQ1 H17 H17 H 0 1 N N N 135.712 132.813 101.813 ? ? ? H17 YQ1 38
YQ1 H18 H18 H 0 1 N N N 136.852 133.358 103.959 ? ? ? H18 YQ1 39
YQ1 H19 H19 H 0 1 N N N 136.064 134.973 103.967 ? ? ? H19 YQ1 40
YQ1 H20 H20 H 0 1 N N N 138.382 135.107 103.064 ? ? ? H20 YQ1 41
YQ1 H21 H21 H 0 1 N N N 137.957 133.907 101.797 ? ? ? H21 YQ1 42
YQ1 H22 H22 H 0 1 N N N 137.170 135.522 101.805 ? ? ? H22 YQ1 43
YQ1 H23 H23 H 0 1 N N N 132.300 133.467 104.809 ? ? ? H23 YQ1 44
YQ1 H24 H24 H 0 1 N N N 130.686 132.679 104.821 ? ? ? H24 YQ1 45
YQ1 H25 H25 H 0 1 N N N 131.735 134.590 102.661 ? ? ? H25 YQ1 46
YQ1 H26 H26 H 0 1 N N N 130.121 133.802 102.673 ? ? ? H26 YQ1 47
YQ1 H27 H27 H 0 1 N N N 129.589 134.924 104.830 ? ? ? H27 YQ1 48
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YQ1 H29 H29 H 0 1 N N N 130.642 136.836 102.672 ? ? ? H29 YQ1 50
YQ1 H30 H30 H 0 1 N N N 129.028 136.048 102.682 ? ? ? H30 YQ1 51
YQ1 H31 H31 H 0 1 N N N 128.899 138.371 103.570 ? ? ? H31 YQ1 52
YQ1 H32 H32 H 0 1 N N N 128.494 137.168 104.841 ? ? ? H32 YQ1 53
YQ1 H33 H33 H 0 1 N N N 130.109 137.956 104.831 ? ? ? H33 YQ1 54
YQ1 H34 H34 H 0 1 N N N 131.740 130.523 104.811 ? ? ? H34 YQ1 55
YQ1 H35 H35 H 0 1 N N N 133.353 131.312 104.798 ? ? ? H35 YQ1 56
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YQ1 H38 H38 H 0 1 N N N 132.833 128.279 104.800 ? ? ? H38 YQ1 59
YQ1 H39 H39 H 0 1 N N N 134.448 129.066 104.789 ? ? ? H39 YQ1 60
YQ1 H40 H40 H 0 1 N N N 134.979 127.946 102.629 ? ? ? H40 YQ1 61
YQ1 H41 H41 H 0 1 N N N 133.365 127.158 102.641 ? ? ? H41 YQ1 62
YQ1 H42 H42 H 0 1 N N N 135.122 125.621 103.508 ? ? ? H42 YQ1 63
YQ1 H43 H43 H 0 1 N N N 135.545 126.820 104.776 ? ? ? H43 YQ1 64
YQ1 H44 H44 H 0 1 N N N 133.931 126.032 104.788 ? ? ? H44 YQ1 65
#
loop_
_chem_comp_bond.comp_id
_chem_comp_bond.atom_id_1
_chem_comp_bond.atom_id_2
_chem_comp_bond.value_order
_chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag
_chem_comp_bond.pdbx_stereo_config
_chem_comp_bond.pdbx_ordinal
YQ1 C10 C09 SING N N 1
YQ1 C08 C09 SING N N 2
YQ1 C08 C07 SING N N 3
YQ1 C06 N01 SING N N 4
YQ1 C06 C07 SING N N 5
YQ1 C01 N01 SING N N 6
YQ1 C01 C02 SING N N 7
YQ1 C03 C02 SING N N 8
YQ1 C03 C04 SING N N 9
YQ1 C05 C04 SING N N 10
YQ1 C19 C20 SING N N 11
YQ1 C19 C18 SING N N 12
YQ1 C17 C18 SING N N 13
YQ1 C17 C16 SING N N 14
YQ1 C12 C11 SING N N 15
YQ1 C12 C13 SING N N 16
YQ1 C14 C13 SING N N 17
YQ1 C14 C15 SING N N 18
YQ1 N01 C16 SING N N 19
YQ1 N01 C11 SING N N 20
YQ1 C01 H1 SING N N 21
YQ1 C01 H2 SING N N 22
YQ1 C02 H3 SING N N 23
YQ1 C02 H4 SING N N 24
YQ1 C03 H5 SING N N 25
YQ1 C03 H6 SING N N 26
YQ1 C04 H7 SING N N 27
YQ1 C04 H8 SING N N 28
YQ1 C05 H9 SING N N 29
YQ1 C05 H10 SING N N 30
YQ1 C05 H11 SING N N 31
YQ1 C06 H12 SING N N 32
YQ1 C06 H13 SING N N 33
YQ1 C07 H14 SING N N 34
YQ1 C07 H15 SING N N 35
YQ1 C08 H16 SING N N 36
YQ1 C08 H17 SING N N 37
YQ1 C09 H18 SING N N 38
YQ1 C09 H19 SING N N 39
YQ1 C10 H20 SING N N 40
YQ1 C10 H21 SING N N 41
YQ1 C10 H22 SING N N 42
YQ1 C11 H23 SING N N 43
YQ1 C11 H24 SING N N 44
YQ1 C12 H25 SING N N 45
YQ1 C12 H26 SING N N 46
YQ1 C13 H27 SING N N 47
YQ1 C13 H28 SING N N 48
YQ1 C14 H29 SING N N 49
YQ1 C14 H30 SING N N 50
YQ1 C15 H31 SING N N 51
YQ1 C15 H32 SING N N 52
YQ1 C15 H33 SING N N 53
YQ1 C16 H34 SING N N 54
YQ1 C16 H35 SING N N 55
YQ1 C17 H36 SING N N 56
YQ1 C17 H37 SING N N 57
YQ1 C18 H38 SING N N 58
YQ1 C18 H39 SING N N 59
YQ1 C19 H40 SING N N 60
YQ1 C19 H41 SING N N 61
YQ1 C20 H42 SING N N 62
YQ1 C20 H43 SING N N 63
YQ1 C20 H44 SING N N 64
#
loop_
_pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id
_pdbx_chem_comp_descriptor.type
_pdbx_chem_comp_descriptor.program
_pdbx_chem_comp_descriptor.program_version
_pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor
YQ1 InChI InChI 1.03 "InChI=1S/C20H44N/c1-5-9-13-17-21(18-14-10-6-2,19-15-11-7-3)20-16-12-8-4/h5-20H2,1-4H3"
YQ1 InChIKey InChI 1.03 BTVOGRXNCYUFMB-UHFFFAOYSA-N
YQ1 SMILES_CANONICAL CACTVS 3.385 "CCCCC[N](CCCCC)(CCCCC)CCCCC"
YQ1 SMILES CACTVS 3.385 "CCCCC[N](CCCCC)(CCCCC)CCCCC"
YQ1 SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "CCCCC[N](CCCCC)(CCCCC)CCCCC"
YQ1 SMILES "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "CCCCC[N](CCCCC)(CCCCC)CCCCC"
#
_pdbx_chem_comp_identifier.comp_id YQ1
_pdbx_chem_comp_identifier.type "SYSTEMATIC NAME"
_pdbx_chem_comp_identifier.program "OpenEye OEToolkits"
_pdbx_chem_comp_identifier.program_version 2.0.7
_pdbx_chem_comp_identifier.identifier "1-(tripentyl-$l^{4}-azanyl)pentane"
#
loop_
_pdbx_chem_comp_audit.comp_id
_pdbx_chem_comp_audit.action_type
_pdbx_chem_comp_audit.date
_pdbx_chem_comp_audit.processing_site
YQ1 "Create component" 2021-03-22 RCSB
YQ1 "Initial release" 2022-09-21 RCSB
#