data_ZDJ # _chem_comp.id ZDJ _chem_comp.name 3-methyl-L-tyrosine _chem_comp.type "L-peptide linking" _chem_comp.pdbx_type ATOMP _chem_comp.formula "C10 H13 N O3" _chem_comp.mon_nstd_parent_comp_id TYR _chem_comp.pdbx_synonyms ? _chem_comp.pdbx_formal_charge 0 _chem_comp.pdbx_initial_date 2021-04-15 _chem_comp.pdbx_modified_date 2024-09-27 _chem_comp.pdbx_ambiguous_flag N _chem_comp.pdbx_release_status REL _chem_comp.pdbx_replaced_by ? _chem_comp.pdbx_replaces ? _chem_comp.formula_weight 195.215 _chem_comp.one_letter_code Y _chem_comp.three_letter_code ZDJ _chem_comp.pdbx_model_coordinates_details ? _chem_comp.pdbx_model_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_details Corina _chem_comp.pdbx_ideal_coordinates_missing_flag N _chem_comp.pdbx_model_coordinates_db_code 7MHA _chem_comp.pdbx_subcomponent_list ? _chem_comp.pdbx_processing_site RCSB _chem_comp.pdbx_pcm Y # loop_ _chem_comp_atom.comp_id _chem_comp_atom.atom_id _chem_comp_atom.alt_atom_id _chem_comp_atom.type_symbol _chem_comp_atom.charge _chem_comp_atom.pdbx_align _chem_comp_atom.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_atom.pdbx_leaving_atom_flag _chem_comp_atom.pdbx_stereo_config _chem_comp_atom.pdbx_backbone_atom_flag _chem_comp_atom.pdbx_n_terminal_atom_flag _chem_comp_atom.pdbx_c_terminal_atom_flag _chem_comp_atom.model_Cartn_x _chem_comp_atom.model_Cartn_y _chem_comp_atom.model_Cartn_z _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_x_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_y_ideal _chem_comp_atom.pdbx_model_Cartn_z_ideal _chem_comp_atom.pdbx_component_atom_id _chem_comp_atom.pdbx_component_comp_id _chem_comp_atom.pdbx_ordinal ZDJ O O O 0 1 N N N Y N Y -5.208 -60.928 -28.267 4.201 -0.647 0.023 O ZDJ 1 ZDJ C C C 0 1 N N N Y N Y -4.400 -60.009 -28.159 3.417 0.264 -0.104 C ZDJ 2 ZDJ CA CA C 0 1 N N S Y N N -3.544 -59.594 -29.354 1.970 -0.024 -0.411 CA ZDJ 3 ZDJ N N N 0 1 N N N Y Y N -3.497 -58.143 -29.432 1.848 -1.377 -0.970 N ZDJ 4 ZDJ CB CB C 0 1 N N N N N N -2.140 -60.211 -29.220 1.147 0.072 0.876 CB ZDJ 5 ZDJ CG CG C 0 1 Y N N N N N -1.278 -60.137 -30.466 -0.315 -0.094 0.550 CG ZDJ 6 ZDJ CD2 CD2 C 0 1 Y N N N N N 0.082 -60.439 -30.361 -0.884 -1.355 0.554 CD2 ZDJ 7 ZDJ CE2 CE2 C 0 1 Y N N N N N 0.909 -60.386 -31.486 -2.224 -1.510 0.256 CE2 ZDJ 8 ZDJ CZ CZ C 0 1 Y N N N N N 0.376 -60.025 -32.727 -2.999 -0.400 -0.048 CZ ZDJ 9 ZDJ OH OH O 0 1 N N N N N N 1.216 -59.985 -33.797 -4.317 -0.550 -0.342 OH ZDJ 10 ZDJ CE1 CE1 C 0 1 Y N N N N N -0.987 -59.716 -32.831 -2.426 0.863 -0.051 CE1 ZDJ 11 ZDJ CME CME C 0 1 N N N N N N -1.669 -59.311 -34.114 -3.265 2.071 -0.380 CME ZDJ 12 ZDJ CD1 CD1 C 0 1 Y N N N N N -1.792 -59.767 -31.704 -1.087 1.014 0.253 CD1 ZDJ 13 ZDJ OXT OXT O 0 1 N Y N Y N Y -4.218 -59.315 -27.029 3.834 1.533 0.034 O1 ZDJ 14 ZDJ HA H1 H 0 1 N N N Y N N -4.009 -59.993 -30.268 1.600 0.703 -1.134 H1 ZDJ 15 ZDJ H2 H2 H 0 1 N Y N Y Y N -4.426 -57.783 -29.518 2.330 -1.448 -1.853 H2 ZDJ 16 ZDJ H H H 0 1 N N N Y Y N -3.074 -57.778 -28.603 2.184 -2.069 -0.317 H3 ZDJ 17 ZDJ H5 H5 H 0 1 N N N N N N -2.259 -61.271 -28.951 1.457 -0.712 1.565 H5 ZDJ 18 ZDJ H6 H6 H 0 1 N N N N N N -1.613 -59.684 -28.411 1.307 1.047 1.337 H6 ZDJ 19 ZDJ H7 H7 H 0 1 N N N N N N 0.497 -60.715 -29.403 -0.280 -2.218 0.791 H7 ZDJ 20 ZDJ H8 H8 H 0 1 N N N N N N 1.959 -60.624 -31.397 -2.668 -2.495 0.259 H8 ZDJ 21 ZDJ H9 H9 H 0 1 N N N N N N 2.093 -60.226 -33.521 -4.900 -0.500 0.428 H9 ZDJ 22 ZDJ H10 H10 H 0 1 N N N N N N -2.048 -60.207 -34.627 -3.701 2.471 0.535 H10 ZDJ 23 ZDJ H11 H11 H 0 1 N N N N N N -2.507 -58.636 -33.886 -2.640 2.832 -0.847 H11 ZDJ 24 ZDJ H12 H12 H 0 1 N N N N N N -0.948 -58.794 -34.765 -4.062 1.784 -1.067 H12 ZDJ 25 ZDJ H13 H13 H 0 1 N N N N N N -2.839 -59.515 -31.789 -0.640 1.997 0.251 H13 ZDJ 26 ZDJ HXT HXT H 0 1 N Y N Y N Y -4.800 -59.647 -26.356 4.770 1.667 0.235 H14 ZDJ 27 # loop_ _chem_comp_bond.comp_id _chem_comp_bond.atom_id_1 _chem_comp_bond.atom_id_2 _chem_comp_bond.value_order _chem_comp_bond.pdbx_aromatic_flag _chem_comp_bond.pdbx_stereo_config _chem_comp_bond.pdbx_ordinal ZDJ CME CE1 SING N N 1 ZDJ OH CZ SING N N 2 ZDJ CE1 CZ DOUB Y N 3 ZDJ CE1 CD1 SING Y N 4 ZDJ CZ CE2 SING Y N 5 ZDJ CD1 CG DOUB Y N 6 ZDJ CE2 CD2 DOUB Y N 7 ZDJ CG CD2 SING Y N 8 ZDJ CG CB SING N N 9 ZDJ N CA SING N N 10 ZDJ CA CB SING N N 11 ZDJ CA C SING N N 12 ZDJ O C DOUB N N 13 ZDJ C OXT SING N N 14 ZDJ CA HA SING N N 15 ZDJ N H2 SING N N 16 ZDJ N H SING N N 17 ZDJ CB H5 SING N N 18 ZDJ CB H6 SING N N 19 ZDJ CD2 H7 SING N N 20 ZDJ CE2 H8 SING N N 21 ZDJ OH H9 SING N N 22 ZDJ CME H10 SING N N 23 ZDJ CME H11 SING N N 24 ZDJ CME H12 SING N N 25 ZDJ CD1 H13 SING N N 26 ZDJ OXT HXT SING N N 27 # loop_ _pdbx_chem_comp_descriptor.comp_id _pdbx_chem_comp_descriptor.type _pdbx_chem_comp_descriptor.program _pdbx_chem_comp_descriptor.program_version _pdbx_chem_comp_descriptor.descriptor ZDJ SMILES ACDLabs 12.01 "Cc1cc(CC(N)C(=O)O)ccc1O" ZDJ InChI InChI 1.03 "InChI=1S/C10H13NO3/c1-6-4-7(2-3-9(6)12)5-8(11)10(13)14/h2-4,8,12H,5,11H2,1H3,(H,13,14)/t8-/m0/s1" ZDJ InChIKey InChI 1.03 MQHLULPKDLJASZ-QMMMGPOBSA-N ZDJ SMILES_CANONICAL CACTVS 3.385 "Cc1cc(C[C@H](N)C(O)=O)ccc1O" ZDJ SMILES CACTVS 3.385 "Cc1cc(C[CH](N)C(O)=O)ccc1O" ZDJ SMILES_CANONICAL "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "Cc1cc(ccc1O)C[C@@H](C(=O)O)N" ZDJ SMILES "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "Cc1cc(ccc1O)CC(C(=O)O)N" # loop_ _pdbx_chem_comp_identifier.comp_id _pdbx_chem_comp_identifier.type _pdbx_chem_comp_identifier.program _pdbx_chem_comp_identifier.program_version _pdbx_chem_comp_identifier.identifier ZDJ "SYSTEMATIC NAME" ACDLabs 12.01 3-methyl-L-tyrosine ZDJ "SYSTEMATIC NAME" "OpenEye OEToolkits" 2.0.7 "(2~{S})-2-azanyl-3-(3-methyl-4-oxidanyl-phenyl)propanoic acid" # loop_ _pdbx_chem_comp_audit.comp_id _pdbx_chem_comp_audit.action_type _pdbx_chem_comp_audit.date _pdbx_chem_comp_audit.processing_site ZDJ "Create component" 2021-04-15 RCSB ZDJ "Initial release" 2021-12-29 RCSB ZDJ "Modify backbone" 2023-11-03 PDBE ZDJ "Modify PCM" 2024-09-27 PDBE # _pdbx_chem_comp_pcm.pcm_id 1 _pdbx_chem_comp_pcm.comp_id ZDJ _pdbx_chem_comp_pcm.modified_residue_id TYR _pdbx_chem_comp_pcm.type Methylation _pdbx_chem_comp_pcm.category "Named protein modification" _pdbx_chem_comp_pcm.position "Amino-acid side chain" _pdbx_chem_comp_pcm.polypeptide_position "Any position" _pdbx_chem_comp_pcm.comp_id_linking_atom ? _pdbx_chem_comp_pcm.modified_residue_id_linking_atom ? _pdbx_chem_comp_pcm.uniprot_specific_ptm_accession ? _pdbx_chem_comp_pcm.uniprot_generic_ptm_accession ? #