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COLI DNA TOPOISOMERASE I. HEXAGONAL FORM RCSB Y RCSB 1999-08-31 REL HOH water WAT 1 2 HOH HOH 478 A WAT 3 2 HOH HOH 479 A WAT 5 2 HOH HOH 480 A WAT 8 2 HOH HOH 481 A WAT 11 2 HOH HOH 482 A WAT 12 2 HOH HOH 483 A WAT 14 2 HOH HOH 484 A WAT 16 2 HOH HOH 485 A WAT 20 2 HOH HOH 486 A WAT 22 2 HOH HOH 487 A WAT 23 2 HOH HOH 488 A WAT 24 2 HOH HOH 489 A WAT 27 2 HOH HOH 490 A WAT 31 2 HOH HOH 491 A WAT 32 2 HOH HOH 492 A WAT 33 2 HOH HOH 493 A WAT 34 2 HOH HOH 494 A WAT 35 2 HOH HOH 495 A WAT 36 2 HOH HOH 496 A WAT 37 2 HOH HOH 497 A WAT 38 2 HOH HOH 498 A WAT 40 2 HOH HOH 499 A WAT 41 2 HOH HOH 500 A WAT 46 2 HOH HOH 501 A WAT 49 2 HOH HOH 502 A WAT 50 2 HOH HOH 503 A WAT 53 2 HOH HOH 504 A WAT 54 2 HOH HOH 505 A WAT 58 2 HOH HOH 506 A WAT 59 2 HOH HOH 507 A WAT 60 2 HOH HOH 508 A WAT 62 2 HOH HOH 509 A WAT 66 2 HOH HOH 510 A WAT 67 2 HOH HOH 511 A WAT 70 2 HOH HOH 512 A WAT 72 2 HOH HOH 513 A WAT 74 2 HOH HOH 514 A WAT 75 2 HOH HOH 515 A WAT 76 2 HOH HOH 516 A WAT 78 2 HOH HOH 517 A WAT 79 2 HOH HOH 518 A WAT 80 2 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SOLVENT CORRECTION WITH XPLOR. FINAL REFINEMENT WITH CNS 0.9 0.2420000 0.005 0.2050000 0.2050000 0.2050000 1.80 27.50 2741 54326 54268 5.1 89.5 RANDOM 12805834.68 0.00 1 RESTRAINED THROUGHOUT 2.0 R. A. ENGH AND R. HUBER, ACTA CRYST. SECT. A., 1991 0.24 0.20 5.00 0.09 0.09 1.80 27.50 509 4355 0 0 3846 0.008 1.3 23.7 0.82 1.22 2.00 1.93 3.00 1.68 2.00 2.76 3.00 0.2530000 0.012 0.2350000 1.91 426 7443 6 5.4 78.3 20.3 1.8 50 1CY9 237667 54367 0 0 0.0690000 1 7.5 4.4 89.9 0.2550000 1.8 1.85 1 2.8 76.5 refinement CNS 0.9 model building X-PLOR refinement REFMAC refinement X-PLOR phasing AMoRE data reduction DENZO data scaling CCP4 (SCALA) phasing X-PLOR CRYSTAL STRUCTURE OF THE 30 KDA FRAGMENT OF E. COLI DNA TOPOISOMERASE I. MONOCLINIC FORM 1 N N 1 N N 2 N N 2 N N A ASN 250 A ASN 37 HELX_P A ALA 264 A ALA 51 1 1 15 A ILE 285 A ILE 72 HELX_P A GLY 298 A GLY 85 1 2 14 A GLY 300 A GLY 87 HELX_P A ALA 314 A ALA 101 1 3 15 A SER 328 A SER 115 HELX_P A PHE 343 A PHE 130 1 4 16 A GLY 344 A GLY 131 HELX_P A LEU 348 A LEU 135 5 5 5 A MET 376 A MET 163 HELX_P A LEU 380 A LEU 167 5 6 5 A GLU 384 A GLU 171 HELX_P A GLN 402 A GLN 189 1 7 19 A ASP 432 A ASP 219 HELX_P A VAL 437 A VAL 224 5 8 6 B ASN 250 B ASN 37 HELX_P B ALA 264 B ALA 51 1 9 15 B ILE 285 B ILE 72 HELX_P B GLY 298 B GLY 85 1 10 14 B GLY 300 B GLY 87 HELX_P B ALA 314 B ALA 101 1 11 15 B SER 328 B SER 115 HELX_P B PHE 343 B PHE 130 1 12 16 B GLY 344 B GLY 131 HELX_P B LEU 348 B LEU 135 5 13 5 B MET 376 B MET 163 HELX_P B LEU 380 B LEU 167 5 14 5 B GLU 384 B GLU 171 HELX_P B GLN 402 B GLN 189 1 15 19 B ASP 432 B ASP 219 HELX_P B VAL 437 B VAL 224 5 16 6 ISOMERASE DNA TOPOISOMERASE, DECATENATING ENZYME, ISOMERASE TOP1_ECOLI UNP 1 P06612 214 477 1CY9 214 477 P06612 A 1 1 264 214 477 1CY9 214 477 P06612 B 1 1 264 8 8 anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel A LYS 244 A LYS 31 A PRO 245 A PRO 32 A ALA 233 A ALA 20 A GLN 241 A GLN 28 A GLU 218 A GLU 5 A THR 227 A THR 14 A ALA 458 A ALA 245 A PHE 470 A PHE 257 A TYR 266 A TYR 53 A SER 278 A SER 65 A ALA 406 A ALA 193 A ALA 417 A ALA 204 A PHE 420 A PHE 207 A PHE 431 A PHE 218 A ALA 233 A ALA 20 A GLN 241 A GLN 28 B LYS 244 B LYS 31 B PRO 245 B PRO 32 B ALA 233 B ALA 20 B GLN 241 B GLN 28 B GLU 218 B GLU 5 B THR 227 B THR 14 B ALA 458 B ALA 245 B PHE 470 B PHE 257 B TYR 266 B TYR 53 B SER 278 B SER 65 B ALA 406 B ALA 193 B ALA 417 B ALA 204 B PHE 420 B PHE 207 B PHE 431 B PHE 218 B ALA 233 B ALA 20 B GLN 241 B GLN 28 4 P 1 21 1