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0.00000
Chen, Y.
Wiesmann, C.
Fuh, G.
Li, B.
Christinger, H.W.
McKay, P.
de Vos, A.M.
Lowman, H.B.
http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic
4
90.00
94.70
90.00
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89.093
y
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y
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y
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L-peptide linking
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y
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L-peptide linking
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peptide linking
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y
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18.015
WATER
non-polymer
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y
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L-peptide linking
C6 H13 N O2
131.173
y
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L-peptide linking
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147.195
y
LYSINE
L-peptide linking
C5 H11 N O2 S
149.211
y
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L-peptide linking
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y
PHENYLALANINE
L-peptide linking
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y
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L-peptide linking
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105.093
y
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L-peptide linking
O4 S -2
96.063
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non-polymer
C4 H9 N O3
119.119
y
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L-peptide linking
C11 H12 N2 O2
204.225
y
TRYPTOPHAN
L-peptide linking
C9 H11 N O3
181.189
y
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L-peptide linking
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117.146
y
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L-peptide linking
UK
J.Mol.Biol.
JMOBAK
0070
0022-2836
293
865
881
10.1006/jmbi.1999.3192
10543973
Selection and analysis of an optimized anti-VEGF antibody: crystal structure of an affinity-matured Fab in complex with antigen.
1999
UK
Structure
STRUE6
2005
0969-2126
6
1153
1167
10.1016/S0969-2126(98)00116-6
VEGF and the Fab fragment of a humanized neutralizing antibody: crystal structure of the complex at 2.4 A resolution and mutational analysis of the interface.
1998
1.000000
0.000000
0.000000
0.000000
1.000000
0.000000
0.000000
0.000000
1.000000
0.00000
0.00000
0.00000
100
1
CCD
1998-01-28
ADSC
SINGLE WAVELENGTH
M
x-ray
1
1.000
1.0
5.0.2
ALS
1.000
SYNCHROTRON
ALS BEAMLINE 5.0.2
10999.722
Vascular endothelial growth factor A
RECEPTOR BINDING FRAGMENT
2
man
polymer
MUTATED FORM OF A HUMANIZED MURINE ANTIBODY LIGHT CHAIN
23453.910
LIGHT CHAIN OF NEUTRALIZING ANTIBODY
2
man
polymer
MUTATED FORM OF A HUMANIZED MURINE ANTIBODY HEAVY CHAIN
24979.900
HEAVY CHAIN OF NEUTRALIZING ANTIBODY
2
man
polymer
96.063
SULFATE ION
2
syn
non-polymer
18.015
water
419
nat
water
VEGF-A, Vascular permeability factor, VPF
Ranibizumab Light Chain
Ranibizumab Heavy Chain
no
no
VVKFMDVYQRSYCHPIETLVDIFQEYPDEIEYIFKPSCVPLMRCGGCCNDEGLECVPTEESNITMQIMRIKPHQGQHIGE
MSFLQHNKCECRPK
VVKFMDVYQRSYCHPIETLVDIFQEYPDEIEYIFKPSCVPLMRCGGCCNDEGLECVPTEESNITMQIMRIKPHQGQHIGE
MSFLQHNKCECRPK
V,W
polypeptide(L)
no
no
DIQLTQSPSSLSASVGDRVTITCSASQDISNYLNWYQQKPGKAPKVLIYFTSSLHSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQP
EDFATYYCQQYSTVPWTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQ
ESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
DIQLTQSPSSLSASVGDRVTITCSASQDISNYLNWYQQKPGKAPKVLIYFTSSLHSGVPSRFSGSGSGTDFTLTISSLQP
EDFATYYCQQYSTVPWTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQ
ESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC
L,X
polypeptide(L)
no
no
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGYDFTHYGMNWVRQAPGKGLEWVGWINTYTGEPTYAADFKRRFTFSLDTSKSTAY
LQMNSLRAEDTAVYYCAKYPYYYGTSHWYFDVWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPV
TVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHL
EVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGYDFTHYGMNWVRQAPGKGLEWVGWINTYTGEPTYAADFKRRFTFSLDTSKSTAY
LQMNSLRAEDTAVYYCAKYPYYYGTSHWYFDVWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPV
TVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHL
H,Y
polypeptide(L)
n
n
n
n
n
n
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n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
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Homo
Escherichia
sample
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9606
Homo sapiens
562
Escherichia coli
house mouse
Mus
Escherichia
sample
10090
Mus musculus
562
Escherichia coli
house mouse
Mus
Escherichia
sample
10090
Mus musculus
562
Escherichia coli
1
3.53
65.11
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
6.0
PEG 4000, ISOPROPANOL, AMMONIUM SULFATE, MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
293
repository
Initial release
Version format compliance
Version format compliance
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0
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1
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1
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2017-04-05
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CONTAINS UNCOMPLEXED VEGF
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CONTAINS VEGF IN COMPLEX WITH AN RECEPTOR BLOCKING PEPTIDE
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Y
RCSB
1999-09-01
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SO4
SULFATE ION
HOH
water
SO4
1
4
SO4
SO4
301
H
SO4
2
4
SO4
SO4
301
Y
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5
HOH
HOH
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V
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5
HOH
HOH
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V
WAT
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5
HOH
HOH
203
V
WAT
244
5
HOH
HOH
204
V
WAT
247
5
HOH
HOH
205
V
WAT
250
5
HOH
HOH
206
V
WAT
252
5
HOH
HOH
207
V
WAT
275
5
HOH
HOH
208
V
WAT
292
5
HOH
HOH
209
V
WAT
305
5
HOH
HOH
210
V
WAT
320
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HOH
HOH
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V
WAT
348
5
HOH
HOH
212
V
WAT
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HOH
HOH
213
V
WAT
384
5
HOH
HOH
214
V
WAT
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5
HOH
HOH
215
V
WAT
399
5
HOH
HOH
216
V
WAT
407
5
HOH
HOH
217
V
WAT
409
5
HOH
HOH
218
V
WAT
136
5
HOH
HOH
201
W
WAT
139
5
HOH
HOH
202
W
WAT
202
5
HOH
HOH
203
W
WAT
220
5
HOH
HOH
204
W
WAT
230
5
HOH
HOH
205
W
WAT
240
5
HOH
HOH
206
W
WAT
303
5
HOH
HOH
207
W
WAT
306
5
HOH
HOH
208
W
WAT
315
5
HOH
HOH
209
W
WAT
322
5
HOH
HOH
210
W
WAT
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5
HOH
HOH
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W
WAT
352
5
HOH
HOH
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W
WAT
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5
HOH
HOH
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W
WAT
380
5
HOH
HOH
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W
WAT
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HOH
HOH
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W
WAT
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5
HOH
HOH
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L
WAT
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HOH
HOH
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L
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HOH
HOH
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L
WAT
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HOH
HOH
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L
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HOH
HOH
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L
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HOH
HOH
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L
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HOH
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L
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HOH
HOH
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L
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HOH
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L
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HOH
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HOH
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L
WAT
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HOH
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L
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L
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HOH
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L
WAT
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HOH
HOH
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L
WAT
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HOH
HOH
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L
WAT
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HOH
HOH
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L
WAT
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HOH
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L
WAT
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HOH
HOH
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L
WAT
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HOH
HOH
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L
WAT
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HOH
HOH
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L
WAT
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HOH
HOH
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L
WAT
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HOH
HOH
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L
WAT
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HOH
HOH
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L
WAT
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HOH
HOH
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WAT
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HOH
HOH
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L
WAT
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HOH
HOH
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L
WAT
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HOH
HOH
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L
WAT
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HOH
HOH
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L
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HOH
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WAT
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HOH
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WAT
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HOH
HOH
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WAT
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HOH
HOH
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WAT
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HOH
HOH
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WAT
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HOH
HOH
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WAT
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HOH
HOH
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WAT
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HOH
HOH
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L
WAT
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HOH
HOH
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L
WAT
93
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HOH
HOH
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L
WAT
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HOH
HOH
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L
WAT
100
5
HOH
HOH
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L
WAT
102
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HOH
HOH
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L
WAT
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HOH
HOH
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L
WAT
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HOH
HOH
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L
WAT
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HOH
HOH
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L
WAT
110
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HOH
HOH
349
L
WAT
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HOH
HOH
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L
WAT
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HOH
HOH
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L
WAT
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HOH
HOH
352
L
WAT
125
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HOH
HOH
353
L
WAT
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5
HOH
HOH
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L
WAT
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HOH
HOH
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L
WAT
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HOH
HOH
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L
WAT
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5
HOH
HOH
357
L
WAT
137
5
HOH
HOH
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L
WAT
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HOH
HOH
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L
WAT
143
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HOH
HOH
360
L
WAT
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5
HOH
HOH
361
L
WAT
147
5
HOH
HOH
362
L
WAT
149
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HOH
HOH
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L
WAT
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HOH
HOH
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L
WAT
156
5
HOH
HOH
365
L
WAT
158
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HOH
HOH
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L
WAT
159
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HOH
HOH
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L
WAT
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HOH
HOH
368
L
WAT
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HOH
HOH
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L
WAT
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HOH
HOH
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L
WAT
172
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HOH
HOH
371
L
WAT
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HOH
HOH
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L
WAT
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HOH
HOH
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L
WAT
178
5
HOH
HOH
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L
WAT
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HOH
HOH
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WAT
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HOH
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WAT
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HOH
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L
WAT
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HOH
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L
WAT
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HOH
HOH
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WAT
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HOH
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WAT
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HOH
HOH
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WAT
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HOH
HOH
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L
WAT
200
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HOH
HOH
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WAT
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HOH
HOH
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WAT
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HOH
HOH
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Y
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Y
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Y
WAT
332
5
HOH
HOH
435
Y
WAT
334
5
HOH
HOH
436
Y
WAT
335
5
HOH
HOH
437
Y
WAT
339
5
HOH
HOH
438
Y
WAT
344
5
HOH
HOH
439
Y
WAT
349
5
HOH
HOH
440
Y
WAT
350
5
HOH
HOH
441
Y
WAT
355
5
HOH
HOH
442
Y
WAT
364
5
HOH
HOH
443
Y
WAT
365
5
HOH
HOH
444
Y
WAT
376
5
HOH
HOH
445
Y
WAT
377
5
HOH
HOH
446
Y
WAT
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5
HOH
HOH
447
Y
WAT
400
5
HOH
HOH
448
Y
WAT
406
5
HOH
HOH
449
Y
WAT
408
5
HOH
HOH
450
Y
VAL
14
n
1
VAL
14
V
VAL
15
n
2
VAL
15
V
LYS
16
n
3
LYS
16
V
PHE
17
n
4
PHE
17
V
MET
18
n
5
MET
18
V
ASP
19
n
6
ASP
19
V
VAL
20
n
7
VAL
20
V
TYR
21
n
8
TYR
21
V
GLN
22
n
9
GLN
22
V
ARG
23
n
10
ARG
23
V
SER
24
n
11
SER
24
V
TYR
25
n
12
TYR
25
V
CYS
26
n
13
CYS
26
V
HIS
27
n
14
HIS
27
V
PRO
28
n
15
PRO
28
V
ILE
29
n
16
ILE
29
V
GLU
30
n
17
GLU
30
V
THR
31
n
18
THR
31
V
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32
n
19
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32
V
VAL
33
n
20
VAL
33
V
ASP
34
n
21
ASP
34
V
ILE
35
n
22
ILE
35
V
PHE
36
n
23
PHE
36
V
GLN
37
n
24
GLN
37
V
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38
n
25
GLU
38
V
TYR
39
n
26
TYR
39
V
PRO
40
n
27
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40
V
ASP
41
n
28
ASP
41
V
GLU
42
n
29
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42
V
ILE
43
n
30
ILE
43
V
GLU
44
n
31
GLU
44
V
TYR
45
n
32
TYR
45
V
ILE
46
n
33
ILE
46
V
PHE
47
n
34
PHE
47
V
LYS
48
n
35
LYS
48
V
PRO
49
n
36
PRO
49
V
SER
50
n
37
SER
50
V
CYS
51
n
38
CYS
51
V
VAL
52
n
39
VAL
52
V
PRO
53
n
40
PRO
53
V
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54
n
41
LEU
54
V
MET
55
n
42
MET
55
V
ARG
56
n
43
ARG
56
V
CYS
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n
44
CYS
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V
GLY
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n
45
GLY
58
V
GLY
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n
46
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V
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n
47
CYS
60
V
CYS
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n
48
CYS
61
V
ASN
62
n
49
ASN
62
V
ASP
63
n
50
ASP
63
V
GLU
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n
51
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GLY
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n
52
GLY
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V
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n
53
LEU
66
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n
54
GLU
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n
55
CYS
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VAL
69
n
56
VAL
69
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PRO
70
n
57
PRO
70
V
THR
71
n
58
THR
71
V
GLU
72
n
59
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V
GLU
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n
60
GLU
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V
SER
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n
61
SER
74
V
ASN
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n
62
ASN
75
V
ILE
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n
63
ILE
76
V
THR
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n
64
THR
77
V
MET
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n
65
MET
78
V
GLN
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n
66
GLN
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ILE
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n
67
ILE
80
V
MET
81
n
68
MET
81
V
ARG
82
n
69
ARG
82
V
ILE
83
n
70
ILE
83
V
LYS
84
n
71
LYS
84
V
PRO
85
n
72
PRO
85
V
HIS
86
n
73
HIS
86
V
GLN
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n
74
GLN
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V
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88
n
75
GLY
88
V
GLN
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n
76
GLN
89
V
HIS
90
n
77
HIS
90
V
ILE
91
n
78
ILE
91
V
GLY
92
n
79
GLY
92
V
GLU
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n
80
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93
V
MET
94
n
81
MET
94
V
SER
95
n
82
SER
95
V
PHE
96
n
83
PHE
96
V
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97
n
84
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97
V
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n
85
GLN
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V
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99
n
86
HIS
99
V
ASN
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n
87
ASN
100
V
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n
88
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101
V
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n
89
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V
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n
90
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V
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n
91
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104
V
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n
92
ARG
105
V
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106
n
93
PRO
106
V
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107
n
94
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V
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n
1
VAL
14
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VAL
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n
2
VAL
15
W
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n
3
LYS
16
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PHE
17
n
4
PHE
17
W
MET
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n
5
MET
18
W
ASP
19
n
6
ASP
19
W
VAL
20
n
7
VAL
20
W
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21
n
8
TYR
21
W
GLN
22
n
9
GLN
22
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23
n
10
ARG
23
W
SER
24
n
11
SER
24
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TYR
25
n
12
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25
W
CYS
26
n
13
CYS
26
W
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27
n
14
HIS
27
W
PRO
28
n
15
PRO
28
W
ILE
29
n
16
ILE
29
W
GLU
30
n
17
GLU
30
W
THR
31
n
18
THR
31
W
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32
n
19
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32
W
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33
n
20
VAL
33
W
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34
n
21
ASP
34
W
ILE
35
n
22
ILE
35
W
PHE
36
n
23
PHE
36
W
GLN
37
n
24
GLN
37
W
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38
n
25
GLU
38
W
TYR
39
n
26
TYR
39
W
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40
n
27
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40
W
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41
n
28
ASP
41
W
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42
n
29
GLU
42
W
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43
n
30
ILE
43
W
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44
n
31
GLU
44
W
TYR
45
n
32
TYR
45
W
ILE
46
n
33
ILE
46
W
PHE
47
n
34
PHE
47
W
LYS
48
n
35
LYS
48
W
PRO
49
n
36
PRO
49
W
SER
50
n
37
SER
50
W
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51
n
38
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51
W
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52
n
39
VAL
52
W
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53
n
40
PRO
53
W
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54
n
41
LEU
54
W
MET
55
n
42
MET
55
W
ARG
56
n
43
ARG
56
W
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57
n
44
CYS
57
W
GLY
58
n
45
GLY
58
W
GLY
59
n
46
GLY
59
W
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60
n
47
CYS
60
W
CYS
61
n
48
CYS
61
W
ASN
62
n
49
ASN
62
W
ASP
63
n
50
ASP
63
W
GLU
64
n
51
GLU
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W
GLY
65
n
52
GLY
65
W
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66
n
53
LEU
66
W
GLU
67
n
54
GLU
67
W
CYS
68
n
55
CYS
68
W
VAL
69
n
56
VAL
69
W
PRO
70
n
57
PRO
70
W
THR
71
n
58
THR
71
W
GLU
72
n
59
GLU
72
W
GLU
73
n
60
GLU
73
W
SER
74
n
61
SER
74
W
ASN
75
n
62
ASN
75
W
ILE
76
n
63
ILE
76
W
THR
77
n
64
THR
77
W
MET
78
n
65
MET
78
W
GLN
79
n
66
GLN
79
W
ILE
80
n
67
ILE
80
W
MET
81
n
68
MET
81
W
ARG
82
n
69
ARG
82
W
ILE
83
n
70
ILE
83
W
LYS
84
n
71
LYS
84
W
PRO
85
n
72
PRO
85
W
HIS
86
n
73
HIS
86
W
GLN
87
n
74
GLN
87
W
GLY
88
n
75
GLY
88
W
GLN
89
n
76
GLN
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W
HIS
90
n
77
HIS
90
W
ILE
91
n
78
ILE
91
W
GLY
92
n
79
GLY
92
W
GLU
93
n
80
GLU
93
W
MET
94
n
81
MET
94
W
SER
95
n
82
SER
95
W
PHE
96
n
83
PHE
96
W
LEU
97
n
84
LEU
97
W
GLN
98
n
85
GLN
98
W
HIS
99
n
86
HIS
99
W
ASN
100
n
87
ASN
100
W
LYS
101
n
88
LYS
101
W
CYS
102
n
89
CYS
102
W
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103
n
90
GLU
103
W
CYS
104
n
91
CYS
104
W
ARG
105
n
92
ARG
105
W
PRO
106
n
93
PRO
106
W
LYS
107
n
94
LYS
107
W
ASP
1
n
1
ASP
1
L
ILE
2
n
2
ILE
2
L
GLN
3
n
3
GLN
3
L
LEU
4
n
4
LEU
4
L
THR
5
n
5
THR
5
L
GLN
6
n
6
GLN
6
L
SER
7
n
7
SER
7
L
PRO
8
n
8
PRO
8
L
SER
9
n
9
SER
9
L
SER
10
n
10
SER
10
L
LEU
11
n
11
LEU
11
L
SER
12
n
12
SER
12
L
ALA
13
n
13
ALA
13
L
SER
14
n
14
SER
14
L
VAL
15
n
15
VAL
15
L
GLY
16
n
16
GLY
16
L
ASP
17
n
17
ASP
17
L
ARG
18
n
18
ARG
18
L
VAL
19
n
19
VAL
19
L
THR
20
n
20
THR
20
L
ILE
21
n
21
ILE
21
L
THR
22
n
22
THR
22
L
CYS
23
n
23
CYS
23
L
SER
24
n
24
SER
24
L
ALA
25
n
25
ALA
25
L
SER
26
n
26
SER
26
L
GLN
27
n
27
GLN
27
L
ASP
28
n
28
ASP
28
L
ILE
29
n
29
ILE
29
L
SER
30
n
30
SER
30
L
ASN
31
n
31
ASN
31
L
TYR
32
n
32
TYR
32
L
LEU
33
n
33
LEU
33
L
ASN
34
n
34
ASN
34
L
TRP
35
n
35
TRP
35
L
TYR
36
n
36
TYR
36
L
GLN
37
n
37
GLN
37
L
GLN
38
n
38
GLN
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L
LYS
39
n
39
LYS
39
L
PRO
40
n
40
PRO
40
L
GLY
41
n
41
GLY
41
L
LYS
42
n
42
LYS
42
L
ALA
43
n
43
ALA
43
L
PRO
44
n
44
PRO
44
L
LYS
45
n
45
LYS
45
L
VAL
46
n
46
VAL
46
L
LEU
47
n
47
LEU
47
L
ILE
48
n
48
ILE
48
L
TYR
49
n
49
TYR
49
L
PHE
50
n
50
PHE
50
L
THR
51
n
51
THR
51
L
SER
52
n
52
SER
52
L
SER
53
n
53
SER
53
L
LEU
54
n
54
LEU
54
L
HIS
55
n
55
HIS
55
L
SER
56
n
56
SER
56
L
GLY
57
n
57
GLY
57
L
VAL
58
n
58
VAL
58
L
PRO
59
n
59
PRO
59
L
SER
60
n
60
SER
60
L
ARG
61
n
61
ARG
61
L
PHE
62
n
62
PHE
62
L
SER
63
n
63
SER
63
L
GLY
64
n
64
GLY
64
L
SER
65
n
65
SER
65
L
GLY
66
n
66
GLY
66
L
SER
67
n
67
SER
67
L
GLY
68
n
68
GLY
68
L
THR
69
n
69
THR
69
L
ASP
70
n
70
ASP
70
L
PHE
71
n
71
PHE
71
L
THR
72
n
72
THR
72
L
LEU
73
n
73
LEU
73
L
THR
74
n
74
THR
74
L
ILE
75
n
75
ILE
75
L
SER
76
n
76
SER
76
L
SER
77
n
77
SER
77
L
LEU
78
n
78
LEU
78
L
GLN
79
n
79
GLN
79
L
PRO
80
n
80
PRO
80
L
GLU
81
n
81
GLU
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L
ASP
82
n
82
ASP
82
L
PHE
83
n
83
PHE
83
L
ALA
84
n
84
ALA
84
L
THR
85
n
85
THR
85
L
TYR
86
n
86
TYR
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TYR
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n
87
TYR
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CYS
88
n
88
CYS
88
L
GLN
89
n
89
GLN
89
L
GLN
90
n
90
GLN
90
L
TYR
91
n
91
TYR
91
L
SER
92
n
92
SER
92
L
THR
93
n
93
THR
93
L
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94
n
94
VAL
94
L
PRO
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n
95
PRO
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L
TRP
96
n
96
TRP
96
L
THR
97
n
97
THR
97
L
PHE
98
n
98
PHE
98
L
GLY
99
n
99
GLY
99
L
GLN
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n
100
GLN
100
L
GLY
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n
101
GLY
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L
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n
102
THR
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L
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n
103
LYS
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L
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n
104
VAL
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L
GLU
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n
105
GLU
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L
ILE
106
n
106
ILE
106
L
LYS
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n
107
LYS
107
L
ARG
108
n
108
ARG
108
L
THR
109
n
109
THR
109
L
VAL
110
n
110
VAL
110
L
ALA
111
n
111
ALA
111
L
ALA
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n
112
ALA
112
L
PRO
113
n
113
PRO
113
L
SER
114
n
114
SER
114
L
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115
n
115
VAL
115
L
PHE
116
n
116
PHE
116
L
ILE
117
n
117
ILE
117
L
PHE
118
n
118
PHE
118
L
PRO
119
n
119
PRO
119
L
PRO
120
n
120
PRO
120
L
SER
121
n
121
SER
121
L
ASP
122
n
122
ASP
122
L
GLU
123
n
123
GLU
123
L
GLN
124
n
124
GLN
124
L
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n
125
LEU
125
L
LYS
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n
126
LYS
126
L
SER
127
n
127
SER
127
L
GLY
128
n
128
GLY
128
L
THR
129
n
129
THR
129
L
ALA
130
n
130
ALA
130
L
SER
131
n
131
SER
131
L
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n
132
VAL
132
L
VAL
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n
133
VAL
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L
CYS
134
n
134
CYS
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L
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135
n
135
LEU
135
L
LEU
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n
136
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136
L
ASN
137
n
137
ASN
137
L
ASN
138
n
138
ASN
138
L
PHE
139
n
139
PHE
139
L
TYR
140
n
140
TYR
140
L
PRO
141
n
141
PRO
141
L
ARG
142
n
142
ARG
142
L
GLU
143
n
143
GLU
143
L
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144
n
144
ALA
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L
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n
145
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L
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n
146
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GLN
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n
147
GLN
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L
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n
148
TRP
148
L
LYS
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n
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L
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n
150
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n
151
ASP
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n
152
ASN
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n
153
ALA
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n
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n
155
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n
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n
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n
158
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n
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GLN
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n
160
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L
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n
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n
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n
163
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n
164
THR
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n
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n
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n
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n
169
LYS
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L
ASP
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n
170
ASP
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L
SER
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n
171
SER
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172
n
172
THR
172
L
TYR
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n
173
TYR
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L
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n
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n
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n
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L
SER
177
n
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L
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178
n
178
THR
178
L
LEU
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n
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LEU
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L
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n
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THR
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L
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n
181
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n
182
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L
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n
183
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L
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n
184
ALA
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n
185
ASP
185
L
TYR
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n
186
TYR
186
L
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n
187
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187
L
LYS
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n
188
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189
n
189
HIS
189
L
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n
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L
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n
191
VAL
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n
192
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L
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n
193
ALA
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CYS
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n
194
CYS
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L
GLU
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n
195
GLU
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L
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n
196
VAL
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L
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197
n
197
THR
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L
HIS
198
n
198
HIS
198
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GLN
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n
199
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L
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n
200
GLY
200
L
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n
201
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n
202
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202
L
SER
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n
203
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203
L
PRO
204
n
204
PRO
204
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205
n
205
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205
L
THR
206
n
206
THR
206
L
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207
n
207
LYS
207
L
SER
208
n
208
SER
208
L
PHE
209
n
209
PHE
209
L
ASN
210
n
210
ASN
210
L
ARG
211
n
211
ARG
211
L
GLY
212
n
212
GLY
212
L
GLU
213
n
213
GLU
213
L
n
214
214
L
GLU
1
n
1
GLU
1
H
VAL
2
n
2
VAL
2
H
GLN
3
n
3
GLN
3
H
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n
4
LEU
4
H
VAL
5
n
5
VAL
5
H
GLU
6
n
6
GLU
6
H
SER
7
n
7
SER
7
H
GLY
8
n
8
GLY
8
H
GLY
9
n
9
GLY
9
H
GLY
10
n
10
GLY
10
H
LEU
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n
11
LEU
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H
VAL
12
n
12
VAL
12
H
GLN
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n
13
GLN
13
H
PRO
14
n
14
PRO
14
H
GLY
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n
15
GLY
15
H
GLY
16
n
16
GLY
16
H
SER
17
n
17
SER
17
H
LEU
18
n
18
LEU
18
H
ARG
19
n
19
ARG
19
H
LEU
20
n
20
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20
H
SER
21
n
21
SER
21
H
CYS
22
n
22
CYS
22
H
ALA
23
n
23
ALA
23
H
ALA
24
n
24
ALA
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H
SER
25
n
25
SER
25
H
GLY
26
n
26
GLY
26
H
TYR
27
n
27
TYR
27
H
ASP
28
n
28
ASP
28
H
PHE
29
n
29
PHE
29
H
THR
30
n
30
THR
30
H
HIS
31
n
31
HIS
31
H
TYR
32
n
32
TYR
32
H
GLY
33
n
33
GLY
33
H
MET
34
n
34
MET
34
H
ASN
35
n
35
ASN
35
H
TRP
36
n
36
TRP
36
H
VAL
37
n
37
VAL
37
H
ARG
38
n
38
ARG
38
H
GLN
39
n
39
GLN
39
H
ALA
40
n
40
ALA
40
H
PRO
41
n
41
PRO
41
H
GLY
42
n
42
GLY
42
H
LYS
43
n
43
LYS
43
H
GLY
44
n
44
GLY
44
H
LEU
45
n
45
LEU
45
H
GLU
46
n
46
GLU
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H
TRP
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n
47
TRP
47
H
VAL
48
n
48
VAL
48
H
GLY
49
n
49
GLY
49
H
TRP
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n
50
TRP
50
H
ILE
51
n
51
ILE
51
H
ASN
52
n
52
ASN
52
H
THR
53
n
53
THR
53
H
TYR
54
n
54
TYR
54
H
THR
55
n
55
THR
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H
GLY
56
n
56
GLY
56
H
GLU
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n
57
GLU
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H
PRO
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n
58
PRO
58
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THR
59
n
59
THR
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TYR
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n
60
TYR
60
H
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61
n
61
ALA
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ALA
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n
62
ALA
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H
ASP
63
n
63
ASP
63
H
PHE
64
n
64
PHE
64
H
LYS
65
n
65
LYS
65
H
ARG
66
n
66
ARG
66
H
ARG
67
n
67
ARG
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H
PHE
68
n
68
PHE
68
H
THR
69
n
69
THR
69
H
PHE
70
n
70
PHE
70
H
SER
71
n
71
SER
71
H
LEU
72
n
72
LEU
72
H
ASP
73
n
73
ASP
73
H
THR
74
n
74
THR
74
H
SER
75
n
75
SER
75
H
LYS
76
n
76
LYS
76
H
SER
77
n
77
SER
77
H
THR
78
n
78
THR
78
H
ALA
79
n
79
ALA
79
H
TYR
80
n
80
TYR
80
H
LEU
81
n
81
LEU
81
H
GLN
82
n
82
GLN
82
H
MET
83
n
83
MET
83
H
ASN
84
n
84
ASN
84
H
SER
85
n
85
SER
85
H
LEU
86
n
86
LEU
86
H
ARG
87
n
87
ARG
87
H
ALA
88
n
88
ALA
88
H
GLU
89
n
89
GLU
89
H
ASP
90
n
90
ASP
90
H
THR
91
n
91
THR
91
H
ALA
92
n
92
ALA
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H
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93
n
93
VAL
93
H
TYR
94
n
94
TYR
94
H
TYR
95
n
95
TYR
95
H
CYS
96
n
96
CYS
96
H
ALA
97
n
97
ALA
97
H
LYS
98
n
98
LYS
98
H
TYR
99
n
99
TYR
99
H
PRO
100
n
100
PRO
100
H
TYR
101
n
101
TYR
101
H
TYR
102
n
102
TYR
102
H
TYR
103
n
103
TYR
103
H
GLY
104
n
104
GLY
104
H
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105
n
105
THR
105
H
SER
106
n
106
SER
106
H
HIS
107
n
107
HIS
107
H
TRP
108
n
108
TRP
108
H
TYR
109
n
109
TYR
109
H
PHE
110
n
110
PHE
110
H
ASP
111
n
111
ASP
111
H
VAL
112
n
112
VAL
112
H
TRP
113
n
113
TRP
113
H
GLY
114
n
114
GLY
114
H
GLN
115
n
115
GLN
115
H
GLY
116
n
116
GLY
116
H
THR
117
n
117
THR
117
H
LEU
118
n
118
LEU
118
H
VAL
119
n
119
VAL
119
H
THR
120
n
120
THR
120
H
VAL
121
n
121
VAL
121
H
SER
122
n
122
SER
122
H
SER
123
n
123
SER
123
H
ALA
124
n
124
ALA
124
H
SER
125
n
125
SER
125
H
THR
126
n
126
THR
126
H
LYS
127
n
127
LYS
127
H
GLY
128
n
128
GLY
128
H
PRO
129
n
129
PRO
129
H
SER
130
n
130
SER
130
H
VAL
131
n
131
VAL
131
H
PHE
132
n
132
PHE
132
H
PRO
133
n
133
PRO
133
H
LEU
134
n
134
LEU
134
H
ALA
135
n
135
ALA
135
H
PRO
136
n
136
PRO
136
H
SER
137
n
137
SER
137
H
n
138
138
H
n
139
139
H
n
140
140
H
n
141
141
H
n
142
142
H
n
143
143
H
GLY
144
n
144
GLY
144
H
THR
145
n
145
THR
145
H
ALA
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n
146
ALA
146
H
ALA
147
n
147
ALA
147
H
LEU
148
n
148
LEU
148
H
GLY
149
n
149
GLY
149
H
CYS
150
n
150
CYS
150
H
LEU
151
n
151
LEU
151
H
VAL
152
n
152
VAL
152
H
LYS
153
n
153
LYS
153
H
ASP
154
n
154
ASP
154
H
TYR
155
n
155
TYR
155
H
PHE
156
n
156
PHE
156
H
PRO
157
n
157
PRO
157
H
GLU
158
n
158
GLU
158
H
PRO
159
n
159
PRO
159
H
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160
n
160
VAL
160
H
THR
161
n
161
THR
161
H
VAL
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n
162
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n
163
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n
164
TRP
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n
165
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H
SER
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n
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n
167
GLY
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168
n
168
ALA
168
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n
169
LEU
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H
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n
170
THR
170
H
SER
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n
171
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171
H
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n
172
GLY
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H
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n
173
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H
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n
174
HIS
174
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n
175
THR
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PHE
176
n
176
PHE
176
H
PRO
177
n
177
PRO
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H
ALA
178
n
178
ALA
178
H
VAL
179
n
179
VAL
179
H
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n
180
LEU
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H
GLN
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n
181
GLN
181
H
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n
182
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H
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n
183
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H
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n
184
GLY
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H
LEU
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n
185
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TYR
186
n
186
TYR
186
H
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187
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188
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189
H
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n
190
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n
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n
193
THR
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n
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n
195
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n
196
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197
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n
198
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199
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n
200
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201
n
201
THR
201
H
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n
202
GLN
202
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203
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TYR
204
n
204
TYR
204
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ILE
205
n
205
ILE
205
H
CYS
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n
206
CYS
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207
n
207
ASN
207
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n
208
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208
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ASN
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209
H
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n
210
HIS
210
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LYS
211
n
211
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n
212
PRO
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n
213
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213
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n
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THR
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n
215
THR
215
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LYS
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n
216
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217
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n
218
ASP
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n
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221
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222
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n
223
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n
224
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225
225
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226
226
H
n
227
227
H
n
228
228
H
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229
229
H
n
230
230
H
n
231
231
H
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1
n
1
ASP
1
X
ILE
2
n
2
ILE
2
X
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n
3
GLN
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n
4
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n
5
THR
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n
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GLN
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n
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n
8
PRO
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n
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n
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n
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n
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n
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n
15
VAL
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GLY
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n
17
ASP
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n
18
ARG
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n
19
VAL
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n
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n
21
ILE
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n
22
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n
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CYS
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n
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n
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n
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SER
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n
27
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ASP
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n
28
ASP
28
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n
29
ILE
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SER
30
n
30
SER
30
X
ASN
31
n
31
ASN
31
X
TYR
32
n
32
TYR
32
X
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n
33
LEU
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X
ASN
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n
34
ASN
34
X
TRP
35
n
35
TRP
35
X
TYR
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n
36
TYR
36
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n
37
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38
GLN
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n
39
LYS
39
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n
40
PRO
40
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n
41
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n
42
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43
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44
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n
45
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46
VAL
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n
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n
48
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TYR
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n
49
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n
50
PHE
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n
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55
HIS
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n
58
VAL
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n
61
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PHE
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n
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n
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n
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68
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ASP
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n
71
PHE
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THR
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n
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n
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THR
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n
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X
ILE
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n
75
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X
SER
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n
76
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SER
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n
77
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X
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n
78
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79
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80
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n
81
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n
82
ASP
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83
n
83
PHE
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X
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n
84
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84
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n
85
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X
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TYR
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X
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X
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n
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n
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98
PHE
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X
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n
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n
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n
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n
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n
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n
106
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X
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n
107
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X
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108
n
108
ARG
108
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109
n
109
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109
X
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n
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VAL
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n
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112
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n
113
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n
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n
115
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n
116
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n
117
ILE
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X
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n
118
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n
119
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n
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n
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n
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ASP
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n
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n
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n
127
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n
128
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n
129
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n
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131
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n
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n
139
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TYR
140
n
140
TYR
140
X
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n
141
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X
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n
142
ARG
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X
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n
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n
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n
148
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X
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n
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X
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n
150
VAL
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n
151
ASP
151
X
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n
152
ASN
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n
153
ALA
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n
154
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n
155
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n
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n
157
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n
158
ASN
158
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n
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n
160
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n
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165
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n
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n
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n
169
LYS
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X
ASP
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n
170
ASP
170
X
SER
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n
171
SER
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n
172
THR
172
X
TYR
173
n
173
TYR
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X
SER
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n
174
SER
174
X
LEU
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n
175
LEU
175
X
SER
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n
176
SER
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X
SER
177
n
177
SER
177
X
THR
178
n
178
THR
178
X
LEU
179
n
179
LEU
179
X
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n
180
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X
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181
n
181
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181
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n
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SER
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n
183
LYS
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n
184
ALA
184
X
ASP
185
n
185
ASP
185
X
TYR
186
n
186
TYR
186
X
GLU
187
n
187
GLU
187
X
LYS
188
n
188
LYS
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X
HIS
189
n
189
HIS
189
X
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n
190
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191
n
191
VAL
191
X
TYR
192
n
192
TYR
192
X
ALA
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n
193
ALA
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X
CYS
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n
194
CYS
194
X
GLU
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n
195
GLU
195
X
VAL
196
n
196
VAL
196
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197
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HIS
198
n
198
HIS
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n
199
GLN
199
X
GLY
200
n
200
GLY
200
X
LEU
201
n
201
LEU
201
X
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ASN
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212
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n
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n
5
VAL
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n
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n
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LYS
45
L
O
TYR
49
C
O
TYR
49
L
N
SER
53
C
N
SER
53
L
N
LEU
11
C
N
LEU
11
L
O
LYS
103
C
O
LYS
103
L
N
VAL
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N
VAL
104
L
O
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C
O
ALA
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N
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N
GLN
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O
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C
O
THR
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N
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C
N
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O
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C
O
VAL
133
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N
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N
PHE
139
L
O
TYR
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O
TYR
173
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N
THR
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N
THR
178
L
O
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C
O
GLN
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N
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N
ALA
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O
VAL
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O
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C
O
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N
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N
ALA
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N
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N
VAL
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C
O
VAL
205
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SER
7
D
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SER
7
H
N
SER
21
D
N
SER
21
H
N
CYS
22
D
N
CYS
22
H
O
ALA
79
D
O
ALA
79
H
N
GLN
82
D
N
GLN
82
H
O
THR
69
D
O
THR
69
H
N
THR
59
D
N
THR
59
H
O
TRP
50
D
O
TRP
50
H
N
ILE
51
D
N
ILE
51
H
O
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34
D
O
MET
34
H
N
GLN
39
D
N
GLN
39
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93
D
O
VAL
93
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N
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D
O
VAL
112
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THR
59
D
N
THR
59
H
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TRP
50
D
O
TRP
50
H
N
ILE
51
D
N
ILE
51
H
O
MET
34
D
O
MET
34
H
N
GLN
39
D
N
GLN
39
H
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93
D
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VAL
93
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TYR
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THR
117
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THR
120
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O
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O
GLY
10
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GLY
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155
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VAL
191
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174
D
O
HIS
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N
LEU
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N
LEU
134
H
O
GLY
149
D
O
GLY
149
H
O
TYR
155
D
O
TYR
155
H
N
TYR
186
D
N
TYR
186
H
O
SER
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D
O
SER
187
H
N
VAL
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N
VAL
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H
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SER
163
D
O
SER
163
H
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D
N
ASN
207
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HIS
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D
N
HIS
210
H
O
THR
215
D
O
THR
215
X
O
SER
7
E
O
SER
7
X
N
THR
22
E
N
THR
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X
O
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23
E
O
CYS
23
X
N
PHE
71
E
N
PHE
71
X
N
THR
74
E
N
THR
74
X
O
SER
63
E
O
SER
63
X
N
LEU
11
E
N
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11
X
O
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103
E
O
LYS
103
X
N
VAL
104
E
N
VAL
104
X
O
ALA
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E
O
ALA
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X
O
GLN
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E
O
GLN
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X
N
ASN
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E
N
ASN
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X
O
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E
O
GLN
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LYS
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E
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LYS
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TYR
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E
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TYR
49
X
N
SER
53
E
N
SER
53
X
N
LEU
11
E
N
LEU
11
X
O
LYS
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E
O
LYS
103
X
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VAL
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E
N
VAL
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X
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E
O
ALA
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X
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E
N
GLN
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X
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97
E
O
THR
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X
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E
N
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X
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E
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VAL
133
X
O
PHE
139
E
O
PHE
139
X
N
TYR
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THR
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E
O
GLN
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LYS
149
E
O
LYS
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N
ALA
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N
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E
N
VAL
196
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VAL
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E
O
VAL
205
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O
SER
7
F
O
SER
7
Y
N
SER
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F
N
SER
21
Y
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N
CYS
22
Y
O
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F
O
ALA
79
Y
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F
N
GLN
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Y
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F
O
THR
69
Y
N
THR
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F
N
THR
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Y
O
TRP
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F
O
TRP
50
Y
O
ILE
51
F
O
ILE
51
Y
N
MET
34
F
N
MET
34
Y
O
GLN
39
F
O
GLN
39
Y
N
VAL
93
F
N
VAL
93
Y
N
LYS
98
F
N
LYS
98
Y
O
VAL
112
F
O
VAL
112
Y
N
THR
59
F
N
THR
59
Y
O
TRP
50
F
O
TRP
50
Y
O
ILE
51
F
O
ILE
51
Y
N
MET
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F
N
MET
34
Y
O
GLN
39
F
O
GLN
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N
VAL
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N
VAL
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Y
N
TYR
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F
N
TYR
94
Y
O
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117
F
O
THR
117
Y
N
THR
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F
N
THR
120
Y
O
GLY
10
F
O
GLY
10
Y
N
LEU
134
F
N
LEU
134
Y
O
GLY
149
F
O
GLY
149
Y
O
TYR
155
F
O
TYR
155
Y
N
TYR
186
F
N
TYR
186
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O
VAL
191
F
O
VAL
191
Y
N
HIS
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F
N
HIS
174
Y
N
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N
LEU
134
Y
O
GLY
149
F
O
GLY
149
Y
O
TYR
155
F
O
TYR
155
Y
N
TYR
186
F
N
TYR
186
Y
O
SER
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F
O
SER
187
Y
N
VAL
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N
VAL
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Y
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SER
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F
O
SER
163
Y
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F
N
ASN
207
Y
O
HIS
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F
O
HIS
210
Y
N
THR
215
F
N
THR
215
1
L
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214
C
CYS
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1
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1
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D
SER
138
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1
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1
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Y
1
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THR
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D
THR
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1
Y
1
H
SER
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D
SER
142
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Y
1
H
GLY
143
D
GLY
143
1
Y
1
H
SER
225
D
SER
225
1
Y
1
H
CYS
226
D
CYS
226
1
Y
1
H
ASP
227
D
ASP
227
1
Y
1
H
LYS
228
D
LYS
228
1
Y
1
H
THR
229
D
THR
229
1
Y
1
H
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230
D
HIS
230
1
Y
1
H
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231
D
LEU
231
1
Y
1
X
CYS
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E
CYS
214
1
Y
1
Y
SER
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F
SER
138
1
Y
1
Y
LYS
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F
LYS
139
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Y
1
Y
SER
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F
SER
140
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Y
1
Y
THR
141
F
THR
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1
Y
1
Y
SER
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F
SER
142
1
Y
1
Y
GLY
143
F
GLY
143
1
Y
1
Y
SER
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SER
225
1
Y
1
Y
CYS
226
F
CYS
226
1
Y
1
Y
ASP
227
F
ASP
227
1
Y
1
Y
LYS
228
F
LYS
228
1
Y
1
Y
THR
229
F
THR
229
1
Y
1
Y
HIS
230
F
HIS
230
1
Y
1
Y
LEU
231
F
LEU
231
1
Y
1
V
V
O
O
PRO
HOH
28
218
2.17
1
W
TYR
21
0.067
SIDE CHAIN
1
-4.25
0.50
120.30
116.05
V
V
V
NE
CZ
NH1
ARG
ARG
ARG
56
56
56
N
1
3.53
0.50
120.30
123.83
V
V
V
NE
CZ
NH2
ARG
ARG
ARG
56
56
56
N
1
-3.17
0.50
120.30
117.13
Y
Y
Y
NE
CZ
NH1
ARG
ARG
ARG
19
19
19
N
1
3.27
0.50
120.30
123.57
Y
Y
Y
NE
CZ
NH2
ARG
ARG
ARG
19
19
19
N
1
V
CYS
26
-18.34
119.13
1
V
GLU
42
-65.86
33.02
1
V
HIS
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78.51
-19.44
1
W
CYS
26
-11.95
115.19
1
W
TYR
39
-113.43
76.03
1
W
GLU
42
-75.79
41.85
1
W
HIS
86
76.09
-11.36
1
L
SER
30
57.33
-132.77
1
L
THR
51
66.51
-37.68
1
L
SER
67
178.80
164.31
1
L
ALA
84
177.25
-179.73
1
L
ASN
138
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1
X
SER
30
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1
X
THR
51
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-40.79
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X
ALA
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175.84
1
X
PRO
120
-53.07
100.93
1
X
ASP
122
-27.83
-71.65
1
X
ASN
138
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1
X
ASN
152
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1
X
LYS
169
-93.60
-66.03
1
X
ALA
184
-66.92
-77.40
1
X
LYS
190
-131.55
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1
X
PRO
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-45.87
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1
X
ARG
211
-41.51
108.18
1
Y
GLN
3
-170.31
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1
Y
LYS
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1
Y
PRO
136
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-161.36
1
Y
ASP
154
45.24
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1
Y
THR
170
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1
Y
SER
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9.9
97.1
SAME AS ENTRY 1BJ1
10000000.00
0.00
1
RESTRAINED
THROUGHOUT
0.2
0.0
ENGH & HUBER
0.38
0.29
5.00
0.36
0.29
2.40
20.00
419
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10
0
8148
0.012
1.6
29.6
0.92
2.58
1.50
3.76
2.00
4.57
2.00
6.07
2.50
1
RESTRAINED
1
X-RAY DIFFRACTION
0.356
0.012
0.31
2.55
902
9243
6
8.9
96.3
48.1
2.4
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1CZ8
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61742
0.0
0.0
0.076
1
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3.4
97.4
0.38
2.40
2.53
1
2.5
96.7
data reduction
MOSFLM
data reduction
TRUNCATE
model building
X-PLOR
refinement
X-PLOR
98.1
data scaling
CCP4
(TRUNCATE)
phasing
X-PLOR
VASCULAR ENDOTHELIAL GROWTH FACTOR/LIGHT CHAIN OF NEUTRALIZING ANTIBODY/HEAVY CHAIN OF NEUTRALIZING ANTIBODY COMPLEX
VASCULAR ENDOTHELIAL GROWTH FACTOR IN COMPLEX WITH AN AFFINITY MATURED ANTIBODY
1
N
N
1
N
N
2
N
N
3
N
N
2
N
N
3
N
N
4
N
N
4
N
N
5
N
N
5
N
N
5
N
N
5
N
N
5
N
N
5
N
N
V
LYS
16
A
LYS
3
HELX_P
V
TYR
25
A
TYR
12
1
1
10
V
ILE
35
A
ILE
22
HELX_P
V
TYR
39
A
TYR
26
1
2
5
W
LYS
16
B
LYS
3
HELX_P
W
TYR
25
B
TYR
12
1
3
10
W
ILE
35
B
ILE
22
HELX_P
W
TYR
39
B
TYR
26
1
4
5
L
GLN
79
C
GLN
79
HELX_P
L
PHE
83
C
PHE
83
5
5
5
L
SER
121
C
SER
121
HELX_P
L
LYS
126
C
LYS
126
1
6
6
L
LYS
183
C
LYS
183
HELX_P
L
HIS
189
C
HIS
189
1
7
7
H
ASP
28
D
ASP
28
HELX_P
H
HIS
31
D
HIS
31
5
8
4
H
ALA
62
D
ALA
62
HELX_P
H
LYS
65
D
LYS
65
5
9
4
H
THR
74
D
THR
74
HELX_P
H
LYS
76
D
LYS
76
5
10
3
H
ARG
87
D
ARG
87
HELX_P
H
THR
91
D
THR
91
5
11
5
H
SER
166
D
SER
166
HELX_P
H
ALA
168
D
ALA
168
5
12
3
H
SER
197
D
SER
197
HELX_P
H
LEU
199
D
LEU
199
5
13
3
H
LYS
211
D
LYS
211
HELX_P
H
ASN
214
D
ASN
214
5
14
4
X
GLN
79
E
GLN
79
HELX_P
X
PHE
83
E
PHE
83
5
15
5
X
SER
121
E
SER
121
HELX_P
X
LYS
126
E
LYS
126
1
16
6
X
SER
182
E
SER
182
HELX_P
X
GLU
187
E
GLU
187
1
17
6
Y
ASP
28
F
ASP
28
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Y
HIS
31
F
HIS
31
5
18
4
Y
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62
F
ALA
62
HELX_P
Y
LYS
65
F
LYS
65
5
19
4
Y
THR
74
F
THR
74
HELX_P
Y
LYS
76
F
LYS
76
5
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3
Y
ARG
87
F
ARG
87
HELX_P
Y
THR
91
F
THR
91
5
21
5
Y
SER
166
F
SER
166
HELX_P
Y
ALA
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F
ALA
168
5
22
3
Y
SER
197
F
SER
197
HELX_P
Y
LEU
199
F
LEU
199
5
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3
Y
LYS
211
F
LYS
211
HELX_P
Y
ASN
214
F
ASN
214
5
24
4
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V
CYS
26
A
SG
CYS
13
1_555
V
CYS
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A
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1_555
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V
CYS
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A
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W
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B
SG
CYS
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1_555
disulf
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V
CYS
57
A
SG
CYS
44
1_555
V
CYS
102
A
SG
CYS
89
1_555
disulf
2.067
V
CYS
60
A
SG
CYS
47
1_555
W
CYS
51
B
SG
CYS
38
1_555
disulf
2.025
V
CYS
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A
SG
CYS
48
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V
CYS
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A
SG
CYS
91
1_555
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W
CYS
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B
SG
CYS
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1_555
W
CYS
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B
SG
CYS
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1_555
disulf
2.045
W
CYS
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B
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CYS
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W
CYS
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B
SG
CYS
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1_555
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W
CYS
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B
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W
CYS
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B
SG
CYS
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L
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CYS
23
1_555
L
CYS
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C
SG
CYS
88
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L
CYS
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C
SG
CYS
134
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L
CYS
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C
SG
CYS
194
1_555
disulf
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H
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D
SG
CYS
22
1_555
H
CYS
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D
SG
CYS
96
1_555
disulf
2.026
H
CYS
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D
SG
CYS
150
1_555
H
CYS
206
D
SG
CYS
206
1_555
disulf
2.071
X
CYS
23
E
SG
CYS
23
1_555
X
CYS
88
E
SG
CYS
88
1_555
disulf
2.041
X
CYS
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E
SG
CYS
134
1_555
X
CYS
194
E
SG
CYS
194
1_555
disulf
2.045
Y
CYS
22
F
SG
CYS
22
1_555
Y
CYS
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F
SG
CYS
96
1_555
disulf
2.033
Y
CYS
150
F
SG
CYS
150
1_555
Y
CYS
206
F
SG
CYS
206
1_555
IMMUNE SYSTEM
COMPLEX (ANTIBODY-ANTIGEN), CYSTINE KNOT, FAB FRAGMENT, IMMUNE SYSTEM
V
LYS
48
A
LYS
35
1
V
PRO
49
A
PRO
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-0.46
W
LYS
48
B
LYS
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1
W
PRO
49
B
PRO
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L
SER
7
C
SER
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1
L
PRO
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C
PRO
8
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L
VAL
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C
VAL
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L
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C
PRO
95
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L
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C
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L
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C
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H
PHE
156
D
PHE
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1
H
PRO
157
D
PRO
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-0.75
H
GLU
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D
GLU
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H
PRO
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D
PRO
159
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X
SER
7
E
SER
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1
X
PRO
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E
PRO
8
-0.47
X
VAL
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E
VAL
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X
PRO
95
E
PRO
95
-0.09
X
TYR
140
E
TYR
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1
X
PRO
141
E
PRO
141
0.00
Y
PHE
156
F
PHE
156
1
Y
PRO
157
F
PRO
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-0.27
Y
GLU
158
F
GLU
158
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Y
PRO
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F
PRO
159
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UNP
1
40
P15692
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1CZ8
1CZ8
PDB
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1
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P15692
W
1
1
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214
1CZ8
1
214
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L
2
1
214
1
214
1CZ8
1
214
1CZ8
X
2
1
214
1
231
1CZ8
1
231
1CZ8
H
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1
231
1
231
1CZ8
1
231
1CZ8
Y
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1
231
2
4
2
3
3
4
6
4
4
4
4
5
6
4
4
3
4
6
4
4
3
4
5
6
4
4
3
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
V
HIS
27
A
HIS
14
V
ASP
34
A
ASP
21
V
CYS
51
A
CYS
38
V
GLY
58
A
GLY
45
V
ILE
46
A
ILE
33
V
LYS
48
A
LYS
35
V
LEU
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A
LEU
53
V
LYS
84
A
LYS
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V
GLY
88
A
GLY
75
V
PRO
106
A
PRO
93
Y
TYR
102
F
TYR
102
Y
TYR
103
F
TYR
103
W
HIS
27
B
HIS
14
W
ASP
34
B
ASP
21
W
CYS
51
B
CYS
38
W
GLY
58
B
GLY
45
W
ILE
46
B
ILE
33
W
LYS
48
B
LYS
35
W
MET
81
B
MET
68
W
LYS
84
B
LYS
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W
GLY
88
B
GLY
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HIS
90
B
HIS
77
W
LEU
66
B
LEU
53
W
GLN
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B
GLN
66
W
GLY
92
B
GLY
79
W
PRO
106
B
PRO
93
H
TYR
102
D
TYR
102
H
TYR
103
D
TYR
103
L
LEU
4
C
LEU
4
L
SER
7
C
SER
7
L
VAL
19
C
VAL
19
L
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C
ALA
25
L
ASP
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C
ASP
70
L
ILE
75
C
ILE
75
L
PHE
62
C
PHE
62
L
SER
67
C
SER
67
L
SER
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C
SER
10
L
SER
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C
SER
14
L
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102
C
THR
102
L
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C
LYS
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L
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C
ALA
84
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C
GLN
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C
LEU
33
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C
GLN
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C
LYS
45
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C
TYR
49
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C
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53
L
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C
LEU
54
L
SER
10
C
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10
L
SER
14
C
SER
14
L
THR
102
C
THR
102
L
LYS
107
C
LYS
107
L
ALA
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C
ALA
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C
GLN
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C
THR
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PHE
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C
PHE
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L
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C
SER
114
L
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C
PHE
118
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C
THR
129
L
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C
PHE
139
L
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C
TYR
173
L
SER
182
C
SER
182
L
SER
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C
SER
159
L
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C
VAL
163
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C
ALA
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L
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C
LEU
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L
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C
LYS
145
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C
VAL
150
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VAL
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VAL
205
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C
ASN
210
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D
GLN
3
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7
D
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H
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D
LEU
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H
SER
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D
SER
25
H
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D
THR
78
H
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D
MET
83
H
PHE
68
D
PHE
68
H
ASP
73
D
ASP
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H
PRO
58
D
PRO
58
H
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D
TYR
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H
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GLU
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51
D
ILE
51
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34
D
MET
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D
GLN
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D
ALA
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LYS
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D
VAL
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D
TRP
113
H
PRO
58
D
PRO
58
H
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D
TYR
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D
GLU
46
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ILE
51
D
ILE
51
H
MET
34
D
MET
34
H
GLN
39
D
GLN
39
H
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92
D
ALA
92
H
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D
LYS
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D
THR
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D
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D
GLY
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H
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D
SER
130
H
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D
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D
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D
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D
PRO
195
H
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D
VAL
173
H
THR
175
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THR
175
H
SER
130
D
SER
130
H
LEU
134
D
LEU
134
H
THR
145
D
THR
145
H
TYR
155
D
TYR
155
H
TYR
186
D
TYR
186
H
PRO
195
D
PRO
195
H
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179
D
VAL
179
H
LEU
180
D
LEU
180
H
THR
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D
THR
161
H
TRP
164
D
TRP
164
H
ILE
205
D
ILE
205
H
HIS
210
D
HIS
210
H
THR
215
D
THR
215
H
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D
LYS
220
X
LEU
4
E
LEU
4
X
SER
7
E
SER
7
X
VAL
19
E
VAL
19
X
ALA
25
E
ALA
25
X
ASP
70
E
ASP
70
X
ILE
75
E
ILE
75
X
PHE
62
E
PHE
62
X
SER
67
E
SER
67
X
SER
10
E
SER
10
X
SER
14
E
SER
14
X
THR
102
E
THR
102
X
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E
LYS
107
X
ALA
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E
ALA
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X
GLN
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E
GLN
90
X
LEU
33
E
LEU
33
X
GLN
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E
GLN
38
X
LYS
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E
LYS
45
X
TYR
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E
TYR
49
X
SER
53
E
SER
53
X
LEU
54
E
LEU
54
X
SER
10
E
SER
10
X
SER
14
E
SER
14
X
THR
102
E
THR
102
X
LYS
107
E
LYS
107
X
ALA
84
E
ALA
84
X
GLN
90
E
GLN
90
X
THR
97
E
THR
97
X
PHE
98
E
PHE
98
X
SER
114
E
SER
114
X
PHE
118
E
PHE
118
X
ALA
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E
ALA
130
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PHE
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E
PHE
139
X
TYR
173
E
TYR
173
X
LEU
181
E
LEU
181
X
SER
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E
SER
159
X
VAL
163
E
VAL
163
X
LYS
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E
LYS
145
X
VAL
150
E
VAL
150
X
VAL
191
E
VAL
191
X
THR
197
E
THR
197
X
VAL
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E
VAL
205
X
ASN
210
E
ASN
210
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GLN
3
F
GLN
3
Y
SER
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F
SER
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Y
LEU
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F
LEU
18
Y
SER
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F
SER
25
Y
THR
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F
THR
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Y
MET
83
F
MET
83
Y
PHE
68
F
PHE
68
Y
ASP
73
F
ASP
73
Y
PRO
58
F
PRO
58
Y
TYR
60
F
TYR
60
Y
GLU
46
F
GLU
46
Y
ILE
51
F
ILE
51
Y
MET
34
F
MET
34
Y
GLN
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F
GLN
39
Y
ALA
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F
ALA
92
Y
LYS
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F
LYS
98
Y
VAL
112
F
VAL
112
Y
TRP
113
F
TRP
113
Y
PRO
58
F
PRO
58
Y
TYR
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F
TYR
60
Y
GLU
46
F
GLU
46
Y
ILE
51
F
ILE
51
Y
MET
34
F
MET
34
Y
GLN
39
F
GLN
39
Y
ALA
92
F
ALA
92
Y
LYS
98
F
LYS
98
Y
THR
117
F
THR
117
Y
VAL
121
F
VAL
121
Y
GLY
10
F
GLY
10
Y
VAL
12
F
VAL
12
Y
SER
130
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SER
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