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186 N H N 187 N H N 188 N H N 189 N H N 190 N H N 191 N H N 192 N H N 193 N H N 194 N H N 195 N H N 196 N H N 197 N N N 198 S C N 199 N C N 200 N O N 201 N C N 202 N C N 203 N C N 204 N C N 205 N O N 206 N H N 207 N H N 208 N H N 209 N H N 210 N H N 211 N H N 212 N H N 213 N H N 214 N H N 215 N H N 216 N H N 217 N H N 218 N H N 219 N N N 220 S C N 221 N C N 222 N O N 223 N C N 224 N C N 225 N C N 226 N C N 227 N N N 228 N O N 229 N H N 230 N H N 231 N H N 232 N H N 233 N H N 234 N H N 235 N H N 236 N H N 237 N H N 238 N H N 239 N H N 240 N H N 241 N H N 242 N H N 243 N H N 244 N N N 245 S C N 246 N C N 247 N O N 248 N C N 249 N C N 250 N S N 251 N C N 252 N O N 253 N H N 254 N H N 255 N H N 256 N H N 257 N H N 258 N H N 259 N H N 260 N H N 261 N H N 262 N H N 263 N H N 264 N N N 265 S C N 266 N C N 267 N O N 268 N C Y 269 N C Y 270 N C Y 271 N C Y 272 N C Y 273 N C Y 274 N C N 275 N O N 276 N H N 277 N H N 278 N H N 279 N H N 280 N H N 281 N H N 282 N H N 283 N H N 284 N H N 285 N H N 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JMOBAK 0070 0022-2836 303 405 421 10.1006/jmbi.2000.4138 11031117 Active site modulation in the N-acetylneuraminate lyase sub-family as revealed by the structure of the inhibitor-complexed Haemophilus influenzae enzyme. 2000 10.2210/pdb1f6k/pdb pdb_00001f6k 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 0.00000 0.00000 113 1 IMAGE PLATE 1996-11-11 RIGAKU RAXIS II SINGLE WAVELENGTH M x-ray 1 1.5418 1.0 1.5418 ROTATING ANODE MACSCIENCE 32561.570 N-ACETYLNEURAMINATE LYASE 4.1.3.3 2 man polymer 96.063 SULFATE ION 5 syn non-polymer 92.094 GLYCEROL 4 syn non-polymer 18.015 water 890 nat water no no MRDLKGIFSALLVSFNEDGTINEKGLRQIIRHNIDKMKVDGLYVGGSTGENFMLSTEEKKEIFRIAKDEAKDQIALIAQV GSVNLKEAVELGKYATELGYDCLSAVTPFYYKFSFPEIKHYYDTIIAETGSNMIVYSIPFLTGVNMGIEQFGELYKNPKV LGVKFTAGDFYLLERLKKAYPNHLIWAGFDEMMLPAASLGVDGAIGSTFNVNGVRARQIFELTKAGKLKEALEIQHVTND LIEGILANGLYLTIKELLKLEGVDAGYCREPMTSKATAEQVAKAKDLKAKFLS MRDLKGIFSALLVSFNEDGTINEKGLRQIIRHNIDKMKVDGLYVGGSTGENFMLSTEEKKEIFRIAKDEAKDQIALIAQV GSVNLKEAVELGKYATELGYDCLSAVTPFYYKFSFPEIKHYYDTIIAETGSNMIVYSIPFLTGVNMGIEQFGELYKNPKV LGVKFTAGDFYLLERLKKAYPNHLIWAGFDEMMLPAASLGVDGAIGSTFNVNGVRARQIFELTKAGKLKEALEIQHVTND LIEGILANGLYLTIKELLKLEGVDAGYCREPMTSKATAEQVAKAKDLKAKFLS A,C polypeptide(L) n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n Haemophilus Escherichia sample 727 Haemophilus influenzae 562 Escherichia coli PLASMID PKKTAC (VTT BIOTECH, FINLAND) 1 2.43 49.39 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP 4.6 PEG 4000, ammonium sulphate, sodium acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 20.0K 293.0 exptl_crystal_grow chem_comp_atom chem_comp_bond database_2 struct_ref_seq_dif struct_site repository Initial release Version format compliance Derived calculations Version format compliance Experimental preparation Data collection Database references Derived calculations 1 0 2000-12-20 1 1 2008-04-27 1 2 2011-07-13 1 3 2018-01-31 1 4 2024-02-07 _exptl_crystal_grow.temp _database_2.pdbx_DOI _database_2.pdbx_database_accession _struct_ref_seq_dif.details _struct_site.pdbx_auth_asym_id _struct_site.pdbx_auth_comp_id _struct_site.pdbx_auth_seq_id N-acetylneuraminate lyase from Escherichia coli Izard, T., Lawrence, M.C., Malby, R.L., Lilley, G.G., Colman, P.M.: The three-dimensional struture of N-acetylneuraminate lyase Escherichia coli. Structure (1994) 2, 361. Structure and Mechansism of a Sub-Family of Enzymes Related to N-acetylneuraminate Lyase M.C. Lawrence, J.A.R.G. Barbosa, B.J. Smith, N.E. Hall, P.A. Pilling, H,C, Ooi, S.M. Marcuccio J. Mol. Biol. (1997) 266, 381-399 Structure and Mechansism of a Sub-Family of Enzymes Related to N-acetylneuraminate Lyase M.C. Lawrence, J.A.R.G. Barbosa, B.J. Smith, N.E. Hall, P.A. Pilling, H,C, Ooi, S.M. Marcuccio J. Mol. Biol. (1997) 266, 381-399 Crystal Structure Analysis of N-acetylneuraminate lyase from Haemophilus influenzae: crystal form I RCSB Y RCSB 2000-06-21 REL REL SO4 SULFATE ION GOL GLYCEROL HOH water SO4 1 2 SO4 SO4 2001 A SO4 4 2 SO4 SO4 2004 A SO4 5 2 SO4 SO4 2005 A GOL 1 3 GOL GOL 1001 A GOL 3 3 GOL GOL 1003 A GOL 4 3 GOL GOL 1004 A SO4 2 2 SO4 SO4 2002 C SO4 3 2 SO4 SO4 2003 C GOL 5 3 GOL GOL 1005 C WAT 1 4 HOH HOH 2006 A WAT 3 4 HOH HOH 2007 A WAT 4 4 HOH HOH 2008 A WAT 6 4 HOH HOH 2009 A WAT 7 4 HOH HOH 2010 A WAT 8 4 HOH HOH 2011 A WAT 9 4 HOH HOH 2012 A WAT 11 4 HOH HOH 2013 A WAT 12 4 HOH HOH 2014 A WAT 13 4 HOH HOH 2015 A WAT 17 4 HOH HOH 2016 A WAT 18 4 HOH HOH 2017 A WAT 21 4 HOH HOH 2018 A WAT 25 4 HOH HOH 2019 A WAT 26 4 HOH HOH 2020 A WAT 27 4 HOH HOH 2021 A WAT 28 4 HOH HOH 2022 A WAT 29 4 HOH HOH 2023 A WAT 30 4 HOH HOH 2024 A WAT 31 4 HOH HOH 2025 A WAT 32 4 HOH HOH 2026 A WAT 34 4 HOH HOH 2027 A WAT 36 4 HOH HOH 2028 A WAT 37 4 HOH HOH 2029 A WAT 39 4 HOH HOH 2030 A WAT 40 4 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WAT 393 4 HOH HOH 2233 A WAT 394 4 HOH HOH 2234 A WAT 395 4 HOH HOH 2235 A WAT 399 4 HOH HOH 2236 A WAT 400 4 HOH HOH 2237 A WAT 401 4 HOH HOH 2238 A WAT 402 4 HOH HOH 2239 A WAT 404 4 HOH HOH 2240 A WAT 405 4 HOH HOH 2241 A WAT 406 4 HOH HOH 2242 A WAT 407 4 HOH HOH 2243 A WAT 408 4 HOH HOH 2244 A WAT 410 4 HOH HOH 2245 A WAT 413 4 HOH HOH 2246 A WAT 414 4 HOH HOH 2247 A WAT 415 4 HOH HOH 2248 A WAT 416 4 HOH HOH 2249 A WAT 417 4 HOH HOH 2250 A WAT 419 4 HOH HOH 2251 A WAT 423 4 HOH HOH 2252 A WAT 424 4 HOH HOH 2253 A WAT 426 4 HOH HOH 2254 A WAT 431 4 HOH HOH 2255 A WAT 433 4 HOH HOH 2256 A WAT 434 4 HOH HOH 2257 A WAT 436 4 HOH HOH 2258 A WAT 438 4 HOH HOH 2259 A WAT 441 4 HOH HOH 2260 A WAT 445 4 HOH HOH 2261 A WAT 446 4 HOH HOH 2262 A WAT 447 4 HOH HOH 2263 A WAT 451 4 HOH HOH 2264 A WAT 452 4 HOH HOH 2265 A WAT 454 4 HOH HOH 2266 A WAT 456 4 HOH HOH 2267 A WAT 457 4 HOH HOH 2268 A WAT 458 4 HOH HOH 2269 A WAT 459 4 HOH HOH 2270 A WAT 464 4 HOH HOH 2271 A WAT 465 4 HOH HOH 2272 A 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N N 4 N N 4 N N The biological assembly is a tetramer constructed from chains A and C generated by the two-fold. A ASN 22 A ASN 22 HELX_P A LYS 36 A LYS 36 1 1 15 A GLY 46 A GLY 46 HELX_P A GLU 50 A GLU 50 5 2 5 A GLU 50 A GLU 50 HELX_P A LEU 54 A LEU 54 5 3 5 A SER 55 A SER 55 HELX_P A LYS 71 A LYS 71 1 4 17 A ASN 84 A ASN 84 HELX_P A GLY 99 A GLY 99 1 5 16 A SER 114 A SER 114 HELX_P A GLY 130 A GLY 130 1 6 17 A ILE 138 A ILE 138 HELX_P A GLY 143 A GLY 143 1 7 6 A GLY 147 A GLY 147 HELX_P A LYS 156 A LYS 156 1 8 10 A ASP 169 A ASP 169 HELX_P A TYR 180 A TYR 180 1 9 12 A PHE 189 A PHE 189 HELX_P A GLU 191 A GLU 191 5 10 3 A MET 192 A MET 192 HELX_P A LEU 199 A LEU 199 1 11 8 A THR 208 A THR 208 HELX_P A GLY 213 A GLY 213 1 12 6 A ASN 212 A ASN 212 HELX_P A ALA 225 A ALA 225 1 13 14 A LYS 227 A LYS 227 HELX_P A GLY 249 A GLY 249 1 14 23 A GLY 249 A GLY 249 HELX_P A GLU 261 A GLU 261 1 15 13 A THR 277 A THR 277 HELX_P A LEU 292 A LEU 292 1 16 16 C ASN 22 B ASN 22 HELX_P C LYS 36 B LYS 36 1 17 15 C GLY 46 B GLY 46 HELX_P C GLU 50 B GLU 50 5 18 5 C GLU 50 B GLU 50 HELX_P C LEU 54 B LEU 54 5 19 5 C 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44 C ALA 75 B ALA 75 C GLN 79 B GLN 79 C CYS 102 B CYS 102 C SER 104 B SER 104 C MET 133 B MET 133 C SER 137 B SER 137 C VAL 160 B VAL 160 C PHE 165 B PHE 165 C LEU 184 B LEU 184 C ALA 187 B ALA 187 C GLY 203 B GLY 203 C GLY 206 B GLY 206 C GLY 6 B GLY 6 C ALA 10 B ALA 10 BINDING SITE FOR RESIDUE SO4 A 2001 A SO4 2001 Software 9 BINDING SITE FOR RESIDUE SO4 C 2002 C SO4 2002 Software 7 BINDING SITE FOR RESIDUE SO4 C 2003 C SO4 2003 Software 8 BINDING SITE FOR RESIDUE SO4 A 2004 A SO4 2004 Software 8 BINDING SITE FOR RESIDUE SO4 A 2005 A SO4 2005 Software 5 BINDING SITE FOR RESIDUE GOL A 1001 A GOL 1001 Software 9 BINDING SITE FOR RESIDUE GOL A 1003 A GOL 1003 Software 7 BINDING SITE FOR RESIDUE GOL A 1004 A GOL 1004 Software 8 BINDING SITE FOR RESIDUE GOL C 1005 C GOL 1005 Software 8 A ALA 10 A ALA 10 9 1_555 A TYR 43 A TYR 43 9 1_555 A GLY 46 A GLY 46 9 1_555 A SER 47 A SER 47 9 1_555 A THR 48 A THR 48 9 1_555 A TYR 136 A TYR 136 9 1_555 A LYS 164 A LYS 164 9 1_555 A HOH 2072 L HOH 9 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