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0.00000
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Smith, B.J.
DeGori, R.
Lawrence, M.C.
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90.00
90.00
90.00
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C3 H7 N O2
89.093
y
ALANINE
L-peptide linking
C6 H15 N4 O2 1
175.209
y
ARGININE
L-peptide linking
C4 H8 N2 O3
132.118
y
ASPARAGINE
L-peptide linking
C4 H7 N O4
133.103
y
ASPARTIC ACID
L-peptide linking
Cl -1
35.453
CHLORIDE ION
non-polymer
C3 H7 N O2 S
121.158
y
CYSTEINE
L-peptide linking
C5 H10 N2 O3
146.144
y
GLUTAMINE
L-peptide linking
C5 H9 N O4
147.129
y
GLUTAMIC ACID
L-peptide linking
C2 H5 N O2
75.067
y
GLYCINE
peptide linking
C3 H8 O3
92.094
GLYCEROL
GLYCERIN; PROPANE-1,2,3-TRIOL
non-polymer
C6 H10 N3 O2 1
156.162
y
HISTIDINE
L-peptide linking
H2 O
18.015
WATER
non-polymer
C6 H13 N O2
131.173
y
ISOLEUCINE
L-peptide linking
C6 H13 N O2
131.173
y
LEUCINE
L-peptide linking
C6 H15 N2 O2 1
147.195
y
LYSINE
L-peptide linking
C5 H11 N O2 S
149.211
y
METHIONINE
L-peptide linking
C11 H19 N O8
293.270
6,7,8,9-TETRAHYDROXY-5-METHYLCARBOXAMIDO-2-OXONONANOIC ACID
non-polymer
C9 H11 N O2
165.189
y
PHENYLALANINE
L-peptide linking
C5 H9 N O2
115.130
y
PROLINE
L-peptide linking
C3 H7 N O3
105.093
y
SERINE
L-peptide linking
C4 H9 N O3
119.119
y
THREONINE
L-peptide linking
C11 H12 N2 O2
204.225
y
TRYPTOPHAN
L-peptide linking
C9 H11 N O3
181.189
y
TYROSINE
L-peptide linking
C5 H11 N O2
117.146
y
VALINE
L-peptide linking
N
1
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N
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2
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C
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N-acetylneuraminate Lyase from Escherichia coli. Izard, T., Lawrence, M.C., Malby, R.L., Lilley, G.G., Colman, P.M. The Three-dimensional Struture of N-acetylneuraminate Lyase from Escherichia coli. Structure (1994) 2, 361.
Structure and Mechanism of a Sub-Family of Enzymes Related to N-acetylneuraminate Lyase. Lawrence, M.C., Barbosa, J.A.R.G., Smith, B.J., Hall, N.E., Pilling, P.A., Ooi, H.C., Marcuccio, S.M. J. Mol. Biol. (1997) 266, 381-399
Structure and Mechanism of a Sub-Family of Enzymes Related to N-acetylneuraminate Lyase. Lawrence, M.C., Barbosa, J.A.R.G., Smith, B.J., Hall, N.E., Pilling, P.A., Ooi, H.C., Marcuccio, S.M. J. Mol. Biol. (1997) 266, 381-399
Active Site Modulation in the N-acetylneuraminate Lyase Sub-family as Revealed by the Structure of the Inhibitor-Complexed Haemophilus influenzae Enzyme
Active Site Modulation in the N-acetylneuraminate Lyase Sub-family as Revealed by the Structure of the Inhibitor-Complexed Haemophilus influenzae Enzyme
Active Site Modulation in the N-acetylneuraminate Lyase Sub-family as Revealed by the Structure of the Inhibitor-Complexed Haemophilus influenzae Enzyme
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2000-06-26
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C
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C
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HOH
HOH
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HOH
HOH
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C
WAT
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HOH
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C
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HOH
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C
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HOH
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C
WAT
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HOH
HOH
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C
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C
WAT
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WAT
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HOH
HOH
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C
WAT
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5
HOH
HOH
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HOH
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HOH
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HOH
HOH
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HOH
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HOH
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HOH
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HOH
HOH
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C
WAT
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5
HOH
HOH
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C
WAT
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5
HOH
HOH
1326
C
WAT
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5
HOH
HOH
1327
C
WAT
754
5
HOH
HOH
1328
C
WAT
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5
HOH
HOH
1329
C
WAT
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5
HOH
HOH
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C
WAT
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5
HOH
HOH
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C
WAT
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HOH
HOH
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C
WAT
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5
HOH
HOH
1333
C
WAT
764
5
HOH
HOH
1334
C
WAT
766
5
HOH
HOH
1335
C
WAT
767
5
HOH
HOH
1336
C
WAT
768
5
HOH
HOH
1337
C
WAT
770
5
HOH
HOH
1338
C
WAT
771
5
HOH
HOH
1339
C
WAT
773
5
HOH
HOH
1340
C
WAT
775
5
HOH
HOH
1341
C
WAT
778
5
HOH
HOH
1342
C
WAT
782
5
HOH
HOH
1343
C
WAT
785
5
HOH
HOH
1344
C
WAT
793
5
HOH
HOH
1345
C
WAT
797
5
HOH
HOH
1346
C
WAT
805
5
HOH
HOH
1347
C
WAT
807
5
HOH
HOH
1348
C
WAT
810
5
HOH
HOH
1349
C
WAT
812
5
HOH
HOH
1350
C
WAT
817
5
HOH
HOH
1351
C
WAT
820
5
HOH
HOH
1352
C
WAT
822
5
HOH
HOH
1353
C
WAT
824
5
HOH
HOH
1354
C
WAT
826
5
HOH
HOH
1355
C
WAT
827
5
HOH
HOH
1356
C
WAT
828
5
HOH
HOH
1357
C
WAT
829
5
HOH
HOH
1358
C
WAT
835
5
HOH
HOH
1359
C
WAT
838
5
HOH
HOH
1360
C
WAT
842
5
HOH
HOH
1361
C
WAT
844
5
HOH
HOH
1362
C
WAT
848
5
HOH
HOH
1363
C
WAT
851
5
HOH
HOH
1364
C
WAT
852
5
HOH
HOH
1365
C
WAT
853
5
HOH
HOH
1366
C
WAT
856
5
HOH
HOH
1367
C
WAT
865
5
HOH
HOH
1368
C
WAT
868
5
HOH
HOH
1369
C
WAT
869
5
HOH
HOH
1370
C
WAT
876
5
HOH
HOH
1371
C
WAT
881
5
HOH
HOH
1372
C
WAT
882
5
HOH
HOH
1373
C
WAT
883
5
HOH
HOH
1374
C
WAT
886
5
HOH
HOH
1375
C
WAT
888
5
HOH
HOH
1376
C
WAT
895
5
HOH
HOH
1377
C
WAT
900
5
HOH
HOH
1378
C
WAT
901
5
HOH
HOH
1379
C
WAT
902
5
HOH
HOH
1380
C
WAT
903
5
HOH
HOH
1381
C
WAT
904
5
HOH
HOH
1382
C
WAT
905
5
HOH
HOH
1383
C
WAT
907
5
HOH
HOH
1384
C
WAT
910
5
HOH
HOH
1385
C
WAT
912
5
HOH
HOH
1386
C
WAT
915
5
HOH
HOH
1387
C
WAT
917
5
HOH
HOH
1388
C
WAT
920
5
HOH
HOH
1389
C
WAT
921
5
HOH
HOH
1390
C
WAT
923
5
HOH
HOH
1391
C
WAT
924
5
HOH
HOH
1392
C
WAT
925
5
HOH
HOH
1393
C
WAT
929
5
HOH
HOH
1394
C
MET
1
n
1
MET
1
A
ARG
2
n
2
ARG
2
A
ASP
3
n
3
ASP
3
A
LEU
4
n
4
LEU
4
A
LYS
5
n
5
LYS
5
A
GLY
6
n
6
GLY
6
A
ILE
7
n
7
ILE
7
A
PHE
8
n
8
PHE
8
A
SER
9
n
9
SER
9
A
ALA
10
n
10
ALA
10
A
LEU
11
n
11
LEU
11
A
LEU
12
n
12
LEU
12
A
VAL
13
n
13
VAL
13
A
SER
14
n
14
SER
14
A
PHE
15
n
15
PHE
15
A
ASN
16
n
16
ASN
16
A
GLU
17
n
17
GLU
17
A
ASP
18
n
18
ASP
18
A
GLY
19
n
19
GLY
19
A
THR
20
n
20
THR
20
A
ILE
21
n
21
ILE
21
A
ASN
22
n
22
ASN
22
A
GLU
23
n
23
GLU
23
A
LYS
24
n
24
LYS
24
A
GLY
25
n
25
GLY
25
A
LEU
26
n
26
LEU
26
A
ARG
27
n
27
ARG
27
A
GLN
28
n
28
GLN
28
A
ILE
29
n
29
ILE
29
A
ILE
30
n
30
ILE
30
A
ARG
31
n
31
ARG
31
A
HIS
32
n
32
HIS
32
A
ASN
33
n
33
ASN
33
A
ILE
34
n
34
ILE
34
A
ASP
35
n
35
ASP
35
A
LYS
36
n
36
LYS
36
A
MET
37
n
37
MET
37
A
LYS
38
n
38
LYS
38
A
VAL
39
n
39
VAL
39
A
ASP
40
n
40
ASP
40
A
GLY
41
n
41
GLY
41
A
LEU
42
n
42
LEU
42
A
TYR
43
n
43
TYR
43
A
VAL
44
n
44
VAL
44
A
GLY
45
n
45
GLY
45
A
GLY
46
n
46
GLY
46
A
SER
47
n
47
SER
47
A
THR
48
n
48
THR
48
A
GLY
49
n
49
GLY
49
A
GLU
50
n
50
GLU
50
A
ASN
51
n
51
ASN
51
A
PHE
52
n
52
PHE
52
A
MET
53
n
53
MET
53
A
LEU
54
n
54
LEU
54
A
SER
55
n
55
SER
55
A
THR
56
n
56
THR
56
A
GLU
57
n
57
GLU
57
A
GLU
58
n
58
GLU
58
A
LYS
59
n
59
LYS
59
A
LYS
60
n
60
LYS
60
A
GLU
61
n
61
GLU
61
A
ILE
62
n
62
ILE
62
A
PHE
63
n
63
PHE
63
A
ARG
64
n
64
ARG
64
A
ILE
65
n
65
ILE
65
A
ALA
66
n
66
ALA
66
A
LYS
67
n
67
LYS
67
A
ASP
68
n
68
ASP
68
A
GLU
69
n
69
GLU
69
A
ALA
70
n
70
ALA
70
A
LYS
71
n
71
LYS
71
A
ASP
72
n
72
ASP
72
A
GLN
73
n
73
GLN
73
A
ILE
74
n
74
ILE
74
A
ALA
75
n
75
ALA
75
A
LEU
76
n
76
LEU
76
A
ILE
77
n
77
ILE
77
A
ALA
78
n
78
ALA
78
A
GLN
79
n
79
GLN
79
A
VAL
80
n
80
VAL
80
A
GLY
81
n
81
GLY
81
A
SER
82
n
82
SER
82
A
VAL
83
n
83
VAL
83
A
ASN
84
n
84
ASN
84
A
LEU
85
n
85
LEU
85
A
LYS
86
n
86
LYS
86
A
GLU
87
n
87
GLU
87
A
ALA
88
n
88
ALA
88
A
VAL
89
n
89
VAL
89
A
GLU
90
n
90
GLU
90
A
LEU
91
n
91
LEU
91
A
GLY
92
n
92
GLY
92
A
LYS
93
n
93
LYS
93
A
TYR
94
n
94
TYR
94
A
ALA
95
n
95
ALA
95
A
THR
96
n
96
THR
96
A
GLU
97
n
97
GLU
97
A
LEU
98
n
98
LEU
98
A
GLY
99
n
99
GLY
99
A
TYR
100
n
100
TYR
100
A
ASP
101
n
101
ASP
101
A
CYS
102
n
102
CYS
102
A
LEU
103
n
103
LEU
103
A
SER
104
n
104
SER
104
A
ALA
105
n
105
ALA
105
A
VAL
106
n
106
VAL
106
A
THR
107
n
107
THR
107
A
PRO
108
n
108
PRO
108
A
PHE
109
n
109
PHE
109
A
TYR
110
n
110
TYR
110
A
TYR
111
n
111
TYR
111
A
LYS
112
n
112
LYS
112
A
PHE
113
n
113
PHE
113
A
SER
114
n
114
SER
114
A
PHE
115
n
115
PHE
115
A
PRO
116
n
116
PRO
116
A
GLU
117
n
117
GLU
117
A
ILE
118
n
118
ILE
118
A
LYS
119
n
119
LYS
119
A
HIS
120
n
120
HIS
120
A
TYR
121
n
121
TYR
121
A
TYR
122
n
122
TYR
122
A
ASP
123
n
123
ASP
123
A
THR
124
n
124
THR
124
A
ILE
125
n
125
ILE
125
A
ILE
126
n
126
ILE
126
A
ALA
127
n
127
ALA
127
A
GLU
128
n
128
GLU
128
A
THR
129
n
129
THR
129
A
GLY
130
n
130
GLY
130
A
SER
131
n
131
SER
131
A
ASN
132
n
132
ASN
132
A
MET
133
n
133
MET
133
A
ILE
134
n
134
ILE
134
A
VAL
135
n
135
VAL
135
A
TYR
136
n
136
TYR
136
A
SER
137
n
137
SER
137
A
ILE
138
n
138
ILE
138
A
PRO
139
n
139
PRO
139
A
PHE
140
n
140
PHE
140
A
LEU
141
n
141
LEU
141
A
THR
142
n
142
THR
142
A
GLY
143
n
143
GLY
143
A
VAL
144
n
144
VAL
144
A
ASN
145
n
145
ASN
145
A
MET
146
n
146
MET
146
A
GLY
147
n
147
GLY
147
A
ILE
148
n
148
ILE
148
A
GLU
149
n
149
GLU
149
A
GLN
150
n
150
GLN
150
A
PHE
151
n
151
PHE
151
A
GLY
152
n
152
GLY
152
A
GLU
153
n
153
GLU
153
A
LEU
154
n
154
LEU
154
A
TYR
155
n
155
TYR
155
A
LYS
156
n
156
LYS
156
A
ASN
157
n
157
ASN
157
A
PRO
158
n
158
PRO
158
A
LYS
159
n
159
LYS
159
A
VAL
160
n
160
VAL
160
A
LEU
161
n
161
LEU
161
A
GLY
162
n
162
GLY
162
A
VAL
163
n
163
VAL
163
A
LYS
164
n
164
LYS
164
A
PHE
165
n
165
PHE
165
A
THR
166
n
166
THR
166
A
ALA
167
n
167
ALA
167
A
GLY
168
n
168
GLY
168
A
ASP
169
n
169
ASP
169
A
PHE
170
n
170
PHE
170
A
TYR
171
n
171
TYR
171
A
LEU
172
n
172
LEU
172
A
LEU
173
n
173
LEU
173
A
GLU
174
n
174
GLU
174
A
ARG
175
n
175
ARG
175
A
LEU
176
n
176
LEU
176
A
LYS
177
n
177
LYS
177
A
LYS
178
n
178
LYS
178
A
ALA
179
n
179
ALA
179
A
TYR
180
n
180
TYR
180
A
PRO
181
n
181
PRO
181
A
ASN
182
n
182
ASN
182
A
HIS
183
n
183
HIS
183
A
LEU
184
n
184
LEU
184
A
ILE
185
n
185
ILE
185
A
TRP
186
n
186
TRP
186
A
ALA
187
n
187
ALA
187
A
GLY
188
n
188
GLY
188
A
PHE
189
n
189
PHE
189
A
ASP
190
n
190
ASP
190
A
GLU
191
n
191
GLU
191
A
MET
192
n
192
MET
192
A
MET
193
n
193
MET
193
A
LEU
194
n
194
LEU
194
A
PRO
195
n
195
PRO
195
A
ALA
196
n
196
ALA
196
A
ALA
197
n
197
ALA
197
A
SER
198
n
198
SER
198
A
LEU
199
n
199
LEU
199
A
GLY
200
n
200
GLY
200
A
VAL
201
n
201
VAL
201
A
ASP
202
n
202
ASP
202
A
GLY
203
n
203
GLY
203
A
ALA
204
n
204
ALA
204
A
ILE
205
n
205
ILE
205
A
GLY
206
n
206
GLY
206
A
SER
207
n
207
SER
207
A
THR
208
n
208
THR
208
A
PHE
209
n
209
PHE
209
A
ASN
210
n
210
ASN
210
A
VAL
211
n
211
VAL
211
A
ASN
212
n
212
ASN
212
A
GLY
213
n
213
GLY
213
A
VAL
214
n
214
VAL
214
A
ARG
215
n
215
ARG
215
A
ALA
216
n
216
ALA
216
A
ARG
217
n
217
ARG
217
A
GLN
218
n
218
GLN
218
A
ILE
219
n
219
ILE
219
A
PHE
220
n
220
PHE
220
A
GLU
221
n
221
GLU
221
A
LEU
222
n
222
LEU
222
A
THR
223
n
223
THR
223
A
LYS
224
n
224
LYS
224
A
ALA
225
n
225
ALA
225
A
GLY
226
n
226
GLY
226
A
LYS
227
n
227
LYS
227
A
LEU
228
n
228
LEU
228
A
LYS
229
n
229
LYS
229
A
GLU
230
n
230
GLU
230
A
ALA
231
n
231
ALA
231
A
LEU
232
n
232
LEU
232
A
GLU
233
n
233
GLU
233
A
ILE
234
n
234
ILE
234
A
GLN
235
n
235
GLN
235
A
HIS
236
n
236
HIS
236
A
VAL
237
n
237
VAL
237
A
THR
238
n
238
THR
238
A
ASN
239
n
239
ASN
239
A
ASP
240
n
240
ASP
240
A
LEU
241
n
241
LEU
241
A
ILE
242
n
242
ILE
242
A
GLU
243
n
243
GLU
243
A
GLY
244
n
244
GLY
244
A
ILE
245
n
245
ILE
245
A
LEU
246
n
246
LEU
246
A
ALA
247
n
247
ALA
247
A
ASN
248
n
248
ASN
248
A
GLY
249
n
249
GLY
249
A
LEU
250
n
250
LEU
250
A
TYR
251
n
251
TYR
251
A
LEU
252
n
252
LEU
252
A
THR
253
n
253
THR
253
A
ILE
254
n
254
ILE
254
A
LYS
255
n
255
LYS
255
A
GLU
256
n
256
GLU
256
A
LEU
257
n
257
LEU
257
A
LEU
258
n
258
LEU
258
A
LYS
259
n
259
LYS
259
A
LEU
260
n
260
LEU
260
A
GLU
261
n
261
GLU
261
A
GLY
262
n
262
GLY
262
A
VAL
263
n
263
VAL
263
A
ASP
264
n
264
ASP
264
A
ALA
265
n
265
ALA
265
A
GLY
266
n
266
GLY
266
A
TYR
267
n
267
TYR
267
A
CYS
268
n
268
CYS
268
A
ARG
269
n
269
ARG
269
A
GLU
270
n
270
GLU
270
A
PRO
271
n
271
PRO
271
A
MET
272
n
272
MET
272
A
THR
273
n
273
THR
273
A
SER
274
n
274
SER
274
A
LYS
275
n
275
LYS
275
A
ALA
276
n
276
ALA
276
A
THR
277
n
277
THR
277
A
ALA
278
n
278
ALA
278
A
GLU
279
n
279
GLU
279
A
GLN
280
n
280
GLN
280
A
VAL
281
n
281
VAL
281
A
ALA
282
n
282
ALA
282
A
LYS
283
n
283
LYS
283
A
ALA
284
n
284
ALA
284
A
LYS
285
n
285
LYS
285
A
ASP
286
n
286
ASP
286
A
LEU
287
n
287
LEU
287
A
LYS
288
n
288
LYS
288
A
ALA
289
n
289
ALA
289
A
LYS
290
n
290
LYS
290
A
PHE
291
n
291
PHE
291
A
LEU
292
n
292
LEU
292
A
SER
293
n
293
SER
293
A
MET
1
n
1
MET
1
C
ARG
2
n
2
ARG
2
C
ASP
3
n
3
ASP
3
C
LEU
4
n
4
LEU
4
C
LYS
5
n
5
LYS
5
C
GLY
6
n
6
GLY
6
C
ILE
7
n
7
ILE
7
C
PHE
8
n
8
PHE
8
C
SER
9
n
9
SER
9
C
ALA
10
n
10
ALA
10
C
LEU
11
n
11
LEU
11
C
LEU
12
n
12
LEU
12
C
VAL
13
n
13
VAL
13
C
SER
14
n
14
SER
14
C
PHE
15
n
15
PHE
15
C
ASN
16
n
16
ASN
16
C
GLU
17
n
17
GLU
17
C
ASP
18
n
18
ASP
18
C
GLY
19
n
19
GLY
19
C
THR
20
n
20
THR
20
C
ILE
21
n
21
ILE
21
C
ASN
22
n
22
ASN
22
C
GLU
23
n
23
GLU
23
C
LYS
24
n
24
LYS
24
C
GLY
25
n
25
GLY
25
C
LEU
26
n
26
LEU
26
C
ARG
27
n
27
ARG
27
C
GLN
28
n
28
GLN
28
C
ILE
29
n
29
ILE
29
C
ILE
30
n
30
ILE
30
C
ARG
31
n
31
ARG
31
C
HIS
32
n
32
HIS
32
C
ASN
33
n
33
ASN
33
C
ILE
34
n
34
ILE
34
C
ASP
35
n
35
ASP
35
C
LYS
36
n
36
LYS
36
C
MET
37
n
37
MET
37
C
LYS
38
n
38
LYS
38
C
VAL
39
n
39
VAL
39
C
ASP
40
n
40
ASP
40
C
GLY
41
n
41
GLY
41
C
LEU
42
n
42
LEU
42
C
TYR
43
n
43
TYR
43
C
VAL
44
n
44
VAL
44
C
GLY
45
n
45
GLY
45
C
GLY
46
n
46
GLY
46
C
SER
47
n
47
SER
47
C
THR
48
n
48
THR
48
C
GLY
49
n
49
GLY
49
C
GLU
50
n
50
GLU
50
C
ASN
51
n
51
ASN
51
C
PHE
52
n
52
PHE
52
C
MET
53
n
53
MET
53
C
LEU
54
n
54
LEU
54
C
SER
55
n
55
SER
55
C
THR
56
n
56
THR
56
C
GLU
57
n
57
GLU
57
C
GLU
58
n
58
GLU
58
C
LYS
59
n
59
LYS
59
C
LYS
60
n
60
LYS
60
C
GLU
61
n
61
GLU
61
C
ILE
62
n
62
ILE
62
C
PHE
63
n
63
PHE
63
C
ARG
64
n
64
ARG
64
C
ILE
65
n
65
ILE
65
C
ALA
66
n
66
ALA
66
C
LYS
67
n
67
LYS
67
C
ASP
68
n
68
ASP
68
C
GLU
69
n
69
GLU
69
C
ALA
70
n
70
ALA
70
C
LYS
71
n
71
LYS
71
C
ASP
72
n
72
ASP
72
C
GLN
73
n
73
GLN
73
C
ILE
74
n
74
ILE
74
C
ALA
75
n
75
ALA
75
C
LEU
76
n
76
LEU
76
C
ILE
77
n
77
ILE
77
C
ALA
78
n
78
ALA
78
C
GLN
79
n
79
GLN
79
C
VAL
80
n
80
VAL
80
C
GLY
81
n
81
GLY
81
C
SER
82
n
82
SER
82
C
VAL
83
n
83
VAL
83
C
ASN
84
n
84
ASN
84
C
LEU
85
n
85
LEU
85
C
LYS
86
n
86
LYS
86
C
GLU
87
n
87
GLU
87
C
ALA
88
n
88
ALA
88
C
VAL
89
n
89
VAL
89
C
GLU
90
n
90
GLU
90
C
LEU
91
n
91
LEU
91
C
GLY
92
n
92
GLY
92
C
LYS
93
n
93
LYS
93
C
TYR
94
n
94
TYR
94
C
ALA
95
n
95
ALA
95
C
THR
96
n
96
THR
96
C
GLU
97
n
97
GLU
97
C
LEU
98
n
98
LEU
98
C
GLY
99
n
99
GLY
99
C
TYR
100
n
100
TYR
100
C
ASP
101
n
101
ASP
101
C
CYS
102
n
102
CYS
102
C
LEU
103
n
103
LEU
103
C
SER
104
n
104
SER
104
C
ALA
105
n
105
ALA
105
C
VAL
106
n
106
VAL
106
C
THR
107
n
107
THR
107
C
PRO
108
n
108
PRO
108
C
PHE
109
n
109
PHE
109
C
TYR
110
n
110
TYR
110
C
TYR
111
n
111
TYR
111
C
LYS
112
n
112
LYS
112
C
PHE
113
n
113
PHE
113
C
SER
114
n
114
SER
114
C
PHE
115
n
115
PHE
115
C
PRO
116
n
116
PRO
116
C
GLU
117
n
117
GLU
117
C
ILE
118
n
118
ILE
118
C
LYS
119
n
119
LYS
119
C
HIS
120
n
120
HIS
120
C
TYR
121
n
121
TYR
121
C
TYR
122
n
122
TYR
122
C
ASP
123
n
123
ASP
123
C
THR
124
n
124
THR
124
C
ILE
125
n
125
ILE
125
C
ILE
126
n
126
ILE
126
C
ALA
127
n
127
ALA
127
C
GLU
128
n
128
GLU
128
C
THR
129
n
129
THR
129
C
GLY
130
n
130
GLY
130
C
SER
131
n
131
SER
131
C
ASN
132
n
132
ASN
132
C
MET
133
n
133
MET
133
C
ILE
134
n
134
ILE
134
C
VAL
135
n
135
VAL
135
C
TYR
136
n
136
TYR
136
C
SER
137
n
137
SER
137
C
ILE
138
n
138
ILE
138
C
PRO
139
n
139
PRO
139
C
PHE
140
n
140
PHE
140
C
LEU
141
n
141
LEU
141
C
THR
142
n
142
THR
142
C
GLY
143
n
143
GLY
143
C
VAL
144
n
144
VAL
144
C
ASN
145
n
145
ASN
145
C
MET
146
n
146
MET
146
C
GLY
147
n
147
GLY
147
C
ILE
148
n
148
ILE
148
C
GLU
149
n
149
GLU
149
C
GLN
150
n
150
GLN
150
C
PHE
151
n
151
PHE
151
C
GLY
152
n
152
GLY
152
C
GLU
153
n
153
GLU
153
C
LEU
154
n
154
LEU
154
C
TYR
155
n
155
TYR
155
C
LYS
156
n
156
LYS
156
C
ASN
157
n
157
ASN
157
C
PRO
158
n
158
PRO
158
C
LYS
159
n
159
LYS
159
C
VAL
160
n
160
VAL
160
C
LEU
161
n
161
LEU
161
C
GLY
162
n
162
GLY
162
C
VAL
163
n
163
VAL
163
C
LYS
164
n
164
LYS
164
C
PHE
165
n
165
PHE
165
C
THR
166
n
166
THR
166
C
ALA
167
n
167
ALA
167
C
GLY
168
n
168
GLY
168
C
ASP
169
n
169
ASP
169
C
PHE
170
n
170
PHE
170
C
TYR
171
n
171
TYR
171
C
LEU
172
n
172
LEU
172
C
LEU
173
n
173
LEU
173
C
GLU
174
n
174
GLU
174
C
ARG
175
n
175
ARG
175
C
LEU
176
n
176
LEU
176
C
LYS
177
n
177
LYS
177
C
LYS
178
n
178
LYS
178
C
ALA
179
n
179
ALA
179
C
TYR
180
n
180
TYR
180
C
PRO
181
n
181
PRO
181
C
ASN
182
n
182
ASN
182
C
HIS
183
n
183
HIS
183
C
LEU
184
n
184
LEU
184
C
ILE
185
n
185
ILE
185
C
TRP
186
n
186
TRP
186
C
ALA
187
n
187
ALA
187
C
GLY
188
n
188
GLY
188
C
PHE
189
n
189
PHE
189
C
ASP
190
n
190
ASP
190
C
GLU
191
n
191
GLU
191
C
MET
192
n
192
MET
192
C
MET
193
n
193
MET
193
C
LEU
194
n
194
LEU
194
C
PRO
195
n
195
PRO
195
C
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n
196
ALA
196
C
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n
197
ALA
197
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n
198
SER
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n
199
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199
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n
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n
201
VAL
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n
202
ASP
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n
203
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ALA
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n
205
ILE
205
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GLY
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n
206
GLY
206
C
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n
207
SER
207
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n
208
THR
208
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PHE
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n
209
PHE
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n
210
ASN
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211
VAL
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n
213
GLY
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214
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n
215
ARG
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217
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218
GLN
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220
PHE
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223
THR
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235
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236
HIS
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238
THR
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n
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ASP
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n
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n
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n
248
ASN
248
C
GLY
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n
249
GLY
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LEU
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n
251
TYR
251
C
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n
252
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n
253
THR
253
C
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n
254
ILE
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C
LYS
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n
255
LYS
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n
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GLU
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n
257
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257
C
LEU
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n
258
LEU
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C
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n
259
LYS
259
C
LEU
260
n
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C
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GLU
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GLY
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263
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ASP
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n
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TYR
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n
268
CYS
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n
269
ARG
269
C
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n
270
GLU
270
C
PRO
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n
271
PRO
271
C
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n
272
MET
272
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273
THR
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SER
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276
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THR
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n
278
ALA
278
C
GLU
279
n
279
GLU
279
C
GLN
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n
280
GLN
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281
VAL
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n
282
ALA
282
C
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283
LYS
283
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n
284
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284
C
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285
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n
286
ASP
286
C
LEU
287
n
287
LEU
287
C
LYS
288
n
288
LYS
288
C
ALA
289
n
289
ALA
289
C
LYS
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n
290
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290
C
PHE
291
n
291
PHE
291
C
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n
292
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n
293
SER
293
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4
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-64
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x,y,z
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0.0000000000
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-x,-y,z
crystal symmetry operation
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0.0000000000
0.0000000000
A
N
SER
9
A
N
SER
9
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A
O
GLY
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N
LEU
42
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O
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A
O
ALA
75
A
N
ALA
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A
N
ALA
78
A
O
CYS
102
A
O
CYS
102
A
O
LEU
103
A
O
LEU
103
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N
ILE
134
A
N
ILE
134
A
O
MET
133
A
O
MET
133
A
N
LEU
161
A
N
LEU
161
A
O
LEU
161
A
O
LEU
161
A
N
LEU
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A
N
LEU
184
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N
ALA
187
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O
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A
O
GLY
203
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A
N
ALA
204
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O
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A
O
GLY
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N
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9
B
N
SER
9
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O
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B
O
GLY
41
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N
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B
N
LEU
42
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B
O
ALA
75
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N
ALA
78
B
N
ALA
78
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O
CYS
102
B
O
CYS
102
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O
LEU
103
B
O
LEU
103
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N
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134
B
N
ILE
134
C
O
MET
133
B
O
MET
133
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N
LEU
161
B
N
LEU
161
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O
LEU
161
B
O
LEU
161
C
N
LEU
184
B
N
LEU
184
C
N
ALA
187
B
N
ALA
187
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O
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B
O
GLY
203
C
N
ALA
204
B
N
ALA
204
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O
GLY
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B
O
GLY
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1
C
C
CE2
NZ
TYR
LYS
136
164
2.19
1
A
GLU
270
20.26
1
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TYR
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1
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GLU
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1
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A
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270
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C
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A
A
A
CA
CB
CG
TYR
TYR
TYR
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121
121
N
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A
A
A
CA
C
O
GLU
GLU
GLU
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270
270
N
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A
A
A
CA
N
CD
PRO
PRO
PRO
271
271
271
N
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A
A
A
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CB
PRO
PRO
PRO
271
271
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A
A
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N
CD
CG
PRO
PRO
PRO
271
271
271
N
1
-3.15
0.50
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C
C
C
NE
CZ
NH2
ARG
ARG
ARG
2
2
2
N
1
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C
C
C
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CYS
CYS
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102
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N
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C
C
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N
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TYR
TYR
TYR
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N
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C
C
C
N
CA
CB
TYR
TYR
TYR
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155
155
N
1
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0.50
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C
C
C
NE
CZ
NH2
ARG
ARG
ARG
269
269
269
N
1
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103.74
C
C
C
CA
C
O
GLU
GLU
GLU
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270
270
N
1
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C
C
C
CA
N
CD
PRO
PRO
PRO
271
271
271
N
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C
C
C
N
CA
CB
PRO
PRO
PRO
271
271
271
N
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A
LYS
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1
A
PHE
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A
TYR
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C
LYS
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1
C
PHE
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C
TYR
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0
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1.60
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1
1.8
53.5
model building
X-PLOR
refinement
REFMAC
data reduction
DENZO
data scaling
SCALEPACK
phasing
X-PLOR
CRYSTAL STRUCTURE ANALYSIS OF N-ACETYLNEURAMINATE LYASE FROM HAEMOPHILUS INFLUENZAE: CRYSTAL FORM II COMPLEXED WITH 4-DEOXY-SIALIC ACID
1
N
N
1
N
N
2
N
N
3
N
N
3
N
N
4
N
N
2
N
N
3
N
N
3
N
N
5
N
N
5
N
N
The biological assembly is a tetramer constructed from chains A and C generated by the two-fold.
A
ASN
22
A
ASN
22
HELX_P
A
LYS
36
A
LYS
36
1
1
15
A
GLY
46
A
GLY
46
HELX_P
A
GLU
50
A
GLU
50
5
2
5
A
GLU
50
A
GLU
50
HELX_P
A
LEU
54
A
LEU
54
5
3
5
A
SER
55
A
SER
55
HELX_P
A
LYS
71
A
LYS
71
1
4
17
A
ASN
84
A
ASN
84
HELX_P
A
GLY
99
A
GLY
99
1
5
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A
SER
114
A
SER
114
HELX_P
A
GLY
130
A
GLY
130
1
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17
A
GLY
143
A
GLY
143
HELX_P
A
LYS
156
A
LYS
156
1
7
14
A
ASP
169
A
ASP
169
HELX_P
A
TYR
180
A
TYR
180
1
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12
A
PHE
189
A
PHE
189
HELX_P
A
GLU
191
A
GLU
191
5
9
3
A
MET
192
A
MET
192
HELX_P
A
LEU
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A
LEU
199
1
10
8
A
THR
208
A
THR
208
HELX_P
A
GLY
213
A
GLY
213
1
11
6
A
ASN
212
A
ASN
212
HELX_P
A
ALA
225
A
ALA
225
1
12
14
A
LYS
227
A
LYS
227
HELX_P
A
GLY
249
A
GLY
249
1
13
23
A
GLY
249
A
GLY
249
HELX_P
A
GLU
261
A
GLU
261
1
14
13
A
THR
277
A
THR
277
HELX_P
A
LEU
292
A
LEU
292
1
15
16
C
ASN
22
B
ASN
22
HELX_P
C
LYS
36
B
LYS
36
1
16
15
C
GLY
46
B
GLY
46
HELX_P
C
GLU
50
B
GLU
50
5
17
5
C
GLU
50
B
GLU
50
HELX_P
C
LEU
54
B
LEU
54
5
18
5
C
SER
55
B
SER
55
HELX_P
C
LYS
71
B
LYS
71
1
19
17
C
ASN
84
B
ASN
84
HELX_P
C
GLY
99
B
GLY
99
1
20
16
C
SER
114
B
SER
114
HELX_P
C
GLY
130
B
GLY
130
1
21
17
C
GLY
143
B
GLY
143
HELX_P
C
TYR
155
B
TYR
155
1
22
13
C
ASP
169
B
ASP
169
HELX_P
C
TYR
180
B
TYR
180
1
23
12
C
PHE
189
B
PHE
189
HELX_P
C
GLU
191
B
GLU
191
5
24
3
C
MET
192
B
MET
192
HELX_P
C
LEU
199
B
LEU
199
1
25
8
C
THR
208
B
THR
208
HELX_P
C
GLY
213
B
GLY
213
1
26
6
C
ASN
212
B
ASN
212
HELX_P
C
ALA
225
B
ALA
225
1
27
14
C
LYS
227
B
LYS
227
HELX_P
C
GLY
249
B
GLY
249
1
28
23
C
GLY
249
B
GLY
249
HELX_P
C
LEU
260
B
LEU
260
1
29
12
C
THR
277
B
THR
277
HELX_P
C
LEU
292
B
LEU
292
1
30
16
LYASE
BETA BARREL, LYASE
NANA_HAEIN
UNP
1
1
P44539
MRDLKGIFSALLVSFNEDGTINEKGLRQIIRHNIDKMKVDGLYVGGSTGENFMLSTEEKKEIFRIAKDEAKDQIALIAQV
GSVNLKEAVELGKYATELGYDCLSAVTPFYYKFSFPEIKHYYDTIIAETGNNMIVYSIPFLTGVNMGIEQFGELYKNPKV
LGVKFTAGDFYLLERLKKAYPNHLIWAGFDEMMLPAASLGVDGAIGSTFNVNGVRARQIFELTKAGKLAEALEIQHVTND
LIEGILANGLYLTIKELLKLEGVDAGYCREPMTSKATEEQLAKAKDLKAKFLS
1
293
1F74
1
293
P44539
A
1
1
293
1
293
1F74
1
293
P44539
C
1
1
293
1
ASN
SEE REMARK 999
SER
131
1F74
A
P44539
UNP
131
131
1
ALA
SEE REMARK 999
LYS
229
1F74
A
P44539
UNP
229
229
1
GLU
SEE REMARK 999
ALA
278
1F74
A
P44539
UNP
278
278
1
LEU
SEE REMARK 999
VAL
281
1F74
A
P44539
UNP
281
281
2
ASN
SEE REMARK 999
SER
131
1F74
C
P44539
UNP
131
131
2
ALA
SEE REMARK 999
LYS
229
1F74
C
P44539
UNP
229
229
2
GLU
SEE REMARK 999
ALA
278
1F74
C
P44539
UNP
278
278
2
LEU
SEE REMARK 999
VAL
281
1F74
C
P44539
UNP
281
281
9
9
parallel
parallel
parallel
parallel
parallel
parallel
parallel
parallel
parallel
parallel
parallel
parallel
parallel
parallel
parallel
parallel
A
GLY
6
A
GLY
6
A
ALA
10
A
ALA
10
A
GLY
41
A
GLY
41
A
VAL
44
A
VAL
44
A
ALA
75
A
ALA
75
A
GLN
79
A
GLN
79
A
CYS
102
A
CYS
102
A
SER
104
A
SER
104
A
MET
133
A
MET
133
A
TYR
136
A
TYR
136
A
VAL
160
A
VAL
160
A
PHE
165
A
PHE
165
A
LEU
184
A
LEU
184
A
ALA
187
A
ALA
187
A
GLY
203
A
GLY
203
A
GLY
206
A
GLY
206
A
GLY
6
A
GLY
6
A
ALA
10
A
ALA
10
C
GLY
6
B
GLY
6
C
ALA
10
B
ALA
10
C
GLY
41
B
GLY
41
C
VAL
44
B
VAL
44
C
ALA
75
B
ALA
75
C
GLN
79
B
GLN
79
C
CYS
102
B
CYS
102
C
SER
104
B
SER
104
C
MET
133
B
MET
133
C
TYR
136
B
TYR
136
C
VAL
160
B
VAL
160
C
PHE
165
B
PHE
165
C
LEU
184
B
LEU
184
C
ALA
187
B
ALA
187
C
GLY
203
B
GLY
203
C
GLY
206
B
GLY
206
C
GLY
6
B
GLY
6
C
ALA
10
B
ALA
10
BINDING SITE FOR RESIDUE CL C 999
C
CL
999
Software
4
BINDING SITE FOR RESIDUE NAY A 950
A
NAY
950
Software
18
BINDING SITE FOR RESIDUE NAY C 951
C
NAY
951
Software
19
BINDING SITE FOR RESIDUE GOL C 931
C
GOL
931
Software
9
BINDING SITE FOR RESIDUE GOL C 932
C
GOL
932
Software
11
BINDING SITE FOR RESIDUE GOL A 933
A
GOL
933
Software
8
BINDING SITE FOR RESIDUE GOL A 934
A
GOL
934
Software
6
C
TYR
180
B
TYR
180
4
1_555
C
PRO
181
B
PRO
181
4
1_555
C
ASN
182
B
ASN
182
4
1_555
C
HIS
183
B
HIS
183
4
1_555
A
ALA
10
A
ALA
10
18
1_555
A
TYR
43
A
TYR
43
18
1_555
A
SER
47
A
SER
47
18
1_555
A
THR
48
A
THR
48
18
1_555
A
TYR
136
A
TYR
136
18
1_555
A
LYS
164
A
LYS
164
18
1_555
A
GLY
188
A
GLY
188
18
1_555
A
PHE
189
A
PHE
189
18
1_555
A
ASP
190
A
ASP
190
18
1_555
A
GLU
191
A
GLU
191
18
1_555
A
ILE
205
A
ILE
205
18
1_555
A
GLY
206
A
GLY
206
18
1_555
A
SER
207
A
SER
207
18
1_555
A
LEU
250
A
LEU
250
18
1_555
A
HOH
1312
J
HOH
18
1_555
A
HOH
1313
J
HOH
18
1_555
A
HOH
1344
J
HOH
18
1_555
A
HOH
1373
J
HOH
18
1_555
C
ALA
10
B
ALA
10
19
1_555
C
TYR
43
B
TYR
43
19
1_555
C
SER
47
B
SER
47
19
1_555
C
THR
48
B
THR
48
19
1_555
C
TYR
136
B
TYR
136
19
1_555
C
LYS
164
B
LYS
164
19
1_555
C
GLY
188
B
GLY
188
19
1_555
C
PHE
189
B
PHE
189
19
1_555
C
ASP
190
B
ASP
190
19
1_555
C
GLU
191
B
GLU
191
19
1_555
C
ILE
205
B
ILE
205
19
1_555
C
GLY
206
B
GLY
206
19
1_555
C
SER
207
B
SER
207
19
1_555
C
LEU
250
B
LEU
250
19
1_555
C
HOH
1260
K
HOH
19
1_555
C
HOH
1290
K
HOH
19
1_555
C
HOH
1296
K
HOH
19
1_555
C
HOH
1315
K
HOH
19
1_555
C
HOH
1329
K
HOH
19
1_555
C
ASN
132
B
ASN
132
9
4_556
C
PRO
158
B
PRO
158
9
4_556
C
LYS
159
B
LYS
159
9
4_556
C
LEU
161
B
LEU
161
9
4_556
C
GLU
230
B
GLU
230
9
1_555
C
GOL
932
I
GOL
9
1_555
C
HOH
1141
K
HOH
9
4_556
C
HOH
1176
K
HOH
9
1_555
C
HOH
1262
K
HOH
9
4_556
C
PRO
158
B
PRO
158
11
4_556
C
VAL
160
B
VAL
160
11
4_556
C
LEU
161
B
LEU
161
11
4_556
C
ASN
182
B
ASN
182
11
4_556
C
VAL
214
B
VAL
214
11
1_555
C
GLN
218
B
GLN
218
11
1_555
C
GOL
931
H
GOL
11
1_555
C
HOH
1153
K
HOH
11
4_556
C
HOH
1154
K
HOH
11
1_555
C
HOH
1343
K
HOH
11
4_556
C
HOH
1371
K
HOH
11
1_555
A
ARG
2
A
ARG
2
8
1_555
A
LYS
67
A
LYS
67
8
1_555
A
ASP
72
A
ASP
72
8
1_555
A
ASP
101
A
ASP
101
8
1_555
A
ALA
289
A
ALA
289
8
4_555
A
SER
293
A
SER
293
8
4_555
A
HOH
977
J
HOH
8
1_555
A
HOH
1240
J
HOH
8
1_555
A
GLY
226
A
GLY
226
6
1_555
A
LYS
227
A
LYS
227
6
1_555
A
LEU
228
A
LEU
228
6
1_555
A
LYS
229
A
LYS
229
6
1_555
A
GLU
230
A
GLU
230
6
1_555
A
HOH
1232
J
HOH
6
1_555
18
P 21 21 2