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H
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n
3
F
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4
E
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D
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n
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7
B
ALA
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n
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A
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n
9
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n
10
GLY
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A
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n
11
LEU
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ARG
4
n
12
ARG
4
A
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n
13
PRO
5
A
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n
14
LEU
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PHE
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n
15
PHE
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A
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n
16
GLU
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n
17
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n
18
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n
19
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n
22
ASP
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23
A
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THR
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n
24
B
THR
14
A
GLU
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25
C
GLU
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A
ARG
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n
26
D
ARG
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A
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27
E
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28
F
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LEU
14
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29
G
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A
GLU
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H
GLU
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A
SER
14
n
31
I
SER
14
A
TYR
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n
32
J
TYR
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A
n
33
K
14
A
n
34
L
14
A
n
35
M
14
A
n
36
N
14
A
ILE
16
n
1
ILE
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B
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n
2
VAL
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B
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3
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n
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n
5
SER
20
B
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n
6
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B
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n
7
ALA
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B
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n
9
ILE
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B
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n
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MET
26
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27
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n
13
PRO
28
B
TRP
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n
14
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GLN
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n
16
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17
MET
32
B
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18
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PHE
34
n
19
PHE
34
B
ARG
35
n
20
ARG
35
B
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n
21
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22
A
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36
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n
23
PRO
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B
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GLN
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26
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40
B
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n
27
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B
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n
28
CYS
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B
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n
29
GLY
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B
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n
30
ALA
44
B
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45
n
31
SER
45
B
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n
32
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B
ILE
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n
33
ILE
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B
SER
48
n
34
SER
48
B
ASP
49
n
35
ASP
49
B
ARG
50
n
36
ARG
50
B
TRP
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n
37
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51
B
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52
n
38
VAL
52
B
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n
39
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B
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n
40
THR
54
B
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n
41
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B
ALA
56
n
42
ALA
56
B
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n
43
HIS
57
B
CYS
58
n
44
CYS
58
B
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n
45
LEU
59
B
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n
46
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B
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n
47
A
TYR
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B
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n
48
B
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60
B
PRO
60
n
49
C
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B
TRP
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n
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D
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B
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n
51
E
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B
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n
52
F
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B
ASN
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n
53
G
ASN
60
B
PHE
60
n
54
H
PHE
60
B
THR
60
n
55
I
THR
60
B
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n
56
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n
57
ASN
62
B
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n
58
ASP
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B
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n
59
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B
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n
60
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n
61
VAL
66
B
ARG
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n
62
ARG
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B
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n
63
ILE
68
B
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n
64
GLY
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n
65
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B
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71
n
66
HIS
71
B
SER
72
n
67
SER
72
B
ARG
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n
68
ARG
73
B
THR
74
n
69
THR
74
B
ARG
75
n
70
ARG
75
B
TYR
76
n
71
TYR
76
B
GLU
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n
72
GLU
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B
ARG
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n
73
A
ARG
77
B
ASN
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n
74
ASN
78
B
ILE
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n
75
ILE
79
B
GLU
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n
76
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B
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n
77
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B
ILE
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n
78
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82
B
SER
83
n
79
SER
83
B
MET
84
n
80
MET
84
B
LEU
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n
81
LEU
85
B
GLU
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n
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GLU
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B
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n
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LYS
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B
ILE
88
n
84
ILE
88
B
TYR
89
n
85
TYR
89
B
ILE
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n
86
ILE
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B
HIS
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n
87
HIS
91
B
PRO
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n
88
PRO
92
B
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n
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ARG
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ASN
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n
91
ASN
95
B
TRP
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n
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TRP
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B
ARG
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n
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97
B
GLU
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n
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n
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B
ASP
100
n
97
ASP
100
B
ARG
101
n
98
ARG
101
B
ASP
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n
99
ASP
102
B
ILE
103
n
100
ILE
103
B
ALA
104
n
101
ALA
104
B
LEU
105
n
102
LEU
105
B
MET
106
n
103
MET
106
B
LYS
107
n
104
LYS
107
B
LEU
108
n
105
LEU
108
B
LYS
109
n
106
LYS
109
B
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n
107
LYS
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B
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n
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112
n
109
VAL
112
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113
n
110
ALA
113
B
PHE
114
n
111
PHE
114
B
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115
n
112
SER
115
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ASP
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n
113
ASP
116
B
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n
114
TYR
117
B
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118
n
115
ILE
118
B
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119
n
116
HIS
119
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n
117
PRO
120
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121
n
118
VAL
121
B
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n
119
CYS
122
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n
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123
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PRO
124
n
121
PRO
124
B
ASP
125
n
122
ASP
125
B
ARG
126
n
123
ARG
126
B
GLU
127
n
124
GLU
127
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128
n
125
THR
128
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n
126
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ALA
129
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A
ALA
129
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129
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128
B
SER
129
B
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129
n
129
C
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129
B
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130
n
130
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n
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n
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n
133
GLY
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n
134
TYR
134
B
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n
135
LYS
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n
136
GLY
136
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n
137
ARG
137
B
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138
n
138
VAL
138
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139
n
139
THR
139
B
GLY
140
n
140
GLY
140
B
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141
n
141
TRP
141
B
GLY
142
n
142
GLY
142
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143
n
143
ASN
143
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144
n
144
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144
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145
n
145
LYS
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146
n
146
GLU
146
B
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147
n
147
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B
n
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A
147
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149
B
147
B
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C
147
B
n
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D
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B
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E
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F
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B
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G
147
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GLY
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GLN
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n
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n
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VAL
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n
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B
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ILE
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VAL
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n
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ARG
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n
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ALA
190
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n
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CYS
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n
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SER
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n
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n
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GLY
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PHE
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VAL
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n
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MET
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n
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A
PHE
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216
B
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B
ASN
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n
217
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B
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n
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ARG
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B
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TYR
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n
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MET
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GLY
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n
224
ILE
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n
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VAL
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PHE
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TYR
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TYR
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n
241
THR
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242
HIS
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VAL
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PHE
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245
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248
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TRP
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249
TRP
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B
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238
n
250
ILE
238
B
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n
251
GLN
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B
LYS
240
n
252
LYS
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B
VAL
241
n
253
VAL
241
B
ILE
242
n
254
ILE
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B
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n
255
ASP
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B
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n
256
GLN
244
B
PHE
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n
257
PHE
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B
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246
n
258
GLY
246
B
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n
259
GLU
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B
ASP
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n
1
ASP
255
C
PHE
256
n
2
PHE
256
C
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n
3
GLU
257
C
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n
4
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259
n
5
ILE
259
C
PRO
260
n
6
PRO
260
C
GLU
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n
7
GLU
261
C
GLU
262
n
8
GLU
262
C
TXR
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n
9
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C
LEU
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n
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n
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C
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O
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PRO
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TYR
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227
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ARG
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B
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ARG
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MET
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N
ARG
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B
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ARG
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B
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B
O
LYS
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N
GLU
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THR
1
A
THR
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SER
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L
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ASP
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ASP
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GLY
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N
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ARG
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TRP
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B
ASN
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C
GLN
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A
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N
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N
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N
N
5
N
N
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A
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THR
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A
SER
14
A
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B
I
B
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CYS
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THR
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I
B
ASP
125
B
ASP
122
HELX_P
B
LEU
130
B
LEU
130
1
6
9
B
GLU
164
B
GLU
169
HELX_P
B
SER
171
B
SER
176
1
7
8
B
LYS
185
B
LYS
191
HELX_P
B
GLY
186
B
GLY
195
5
8
5
C
B
LEU
234
B
LEU
246
HELX_P
B
GLY
246
B
GLY
258
1
9
13
disulf
2.027
A
CYS
1
A
SG
CYS
9
1_555
B
CYS
122
B
SG
CYS
119
1_555
disulf
2.028
B
CYS
42
B
SG
CYS
28
1_555
B
CYS
58
B
SG
CYS
44
1_555
disulf
2.041
B
CYS
168
B
SG
CYS
173
1_555
B
CYS
182
B
SG
CYS
187
1_555
disulf
2.038
B
CYS
191
B
SG
CYS
201
1_555
B
CYS
220
B
SG
CYS
231
1_555
covale
1.330
C
GLU
262
C
C
GLU
8
1_555
C
TYS
263
C
N
TYS
9
1_555
covale
1.326
C
TYS
263
C
C
TYS
9
1_555
C
LEU
264
C
N
LEU
10
1_555
HYDROLASE/HYDROLASE INHIBITOR
blood coagulation; factor Xa; inhibitor complexes, serine proteinase, blood coagulation cascade, HYDROLASE, HYDROLASE-HYDROLASE INHIBITOR COMPLEX
B
SER
36
B
SER
22
A
1
B
PRO
37
B
PRO
23
-0.50
THRB_HUMAN
UNP
1
328
P00734
TFGSGEADCGLRPLFEKKSLEDKTERELLESYIDGR
THRB_HUMAN
UNP
2
364
P00734
IVEGSDAEIGMSPWQVMLFRKSPQELLCGASLISDRWVLTAAHCLLYPPWDKNFTENDLLVRIGKHSRTRYERNIEKISM
LEKIYIHPRYNWRENLDRDIALMKLKKPVAFSDYIHPVCLPDRETAASLLQAGYKGRVTGWGNLKETWTANVGKGQPSVL
QVVNLPIVERPVCKDSTRIRITDNMFCAGYKPDEGKRGDACEGDSGGPFVMKSPFNNRWYQMGIVSWGEGCDRDGKYGFY
THVFRLKKWIQKVIDQFGE
ITHF_HIRME
UNP
3
55
P28506
DFEEIPEEYLQ
328
363
1G32
1
14
P00734
H
N
A
1
1
36
364
622
1G32
16
247
P00734
B
2
1
259
55
65
1G32
255
265
P28506
C
3
1
11
7
7
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
anti-parallel
B
SER
20
B
SER
5
B
ASP
21
B
ASP
6
B
GLN
156
B
GLN
161
B
PRO
161
B
PRO
166
B
LYS
135
B
LYS
135
B
GLY
140
B
GLY
140
B
PRO
198
B
PRO
208
B
LYS
202
B
LYS
212
B
TRP
207
B
TRP
219
B
TRP
215
B
TRP
227
B
GLY
226
B
GLY
238
B
HIS
230
B
HIS
242
B
MET
180
B
MET
185
B
ALA
183
B
ALA
188
B
LYS
81
B
LYS
77
B
SER
83
B
SER
79
B
LEU
64
B
LEU
59
B
ILE
68
B
ILE
63
B
GLN
30
B
GLN
15
B
ARG
35
B
ARG
20
B
GLU
39
B
GLU
25
B
LEU
46
B
LEU
32
B
TRP
51
B
TRP
37
B
THR
54
B
THR
40
B
ALA
104
B
ALA
101
B
LEU
108
B
LEU
105
B
LEU
85
B
LEU
81
B
ILE
90
B
ILE
86
BINDING SITE FOR RESIDUE R11 B 1
Software
15
BINDING SITE FOR CHAIN C OF HIRUDIN IIB
Software
28
B
HIS
57
B
HIS
43
15
1_555
B
TYR
60
B
TYR
47
A
15
1_555
B
TRP
60
B
TRP
50
D
15
1_555
B
GLU
97
B
GLU
94
A
15
1_555
B
ASN
98
B
ASN
95
15
1_555
B
LEU
99
B
LEU
96
15
1_555
B
ILE
174
B
ILE
179
15
1_555
B
ASP
189
B
ASP
199
15
1_555
B
ALA
190
B
ALA
200
15
1_555
B
SER
195
B
SER
205
15
1_555
B
SER
214
B
SER
226
15
1_555
B
TRP
215
B
TRP
227
15
1_555
B
GLY
216
B
GLY
228
15
1_555
B
GLY
219
B
GLY
230
15
1_555
B
GLY
226
B
GLY
238
15
1_555
B
PHE
34
B
PHE
19
28
1_555
B
GLN
38
B
GLN
24
28
1_555
B
LEU
40
B
LEU
26
28
1_555
B
LEU
65
B
LEU
60
28
1_555
B
ARG
73
B
ARG
68
28
1_555
B
THR
74
B
THR
69
28
1_555
B
ARG
75
B
ARG
70
28
2_555
B
ARG
75
B
ARG
70
28
1_555
B
TYR
76
B
TYR
71
28
1_555
B
LYS
81
B
LYS
77
28
1_555
B
ILE
82
B
ILE
78
28
1_555
B
MET
84
B
MET
80
28
1_555
B
HOH
543
F
HOH
28
1_555
B
HOH
703
F
HOH
28
2_555
B
HOH
792
F
HOH
28
1_555
C
HOH
582
G
HOH
28
1_555
C
HOH
630
G
HOH
28
1_555
C
HOH
647
G
HOH
28
1_555
C
HOH
650
G
HOH
28
1_555
C
HOH
671
G
HOH
28
1_555
C
HOH
675
G
HOH
28
1_555
C
HOH
687
G
HOH
28
1_555
C
HOH
713
G
HOH
28
1_555
C
HOH
736
G
HOH
28
1_555
C
HOH
754
G
HOH
28
1_555
C
HOH
779
G
HOH
28
1_555
C
HOH
784
G
HOH
28
1_555
C
HOH
803
G
HOH
28
1_555
5
C 1 2 1