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Rossjohn, J. http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic 8 90 90 90 85.4 90.1 125.3 C3 H7 N O2 89.093 y ALANINE L-peptide linking C6 H15 N4 O2 1 175.209 y ARGININE L-peptide linking C4 H8 N2 O3 132.118 y ASPARAGINE L-peptide linking C4 H7 N O4 133.103 y ASPARTIC ACID L-peptide linking Cd 2 112.411 CADMIUM ION non-polymer C3 H7 N O2 S 121.158 y CYSTEINE L-peptide linking C5 H10 N2 O3 146.144 y GLUTAMINE L-peptide linking C5 H9 N O4 147.129 y GLUTAMIC ACID L-peptide linking C2 H5 N O2 75.067 y GLYCINE peptide linking C6 H10 N3 O2 1 156.162 y HISTIDINE L-peptide linking H2 O 18.015 WATER non-polymer C6 H13 N O2 131.173 y ISOLEUCINE L-peptide linking C6 H13 N O2 131.173 y LEUCINE L-peptide linking C6 H15 N2 O2 1 147.195 y LYSINE L-peptide linking C5 H11 N O2 S 149.211 y METHIONINE L-peptide linking C9 H11 N O2 165.189 y PHENYLALANINE L-peptide linking C5 H9 N O2 115.130 y PROLINE L-peptide linking C3 H7 N O3 105.093 y SERINE L-peptide linking C4 H9 N O3 119.119 y THREONINE L-peptide linking C11 H12 N2 O2 204.225 y TRYPTOPHAN L-peptide linking C9 H11 N O3 181.189 y TYROSINE L-peptide linking C5 H11 N O2 117.146 y VALINE L-peptide linking US J.IMMUNOL. JOIMA3 0952 0022-1767 169 5153 5160 12391232 The structure of HLA-B8 complexed to an immunodominant viral determinant: peptide-induced conformational changes and a mode of MHC class I dimerization. 2003 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 0.00000 0.00000 100 1 2002-03-15 osmic mirrors SINGLE WAVELENGTH M x-ray 1 1.5418 1.0 1.5418 ROTATING ANODE RIGAKU RU300 truncation mutant 32015.055 HLA class I histocompatibility antigen, B-8 B*0801 alpha chain residues 25-301 2 man polymer 11748.160 Beta-2-microglobulin residues 21-119 2 man polymer 1054.247 EBNA-3 nuclear protein residues 193-201 2 syn polymer 112.411 CADMIUM ION 2 syn non-polymer 18.015 water 794 nat water EBNA-3A no no GSHSMRYFDTAMSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAASPREEPRAPWIEQEGPEYWDRNTQIFKTNTQTDRESLRN LRGYYNQSEAGSHTLQSMYGCDVGPDGRLLRGHNQYAYDGKDYIALNEDLRSWTAADTAAQITQRKWEAARVAEQDRAYL EGTCVEWLRRYLENGKDTLERADPPKTHVTHHPISDHEATLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDTELVETRPAGDRT FQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWEPS GSHSMRYFDTAMSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRFDSDAASPREEPRAPWIEQEGPEYWDRNTQIFKTNTQTDRESLRN LRGYYNQSEAGSHTLQSMYGCDVGPDGRLLRGHNQYAYDGKDYIALNEDLRSWTAADTAAQITQRKWEAARVAEQDRAYL EGTCVEWLRRYLENGKDTLERADPPKTHVTHHPISDHEATLRCWALGFYPAEITLTWQRDGEDQTQDTELVETRPAGDRT FQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWEPS A,C polypeptide(L) no no IQRTPKIQVYSRHPAENGKSNFLNCYVSGFHPSDIEVDLLKNGERIEKVEHSDLSFSKDWSFYLLYYTEFTPTEKDEYAC RVNHVTLSQPKIVKWDRDM IQRTPKIQVYSRHPAENGKSNFLNCYVSGFHPSDIEVDLLKNGERIEKVEHSDLSFSKDWSFYLLYYTEFTPTEKDEYAC RVNHVTLSQPKIVKWDRDM B,D polypeptide(L) no no FLRGRAYGL FLRGRAYGL E,F polypeptide(L) n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n human Homo Escherichia sample 9606 Homo sapiens 562 Escherichia coli human Homo Escherichia sample 9606 Homo sapiens 562 Escherichia coli 1 2.69 54.24 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP software repository Initial release Version format compliance Version format compliance Refinement description 1 0 2003-09-02 1 1 2008-04-28 1 2 2011-07-13 1 3 2017-10-11 HLA B8 in complex with a GAG peptide (from HIV) SEQUENCE ACCORDING TO THE AUTHOR, THIS IS A SITE OF POLYMORPHISM IN THE EBNA 3 ANTIGEN. THE 9-MER PEPTIDE THAT WAS SYNTHESIZED HAD LEU IN THE 9TH POSITION. RCSB Y RCSB 2002-06-11 REL CD CADMIUM ION HOH water THE PEPTIDE WAS CHEMICALLY SYNTHESIZED. THE SEQUENCE OF THE PROTEIN IS NATURALLY FOUND IN EPSTEIN-BARR VIRUS. sample CD 1 4 CD CD 101 B CD 2 4 CD CD 101 D WAT 2 5 HOH HOH 278 A WAT 7 5 HOH HOH 279 A WAT 10 5 HOH HOH 280 A WAT 12 5 HOH HOH 281 A WAT 15 5 HOH HOH 282 A WAT 16 5 HOH HOH 283 A WAT 19 5 HOH HOH 284 A WAT 23 5 HOH HOH 285 A WAT 27 5 HOH HOH 286 A WAT 29 5 HOH HOH 287 A WAT 35 5 HOH HOH 288 A WAT 36 5 HOH HOH 289 A WAT 41 5 HOH HOH 290 A WAT 45 5 HOH HOH 291 A WAT 49 5 HOH HOH 292 A WAT 51 5 HOH HOH 293 A WAT 52 5 HOH HOH 294 A WAT 53 5 HOH HOH 295 A WAT 54 5 HOH HOH 296 A WAT 60 5 HOH HOH 297 A WAT 61 5 HOH HOH 298 A WAT 64 5 HOH HOH 299 A WAT 65 5 HOH HOH 300 A WAT 73 5 HOH HOH 301 A WAT 74 5 HOH HOH 302 A WAT 75 5 HOH HOH 303 A WAT 78 5 HOH HOH 304 A WAT 81 5 HOH HOH 305 A WAT 94 5 HOH HOH 306 A WAT 100 5 HOH HOH 307 A WAT 105 5 HOH HOH 308 A WAT 107 5 HOH HOH 309 A WAT 110 5 HOH HOH 310 A WAT 116 5 HOH HOH 311 A WAT 118 5 HOH HOH 312 A WAT 119 5 HOH HOH 313 A WAT 124 5 HOH HOH 314 A WAT 129 5 HOH HOH 315 A WAT 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