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sing N 508 N sing N 509 N sing N 510 N sing N 511 N sing N 512 N sing N 513 N sing US Biochemistry BICHAW 0033 0006-2960 41 13672 13680 10.1021/bi026556b 12427029 Ligand-Induced Structural Changes in Adenosine 5'-Phosphosulfate Kinase from Penicillium chrysogenum. 2002 10.2210/pdb1m7g/pdb pdb_00001m7g 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 0.00000 0.00000 100 1 IMAGE PLATE 2001-04-26 MARRESEARCH curved crystal SINGLE WAVELENGTH M x-ray 1 0.97 1.0 BL9-1 SSRL 0.97 SYNCHROTRON SSRL BEAMLINE BL9-1 23804.781 Adenylylsulfate kinase 2.7.1.25 4 man polymer 96.063 SULFATE ION 6 syn non-polymer 509.133 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE-2',3'-VANADATE 2 syn non-polymer 427.284 ADENOSINE-5'-PHOSPHOSULFATE 4 syn non-polymer 427.201 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE 2 syn non-polymer 92.094 GLYCEROL 2 syn non-polymer 18.015 water 790 nat water APS kinase, Adenosine-5'phosphosulfate kinase, ATP adenosine-5'-phosphosulfate 3'- phosphotransferase no no MSTNITFHASALTRSERTELRNQRGLTIWLTGLSASGKSTLAVELEHQLVRDRRVHAYRLDGDNIRFGLNKDLGFSEADR NENIRRIAEVAKLFADSNSIAITSFISPYRKDRDTARQLHEVATPGEETGLPFVEVYVDVPVEVAEQRDPKGLYKKAREG VIKEFTGISAPYEAPANPEVHVKNYELPVQDAVKQIIDYLDTKGYLPAKKE MSTNITFHASALTRSERTELRNQRGLTIWLTGLSASGKSTLAVELEHQLVRDRRVHAYRLDGDNIRFGLNKDLGFSEADR NENIRRIAEVAKLFADSNSIAITSFISPYRKDRDTARQLHEVATPGEETGLPFVEVYVDVPVEVAEQRDPKGLYKKAREG VIKEFTGISAPYEAPANPEVHVKNYELPVQDAVKQIIDYLDTKGYLPAKKE A,B,C,D polypeptide(L) n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n Penicillium Escherichia Escherichia coli sample 5076 Penicillium chrysogenum 511693 Escherichia coli BL21 BL21 plasmid pET23A 1 2.48 50.32 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP 4.0 Na monobasic phosphate, K dibasic phosphate, succinate, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K 298 chem_comp_atom chem_comp_bond database_2 struct_conn struct_site repository Initial release Version format compliance Non-polymer description Version format compliance Data collection Database references Derived calculations 1 0 2002-11-27 1 1 2008-04-28 1 2 2011-07-13 1 3 2024-02-14 _database_2.pdbx_DOI _database_2.pdbx_database_accession _struct_conn.ptnr1_auth_asym_id _struct_conn.ptnr1_auth_seq_id _struct_conn.ptnr1_label_asym_id _struct_conn.ptnr1_label_atom_id _struct_conn.ptnr1_symmetry _struct_conn.ptnr2_auth_asym_id _struct_conn.ptnr2_auth_seq_id _struct_conn.ptnr2_label_asym_id _struct_conn.ptnr2_label_atom_id _struct_conn.ptnr2_symmetry _struct_site.pdbx_auth_asym_id _struct_site.pdbx_auth_comp_id _struct_site.pdbx_auth_seq_id apo crystal structure Crystal Structure of APS kinase from Penicillium Chrysogenum: Structure with APS soaked out of one dimer SEQUENCE Residue 54 in all of the subunits is listed as Arg in the database sequence (SwissProt accession Q12657). According to the author, the gene has been resequenced and residue 54 is actually Gly. RCSB Y RCSB 2002-07-19 REL REL SO4 SULFATE ION AV2 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE-2',3'-VANADATE ADX ADENOSINE-5'-PHOSPHOSULFATE ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE GOL GLYCEROL HOH water SO4 2001 2 SO4 SO4 2001 A SO4 2002 2 SO4 SO4 2002 A SO4 2003 2 SO4 SO4 2003 A ADP 301 3 AV2 AV2 1301 A APS 302 4 ADX ADX 1302 A SO4 2004 2 SO4 SO4 2004 B ADP 301 5 ADP ADP 1304 B APS 302 4 ADX ADX 1305 B CRY 2011 6 GOL GOL 2011 B SO4 2005 2 SO4 SO4 2005 C SO4 2006 2 SO4 SO4 2006 C ADP 301 3 AV2 AV2 1306 C APS 302 4 ADX ADX 1307 C CRY 2010 6 GOL GOL 2010 C ADP 301 5 ADP ADP 1309 D APS 302 4 ADX ADX 1310 D WAT 3 7 HOH HOH 2004 A WAT 6 7 HOH HOH 2005 A WAT 9 7 HOH HOH 2006 A WAT 18 7 HOH HOH 2007 A WAT 19 7 HOH HOH 2008 A WAT 20 7 HOH HOH 2009 A WAT 22 7 HOH HOH 2010 A WAT 25 7 HOH HOH 2011 A WAT 31 7 HOH HOH 2012 A WAT 33 7 HOH HOH 2013 A WAT 35 7 HOH HOH 2014 A WAT 41 7 HOH HOH 2015 A WAT 43 7 HOH HOH 2016 A WAT 47 7 HOH HOH 2017 A WAT 49 7 HOH HOH 2018 A WAT 55 7 HOH HOH 2019 A WAT 56 7 HOH HOH 2020 A WAT 57 7 HOH 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