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PRO 224 1 Y 1 H PRO 237 D PRO 225 1 Y 1 H CYS 238 D CYS 226 1 Y 1 H LYS 239 D LYS 227 1 Y 1 B B OE O PCA HOH 1 2054 2.14 1 A MET 51 66.25 -31.62 1 A SER 67 -90.92 -145.88 1 A SER 171 57.74 14.12 1 A SER 201 -176.27 145.68 1 B GLN 43 -100.44 -167.61 B 1 B SER 82 33.07 71.51 1 B ALA 88 178.82 172.51 1 B PHE 148 -175.12 136.50 1 L GLN 6 -106.63 67.16 1 L ALA 7 -26.24 -52.21 1 L VAL 13 -171.67 139.37 1 L MET 51 64.19 -28.18 1 L SER 52 -142.05 -5.67 1 L SER 67 -88.89 -134.19 1 L SER 201 165.06 141.25 1 H PRO 41 -37.42 130.83 B 1 H SER 82 37.20 67.79 1 H ALA 214 -39.79 -31.01 protein_rep.param ion.param water_rep.param hap.param 25.1 0.2555 0.1784 2.1 10.0 2707 50305 50305 RANDOM 1 Isotropic THROUGHOUT 0 MIR PDB ENTRY 1MH5 Engh & Huber 2.1 10.0 913 7570 81 0 6576 1.66854 0.009621 4.942 3.5 7.282 4.0 6.058 4.0 8.589 4.5 2.1 10.0 1MJJ 50305 50305 0 -3 0.1 1 11.0 4.3 85.0 0.323 2.1 2.15 3.0 49.5 data reduction DENZO data scaling SCALEPACK refinement CNS phasing CNS IMMUNOGLOBULIN MS6-12 (light and heavy chains) HIGH RESOLUTION CRYSTAL STRUCTURE OF THE COMPLEX OF THE FAB FRAGMENT OF ESTEROLYTIC ANTIBODY MS6-12 AND A TRANSITION-STATE ANALOG 1 N N 2 N N 1 N N 2 N N 3 N N 4 N N 3 N N 3 N N 4 N N 5 N N 5 N N 5 N N 5 N N A GLU 79 A GLU 84 HELX_P A VAL 83 A VAL 88 5 1 5 A SER 121 A SER 126 HELX_P A GLY 128 A GLY 133 1 2 8 A LYS 183 A LYS 188 HELX_P A ARG 188 A ARG 193 1 3 6 B THR 28 B THR 28 HELX_P B TYR 32 B TYR 32 5 4 5 B GLU 61 B GLU 62 HELX_P B LYS 64 B LYS 65 5 5 4 B THR 73 B THR 74 HELX_P B SER 75 B SER 76 5 6 3 B THR 83 B THR 87 HELX_P B SER 87 B SER 91 5 7 5 B SER 163 B SER 159 HELX_P B SER 165 B SER 161 5 8 3 B SER 196 B SER 189 HELX_P B TRP 199 B TRP 191 5 9 3 B PRO 213 B PRO 203 HELX_P B SER 216 B SER 206 5 10 4 L GLU 79 C GLU 84 HELX_P L VAL 83 C VAL 88 5 11 5 L SER 121 C SER 126 HELX_P L THR 126 C THR 131 1 12 6 L LYS 183 C LYS 188 HELX_P L ARG 188 C ARG 193 1 13 6 H THR 28 D THR 28 HELX_P H TYR 32 D TYR 32 5 14 5 H GLU 61 D GLU 62 HELX_P H LYS 64 D LYS 65 5 15 4 H THR 83 D THR 87 HELX_P H SER 87 D SER 91 5 16 5 H SER 163 D SER 159 HELX_P H SER 165 D SER 161 5 17 3 H PRO 213 D PRO 203 HELX_P H SER 216 D SER 206 5 18 4 disulf 2.072 A CYS 23 A SG CYS 23 1_555 A CYS 88 A SG CYS 93 1_555 disulf 2.031 A CYS 134 A SG CYS 139 1_555 A CYS 194 A SG CYS 199 1_555 disulf 2.046 B CYS 22 B SG CYS 22 1_555 B CYS 92 B SG CYS 96 1_555 disulf 2.023 B CYS 142 B SG CYS 143 1_555 B CYS 208 B SG CYS 198 1_555 disulf 2.050 L CYS 23 C SG CYS 23 1_555 L CYS 88 C SG CYS 93 1_555 disulf 2.029 L CYS 134 C SG CYS 139 1_555 L CYS 194 C SG CYS 199 1_555 disulf 2.053 H CYS 22 D SG CYS 22 1_555 H CYS 92 D SG CYS 96 1_555 disulf 2.019 H CYS 142 D SG CYS 143 1_555 H CYS 208 D SG CYS 198 1_555 covale 1.322 both B PCA 1 B C PCA 1 1_555 B VAL 2 B N VAL 2 1_555 covale 1.353 both H PCA 1 D C PCA 1 1_555 H VAL 2 D N VAL 2 1_555 IMMUNE SYSTEM CATALYTIC ANTIBODY, ESTER HYDROLYSIS, ESTEROLYTIC, FAB, IMMUNOGLOBULIN, IMMUNE SYSTEM A TYR 94 A TYR 99 1 A PRO 95 A PRO 100 -0.21 A TYR 140 A TYR 145 1 A PRO 141 A PRO 146 0.54 B PHE 148 B PHE 149 1 B PRO 149 B PRO 150 -0.14 B GLU 150 B GLU 151 1 B PRO 151 B PRO 152 0.01 B TRP 199 B TRP 191 1 B PRO 200 B PRO 192 0.60 L TYR 94 C TYR 99 1 L PRO 95 C PRO 100 -0.17 L TYR 140 C TYR 145 1 L PRO 141 C PRO 146 0.25 H PHE 148 D PHE 149 1 H PRO 149 D PRO 150 -0.12 H GLU 150 D GLU 151 1 H PRO 151 D PRO 152 0.40 H TRP 199 D TRP 191 1 H PRO 200 D PRO 192 -0.05 1MJJ PDB 1 1MJJ 1MJJ PDB 2 1MJJ 1 214 1MJJ 1 214 1MJJ A 1 1 219 1 239 1MJJ 1 239 1MJJ B 2 1 227 1 214 1MJJ 1 214 1MJJ L 1 1 219 1 239 1MJJ 1 239 1MJJ H 2 1 227 4 5 6 4 4 4 5 6 4 3 4 5 6 4 4 4 5 6 4 3 anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel A MET 4 A MET 4 A THR 5 A THR 5 A VAL 19 A VAL 19 A SER 25 A SER 25 A ALA 70 A ALA 75 A ILE 75 A ILE 80 A PHE 62 A PHE 67 A GLY 66 A GLY 71 A ASN 53 A ASN 58 A LEU 54 A LEU 59 A GLN 45 A GLN 50 A TYR 49 A TYR 54 A LEU 33 A LEU 38 A GLN 38 A GLN 43 A GLY 84 A GLY 89 A GLN 90 A GLN 95 A THR 97 A THR 102 A PHE 98 A PHE 103 A ASN 53 A ASN 58 A LEU 54 A LEU 59 A GLN 45 A GLN 50 A TYR 49 A TYR 54 A LEU 33 A LEU 38 A GLN 38 A GLN 43 A GLY 84 A GLY 89 A GLN 90 A GLN 95 A THR 102 A THR 107 A LEU 106 A LEU 111 A SER 10 A SER 10 A VAL 13 A VAL 13 A THR 114 A THR 119 A PHE 118 A PHE 123 A GLY 129 A GLY 134 A PHE 139 A PHE 144 A TYR 173 A TYR 178 A THR 182 A THR 187 A VAL 159 A VAL 164 A TRP 163 A TRP 168 A SER 153 A SER 158 A ARG 155 A ARG 160 A ASN 145 A ASN 150 A ILE 150 A ILE 155 A SER 191 A SER 196 A THR 197 A THR 202 A ILE 205 A ILE 210 A ASN 210 A ASN 215 B GLN 3 B GLN 3 B GLN 5 B GLN 5 B VAL 18 B VAL 18 B SER 25 B SER 25 B THR 77 B THR 78 B LEU 82 B LEU 83 B ALA 67 B ALA 68 B ASP 72 B ASP 73 B THR 57 B THR 58 B TYR 59 B TYR 60 B LEU 45 B LEU 45 B ILE 51 B ILE 51 B ILE 34 B ILE 34 B GLN 39 B GLN 39 B ALA 88 B ALA 92 B LEU 96 B LEU 100 B PHE 99 B PHE 103 B TRP 103 B TRP 106 B THR 57 B THR 58 B TYR 59 B TYR 60 B LEU 45 B LEU 45 B ILE 51 B ILE 51 B ILE 34 B ILE 34 B GLN 39 B GLN 39 B ALA 88 B ALA 92 B LEU 96 B LEU 100 B THR 107 B THR 110 B VAL 111 B VAL 114 B ALA 9 B ALA 9 B VAL 12 B VAL 12 B SER 120 B SER 123 B LEU 124 B LEU 127 B SER 137 B SER 138 B TYR 147 B TYR 148 B LEU 184 B LEU 177 B THR 194 B THR 187 B VAL 171 B VAL 166 B GLN 179 B GLN 174 B THR 153 B THR 154 B TRP 158 B TRP 157 B THR 206 B THR 197 B HIS 212 B HIS 202 B THR 217 B THR 207 B LYS 222 B LYS 212 L MET 4 C MET 4 L THR 5 C THR 5 L VAL 19 C VAL 19 L SER 25 C SER 25 L ALA 70 C ALA 75 L ILE 75 C ILE 80 L PHE 62 C PHE 67 L GLY 66 C GLY 71 L ASN 53 C ASN 58 L LEU 54 C LEU 59 L GLN 45 C GLN 50 L TYR 49 C TYR 54 L LEU 33 C LEU 38 L GLN 38 C GLN 43 L GLY 84 C GLY 89 L GLN 90 C GLN 95 L THR 97 C THR 102 L PHE 98 C PHE 103 L ASN 53 C ASN 58 L LEU 54 C LEU 59 L GLN 45 C GLN 50 L TYR 49 C TYR 54 L LEU 33 C LEU 38 L GLN 38 C GLN 43 L GLY 84 C GLY 89 L GLN 90 C GLN 95 L THR 102 C THR 107 L LEU 106 C LEU 111 L SER 10 C SER 10 L VAL 13 C VAL 13 L THR 114 C THR 119 L PHE 118 C PHE 123 L GLY 129 C GLY 134 L PHE 139 C PHE 144 L TYR 173 C TYR 178 L THR 182 C THR 187 L VAL 159 C VAL 164 L TRP 163 C TRP 168 L SER 153 C SER 158 L ARG 155 C ARG 160 L ILE 144 C ILE 149 L ILE 150 C ILE 155 L SER 191 C SER 196 L HIS 198 C HIS 203 L ILE 205 C ILE 210 L ASN 210 C ASN 215 H GLN 3 D GLN 3 H GLN 5 D GLN 5 H VAL 18 D VAL 18 H SER 25 D SER 25 H THR 77 D THR 78 H LEU 82 D LEU 83 H ALA 67 D ALA 68 H ASP 72 D ASP 73 H THR 57 D THR 58 H TYR 59 D TYR 60 H GLU 46 D GLU 46 H ILE 51 D ILE 51 H ILE 34 D ILE 34 H GLN 39 D GLN 39 H ALA 88 D ALA 92 H LEU 96 D LEU 100 H PHE 99 D PHE 103 H TRP 103 D TRP 106 H THR 57 D THR 58 H TYR 59 D TYR 60 H GLU 46 D GLU 46 H ILE 51 D ILE 51 H ILE 34 D ILE 34 H GLN 39 D GLN 39 H ALA 88 D ALA 92 H LEU 96 D LEU 100 H THR 107 D THR 110 H VAL 111 D VAL 114 H ALA 9 D ALA 9 H VAL 12 D VAL 12 H SER 120 D SER 123 H LEU 124 D LEU 127 H SER 137 D SER 138 H TYR 147 D TYR 148 H LEU 184 D LEU 177 H THR 194 D THR 187 H VAL 171 D VAL 166 H GLN 179 D GLN 174 H THR 153 D THR 154 H TRP 158 D TRP 157 H THR 206 D THR 197 H HIS 212 D HIS 202 H THR 217 D THR 207 H LYS 222 D LYS 212 BINDING SITE FOR RESIDUE SO4 A 2001 Software 5 BINDING SITE FOR RESIDUE SO4 B 2002 Software 3 BINDING SITE FOR RESIDUE SO4 B 2003 Software 4 BINDING SITE FOR RESIDUE HAL A 1001 Software 13 BINDING SITE FOR RESIDUE HAL H 1002 Software 13 A ARG 211 A ARG 216 5 1_555 A ASN 212 A ASN 217 5 1_555 A HOH 2224 J HOH 5 1_555 A HOH 2279 J HOH 5 1_555 L SER 203 C SER 208 5 2_564 B PRO 7 B PRO 7 3 1_555 B GLY 8 B GLY 8 3 1_555 B HOH 2035 K HOH 3 1_555 B ARG 40 B ARG 40 4 1_555 B LYS 62 B LYS 63 4 1_555 B HOH 2061 K HOH 4 1_555 B HOH 2200 K HOH 4 1_555 A TYR 32 A TYR 37 13 1_555 A HIS 91 A HIS 96 13 1_555 A LEU 92 A LEU 97 13 1_555 A PHE 96 A PHE 101 13 1_555 A HOH 2160 J HOH 13 1_555 A HOH 2203 J HOH 13 1_555 A HOH 2245 J HOH 13 1_555 B TRP 33 B TRP 33 13 1_555 B ASN 35 B ASN 35 13 1_555 B ASN 50 B ASN 50 13 1_555 B LYS 95 B LYS 99 13 1_555 H HAL 1002 I HAL 13 2_565 L HOH 347 L HOH 13 2_565 A HAL 1001 F HAL 13 2_564 H TRP 33 D TRP 33 13 1_555 H ASN 35 D ASN 35 13 1_555 H ASN 50 D ASN 50 13 1_555 H LYS 95 D LYS 99 13 1_555 H HOH 1142 M HOH 13 1_555 L TYR 32 C TYR 37 13 1_555 L HIS 91 C HIS 96 13 1_555 L LEU 92 C LEU 97 13 1_555 L TYR 94 C TYR 99 13 1_555 L PHE 96 C PHE 101 13 1_555 L HOH 374 L HOH 13 1_555 L HOH 552 L HOH 13 1_555 19 P 21 21 21