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Schultz, P.G. http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic 4 90.00 92.58 90.00 70.666 64.723 93.382 C3 H7 N O2 89.093 y ALANINE L-peptide linking C6 H15 N4 O2 1 175.209 y ARGININE L-peptide linking C4 H8 N2 O3 132.118 y ASPARAGINE L-peptide linking C4 H7 N O4 133.103 y ASPARTIC ACID L-peptide linking C3 H7 N O2 S 121.158 y CYSTEINE L-peptide linking C5 H10 N2 O3 146.144 y GLUTAMINE L-peptide linking C5 H9 N O4 147.129 y GLUTAMIC ACID L-peptide linking C2 H5 N O2 75.067 y GLYCINE peptide linking C6 H10 N3 O2 1 156.162 y HISTIDINE L-peptide linking H2 O 18.015 WATER non-polymer C6 H13 N O2 131.173 y ISOLEUCINE L-peptide linking C30 H63 N O10 597.822 O-(O-(2-AMINOPROPYL)-O'-(2-METHOXYETHYL)POLYPROPYLENE GLYCOL 500) JEFFAMINE non-polymer C6 H13 N O2 131.173 y LEUCINE L-peptide linking C6 H15 N2 O2 1 147.195 y LYSINE L-peptide linking C5 H11 N O2 S 149.211 y METHIONINE L-peptide linking C9 H11 N O2 165.189 y PHENYLALANINE L-peptide linking C5 H9 N O2 115.130 y PROLINE L-peptide linking C3 H7 N O3 105.093 y SERINE L-peptide linking C4 H9 N O3 119.119 y THREONINE L-peptide linking C11 H12 N2 O2 204.225 y TRYPTOPHAN L-peptide linking C9 H11 N O3 181.189 y TYROSINE L-peptide linking C5 H11 N O2 117.146 y VALINE L-peptide linking US Proc.Natl.Acad.Sci.USA PNASA6 0040 0027-8424 100 856 861 10.1073/pnas.0235873100 12552112 Structural evidence for substrate strain in antibody catalysis 2003 100 1 IMAGE PLATE RIGAKU RAXIS IV SINGLE WAVELENGTH M x-ray 1 1.5418 1.0 1.5418 ROTATING ANODE RIGAKU FR-D 23391.951 Germline Metal Chelatase Catalytic Antibody, Light chain germline Fab fragment 2 man polymer 23051.930 Germline Metal Chelatase Catalytic Antibody, Heavy chain germline Fab fragment 2 man polymer 597.822 O-(O-(2-AMINOPROPYL)-O'-(2-METHOXYETHYL)POLYPROPYLENE GLYCOL 500) 2 syn non-polymer 18.015 water 672 nat water no no ELVMTQTPKFMSTSVGDRVSITCKASQNVGTAVAWYQQKPGQSPKLLIYSASNRYTGVPDRFTGSGSGTDFTLTISNMQS EDLADYFCQQYSSYPLTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQ ESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRNE ELVMTQTPKFMSTSVGDRVSITCKASQNVGTAVAWYQQKPGQSPKLLIYSASNRYTGVPDRFTGSGSGTDFTLTISNMQS EDLADYFCQQYSSYPLTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQ ESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRNE A,L polypeptide(L) no no QVQLLESGAELVKPGASVKLSCKASGYTFTSYWMHWVKQRPGRGLEWIGRIDPNSGGTKYNEKFKSKATLTVDKPSSTAY MQLSSLTSEDSAVYYCTRRDSDYWGAGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGAL TSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKIVPKS QVQLLESGAELVKPGASVKLSCKASGYTFTSYWMHWVKQRPGRGLEWIGRIDPNSGGTKYNEKFKSKATLTVDKPSSTAY MQLSSLTSEDSAVYYCTRRDSDYWGAGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGAL TSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKIVPKS B,H polypeptide(L) n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n house mouse, human Mus, Homo , , Escherichia sample 10090,9606 Mus musculus, Homo sapiens 562 Escherichia coli house mouse, human Mus, Homo , , Escherichia sample 10090,9606 Mus musculus, Homo sapiens 562 Escherichia coli 1 2.10 40.97 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP 7 PEG2000MME, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 100K exptl_crystal_grow repository Initial release Version format compliance Non-polymer description Version format compliance Experimental preparation 1 0 2003-03-18 1 1 2008-04-29 1 2 2011-07-13 1 3 2018-01-31 _exptl_crystal_grow.temp SEQUENCE The gene sequences are derived from a mouse hybridoma. The sequences of the protein chains are not found in any sequence databases. HETEROGEN THE JEF RESIDUE PRESENT IN THE COORDINATES IS ONLY A FRAGMENT OF THE LARGER JEFFAMINE POLYMER. IT DOES NOT CONTAIN ATOMS FROM EITHER TERMINI OF THIS POLYMER. RCSB Y RCSB 2002-12-18 REL REL JEF O-(O-(2-AMINOPROPYL)-O'-(2-METHOXYETHYL)POLYPROPYLENE GLYCOL 500) HOH water ETH 1 3 JEF JEF 700 B ETH 1 3 JEF JEF 701 H WAT 4 4 HOH HOH 214 A WAT 6 4 HOH HOH 215 A WAT 7 4 HOH HOH 216 A WAT 8 4 HOH HOH 217 A WAT 11 4 HOH HOH 218 A WAT 16 4 HOH HOH 219 A WAT 20 4 HOH HOH 220 A WAT 27 4 HOH HOH 221 A WAT 28 4 HOH HOH 222 A WAT 39 4 HOH HOH 223 A WAT 41 4 HOH HOH 224 A WAT 42 4 HOH HOH 225 A WAT 51 4 HOH HOH 226 A WAT 52 4 HOH HOH 227 A WAT 60 4 HOH HOH 228 A WAT 73 4 HOH HOH 229 A WAT 75 4 HOH HOH 230 A WAT 76 4 HOH HOH 231 A WAT 86 4 HOH HOH 232 A WAT 87 4 HOH HOH 233 A WAT 96 4 HOH HOH 234 A WAT 100 4 HOH HOH 235 A WAT 101 4 HOH HOH 236 A WAT 104 4 HOH HOH 237 A WAT 111 4 HOH HOH 238 A WAT 112 4 HOH HOH 239 A WAT 116 4 HOH HOH 240 A WAT 117 4 HOH HOH 241 A WAT 121 4 HOH HOH 242 A WAT 124 4 HOH HOH 243 A WAT 125 4 HOH HOH 244 A WAT 134 4 HOH HOH 245 A WAT 137 4 HOH HOH 246 A WAT 142 4 HOH HOH 247 A WAT 147 4 HOH HOH 248 A WAT 151 4 HOH HOH 249 A WAT 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-28.79 -77.58 1 H SER 85 37.44 57.97 1 H ALA 92 179.58 179.00 1 H ASP 100 -105.07 40.58 1 H ALA 106 -32.43 -112.78 1 H SER 128 -42.46 107.93 1 H LYS 130 71.32 -33.60 1 H THR 192 -129.47 -58.30 protein_rep.param protein.top carbohydrate.param carbohydrate.top water_rep.param water.top eth.par eth.top 77.66 22.10 5.30 -2.68 0.00 1.95 2.21 0.00 0.47 0.25 0.004 0.225 1.80 19.87 3696 78130 73191 5.0 93.7 1.00 1.00 random 1 THROUGHOUT MOLECULAR REPLACEMENT CNS bulk solvent model used 32.8053 0.327777 0.24 0.21 5.00 0.12 0.06 1.80 1.80 19.87 672 7256 56 0 6528 0.005 1.4 27.0 0.80 0.299 0.014 0.267 1.88 427 8129 9707 8556 8 5.0 88.1 0.269 0.013 0.228 1.98 461 8250 9714 8711 8 5.3 89.7 0.246 0.012 0.216 2.10 427 8401 9751 8828 8 4.8 90.5 0.257 0.012 0.217 2.27 446 8527 9760 8973 8 5.0 91.9 0.251 0.012 0.231 2.49 456 8744 9751 9200 8 5.0 94.3 0.254 0.012 0.241 2.86 481 8985 9775 9466 8 5.1 96.8 0.259 0.012 0.234 3.59 490 9114 9825 9604 8 5.1 97.8 0.229 0.010 0.206 19.87 508 9345 9948 9853 8 5.2 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Brunger axel.brunger@yale.edu 1998 Fortran CNS package 1.1 data reduction DENZO data scaling SCALEPACK phasing EPMR Germline Metal Chelatase Catalytic Antibody, Light chain/ Germline Metal Chelatase Catalytic Antibody, Heavy chain Chimeric Germline Fab 7g12 with jeffamine fragment bound 1 N N 2 N N 1 N N 2 N N 3 N N 3 N N 4 N N 4 N N 4 N N 4 N N A GLN 79 A GLN 79 HELX_P A LEU 83 A LEU 83 5 1 5 A SER 121 A SER 121 HELX_P A SER 127 A SER 127 1 2 7 A LYS 183 A LYS 183 HELX_P A GLU 187 A GLU 187 1 3 5 B GLU 62 B GLU 62 HELX_P B LYS 65 B LYS 65 5 4 4 B LYS 74 B LYS 74 HELX_P B SER 76 B SER 76 5 5 3 B THR 87 B THR 87 HELX_P B SER 91 B SER 91 5 6 5 B SER 157 B SER 157 HELX_P B ALA 159 B ALA 159 5 7 3 B SER 188 B SER 188 HELX_P B THR 192 B THR 192 5 8 5 B LYS 202 B LYS 202 HELX_P B ASN 205 B ASN 205 5 9 4 L GLN 79 C GLN 79 HELX_P L LEU 83 C LEU 83 5 10 5 L SER 121 C SER 121 HELX_P L SER 127 C SER 127 1 11 7 L LYS 183 C LYS 183 HELX_P L GLU 187 C GLU 187 1 12 5 H GLU 62 D GLU 62 HELX_P H LYS 65 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anti-parallel parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel parallel anti-parallel anti-parallel parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel A MET 4 A MET 4 A THR 7 A THR 7 A VAL 19 A VAL 19 A ALA 25 A ALA 25 A ASP 70 A ASP 70 A ILE 75 A ILE 75 A PHE 62 A PHE 62 A SER 67 A SER 67 A PHE 10 A PHE 10 A SER 14 A SER 14 A THR 102 A THR 102 A LYS 107 A LYS 107 A ALA 84 A ALA 84 A GLN 89 A GLN 89 A ALA 34 A ALA 34 A GLN 38 A GLN 38 A LYS 45 A LYS 45 A TYR 49 A TYR 49 A ASN 53 A ASN 53 A ARG 54 A ARG 54 A SER 114 A SER 114 A PHE 118 A PHE 118 A THR 129 A THR 129 A PHE 139 A PHE 139 A TYR 173 A TYR 173 A SER 182 A SER 182 A SER 159 A SER 159 A VAL 163 A VAL 163 A ALA 153 A ALA 153 A LEU 154 A LEU 154 A LYS 145 A LYS 145 A VAL 150 A VAL 150 A VAL 191 A VAL 191 A THR 197 A THR 197 A VAL 205 A VAL 205 A ASN 210 A ASN 210 B VAL 2 B VAL 2 B LEU 4 B LEU 4 B VAL 18 B VAL 18 B LYS 23 B LYS 23 B THR 78 B THR 78 B LEU 83 B LEU 83 B ALA 68 B ALA 68 B ASP 73 B ASP 73 B ALA 9 B ALA 9 B VAL 12 B VAL 12 B THR 108 B THR 108 B VAL 112 B VAL 112 B ALA 92 B ALA 92 B CYS 96 B CYS 96 B MET 34 B MET 34 B GLN 39 B GLN 39 B GLU 46 B GLU 46 B ILE 51 B ILE 51 B THR 58 B THR 58 B TYR 60 B TYR 60 B SER 121 B SER 121 B LEU 125 B LEU 125 B THR 136 B THR 136 B TYR 146 B TYR 146 B TYR 177 B TYR 177 B PRO 186 B PRO 186 B VAL 164 B VAL 164 B THR 166 B THR 166 B SER 121 B SER 121 B LEU 125 B LEU 125 B THR 136 B THR 136 B TYR 146 B TYR 146 B TYR 177 B TYR 177 B PRO 186 B PRO 186 B VAL 170 B VAL 170 B LEU 171 B LEU 171 B THR 152 B THR 152 B TRP 155 B TRP 155 B ILE 196 B ILE 196 B HIS 201 B HIS 201 B THR 206 B THR 206 B LYS 211 B LYS 211 L MET 4 C MET 4 L THR 7 C THR 7 L VAL 19 C VAL 19 L ALA 25 C ALA 25 L ASP 70 C ASP 70 L ILE 75 C ILE 75 L PHE 62 C PHE 62 L SER 67 C SER 67 L 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