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Bock, P.E. http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic 8 90.00 130.08 90.00 180.170 102.000 135.300 C23 H36 Cl N6 O4 S 1 528.088 N-(sulfanylacetyl)-D-phenylalanyl-N-[(2S,3S)-6-{[amino(iminio)methyl]amino}-1-chloro-2-hydroxyhexan-3-yl]-L-prolinamide ATA-FPR-CH2Cl, ATA-PPACK peptide-like C3 H7 N O2 89.093 y ALANINE L-peptide linking C6 H15 N4 O2 1 175.209 y ARGININE L-peptide linking C4 H8 N2 O3 132.118 y ASPARAGINE L-peptide linking C4 H7 N O4 133.103 y ASPARTIC ACID L-peptide linking C3 H7 N O2 S 121.158 y CYSTEINE L-peptide linking C5 H10 N2 O3 146.144 y GLUTAMINE L-peptide linking C5 H9 N O4 147.129 y GLUTAMIC ACID L-peptide linking C2 H5 N O2 75.067 y GLYCINE peptide linking Hg 2 200.590 MERCURY (II) ION non-polymer C6 H10 N3 O2 1 156.162 y HISTIDINE L-peptide linking H2 O 18.015 WATER non-polymer C6 H13 N O2 131.173 y ISOLEUCINE L-peptide linking C3 H5 N2 1 69.085 IMIDAZOLE non-polymer C6 H13 N O2 131.173 y LEUCINE L-peptide linking C6 H15 N2 O2 1 147.195 y LYSINE 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n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n sample 1280 Staphylococcus aureus 511693 Escherichia coli BL21 plasmid pET30a human Homo sample 9606 Homo sapiens blood human Homo sample 9606 Homo sapiens blood 1 3.55 65.40 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP 7.5 100mM imidazole, 200mM sodium formate, 12%(w/v) PEG 4000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K 291 repository Initial release Version format compliance Atomic model Database references Derived calculations Non-polymer description Structure summary Version format compliance Other 1 0 2003-10-07 1 1 2008-01-08 1 2 2011-07-13 1 3 2012-12-12 Staphylocoagulase-Prethrombin-2 complex RCSB Y PDBJ 2003-01-31 REL 0ZJ N-(sulfanylacetyl)-D-phenylalanyl-N-[(2S,3S)-6-{[amino(iminio)methyl]amino}-1-chloro-2-hydroxyhexan-3-yl]-L-prolinamide HG MERCURY (II) ION IMD IMIDAZOLE HOH water THE INHIBITOR IS BOUND TO THE ACTIVE SITE OF THE ENZYME. THE UNBOUND FORM OF THE INHIBITOR IS MCR-D-PHE-PRO-ARG-CHLOROMETHYLKETONE. UPON REACTION WITH PROTEIN IT FORMS TWO COVALENT BONDS: 1) A COVALENT BOND TO SER 195 FORMING A HEMIKETAL AR7 AND 2) A COVALENT BOND TO NE2 OF HIS 57 Inhibitor N(alpha)-((acetylthio)acetyl)-phenylalanyl-prolyl-arginine chloromethyl ketone Peptide-like P43 300 4 0ZJ 0ZJ 299 B HG1 1003 5 HG HG 1003 D HG1 1004 5 HG HG 1004 D IMD 2001 6 IMD IMD 2001 D IMD 2003 6 IMD IMD 2003 D IMD 2005 6 IMD IMD 2005 D P43 300 4 0ZJ 0ZJ 299 F HG1 1001 5 HG HG 1001 H HG1 1002 5 HG HG 1002 H IMD 2000 6 IMD IMD 2000 H IMD 2002 6 IMD IMD 2002 H IMD 2004 6 IMD IMD 2004 H WAT 419 7 HOH HOH 419 A WAT 473 7 HOH HOH 473 A WAT 494 7 HOH HOH 494 A WAT 609 7 HOH HOH 609 A WAT 627 7 HOH HOH 627 A WAT 790 7 HOH HOH 790 A WAT 796 7 HOH HOH 796 A WAT 804 7 HOH HOH 804 A WAT 834 7 HOH HOH 834 A WAT 226 7 HOH HOH 248 B WAT 227 7 HOH HOH 249 B WAT 229 7 HOH HOH 250 B WAT 238 7 HOH HOH 251 B WAT 243 7 HOH HOH 252 B WAT 252 7 HOH HOH 253 B WAT 254 7 HOH HOH 254 B WAT 258 7 HOH HOH 255 B WAT 262 7 HOH HOH 256 B WAT 263 7 HOH 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475 7 HOH HOH 300 B WAT 481 7 HOH HOH 301 B WAT 490 7 HOH HOH 302 B WAT 492 7 HOH HOH 303 B WAT 493 7 HOH HOH 304 B WAT 496 7 HOH HOH 305 B WAT 499 7 HOH HOH 306 B WAT 500 7 HOH HOH 307 B WAT 505 7 HOH HOH 308 B WAT 508 7 HOH HOH 309 B WAT 513 7 HOH HOH 310 B WAT 514 7 HOH HOH 311 B WAT 515 7 HOH HOH 312 B WAT 516 7 HOH HOH 313 B WAT 519 7 HOH HOH 314 B WAT 520 7 HOH HOH 315 B WAT 523 7 HOH HOH 316 B WAT 526 7 HOH HOH 317 B WAT 528 7 HOH HOH 318 B WAT 530 7 HOH HOH 319 B WAT 531 7 HOH HOH 320 B WAT 532 7 HOH HOH 321 B WAT 534 7 HOH HOH 322 B WAT 535 7 HOH HOH 323 B WAT 536 7 HOH HOH 324 B WAT 542 7 HOH HOH 325 B WAT 552 7 HOH HOH 326 B WAT 554 7 HOH HOH 327 B WAT 556 7 HOH HOH 328 B WAT 557 7 HOH HOH 329 B WAT 558 7 HOH HOH 330 B WAT 563 7 HOH HOH 331 B WAT 567 7 HOH HOH 332 B WAT 594 7 HOH HOH 333 B WAT 600 7 HOH HOH 334 B WAT 601 7 HOH HOH 335 B WAT 602 7 HOH HOH 336 B WAT 604 7 HOH HOH 337 B WAT 608 7 HOH HOH 338 B WAT 610 7 HOH HOH 339 B WAT 611 7 HOH HOH 340 B WAT 613 7 HOH HOH 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247 1 21 6 D HIS 250 C HIS 251 HELX_P D ALA 268 C ALA 269 1 22 19 D ASP 270 C ASP 271 HELX_P D THR 276 C THR 277 5 23 7 E PHE 7 D PHE 11 HELX_P E SER 11 D SER 15 5 24 5 E THR 14 D THR 20 HELX_P E SER 14 D SER 27 1 25 8 B I F ALA 55 E ALA 41 HELX_P F CYS 58 E CYS 44 5 26 4 F PRO 60 E PRO 48 HELX_P F ASP 60 E ASP 51 5 27 4 B E F THR 60 E THR 55 HELX_P F ASN 62 E ASN 57 5 28 3 I F ASP 125 E ASP 122 HELX_P F LEU 130 E LEU 130 1 29 9 F THR 149 E THR 149 HELX_P F GLY 149 E GLY 153 5 30 5 D F GLU 164 E GLU 169 HELX_P F SER 171 E SER 176 1 31 8 F LYS 185 E LYS 191 HELX_P F GLY 186 E GLY 195 5 32 5 C F LEU 234 E LEU 246 HELX_P F GLY 246 E GLY 258 1 33 13 H ASN 15 F ASN 16 HELX_P H GLY 19 F GLY 20 5 34 5 H SER 23 F SER 24 HELX_P H GLU 46 F GLU 47 1 35 24 H THR 47 F THR 48 HELX_P H GLY 51 F GLY 52 5 36 5 H GLU 52 F GLU 53 HELX_P H GLU 54 F GLU 55 5 37 3 H TYR 55 F TYR 56 HELX_P H ASN 95 F ASN 96 1 38 41 H THR 114 F THR 115 HELX_P H HIS 143 F HIS 144 1 39 30 H HIS 144 F HIS 145 HELX_P H LYS 147 F 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1_555 D TRP 25 C TRP 26 3 1_555 H TYR 84 F TYR 85 3 1_555 H LYS 103 F LYS 104 3 1_555 D TYR 84 C TYR 85 2 1_555 D LYS 103 C LYS 104 2 1_555 D GLU 219 C GLU 220 5 1_555 D LYS 233 C LYS 234 5 1_555 D PRO 234 C PRO 235 5 1_555 D ASP 235 C ASP 236 5 1_555 D HOH 2175 U HOH 5 1_555 H GLU 219 F GLU 220 3 1_555 H LYS 233 F LYS 234 3 1_555 H PRO 234 F PRO 235 3 1_555 5 C 1 2 1