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GEDEEP 2056 0890-9369 17 2552 2563 10.1101/gad.1125603 14561776 Regulation of the transcriptional activator NtrC1: structural studies of the regulatory and AAA+ ATPase domains 2003 10.2210/pdb1ny6/pdb pdb_00001ny6 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 0.00000 0.00000 100 1 CCD 2002-01-17 ADSC QUANTUM 315 Si(111) SINGLE WAVELENGTH M x-ray 1 1.0 1.0 8.3.1 ALS 1.0 SYNCHROTRON ALS BEAMLINE 8.3.1 30618.445 transcriptional regulator (NtrC family) residues 122-387 14 man polymer 427.201 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE 14 syn non-polymer no no MRKENELLRREKDLKEEEYVFESPKMKEILEKIKKISCAECPVLITGESGVGKEVVARLIHKLSDRSKEPFVALNVASIP RDIFEAELFGYEKGAFTGAVSSKEGFFELADGGTLFLDEIGELSLEAQAKLLRVIESGKFYRLGGRKEIEVNVRILAATN RNIKELVKEGKFREDLYYRLGVIEIEIPPLRERKEDIIPLANHFLKKFSRKYAKEVEGFTKSAQELLLSYPWYGNVRELK NVIERAVLFSEGKFIDRGELSCLVNSK MRKENELLRREKDLKEEEYVFESPKMKEILEKIKKISCAECPVLITGESGVGKEVVARLIHKLSDRSKEPFVALNVASIP RDIFEAELFGYEKGAFTGAVSSKEGFFELADGGTLFLDEIGELSLEAQAKLLRVIESGKFYRLGGRKEIEVNVRILAATN RNIKELVKEGKFREDLYYRLGVIEIEIPPLRERKEDIIPLANHFLKKFSRKYAKEVEGFTKSAQELLLSYPWYGNVRELK NVIERAVLFSEGKFIDRGELSCLVNSK A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N polypeptide(L) n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n Aquifex Escherichia sample NtrC1 63363 Aquifex aeolicus 562 Escherichia coli PLASMID pET21 1 2.92 57.54 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP 6.5 diammonium tartrate, PEG 3350, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K 298.0 chem_comp_atom chem_comp_bond database_2 struct_ref_seq_dif struct_site repository Initial release Version format compliance Version format compliance Data collection Database references Derived calculations 1 0 2003-11-11 1 1 2008-04-29 1 2 2011-07-13 1 3 2024-02-14 _database_2.pdbx_DOI _database_2.pdbx_database_accession _struct_ref_seq_dif.details _struct_site.pdbx_auth_asym_id _struct_site.pdbx_auth_comp_id _struct_site.pdbx_auth_seq_id The same protein with both regulatory and central ATPase domains in the inactive state. 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-71.45 1 A GLU 205 -38.32 -30.65 1 A TYR 211 -121.52 -163.08 1 A LYS 213 -36.43 126.46 1 A SER 221 140.81 133.17 1 A ALA 230 -88.50 39.49 1 A ILE 240 -33.29 -39.22 1 A THR 279 176.47 162.49 1 A ARG 311 -48.16 -10.33 1 A ARG 313 -154.33 45.17 1 A GLU 335 -68.60 46.46 1 A TRP 352 49.18 71.80 1 A ASN 355 69.54 -139.90 1 A VAL 362 -39.70 -30.69 1 A ARG 377 -27.54 -38.74 1 A LEU 383 -113.42 -90.22 1 B SER 143 175.98 168.55 1 B ILE 156 -99.70 -64.97 1 B SER 157 -11.40 -49.41 1 B CYS 158 -71.29 37.56 1 B ALA 159 -128.95 -167.28 1 B GLU 168 -58.50 172.59 1 B LYS 173 -39.45 -39.52 1 B LEU 179 -62.06 -70.21 1 B ILE 180 -29.05 -37.37 1 B LYS 182 -38.25 -36.54 1 B ASP 185 -59.68 -6.51 1 B VAL 196 -33.30 -39.10 1 B PRO 200 -33.68 123.79 1 B ILE 203 -73.22 28.49 1 B PHE 204 -95.79 -78.86 1 B GLU 205 -31.52 -37.27 1 B ALA 206 -48.44 -83.30 1 B GLU 207 -44.61 -81.81 1 B LEU 208 -29.93 -39.34 1 B GLU 212 -94.99 -158.86 1 B THR 217 -4.15 -89.44 1 B SER 222 -41.12 156.84 1 B PHE 226 -39.11 -36.32 1 B PHE 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-42.75 1 C ASN 282 -93.68 41.13 1 C ILE 283 24.30 -75.44 1 C GLU 289 -54.01 -5.97 1 C TYR 298 -59.56 7.17 1 C PRO 308 -52.83 171.77 1 C ARG 311 -50.10 1.59 1 C ILE 317 -32.13 -78.07 1 C ASN 322 -51.89 -74.36 1 C HIS 323 -29.27 -45.84 1 C ARG 330 -68.59 -71.10 1 C LYS 331 -36.35 -39.57 1 C ALA 333 59.01 83.58 1 C TYR 350 -33.77 140.20 1 C TRP 352 57.07 80.68 1 C ASN 355 45.63 -168.93 1 C LYS 360 -39.25 -38.93 1 C ARG 377 -32.76 -31.37 1 C CYS 382 -63.72 5.46 1 C LEU 383 -138.58 -67.49 1 D TYR 139 -25.86 124.38 1 D PHE 141 -170.71 66.67 1 D PRO 144 -53.37 -95.47 1 D ILE 156 -52.03 -71.86 1 D SER 157 -9.54 -60.14 1 D CYS 158 -50.14 -2.12 1 D ASP 185 -78.80 21.49 1 D ARG 186 -150.40 32.05 1 D VAL 192 -67.25 76.82 1 D ILE 199 -167.68 110.47 1 D PRO 200 -39.34 109.04 1 D ASP 202 -79.97 22.43 1 D LYS 213 -41.64 168.72 1 D SER 221 -108.73 -154.80 1 D ASP 231 -33.57 145.62 1 D ALA 249 -57.29 -81.83 1 D LYS 250 -36.10 -39.17 1 D ARG 253 -45.67 -18.16 1 D GLU 256 -84.30 -70.75 1 D LEU 263 -30.88 125.62 1 D ASN 272 -108.82 68.88 1 D ILE 275 -37.36 140.44 1 D ARG 293 -45.19 152.38 1 D VAL 302 -21.85 -86.46 1 D LYS 314 -35.18 -35.04 1 D ILE 317 -36.44 -94.71 1 D LYS 327 -53.87 -85.98 1 D GLU 335 -79.06 44.66 1 D LEU 347 -44.31 -73.84 1 D LEU 348 -49.07 -7.72 1 D ASN 355 29.28 -140.19 1 D ARG 357 -89.84 31.67 1 D GLU 358 -135.59 -32.77 1 D VAL 362 -46.38 3.58 1 D PHE 369 -57.40 -1.03 1 D GLU 371 -106.22 -76.73 1 D PHE 374 -116.89 -168.94 1 D ARG 377 -23.50 -59.36 1 E GLU 138 -22.79 125.48 1 E GLU 142 -65.74 99.61 1 E SER 143 -179.87 148.77 1 E LEU 150 -37.37 -28.85 1 E SER 157 -55.28 27.74 1 E GLU 168 -52.28 -179.39 1 E LYS 173 -29.67 -34.75 1 E ILE 180 -56.64 -6.87 1 E HIS 181 -95.76 -61.14 1 E LYS 182 -46.08 -14.99 1 E ASN 195 -68.71 91.70 1 E VAL 196 -54.93 24.89 1 E ALA 197 -143.22 -2.78 1 E ARG 201 -35.17 -36.26 1 E PHE 204 -54.14 -75.88 1 E GLU 205 -38.35 -32.49 1 E ALA 206 -54.81 -78.89 1 E LEU 208 -70.30 -75.67 1 E GLU 212 -89.06 -86.03 1 E PHE 227 -39.49 -75.76 1 E LEU 237 -66.32 87.86 1 E GLU 239 61.33 76.01 1 E ILE 240 -64.84 3.97 1 E LEU 245 -38.52 -19.72 1 E ALA 278 -102.24 74.57 1 E ASN 280 -154.60 25.39 1 E VAL 302 -39.52 -23.35 1 E ILE 303 -151.76 45.06 1 E GLU 304 -45.21 152.67 1 E PRO 309 -54.60 -177.17 1 E ARG 313 -159.46 28.97 1 E LYS 314 -36.60 -17.14 1 E ILE 317 -25.13 -62.39 1 E ALA 321 -35.39 -24.97 1 E LEU 325 -32.49 -33.93 1 E LYS 326 -64.31 -75.75 1 E LYS 327 -35.02 -73.47 1 E LEU 347 -47.48 -3.58 1 E TYR 350 -36.77 121.84 1 E TRP 352 14.77 89.66 1 E ASN 355 43.44 -140.42 1 E GLU 371 -118.96 -74.79 1 E ARG 377 -35.06 -39.05 1 E CYS 382 -63.95 19.01 1 E LEU 383 -144.84 11.55 1 F GLU 138 -73.17 -153.78 1 F SER 157 -23.01 -39.57 1 F GLU 168 -41.81 170.50 1 F SER 169 -69.29 67.69 1 F VAL 171 -51.55 5.98 1 F ARG 186 -142.09 23.74 1 F VAL 196 -39.73 -19.35 1 F PHE 204 -43.77 -72.25 1 F TYR 211 -153.58 -157.25 1 F GLU 212 -148.91 -139.44 1 F ALA 215 142.03 171.02 1 F SER 221 163.90 173.85 1 F GLU 224 27.76 10.36 1 F PHE 226 -15.81 -53.61 1 F GLU 239 71.83 68.63 1 F ASN 272 -116.07 74.39 1 F LYS 284 -35.30 -38.34 1 F GLU 294 -55.54 -76.91 1 F ASP 295 -46.02 -17.24 1 F PRO 308 -52.20 172.17 1 F ARG 311 -58.23 26.51 1 F GLU 312 -148.04 -7.35 1 F LYS 314 -10.40 -53.07 1 F GLU 315 -37.18 -27.12 1 F LYS 327 -41.14 -89.01 1 F PHE 328 -37.76 -28.55 1 F ALA 333 61.28 73.97 1 F GLU 335 -101.88 42.34 1 F GLN 344 -29.18 -24.13 1 F SER 349 -107.38 48.33 1 F TRP 352 48.95 74.06 1 F ASN 355 -33.16 132.18 1 F VAL 356 56.59 -45.88 1 F LEU 359 -60.29 -82.87 1 F LYS 360 -32.30 -32.23 1 F VAL 367 -38.04 -17.65 1 F ARG 377 -21.81 -38.90 1 F LEU 383 -89.65 -96.80 1 G GLU 138 -134.92 -159.87 1 G GLU 142 -150.09 -18.91 1 G GLU 148 -77.27 -79.46 1 G ILE 149 -31.40 -31.67 1 G ILE 156 -43.03 -17.13 1 G SER 157 -32.41 -75.73 1 G CYS 158 -61.38 30.01 1 G GLU 160 -147.45 -4.01 1 G LYS 173 -50.28 -79.70 1 G GLU 174 -46.07 -8.39 1 G ARG 178 -39.85 -36.55 1 G ARG 186 -98.14 42.43 1 G ARG 201 -37.42 -21.95 1 G GLU 205 -78.77 27.01 1 G PHE 209 -76.69 -82.95 1 G LYS 213 -32.92 160.16 1 G THR 217 -32.29 111.44 1 G GLU 224 -59.23 -161.66 1 G LEU 263 81.26 -150.68 1 G GLU 268 -141.70 11.84 1 G PRO 309 -47.65 160.52 1 G ARG 311 -52.59 -3.31 1 G ARG 313 -107.30 45.20 1 G ARG 330 -91.07 -77.34 1 G ALA 333 60.36 66.07 1 G TRP 352 51.98 85.18 1 G ASN 355 -26.39 135.95 1 G VAL 356 60.45 -35.02 1 G ARG 365 -67.90 -70.79 1 G ALA 366 -36.83 -24.21 1 G PHE 369 -99.22 50.33 1 G ARG 377 -39.43 -24.18 1 G CYS 382 -59.28 0.53 1 G LEU 383 -121.52 -54.27 1 H PHE 141 -168.79 114.53 1 H GLU 142 -150.49 -153.68 1 H SER 143 135.42 163.40 1 H PRO 144 56.58 -138.78 1 H CYS 158 -72.12 21.15 1 H ALA 159 -108.74 -161.88 1 H GLU 160 -150.40 -19.68 1 H SER 187 -58.29 -6.62 1 H VAL 196 -46.50 -19.84 1 H GLU 205 -36.84 -31.67 1 H ALA 215 -58.04 -7.35 1 H PHE 216 -155.74 52.72 1 H THR 217 47.11 -40.83 1 H ALA 219 -65.91 61.68 1 H LEU 245 -49.88 -9.25 1 H GLN 248 -27.50 -86.89 1 H ALA 249 -25.04 -51.12 1 H PHE 260 177.24 167.90 1 H LEU 263 -48.12 109.58 1 H ALA 278 -175.00 132.30 1 H GLU 289 -63.95 16.90 1 H PRO 309 -41.67 167.59 1 H ALA 333 78.48 47.77 1 H LYS 334 -18.12 165.28 1 H GLU 335 177.50 -40.93 1 H VAL 356 8.21 -71.78 1 H LYS 373 -35.33 112.26 1 H PHE 374 83.11 137.39 1 H ASP 376 -125.20 -168.55 1 H SER 381 -41.18 102.16 1 I ILE 153 -35.24 -39.10 1 I ILE 156 -59.17 -90.53 1 I SER 157 7.50 -51.56 1 I CYS 158 -64.95 2.62 1 I ALA 159 -121.00 -166.40 1 I GLU 168 -47.84 165.92 1 I SER 184 -68.51 -179.38 1 I ALA 197 -66.12 9.41 1 I PHE 204 -37.80 -75.27 1 I LYS 213 20.94 -83.00 1 I THR 217 -68.23 66.91 1 I ALA 219 64.18 146.76 1 I VAL 220 71.27 -174.63 1 I SER 221 -8.83 122.49 1 I SER 222 -48.16 173.48 1 I ALA 230 -65.34 15.71 1 I GLU 239 77.30 63.34 1 I GLU 242 -37.57 -20.96 1 I LEU 252 -30.97 -33.81 1 I LEU 263 -49.41 109.97 1 I ARG 311 -35.13 -28.41 1 I ARG 313 -114.19 50.20 1 I GLU 315 -63.89 6.32 1 I PRO 319 -50.45 -71.74 1 I LEU 320 -27.94 -48.61 1 I HIS 323 -28.87 -49.60 1 I ARG 330 -64.81 -70.86 1 I ALA 333 31.36 79.85 1 I GLU 337 -140.92 28.83 1 I GLN 344 -39.35 -31.35 1 I LEU 348 -60.67 2.64 1 I TYR 350 -34.49 146.83 1 I TRP 352 49.12 70.64 1 I ASN 355 50.92 -170.47 1 I VAL 356 -25.23 -35.72 1 I LEU 359 -52.55 -76.83 1 I GLU 364 -59.53 -9.87 1 I VAL 367 -70.93 36.65 1 I LEU 368 -146.30 -36.39 1 I GLU 371 -102.43 -68.11 1 I ARG 377 -18.22 -51.65 1 I GLU 379 -52.26 -71.10 1 I CYS 382 -93.03 36.63 1 I LEU 383 -128.24 -52.46 1 J ALA 159 -143.15 -158.50 1 J GLU 160 -153.53 -14.38 1 J LYS 182 -58.08 0.94 1 J SER 184 -58.42 178.54 1 J ALA 215 -82.06 -93.12 1 J THR 217 -33.57 138.37 1 J SER 221 69.18 142.30 1 J GLU 224 -57.28 -154.06 1 J GLU 239 53.25 82.20 1 J ALA 278 -178.88 104.68 1 J PRO 309 -49.79 159.53 1 J ARG 311 -55.45 3.83 1 J ARG 313 -142.42 20.87 1 J LYS 314 -25.64 -48.74 1 J ILE 317 -25.46 -55.12 1 J ASN 322 -48.75 -71.87 1 J HIS 323 -27.57 -58.77 1 J LEU 325 -49.72 -70.04 1 J GLN 344 -31.79 -72.96 1 J GLU 345 -37.82 -37.30 1 J SER 349 -91.58 -63.54 1 J TYR 350 -30.71 130.75 1 J TYR 353 -54.73 -7.74 1 J ASN 355 53.29 -172.06 1 J VAL 356 -24.97 -50.04 1 J GLU 371 -109.82 -74.58 1 J ARG 377 -30.50 -36.77 1 J LEU 383 -96.49 -81.90 1 K TYR 139 -88.88 -144.65 1 K VAL 140 173.14 121.41 1 K PHE 141 -171.87 64.33 1 K LYS 145 64.91 -10.89 1 K LEU 150 -39.22 -34.95 1 K CYS 158 -66.72 6.62 1 K GLU 189 -75.24 -154.10 1 K VAL 196 -27.02 -36.01 1 K ILE 199 178.01 104.86 1 K PRO 200 -28.93 125.01 1 K LEU 208 -104.81 -62.49 1 K LYS 213 -38.44 132.25 1 K THR 217 -44.33 91.62 1 K VAL 220 -125.74 -70.63 1 K SER 221 -58.94 178.31 1 K LEU 237 -66.26 85.47 1 K GLU 239 79.52 56.64 1 K GLN 248 -50.79 -77.49 1 K ALA 249 -38.22 -19.69 1 K GLU 256 -66.35 -70.55 1 K PHE 260 177.03 178.49 1 K ALA 278 176.01 105.83 1 K GLU 294 -59.61 -74.61 1 K ARG 299 -45.79 -15.37 1 K ILE 303 -152.72 36.54 1 K PRO 309 -43.87 172.27 1 K ARG 313 -145.56 29.95 1 K LYS 314 -38.66 -26.66 1 K PRO 319 -56.37 -72.35 1 K LYS 326 -54.53 -77.16 1 K LEU 346 -38.48 -39.52 1 K SER 349 -77.14 -76.39 1 K TYR 350 -25.68 124.33 1 K ASN 355 55.66 -175.71 1 K VAL 356 -12.74 -63.35 1 K ASP 376 -111.91 -162.39 1 K CYS 382 -56.98 -0.88 1 K LEU 383 -118.64 -72.13 1 L TYR 139 115.37 165.09 1 L GLU 142 -147.01 -17.34 1 L LYS 152 -99.69 -61.23 1 L ILE 153 -38.19 -27.80 1 L SER 157 -24.83 -36.37 1 L CYS 158 -58.89 -9.32 1 L SER 169 -69.77 48.81 1 L VAL 171 -62.68 14.66 1 L ASP 185 -38.31 -16.81 1 L GLU 189 -55.18 170.82 1 L VAL 196 -32.90 -22.70 1 L PHE 204 -42.61 -74.28 1 L ALA 215 -165.17 -113.79 1 L ALA 219 -60.09 49.48 1 L PHE 226 -28.12 -54.45 1 L PHE 227 -39.31 -34.60 1 L GLU 239 -154.85 65.85 1 L ILE 240 -39.79 15.80 1 L LEU 245 -48.73 -15.25 1 L ARG 262 -56.06 -171.91 1 L LYS 267 173.04 128.18 1 L ASN 272 -119.22 76.18 1 L ASN 280 -75.51 -72.34 1 L ARG 281 -35.54 138.72 1 L LYS 284 -37.46 -30.67 1 L VAL 287 -53.11 -81.69 1 L GLU 289 -68.51 4.27 1 L LYS 291 -169.16 11.62 1 L GLU 294 -70.79 -79.43 1 L ASP 295 -34.16 -36.49 1 L ARG 311 -27.14 -36.76 1 L ALA 321 -28.73 -48.75 1 L LYS 327 -49.81 -71.40 1 L THR 340 -62.52 -168.15 1 L ALA 343 -100.66 -80.04 1 L GLN 344 -19.83 -44.99 1 L LEU 347 -56.62 -100.03 1 L LEU 348 -14.82 -21.48 1 L TRP 352 55.33 82.95 1 L ASN 355 50.37 -168.77 1 L VAL 356 -28.48 -39.61 1 L LEU 359 -53.39 -76.17 1 L LYS 373 -148.32 -14.48 1 L ARG 377 -26.74 -20.73 1 L LEU 380 -51.49 -4.64 1 L SER 381 -27.95 -47.78 1 M TYR 139 -70.86 -165.00 1 M GLU 142 -1.03 73.94 1 M SER 143 -179.23 -179.34 1 M PRO 144 -38.56 -110.63 1 M LYS 155 -57.39 -71.18 1 M SER 157 -14.78 -62.38 1 M CYS 158 -61.13 21.48 1 M ALA 159 -121.88 -164.71 1 M GLU 160 -158.11 16.48 1 M LYS 173 -64.84 -74.07 1 M VAL 196 -39.40 -23.94 1 M THR 217 -57.61 79.10 1 M ALA 219 -151.85 76.86 1 M ASP 231 -33.91 123.98 1 M GLU 239 79.33 75.39 1 M ALA 247 -64.90 -81.72 1 M ALA 249 -45.90 -82.15 1 M ARG 253 -41.87 -73.94 1 M SER 257 57.94 -74.90 1 M ARG 266 48.99 -152.55 1 M LYS 267 -45.45 169.99 1 M ARG 281 -55.05 178.78 1 M ILE 283 -37.78 -87.12 1 M GLU 289 -60.25 5.43 1 M PRO 309 -63.96 -178.28 1 M ARG 311 -37.72 -36.35 1 M ARG 313 -73.57 32.96 1 M LYS 314 -36.03 -31.02 1 M LYS 327 -61.89 -75.92 1 M ARG 330 -152.20 -39.12 1 M ALA 333 51.46 5.37 1 M LYS 334 -77.07 -157.87 1 M LYS 341 -68.80 3.78 1 M TRP 352 71.38 70.43 1 M ASN 355 32.93 -151.63 1 M GLU 358 -60.55 -72.46 1 M LEU 359 -34.12 -83.41 1 M ILE 363 -39.64 -26.42 1 M ALA 366 -63.54 -77.31 1 M VAL 367 -46.13 -19.82 1 M SER 370 -33.66 155.47 1 M GLU 371 -121.06 -89.94 1 M ARG 377 -63.93 0.88 1 M LEU 380 -64.47 0.24 1 M SER 381 -96.61 -70.80 1 M LEU 383 -69.16 -77.57 1 N PRO 144 -10.96 -109.34 1 N SER 157 -28.16 -41.78 1 N CYS 158 -76.62 46.24 1 N GLU 160 -150.39 10.91 1 N GLU 189 -59.54 176.24 1 N PRO 200 -39.00 113.12 1 N ARG 201 -39.19 -18.49 1 N PHE 204 -65.63 53.06 1 N GLU 205 -151.14 -38.58 1 N ALA 219 -22.07 110.69 1 N VAL 220 -72.95 -74.38 1 N SER 221 -90.76 -155.56 1 N LEU 229 -27.62 -31.19 1 N GLU 239 73.93 35.90 1 N ILE 240 -16.49 -39.06 1 N GLU 242 -75.51 23.31 1 N LEU 252 -68.71 -70.75 1 N ARG 253 -34.16 -35.66 1 N ILE 255 -56.94 1.13 1 N GLU 256 -117.47 -73.31 1 N PHE 260 177.85 169.26 1 N GLU 268 -53.44 79.27 1 N ALA 278 170.73 131.30 1 N GLU 289 -65.50 8.13 1 N ARG 293 -37.57 143.80 1 N ILE 303 -142.24 49.36 1 N PRO 309 -68.33 -170.69 1 N GLU 312 -159.59 -12.59 1 N LYS 314 -43.70 -5.22 1 N ILE 317 -45.12 -93.03 1 N ILE 318 -32.93 -33.90 1 N PHE 328 -67.97 11.76 1 N ALA 333 38.27 72.68 1 N GLU 335 -87.47 30.04 1 N GLU 337 -109.81 -61.20 1 N TYR 350 -34.95 119.28 1 N TRP 352 64.66 90.24 1 N ASN 355 52.16 -173.52 1 N VAL 356 -29.46 -46.02 1 N ARG 365 -52.11 -71.68 1 N GLU 371 -159.90 -6.68 1 N LYS 373 -21.83 -44.31 PROTEIN_REP.PARAM PROTEIN.TOP ADP_XPLOR2.PAR ADP_XPLOR2.TOP 103.2 5.64 -26.61 -8.84 -0.09 -16.43 -5.56 0.329 0.004 0.266 0.272 0.266 3.10 19.98 7844 78375 10.0 97.6 RANDOM 1 RESTRAINED THROUGHOUT 0.0 MOLECULAR REPLACEMENT Engh & Huber FLAT MODEL 10 0.221601 0.69 0.56 5.00 0.94 0.88 3.10 19.98 0 28041 378 0 27663 0.010 1.6 22.6 1.11 0.473 0.013 0.462 3.29 1286 11738 6 9.9 97.1 103 3.1 62.02 1NY6 86929 2 2 0.061 1 7.8 2 98.0 3.1 3.27 97.1 refinement CNS 1.1 data reduction MOSFLM data scaling CCP4 (SCALA) phasing MOLREP Crystal structure of sigm54 activator (AAA+ ATPase) in the active state 1 N N 1 N N 1 N N 1 N N 1 N N 1 N N 1 N N 1 N N 1 N N 1 N N 1 N N 1 N N 1 N N 1 N N 2 N N 2 N N 2 N N 2 N N 2 N N 2 N N 2 N N 2 N N 2 N N 2 N N 2 N N 2 N N 2 N N 2 N N The biological assembly is a heptamer that forms a ring-like structure in the assymetric unit (there are 14 molecules in the assymetric unit) A SER 143 A SER 23 HELX_P A CYS 158 A CYS 38 1 1 16 A GLY 172 A GLY 52 HELX_P A LEU 183 A LEU 63 1 2 12 A PRO 200 A PRO 80 HELX_P A GLY 210 A GLY 90 1 3 11 A GLY 225 A GLY 105 HELX_P A ALA 230 A ALA 110 1 4 6 A GLU 239 A GLU 119 HELX_P A LEU 243 A LEU 123 5 5 5 A SER 244 A SER 124 HELX_P A SER 257 A SER 137 1 6 14 A ASN 282 A ASN 162 HELX_P A GLY 290 A GLY 170 1 7 9 A ARG 293 A ARG 173 HELX_P A GLY 301 A GLY 181 1 8 9 A PRO 309 A PRO 189 HELX_P A GLU 312 A GLU 192 5 9 4 A ARG 313 A ARG 193 HELX_P A TYR 332 A TYR 212 1 10 20 A THR 340 A THR 220 HELX_P A TYR 350 A TYR 230 1 11 11 A ASN 355 A ASN 235 HELX_P A SER 370 A SER 250 1 12 16 A ASP 376 A ASP 256 HELX_P A CYS 382 A CYS 262 1 13 7 B LYS 145 B LYS 25 HELX_P B SER 157 B SER 37 1 14 13 B GLY 172 B GLY 52 HELX_P B SER 184 B SER 64 1 15 13 B ALA 197 B ALA 77 HELX_P B ILE 199 B ILE 79 5 16 3 B ASP 202 B ASP 82 HELX_P B GLY 210 B GLY 90 1 17 9 B GLY 225 B GLY 105 HELX_P B ALA 230 B ALA 110 1 18 6 B GLU 239 B GLU 119 HELX_P B LEU 243 B LEU 123 5 19 5 B SER 244 B SER 124 HELX_P B GLY 258 B GLY 138 1 20 15 B ASN 282 B ASN 162 HELX_P B GLU 289 B GLU 169 1 21 8 B ARG 293 B ARG 173 HELX_P B GLY 301 B GLY 181 1 22 9 B VAL 302 B VAL 182 HELX_P B GLU 304 B GLU 184 5 23 3 B ARG 313 B ARG 193 HELX_P B TYR 332 B TYR 212 1 24 20 B THR 340 B THR 220 HELX_P B TYR 350 B TYR 230 1 25 11 B GLY 354 B GLY 234 HELX_P B PHE 369 B PHE 249 1 26 16 B ASP 376 B ASP 256 HELX_P B SER 381 B SER 261 1 27 6 C SER 143 C SER 23 HELX_P C ILE 156 C ILE 36 1 28 14 C SER 157 C SER 37 HELX_P C ALA 159 C ALA 39 5 29 3 C GLY 172 C GLY 52 HELX_P C LEU 183 C LEU 63 1 30 12 C ASN 195 C ASN 75 HELX_P C ILE 199 C ILE 79 5 31 5 C ILE 203 C ILE 83 HELX_P C GLY 210 C GLY 90 1 32 8 C GLY 225 C GLY 105 HELX_P C ALA 230 C ALA 110 1 33 6 C ILE 240 C ILE 120 HELX_P C LEU 243 C LEU 123 5 34 4 C SER 244 C SER 124 HELX_P C SER 257 C SER 137 1 35 14 C ILE 283 C ILE 163 HELX_P C GLU 289 C GLU 169 1 36 7 C ARG 293 C ARG 173 HELX_P C GLY 301 C GLY 181 1 37 9 C PRO 309 C PRO 189 HELX_P C GLU 312 C GLU 192 5 38 4 C ARG 313 C ARG 193 HELX_P C TYR 332 C TYR 212 1 39 20 C THR 340 C THR 220 HELX_P C TYR 350 C TYR 230 1 40 11 C GLY 354 C GLY 234 HELX_P C PHE 369 C PHE 249 1 41 16 C ASP 376 C ASP 256 HELX_P C CYS 382 C CYS 262 1 42 7 D SER 143 D SER 23 HELX_P D CYS 158 D CYS 38 1 43 16 D GLY 172 D GLY 52 HELX_P D SER 184 D SER 64 1 44 13 D PRO 200 D PRO 80 HELX_P D GLY 210 D GLY 90 1 45 11 D GLY 225 D GLY 105 HELX_P D ASP 231 D ASP 111 1 46 7 D GLU 239 D GLU 119 HELX_P D LEU 243 D LEU 123 5 47 5 D SER 244 D SER 124 HELX_P D SER 257 D SER 137 1 48 14 D ASN 282 D ASN 162 HELX_P D GLY 290 D GLY 170 1 49 9 D ARG 293 D ARG 173 HELX_P D VAL 302 D VAL 182 1 50 10 D PRO 309 D PRO 189 HELX_P D GLU 312 D GLU 192 5 51 4 D ARG 313 D ARG 193 HELX_P D TYR 332 D TYR 212 1 52 20 D THR 340 D THR 220 HELX_P D LEU 348 D LEU 228 1 53 9 D ASN 355 D ASN 235 HELX_P D LYS 360 D LYS 240 1 54 6 D LYS 360 D LYS 240 HELX_P D PHE 369 D PHE 249 1 55 10 D ASP 376 D ASP 256 HELX_P D CYS 382 D CYS 262 1 56 7 E SER 143 E SER 23 HELX_P E SER 157 E SER 37 1 57 15 E GLY 172 E GLY 52 HELX_P E LEU 183 E LEU 63 1 58 12 E PRO 200 E PRO 80 HELX_P E GLY 210 E GLY 90 1 59 11 E GLY 225 E GLY 105 HELX_P E ALA 230 E ALA 110 1 60 6 E SER 244 E SER 124 HELX_P E GLY 258 E GLY 138 1 61 15 E ASN 282 E ASN 162 HELX_P E GLY 290 E GLY 170 1 62 9 E ARG 293 E ARG 173 HELX_P E GLY 301 E GLY 181 1 63 9 E VAL 302 E VAL 182 HELX_P E GLU 304 E GLU 184 5 64 3 E ARG 313 E ARG 193 HELX_P E TYR 332 E TYR 212 1 65 20 E THR 340 E THR 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