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N 467 N sing N 468 N sing N 469 N sing DK Acta Crystallogr.,Sect.D ABCRE6 0766 0907-4449 59 1154 1164 10.1107/S0907444903008205 12832758 Structures of NAD(+)- and NADH-bound 1-l-myo-inositol 1-phosphate synthase. 2003 10.2210/pdb1p1j/pdb pdb_00001p1j 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 0.00000 0.00000 100 1 CCD 2002-04-09 MARRESEARCH SINGLE WAVELENGTH M x-ray 1 1 1.0 17-ID APS 1 SYNCHROTRON APS BEAMLINE 17-ID 59707.766 Inositol-3-phosphate synthase 5.5.1.4 2 man polymer 94.971 PHOSPHATE ION 2 syn non-polymer 665.441 1,4-DIHYDRONICOTINAMIDE ADENINE DINUCLEOTIDE 2 syn non-polymer 92.094 GLYCEROL 2 syn non-polymer 18.015 water 1068 nat water 1L-myo-inositol 1-phosphate synthase, Myo-inositol-1-phosphate synthase, MI-1-P synthase, IPS no no MTEDNIAPITSVKVVTDKCTYKDNELLTKYSYENAVVTKTASGRFDVTPTVQDYVFKLDLKKPEKLGIMLIGLGGNNGST LVASVLANKHNVEFQTKEGVKQPNYFGSMTQCSTLKLGIDAEGNDVYAPFNSLLPMVSPNDFVVSGWDINNADLYEAMQR 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n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n baker's yeast Saccharomyces Escherichia sample 4932 Saccharomyces cerevisiae 562 Escherichia coli 1 3.08 60.06 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP 4.6 PEG 8000, sodium acetate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K 298 chem_comp_atom chem_comp_bond database_2 struct_site repository Initial release Version format compliance Derived calculations Version format compliance Data collection Database references Derived calculations 1 0 2003-07-08 1 1 2008-04-29 1 2 2011-07-13 1 3 2024-02-14 _database_2.pdbx_DOI _database_2.pdbx_database_accession _struct_site.pdbx_auth_asym_id _struct_site.pdbx_auth_comp_id _struct_site.pdbx_auth_seq_id Crystal structure of apo 1L-myo-inositol 1-phosphate synthase Crystal structure of 1L-myo-inositol 1-phosphate synthase Crystal structure of the NAD+-bound 1L-myo-inositol 1-phosphate synthase Crystal structure of the 1L-myo-inositol 1-phosphate synthase complexed with NADH and EDTA The differences between the authors' sequence and the database reference sequence are known conflicts and have been documented in Swiss Prot entry P11986. 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asymmetric unit by the operations: -x, y, -z A GLY 75 A GLY 75 HELX_P A HIS 90 A HIS 90 1 1 16 A SER 108 A SER 108 HELX_P A SER 113 A SER 113 1 2 6 A ASN 131 A ASN 131 HELX_P A LEU 133 A LEU 133 5 3 3 A SER 138 A SER 138 HELX_P A ASN 140 A ASN 140 5 4 3 A ASP 153 A ASP 153 HELX_P A GLN 162 A GLN 162 1 5 10 A GLU 165 A GLU 165 HELX_P A SER 177 A SER 177 1 6 13 A TYR 187 A TYR 187 HELX_P A ILE 191 A ILE 191 5 7 5 A ALA 192 A ALA 192 HELX_P A ALA 199 A ALA 199 5 8 8 A GLY 215 A GLY 215 HELX_P A ASN 234 A ASN 234 1 9 20 A THR 260 A THR 260 HELX_P A ASN 270 A ASN 270 1 10 11 A ALA 276 A ALA 276 HELX_P A GLU 288 A GLU 288 1 11 13 A VAL 302 A VAL 302 HELX_P A GLY 313 A GLY 313 1 12 12 A GLY 324 A GLY 324 HELX_P A ALA 339 A ALA 339 1 13 16 A ASN 354 A ASN 354 HELX_P A SER 361 A SER 361 1 14 8 A ALA 362 A ALA 362 HELX_P A VAL 376 A VAL 376 1 15 15 A ILE 377 A ILE 377 HELX_P A SER 383 A SER 383 1 16 7 A LYS 406 A LYS 406 HELX_P A GLY 409 A GLY 409 5 17 4 A MET 423 A MET 423 HELX_P A GLY 425 A GLY 425 5 18 3 A ASP 438 A ASP 438 HELX_P A ARG 458 A ARG 458 1 19 21 A LEU 481 A LEU 481 HELX_P A LEU 488 A LEU 488 5 20 8 A GLY 502 A GLY 502 HELX_P A ILE 518 A ILE 518 1 21 17 A ARG 527 A ARG 527 HELX_P A LEU 532 A LEU 532 1 22 6 B GLY 75 B GLY 75 HELX_P B HIS 90 B HIS 90 1 23 16 B SER 108 B SER 108 HELX_P B SER 113 B SER 113 1 24 6 B ASN 131 B ASN 131 HELX_P B LEU 133 B LEU 133 5 25 3 B SER 138 B SER 138 HELX_P B ASN 140 B ASN 140 5 26 3 B ASP 153 B ASP 153 HELX_P B GLN 162 B GLN 162 1 27 10 B GLU 165 B GLU 165 HELX_P B SER 177 B SER 177 1 28 13 B TYR 187 B TYR 187 HELX_P B ILE 191 B ILE 191 5 29 5 B ALA 192 B ALA 192 HELX_P B ALA 199 B ALA 199 5 30 8 B GLY 215 B GLY 215 HELX_P B ALA 235 B ALA 235 1 31 21 B THR 260 B THR 260 HELX_P B ASN 270 B ASN 270 1 32 11 B ALA 276 B ALA 276 HELX_P B GLY 289 B GLY 289 1 33 14 B VAL 302 B VAL 302 HELX_P B GLY 313 B GLY 313 1 34 12 B GLY 324 B GLY 324 HELX_P B ALA 339 B ALA 339 1 35 16 B ASN 354 B ASN 354 HELX_P B SER 361 B SER 361 1 36 8 B ALA 362 B ALA 362 HELX_P B VAL 376 B VAL 376 1 37 15 B ILE 377 B ILE 377 HELX_P B SER 383 B SER 383 1 38 7 B LYS 406 B LYS 406 HELX_P B GLY 409 B GLY 409 5 39 4 B MET 423 B MET 423 HELX_P B GLY 425 B GLY 425 5 40 3 B ASP 438 B ASP 438 HELX_P B THR 457 B THR 457 1 41 20 B LEU 481 B LEU 481 HELX_P B LEU 488 B LEU 488 5 42 8 B GLY 502 B GLY 502 HELX_P B ILE 518 B ILE 518 1 43 17 B ARG 527 B ARG 527 HELX_P B LEU 532 B LEU 532 1 44 6 ISOMERASE 1L-myo-inositol 1-phosphate, NADH, isomerase, Rossmann fold INO1_YEAST UNP 1 1 P11986 MTEDNIAPITSVKRLVTDKCTYKDNELLTKYSYENAVVTKTASGRFDVTPTVQDYVFKLDFEKKPEKLGIMLIGLGGNNG STLVASVLANKHNVEFQTKAKGVKQPNYFGSMTQCSTLKLGIDAEGNDVYAPFNSLLPMVSPKHFVVSGWDINNADLYEA MQRSQVLEYDLQQRLKAKMSLVKPLPSIYYPDFIAANQDERANQCINLDEKGNVTTRGKWTHLQRIRRDIQNFKEENALD KVIVLWTANTERYVEVSPGVNDTMENLLQSIKNDHEEIAPSTIFAAASILEGVPYINGSPQNTFVPGLVQLAEHEGTFIA GDDLKSGQTKLKSVLAQFLVDAGIKPVSIASYNHLGNNDGYNLSAPKQFRSKEISKSSVIDDIIASNDILYNDKLGKKVD 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1_555 A LYS 373 A LYS 373 9 1_555 A ILE 402 A ILE 402 9 1_555 A LYS 412 A LYS 412 9 1_555 A ASP 438 A ASP 438 9 1_555 A NAI 650 D NAI 9 1_555 B ASN 350 B ASN 350 9 1_555 B ASP 356 B ASP 356 9 1_555 B LYS 369 B LYS 369 9 1_555 B LYS 373 B LYS 373 9 1_555 B ILE 402 B ILE 402 9 1_555 B LYS 412 B LYS 412 9 1_555 B ASP 438 B ASP 438 9 1_555 B NAI 660 G NAI 9 1_555 B PO4 1701 F PO4 9 1_555 5 C 1 2 1