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HKL-2000 data scaling SCALEPACK phasing SOLVE Crystal Structure of the SAM-dependent methyltransferase from Pyrococcus horikoshii OT3 1 N N 1 N N 1 N N 2 N N 3 N N 4 N N 2 N N 4 N N 2 N N 4 N N 5 N N 5 N N 5 N N The biological assembly is a hexamer generated from the trimer in the asymmetric unit by the operations: x, 1-y, 1-z. A TYR 2 A TYR 2 HELX_P A THR 6 A THR 6 5 1 5 A LEU 8 A LEU 8 HELX_P A GLU 10 A GLU 10 5 2 3 A TYR 11 A TYR 11 HELX_P A TYR 16 A TYR 16 1 3 6 A TYR 16 A TYR 16 HELX_P A ARG 22 A ARG 22 1 4 7 A ARG 22 A ARG 22 HELX_P A ASP 37 A ASP 37 1 5 16 A GLY 53 A GLY 53 HELX_P A ARG 62 A ARG 62 1 6 10 A HIS 72 A HIS 72 HELX_P A ARG 86 A ARG 86 1 7 15 A ASP 96 A ASP 96 HELX_P A ILE 100 A ILE 100 5 8 5 A SER 114 A SER 114 HELX_P A PHE 119 A PHE 119 5 9 6 A ASP 120 A ASP 120 HELX_P A ALA 134 A ALA 134 1 10 15 A THR 211 A THR 211 HELX_P A GLU 220 A GLU 220 1 11 10 B TYR 2 B TYR 2 HELX_P B THR 6 B THR 6 5 12 5 B LEU 8 B LEU 8 HELX_P B GLU 10 B GLU 10 5 13 3 B TYR 11 B TYR 11 HELX_P B TYR 16 B TYR 16 1 14 6 B TYR 16 B TYR 16 HELX_P B ARG 22 B ARG 22 1 15 7 B ARG 22 B ARG 22 HELX_P B ASP 37 B ASP 37 1 16 16 B GLY 53 B GLY 53 HELX_P B ARG 62 B ARG 62 1 17 10 B HIS 72 B HIS 72 HELX_P B ARG 86 B ARG 86 1 18 15 B ASP 96 B ASP 96 HELX_P B ILE 100 B ILE 100 5 19 5 B SER 114 B SER 114 HELX_P B PHE 119 B PHE 119 5 20 6 B ASP 120 B ASP 120 HELX_P B ALA 134 B ALA 134 1 21 15 B THR 211 B THR 211 HELX_P B LYS 221 B LYS 221 1 22 11 C TYR 2 C TYR 2 HELX_P C THR 6 C THR 6 5 23 5 C LEU 8 C LEU 8 HELX_P C GLU 10 C GLU 10 5 24 3 C TYR 11 C TYR 11 HELX_P C TYR 16 C TYR 16 1 25 6 C TYR 16 C TYR 16 HELX_P C ARG 22 C ARG 22 1 26 7 C ARG 22 C ARG 22 HELX_P C ASP 37 C ASP 37 1 27 16 C GLY 53 C GLY 53 HELX_P C ARG 62 C ARG 62 1 28 10 C HIS 72 C HIS 72 HELX_P C ARG 86 C ARG 86 1 29 15 C ASP 96 C ASP 96 HELX_P C ILE 100 C ILE 100 5 30 5 C SER 114 C SER 114 HELX_P C PHE 119 C PHE 119 5 31 6 C ASP 120 C ASP 120 HELX_P C ALA 134 C ALA 134 1 32 15 C THR 211 C THR 211 HELX_P C GLU 220 C GLU 220 1 33 10 metalc 2.374 A ASP 120 A OD2 ASP 120 1_555 A MG 1007 E MG MG 1_555 metalc 1.995 A MG 1007 E MG MG 1_555 A HOH 1062 K O HOH 1_555 metalc 2.099 A MG 1007 E MG MG 1_555 A HOH 1181 K O HOH 1_555 TRANSFERASE SAM-dependent methyltransferase, structural genomics, RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative, RSGI, Transferase C GLY 155 C GLY 155 1 C PRO 156 C PRO 156 0.00 BAA30409 GB 1 1 3257726 MYELYTLLAEYYDTIYRRRIERVKAEIDFVEEIFKEDAKREVRRVLDLACGTGIPTLELAERGYEVVGLDLHEEMLRVAR RKAKERNLKIEFLQGDVLEIAFKNEFDAVTMFFSTIMYFDEEDLRKLFSKVAEALKPGGVFITDFPCWFYGGRDGPVVWN EQKGEEKLVIMDWREVEPAVQKLRFKRLVQILRPNGEVKAFLVDDELNIYTPREVRLLAEKYFEKVKIYGNLKRELSPND MRYWIVGIAKSF 1 252 1WZN 1 252 3257726 A 1 1 252 1 252 1WZN 1 252 3257726 B 1 1 252 1 252 1WZN 1 252 3257726 C 1 1 252 7 4 7 4 7 4 parallel parallel parallel parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel parallel parallel parallel parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel parallel parallel parallel parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel anti-parallel A GLU 91 A GLU 91 A GLN 94 A GLN 94 A GLU 65 A GLU 65 A ASP 70 A ASP 70 A ARG 44 A ARG 44 A LEU 48 A LEU 48 A PHE 106 A PHE 106 A MET 111 A MET 111 A LEU 135 A LEU 135 A PRO 146 A PRO 146 A ARG 242 A ARG 242 A ILE 248 A ILE 248 A LYS 225 A LYS 225 A GLY 230 A GLY 230 A VAL 157 A VAL 157 A LYS 163 A LYS 163 A GLU 166 A GLU 166 A GLU 177 A GLU 177 A LYS 182 A LYS 182 A LEU 192 A LEU 192 A VAL 198 A VAL 198 A ASN 208 A ASN 208 B GLU 91 B GLU 91 B GLN 94 B GLN 94 B GLU 65 B GLU 65 B ASP 70 B ASP 70 B ARG 44 B ARG 44 B LEU 48 B LEU 48 B PHE 106 B PHE 106 B MET 111 B MET 111 B LEU 135 B LEU 135 B PRO 146 B PRO 146 B ARG 242 B ARG 242 B ILE 248 B ILE 248 B LYS 225 B LYS 225 B GLY 230 B GLY 230 B VAL 157 B VAL 157 B LYS 163 B LYS 163 B GLU 166 B GLU 166 B GLU 177 B GLU 177 B LYS 182 B LYS 182 B LEU 192 B LEU 192 B VAL 198 B VAL 198 B ASN 208 B ASN 208 C GLU 91 C GLU 91 C GLN 94 C GLN 94 C GLU 65 C GLU 65 C ASP 70 C ASP 70 C ARG 44 C ARG 44 C LEU 48 C LEU 48 C PHE 106 C PHE 106 C MET 111 C MET 111 C LEU 135 C LEU 135 C PRO 146 C PRO 146 C ARG 242 C ARG 242 C ILE 248 C ILE 248 C LYS 225 C LYS 225 C GLY 230 C GLY 230 C VAL 157 C VAL 157 C LYS 163 C LYS 163 C GLU 166 C GLU 166 C GLU 177 C GLU 177 C LYS 182 C LYS 182 C LEU 192 C LEU 192 C VAL 198 C VAL 198 C ASN 208 C ASN 208 BINDING SITE FOR RESIDUE SO4 A 1004 A SO4 1004 Software 5 BINDING SITE FOR RESIDUE SO4 B 1005 B SO4 1005 Software 5 BINDING SITE FOR RESIDUE SO4 C 1006 C SO4 1006 Software 5 BINDING SITE FOR RESIDUE MG A 1007 A MG 1007 Software 3 BINDING SITE FOR RESIDUE SAH A 1001 A SAH 1001 Software 22 BINDING SITE FOR RESIDUE SAH B 1002 B SAH 1002 Software 23 BINDING SITE FOR RESIDUE SAH C 1003 C SAH 1003 Software 23 A ARG 77 A ARG 77 5 1_555 A ARG 81 A ARG 81 5 1_555 A HOH 1035 K HOH 5 1_555 A HOH 1132 K HOH 5 1_555 A HOH 1229 K HOH 5 1_555 B ARG 77 B ARG 77 5 1_555 B ARG 81 B ARG 81 5 1_555 B HOH 1023 L HOH 5 1_555 B HOH 1082 L HOH 5 1_555 B HOH 1192 L HOH 5 1_555 C ARG 77 C ARG 77 5 1_555 C ARG 81 C ARG 81 5 1_555 C HOH 1034 M HOH 5 1_555 C HOH 1125 M HOH 5 1_555 C HOH 1132 M HOH 5 1_555 A ASP 120 A ASP 120 3 1_555 A HOH 1062 K HOH 3 1_555 A HOH 1181 K HOH 3 1_555 A TYR 5 A TYR 5 22 1_555 A TYR 12 A TYR 12 22 1_555 A ARG 19 A ARG 19 22 1_555 A ALA 49 A ALA 49 22 1_555 A CYS 50 A CYS 50 22 1_555 A GLY 51 A GLY 51 22 1_555 A PRO 55 A PRO 55 22 1_555 A ASP 70 A ASP 70 22 1_555 A LEU 71 A LEU 71 22 1_555 A HIS 72 A HIS 72 22 1_555 A MET 75 A MET 75 22 1_555 A GLY 95 A GLY 95 22 1_555 A ASP 96 A ASP 96 22 1_555 A VAL 97 A VAL 97 22 1_555 A PHE 112 A PHE 112 22 1_555 A PHE 113 A PHE 113 22 1_555 A THR 115 A THR 115 22 1_555 A PHE 119 A PHE 119 22 1_555 A HOH 1008 K HOH 22 1_555 A HOH 1009 K HOH 22 1_555 A HOH 1010 K HOH 22 1_555 A HOH 1060 K HOH 22 1_555 B TYR 5 B TYR 5 23 1_555 B TYR 12 B TYR 12 23 1_555 B ARG 19 B ARG 19 23 1_555 B ALA 49 B ALA 49 23 1_555 B CYS 50 B CYS 50 23 1_555 B GLY 51 B GLY 51 23 1_555 B PRO 55 B PRO 55 23 1_555 B ASP 70 B ASP 70 23 1_555 B LEU 71 B LEU 71 23 1_555 B HIS 72 B HIS 72 23 1_555 B MET 75 B MET 75 23 1_555 B GLY 95 B GLY 95 23 1_555 B ASP 96 B ASP 96 23 1_555 B VAL 97 B VAL 97 23 1_555 B PHE 112 B PHE 112 23 1_555 B PHE 113 B PHE 113 23 1_555 B THR 115 B THR 115 23 1_555 B PHE 119 B PHE 119 23 1_555 B HOH 1006 L HOH 23 1_555 B HOH 1008 L HOH 23 1_555 B HOH 1013 L HOH 23 1_555 B HOH 1094 L HOH 23 1_555 B HOH 1098 L HOH 23 1_555 C TYR 5 C TYR 5 23 1_555 C TYR 12 C TYR 12 23 1_555 C ARG 19 C ARG 19 23 1_555 C ALA 49 C ALA 49 23 1_555 C CYS 50 C CYS 50 23 1_555 C GLY 51 C GLY 51 23 1_555 C PRO 55 C PRO 55 23 1_555 C ASP 70 C ASP 70 23 1_555 C LEU 71 C LEU 71 23 1_555 C HIS 72 C HIS 72 23 1_555 C MET 75 C MET 75 23 1_555 C GLY 95 C GLY 95 23 1_555 C ASP 96 C ASP 96 23 1_555 C VAL 97 C VAL 97 23 1_555 C PHE 112 C PHE 112 23 1_555 C PHE 113 C PHE 113 23 1_555 C THR 115 C THR 115 23 1_555 C PHE 119 C PHE 119 23 1_555 C HOH 1007 M HOH 23 1_555 C HOH 1008 M HOH 23 1_555 C HOH 1023 M HOH 23 1_555 C HOH 1049 M HOH 23 1_555 C HOH 1105 M HOH 23 1_555 20 C 2 2 21