1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 0.00000 0.00000 Ranson, N.A. Clare, D.K. Farr, G.W. Houldershaw, D. Horwich, A.L. Saibil, H.R. http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic 1 90.0 90.0 90.0 1.0 1.0 1.0 C3 H7 N O2 89.093 y ALANINE L-peptide linking C6 H15 N4 O2 1 175.209 y ARGININE L-peptide linking C4 H8 N2 O3 132.118 y ASPARAGINE L-peptide linking C4 H7 N O4 133.103 y ASPARTIC ACID L-peptide linking C3 H7 N O2 S 121.158 y CYSTEINE L-peptide linking C5 H10 N2 O3 146.144 y GLUTAMINE L-peptide linking C5 H9 N O4 147.129 y GLUTAMIC ACID L-peptide linking C2 H5 N O2 75.067 y GLYCINE peptide linking C6 H10 N3 O2 1 156.162 y HISTIDINE L-peptide linking C6 H13 N O2 131.173 y ISOLEUCINE L-peptide linking C6 H13 N O2 131.173 y LEUCINE L-peptide linking C6 H15 N2 O2 1 147.195 y LYSINE L-peptide linking C5 H11 N O2 S 149.211 y METHIONINE L-peptide linking C9 H11 N O2 165.189 y PHENYLALANINE L-peptide linking C5 H9 N O2 115.130 y PROLINE L-peptide linking C3 H7 N O3 105.093 y SERINE L-peptide linking C4 H9 N O3 119.119 y THREONINE L-peptide linking C9 H11 N O3 181.189 y TYROSINE L-peptide linking C5 H11 N O2 117.146 y VALINE L-peptide linking US Nat.Struct.Mol.Biol. 1545-9993 13 147 152 10.1038/nsmb1046 16429154 Allosteric Signalling of ATP Hydrolysis in Groel-Groes Complexes. 2006 ILE N 120 CBETA WRONG HAND 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 0.00000 0.00000 1 1 1.0 METHOD--RECIPROCAL SPACE FITTING IN URO OTHER RECIPROCAL SPACE FITTING OF SEVEN INDEPENDENT RIGID BODIES WITH URO. FITTED ENTITIES WERE GROEL EQUATORIAL (RESIDUES 3-136 AND 410-524), INTERMEDIATE (RESIDUES 137-192 AND 374-409) AND APICAL (RESIDUES 192-373) DOMAINS, PLUS A GROES SUBUNIT. THE MAP INTO WHICH THESE COORDINATES WERE FITTED IS AVAILABLE AT THE EMD (EMD-1180) 2C7C PROJECTION MATCHING-BASED ANGULAR REFINEMENT OF MSA GENERATED CLASSES. ITERATIVE ALGEBRAIC RECONSTRUCTION IN SPIDER. 1.4 16281 7.7 POINT 12.5MM HEPES, 5MM KCL, 5MM MGCL2 12.5MM HEPES, 5MM KCL, 5MM MGCL2 7.5 FULL CORRECTION ON 2D CLASS AVERAGES GROEL-ATP7-GROES 0 COMPLEX PARTICLE 1 1 SINGLE PARTICLE 15 KODAK SO-163 FILM 2C7C 189 200 FIELD EMISSION GUN FLOOD BEAM FEI TECNAI F20 BRIGHT FIELD 2.0 3200 1100 50000 1 100 HOLEY CARBON 2C7C C7 MODEL FITTING 1 URO RECONSTRUCTION 1 IMAGIC RECONSTRUCTION 1 SPIDER 1 NO NO NO YES ETHANE LIQUID ETHANE 2C7C 57260.504 60 KDA CHAPERONIN 14 man polymer 10400.938 10 KDA CHAPERONIN MOLECULE: GROES, PROTEIN CPN10, GROES PROTEIN 7 man polymer GROEL, PROTEIN CPN60, GROEL PROTEIN no no AAKDVKFGNDARVKMLRGVNVLADAVKVTLGPKGRNVVLDKSFGAPTITKDGVSVAREIELEDKFENMGAQMVKEVASKA NDAAGDGTTTATVLAQAIITEGLKAVAAGMNPMDLKRGIDKAVTAAVEELKALSVPCSDSKAIAQVGTISANSDETVGKL IAEAMDKVGKEGVITVEDGTGLQDELDVVEGMQFDRGYLSPYFINKPETGAVELESPFILLADKKISNIREMLPVLEAVA KAGKPLLIIAEDVEGEALATLVVNTMRGIVKVAAVKAPGFGDRRKAMLQDIATLTGGTVISEEIGMELEKATLEDLGQAK RVVINKDTTTIIDGVGEEAAIQGRVAQIRQQIEEATSDYDREKLQERVAKLAGGVAVIKVGAATEVEMKEKKARVEDALH ATRAAVEEGVVAGGGVALIRVASKLADLRGQNEDQNVGIKVALRAMEAPLRQIVLNCGEEPSVVANTVKGGDGNYGYNAA TEEYGNMIDMGILDPTKVTRSALQYAASVAGLMITTECMVTDLPKNDAADLGAAGGMGGMGGMGGMM AAKDVKFGNDARVKMLRGVNVLADAVKVTLGPKGRNVVLDKSFGAPTITKDGVSVAREIELEDKFENMGAQMVKEVASKA NDAAGDGTTTATVLAQAIITEGLKAVAAGMNPMDLKRGIDKAVTAAVEELKALSVPCSDSKAIAQVGTISANSDETVGKL IAEAMDKVGKEGVITVEDGTGLQDELDVVEGMQFDRGYLSPYFINKPETGAVELESPFILLADKKISNIREMLPVLEAVA KAGKPLLIIAEDVEGEALATLVVNTMRGIVKVAAVKAPGFGDRRKAMLQDIATLTGGTVISEEIGMELEKATLEDLGQAK RVVINKDTTTIIDGVGEEAAIQGRVAQIRQQIEEATSDYDREKLQERVAKLAGGVAVIKVGAATEVEMKEKKARVEDALH ATRAAVEEGVVAGGGVALIRVASKLADLRGQNEDQNVGIKVALRAMEAPLRQIVLNCGEEPSVVANTVKGGDGNYGYNAA TEEYGNMIDMGILDPTKVTRSALQYAASVAGLMITTECMVTDLPKNDAADLGAAGGMGGMGGMGGMM A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N polypeptide(L) no no MNIRPLHDRVIVKRKEVETKSAGGIVLTGSAAAKSTRGEVLAVGNGRILENGEVKPLDVKVGDIVIFNDGYGVKSEKIDN EEVLIMSESDILAIVEA MNIRPLHDRVIVKRKEVETKSAGGIVLTGSAAAKSTRGEVLAVGNGRILENGEVKPLDVKVGDIVIFNDGYGVKSEKIDN EEVLIMSESDILAIVEA O,P,Q,R,S,T,U polypeptide(L) n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n sample 562 ESCHERICHIA COLI 562 ESCHERICHIA COLI sample 562 ESCHERICHIA COLI 562 ESCHERICHIA COLI em_software atom_sites cell cell repository Initial release Version format compliance Version format compliance Data collection Data collection Other Data collection Other 1 0 2006-01-25 1 1 2011-05-08 1 2 2011-07-13 1 3 2017-08-23 1 4 2019-10-02 1 5 2019-10-23 _em_software.fitting_id _em_software.image_processing_id _atom_sites.fract_transf_matrix[1][1] _atom_sites.fract_transf_matrix[2][2] _atom_sites.fract_transf_matrix[3][3] _cell.length_a _cell.length_b _cell.length_c _cell.Z_PDB CRYSTAL STRUCTURE OF THE ASYMMETRIC CHAPERONIN COMPLEX GROEL/GROES/(ADP)7 CRYSTAL STRUCTURE OF AN ISOLATED APICAL DOMAIN OF GROEL CRYSTAL STRUCTURE OF A GROEL (APICAL DOMAIN) AND A DODECAMERIC PEPTIDE COMPLEX NMR STRUCTURE OF GROES MOBILE LOOP RESIDUES 19 - 27 IN THE SYNTHETIC PEPTIDE (RESIDUES 13 - 32) BOUND TO GROEL, 20 STRUCTURES CRYSTAL STRUCTURE OF THE HEXA-SUBSTITUTED MUTANT OF THEMOLECULAR CHAPERONIN GROEL APICAL DOMAIN CRYSTAL STRUCTURE OF THE HEXA-SUBSTITUTED MUTANT OF THEMOLECULAR CHAPERONIN GROEL APICAL DOMAIN SOLUTION STRUCTURE OF APO GROEL BY CRYO- ELECTRON MICROSCOPY SOLUTION STRUCTURE OF GROEL(D398A)+ 250UM ATP BY CRYO-ELECTRON MICROSCOPY MOL_ID: 1; MOLECULE: GROEL (HSP60 CLASS); CHAIN: NULL; ENGINEERED: YES; MUTATION: R13G, A126V SOLUTION STRUCTURE OF GROES-ADP7-GROEL-ATP7 COMPLEX BY CRYO-EM STRUCTURAL AND MECHANISTIC BASIS FOR ALLOSTERY IN THEBACTERIAL CHAPERONIN GROEL; SEE REMARK 400 GROEL (HSP60 CLASS) FRAGMENT COMPRISING RESIDUES 191 - 345 GROEL (HSP60 CLASS) FRAGMENT (APICAL DOMAIN) COMPRISING RESIDUES 191-376, MUTANT WITH ALA 262 REPLACED WITH LEU AND ILE 267 REPLACED WITH MET STRUCTURAL BASIS FOR GROEL-ASSISTED PROTEIN FOLDING FROMTHE CRYSTAL STRUCTURE OF (GROEL- KMGATP)14 AT 2.0 ARESOLUTION STRUCTURAL AND MECHANISTIC BASIS FOR ALLOSTERY IN THEBACTERIAL CHAPERONIN GROEL; SEE REMARK 400 GRO-EL FRAGMENT (APICAL DOMAIN) COMPRISING RESIDUES 188-379 DOMAIN MOTIONS IN GROEL UPON BINDING OF AN OLIGOPEPTIDE MOL_ID: 1; MOLECULE: GROEL (HSP60 CLASS); CHAIN: A, B, C, D, E, F, G; ENGINEERED: YES; MUTATION: R13G, A126V CRYSTAL STRUCTURE OF GROEL-GROES GROEL-GROES-ADP GROEL CRYSTAL STRUCTURE OF GROEL14-GROES7-(ADP- ALFX)7 GROEL14-(ATPGAMMAS)14 GROEL-GROES-ADP7 CRYSTAL STRUCTURE OF APO GROEL FITTED COORDINATES FOR GROEL-ADP7-GROES CRYO -EM COMPLEX (EMD-1181) REVISED ATOMIC STRUCTURE FITTING INTO A GROEL(D398A)-ATP7 CRYO-EM MAP (EMD 1047) SHEET THE SHEET STRUCTURE OF THIS MOLECULE IS BIFURCATED. IN ORDER TO REPRESENT THIS FEATURE IN THE SHEET RECORDS BELOW, TWO SHEETS ARE DEFINED. PDBE Y PDBE 2005-11-22 REL ALA 2 n 1 ALA 2 A ALA 3 n 2 ALA 3 A LYS 4 n 3 LYS 4 A ASP 5 n 4 ASP 5 A VAL 6 n 5 VAL 6 A LYS 7 n 6 LYS 7 A PHE 8 n 7 PHE 8 A GLY 9 n 8 GLY 9 A ASN 10 n 9 ASN 10 A ASP 11 n 10 ASP 11 A ALA 12 n 11 ALA 12 A ARG 13 n 12 ARG 13 A VAL 14 n 13 VAL 14 A LYS 15 n 14 LYS 15 A MET 16 n 15 MET 16 A LEU 17 n 16 LEU 17 A ARG 18 n 17 ARG 18 A GLY 19 n 18 GLY 19 A VAL 20 n 19 VAL 20 A ASN 21 n 20 ASN 21 A VAL 22 n 21 VAL 22 A LEU 23 n 22 LEU 23 A ALA 24 n 23 ALA 24 A ASP 25 n 24 ASP 25 A ALA 26 n 25 ALA 26 A VAL 27 n 26 VAL 27 A LYS 28 n 27 LYS 28 A VAL 29 n 28 VAL 29 A THR 30 n 29 THR 30 A LEU 31 n 30 LEU 31 A GLY 32 n 31 GLY 32 A PRO 33 n 32 PRO 33 A LYS 34 n 33 LYS 34 A GLY 35 n 34 GLY 35 A ARG 36 n 35 ARG 36 A ASN 37 n 36 ASN 37 A VAL 38 n 37 VAL 38 A VAL 39 n 38 VAL 39 A LEU 40 n 39 LEU 40 A ASP 41 n 40 ASP 41 A LYS 42 n 41 LYS 42 A SER 43 n 42 SER 43 A PHE 44 n 43 PHE 44 A GLY 45 n 44 GLY 45 A ALA 46 n 45 ALA 46 A PRO 47 n 46 PRO 47 A THR 48 n 47 THR 48 A ILE 49 n 48 ILE 49 A THR 50 n 49 THR 50 A LYS 51 n 50 LYS 51 A ASP 52 n 51 ASP 52 A GLY 53 n 52 GLY 53 A VAL 54 n 53 VAL 54 A SER 55 n 54 SER 55 A VAL 56 n 55 VAL 56 A ALA 57 n 56 ALA 57 A ARG 58 n 57 ARG 58 A GLU 59 n 58 GLU 59 A ILE 60 n 59 ILE 60 A GLU 61 n 60 GLU 61 A LEU 62 n 61 LEU 62 A GLU 63 n 62 GLU 63 A ASP 64 n 63 ASP 64 A LYS 65 n 64 LYS 65 A PHE 66 n 65 PHE 66 A GLU 67 n 66 GLU 67 A ASN 68 n 67 ASN 68 A MET 69 n 68 MET 69 A GLY 70 n 69 GLY 70 A ALA 71 n 70 ALA 71 A GLN 72 n 71 GLN 72 A MET 73 n 72 MET 73 A VAL 74 n 73 VAL 74 A LYS 75 n 74 LYS 75 A GLU 76 n 75 GLU 76 A VAL 77 n 76 VAL 77 A ALA 78 n 77 ALA 78 A SER 79 n 78 SER 79 A LYS 80 n 79 LYS 80 A ALA 81 n 80 ALA 81 A ASN 82 n 81 ASN 82 A ASP 83 n 82 ASP 83 A ALA 84 n 83 ALA 84 A ALA 85 n 84 ALA 85 A GLY 86 n 85 GLY 86 A ASP 87 n 86 ASP 87 A GLY 88 n 87 GLY 88 A THR 89 n 88 THR 89 A THR 90 n 89 THR 90 A THR 91 n 90 THR 91 A ALA 92 n 91 ALA 92 A THR 93 n 92 THR 93 A VAL 94 n 93 VAL 94 A LEU 95 n 94 LEU 95 A ALA 96 n 95 ALA 96 A GLN 97 n 96 GLN 97 A ALA 98 n 97 ALA 98 A ILE 99 n 98 ILE 99 A ILE 100 n 99 ILE 100 A THR 101 n 100 THR 101 A GLU 102 n 101 GLU 102 A GLY 103 n 102 GLY 103 A LEU 104 n 103 LEU 104 A LYS 105 n 104 LYS 105 A ALA 106 n 105 ALA 106 A VAL 107 n 106 VAL 107 A ALA 108 n 107 ALA 108 A ALA 109 n 108 ALA 109 A GLY 110 n 109 GLY 110 A MET 111 n 110 MET 111 A ASN 112 n 111 ASN 112 A PRO 113 n 112 PRO 113 A MET 114 n 113 MET 114 A ASP 115 n 114 ASP 115 A LEU 116 n 115 LEU 116 A LYS 117 n 116 LYS 117 A ARG 118 n 117 ARG 118 A GLY 119 n 118 GLY 119 A ILE 120 n 119 ILE 120 A ASP 121 n 120 ASP 121 A LYS 122 n 121 LYS 122 A ALA 123 n 122 ALA 123 A VAL 124 n 123 VAL 124 A THR 125 n 124 THR 125 A ALA 126 n 125 ALA 126 A ALA 127 n 126 ALA 127 A VAL 128 n 127 VAL 128 A GLU 129 n 128 GLU 129 A GLU 130 n 129 GLU 130 A LEU 131 n 130 LEU 131 A LYS 132 n 131 LYS 132 A ALA 133 n 132 ALA 133 A LEU 134 n 133 LEU 134 A SER 135 n 134 SER 135 A VAL 136 n 135 VAL 136 A PRO 137 n 136 PRO 137 A CYS 138 n 137 CYS 138 A SER 139 n 138 SER 139 A ASP 140 n 139 ASP 140 A SER 141 n 140 SER 141 A LYS 142 n 141 LYS 142 A ALA 143 n 142 ALA 143 A ILE 144 n 143 ILE 144 A ALA 145 n 144 ALA 145 A GLN 146 n 145 GLN 146 A VAL 147 n 146 VAL 147 A GLY 148 n 147 GLY 148 A THR 149 n 148 THR 149 A ILE 150 n 149 ILE 150 A SER 151 n 150 SER 151 A ALA 152 n 151 ALA 152 A ASN 153 n 152 ASN 153 A SER 154 n 153 SER 154 A ASP 155 n 154 ASP 155 A GLU 156 n 155 GLU 156 A THR 157 n 156 THR 157 A VAL 158 n 157 VAL 158 A GLY 159 n 158 GLY 159 A LYS 160 n 159 LYS 160 A LEU 161 n 160 LEU 161 A ILE 162 n 161 ILE 162 A ALA 163 n 162 ALA 163 A GLU 164 n 163 GLU 164 A ALA 165 n 164 ALA 165 A MET 166 n 165 MET 166 A ASP 167 n 166 ASP 167 A LYS 168 n 167 LYS 168 A VAL 169 n 168 VAL 169 A GLY 170 n 169 GLY 170 A LYS 171 n 170 LYS 171 A GLU 172 n 171 GLU 172 A GLY 173 n 172 GLY 173 A VAL 174 n 173 VAL 174 A ILE 175 n 174 ILE 175 A THR 176 n 175 THR 176 A VAL 177 n 176 VAL 177 A GLU 178 n 177 GLU 178 A ASP 179 n 178 ASP 179 A GLY 180 n 179 GLY 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