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Subramaniam, S. http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic 1 90.00 90.00 90.00 1.000 1.000 1.000 C10 H15 N5 O10 P2 427.201 n ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE non-polymer C3 H7 N O2 89.093 y ALANINE L-peptide linking C6 H15 N4 O2 1 175.209 y ARGININE L-peptide linking C4 H8 N2 O3 132.118 y ASPARAGINE L-peptide linking C4 H7 N O4 133.103 y ASPARTIC ACID L-peptide linking C3 H7 N O2 S 121.158 y CYSTEINE L-peptide linking C5 H10 N2 O3 146.144 y GLUTAMINE L-peptide linking C5 H9 N O4 147.129 y GLUTAMIC ACID L-peptide linking C2 H5 N O2 75.067 y GLYCINE peptide linking C6 H10 N3 O2 1 156.162 y HISTIDINE L-peptide linking C6 H13 N O2 131.173 y ISOLEUCINE L-peptide linking C6 H13 N O2 131.173 y LEUCINE L-peptide linking C6 H15 N2 O2 1 147.195 y LYSINE L-peptide linking C5 H11 N O2 S 149.211 y METHIONINE L-peptide linking C9 H11 N O2 165.189 y PHENYLALANINE L-peptide linking C5 H9 N O2 115.130 y PROLINE L-peptide linking C3 H7 N O3 105.093 y SERINE L-peptide linking C4 H9 N O3 119.119 y THREONINE L-peptide linking C11 H12 N2 O2 204.225 y TRYPTOPHAN L-peptide linking C9 H11 N O3 181.189 y TYROSINE L-peptide linking C5 H11 N O2 117.146 y VALINE L-peptide linking N 1 N P N 2 N O N 3 N O N 4 N O N 5 S P N 6 N O N 7 N O N 8 N O N 9 N O N 10 N C N 11 R C N 12 N O N 13 S C N 14 N O N 15 R C N 16 N O N 17 R C Y 18 N N Y 19 N C Y 20 N N Y 21 N C Y 22 N C N 23 N N Y 24 N N Y 25 N C Y 26 N N Y 27 N C N 28 N H N 29 N H N 30 N H N 31 N H N 32 N H N 33 N H N 34 N H N 35 N H N 36 N H N 37 N H N 38 N H N 39 N H N 40 N H N 41 N H N 42 N H N 43 N N N 44 S C N 45 N C N 46 N O N 47 N C N 48 N O N 49 N H N 50 N H N 51 N H N 52 N H N 53 N H N 54 N H N 55 N H N 56 N N N 57 S C N 58 N C N 59 N O N 60 N C N 61 N C N 62 N C N 63 N N N 64 N C N 65 N N N 66 N N N 67 N O N 68 N H N 69 N H N 70 N H N 71 N H N 72 N H N 73 N H N 74 N H N 75 N H N 76 N H N 77 N H N 78 N H N 79 N H N 80 N H N 81 N H N 82 N H N 83 N N N 84 S C N 85 N C N 86 N O N 87 N C N 88 N C N 89 N O N 90 N N N 91 N O N 92 N H N 93 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194 N H N 195 N H N 196 N H N 197 N H N 198 N H N 199 N H N 200 N N N 201 S C N 202 N C N 203 N O N 204 S C N 205 N C N 206 N C N 207 N C N 208 N O N 209 N H N 210 N H N 211 N H N 212 N H N 213 N H N 214 N H N 215 N H N 216 N H N 217 N H N 218 N H N 219 N H N 220 N H N 221 N H N 222 N N N 223 S C N 224 N C N 225 N O N 226 N C N 227 N C N 228 N C N 229 N C N 230 N O N 231 N H N 232 N H N 233 N H N 234 N H N 235 N H N 236 N H N 237 N H N 238 N H N 239 N H N 240 N H N 241 N H N 242 N H N 243 N H N 244 N N N 245 S C N 246 N C N 247 N O N 248 N C N 249 N C N 250 N C N 251 N C N 252 N N N 253 N O N 254 N H N 255 N H N 256 N H N 257 N H N 258 N H N 259 N H N 260 N H N 261 N H N 262 N H N 263 N H N 264 N H N 265 N H N 266 N H N 267 N H N 268 N H N 269 N N N 270 S C N 271 N C N 272 N O N 273 N C N 274 N C N 275 N S N 276 N C N 277 N O N 278 N H N 279 N H N 280 N H N 281 N H N 282 N H N 283 N H N 284 N H N 285 N H N 286 N H N 287 N H N 288 N H N 289 N N N 290 S C N 291 N C N 292 N O N 293 N C Y 294 N C Y 295 N C Y 296 N C Y 297 N C Y 298 N C Y 299 N C N 300 N O N 301 N H N 302 N H N 303 N H N 304 N H N 305 N H N 306 N H N 307 N H N 308 N H N 309 N H N 310 N H N 311 N H N 312 N N N 313 S C N 314 N C N 315 N O N 316 N C N 317 N C N 318 N C N 319 N O N 320 N H N 321 N H N 322 N H N 323 N H N 324 N H N 325 N H N 326 N H N 327 N H N 328 N H N 329 N N N 330 S C N 331 N C N 332 N O N 333 N C N 334 N O N 335 N O N 336 N H N 337 N H N 338 N H N 339 N H N 340 N H N 341 N H N 342 N H N 343 N N N 344 S C N 345 N C N 346 N O N 347 R C N 348 N O N 349 N C N 350 N O N 351 N H N 352 N H N 353 N H N 354 N H N 355 N H N 356 N H N 357 N H N 358 N H N 359 N H N 360 N N N 361 S C N 362 N C N 363 N O N 364 N C Y 365 N C Y 366 N C Y 367 N C Y 368 N N Y 369 N C Y 370 N C Y 371 N C Y 372 N C Y 373 N C N 374 N O N 375 N H N 376 N H N 377 N H N 378 N H N 379 N H N 380 N H N 381 N H N 382 N H N 383 N H N 384 N H N 385 N H N 386 N H N 387 N N N 388 S C N 389 N C N 390 N O N 391 N C Y 392 N C Y 393 N C Y 394 N C Y 395 N C Y 396 N C Y 397 N C N 398 N O N 399 N O N 400 N H N 401 N H N 402 N H N 403 N H N 404 N H N 405 N H N 406 N H N 407 N H N 408 N H N 409 N H N 410 N H N 411 N N N 412 S C N 413 N C N 414 N O N 415 N C N 416 N C N 417 N C N 418 N O N 419 N H N 420 N H N 421 N H N 422 N H N 423 N H N 424 N H N 425 N H N 426 N H N 427 N H N 428 N H N 429 N H N 1 N doub N 2 N sing N 3 N sing N 4 N sing N 5 N sing N 6 N sing N 7 N doub N 8 N sing N 9 N sing N 10 N sing N 11 N sing N 12 N sing N 13 N sing N 14 N sing N 15 N sing N 16 N sing N 17 N sing N 18 N sing N 19 N sing N 20 N sing N 21 N sing N 22 N sing N 23 N sing N 24 N sing N 25 N sing N 26 N sing N 27 N sing N 28 N sing N 29 N sing Y 30 N sing Y 31 N sing Y 32 N doub N 33 N sing Y 34 N sing Y 35 N sing Y 36 N doub N 37 N sing Y 38 N doub N 39 N sing N 40 N sing Y 41 N sing Y 42 N doub N 43 N sing Y 44 N sing N 45 N sing N 46 N sing N 47 N sing N 48 N sing N 49 N sing N 50 N sing N 51 N doub N 52 N sing N 53 N sing N 54 N sing N 55 N sing N 56 N sing N 57 N sing N 58 N sing N 59 N sing N 60 N sing N 61 N sing N 62 N sing N 63 N doub N 64 N sing N 65 N sing N 66 N sing N 67 N sing N 68 N sing N 69 N sing N 70 N sing N 71 N sing N 72 N sing N 73 N sing N 74 N sing N 75 N sing N 76 N sing N 77 N doub N 78 N sing N 79 N sing N 80 N sing N 81 N sing N 82 N sing N 83 N sing N 84 N sing N 85 N sing N 86 N sing N 87 N sing N 88 N sing N 89 N doub N 90 N sing N 91 N sing N 92 N sing N 93 N sing N 94 N doub N 95 N sing N 96 N sing N 97 N sing N 98 N sing N 99 N sing N 100 N sing N 101 N sing N 102 N sing N 103 N sing N 104 N sing N 105 N doub N 106 N sing N 107 N sing N 108 N sing N 109 N sing N 110 N doub N 111 N sing N 112 N sing N 113 N sing N 114 N sing N 115 N sing N 116 N sing N 117 N sing N 118 N sing N 119 N sing N 120 N doub N 121 N sing N 122 N sing N 123 N sing N 124 N sing N 125 N sing N 126 N sing N 127 N sing N 128 N sing N 129 N sing N 130 N sing N 131 N sing N 132 N sing N 133 N doub N 134 N sing N 135 N sing N 136 N sing N 137 N sing N 138 N sing N 139 N sing N 140 N sing N 141 N doub N 142 N sing N 143 N sing N 144 N sing N 145 N sing N 146 N sing N 147 N sing N 148 N sing N 149 N sing N 150 N sing N 151 N sing N 152 N doub N 153 N sing N 154 N sing N 155 N sing N 156 N sing N 157 N sing N 158 N sing N 159 N sing N 160 N doub N 161 N sing N 162 N sing N 163 N sing N 164 N sing N 165 N sing N 166 N sing N 167 N sing N 168 N sing N 169 N sing N 170 N doub N 171 N sing N 172 N sing N 173 N sing N 174 N sing N 175 N sing N 176 N sing N 177 N sing N 178 N sing N 179 N doub N 180 N sing N 181 N sing N 182 N sing N 183 N sing Y 184 N sing Y 185 N doub Y 186 N doub N 187 N sing Y 188 N sing N 189 N sing Y 190 N sing N 191 N sing N 192 N sing N 193 N sing N 194 N sing N 195 N sing N 196 N sing N 197 N sing N 198 N sing N 199 N sing N 200 N doub N 201 N sing N 202 N sing N 203 N sing N 204 N sing N 205 N sing N 206 N sing N 207 N sing N 208 N sing N 209 N sing N 210 N sing N 211 N sing N 212 N sing N 213 N sing N 214 N sing N 215 N sing N 216 N sing N 217 N sing N 218 N sing N 219 N sing N 220 N sing N 221 N doub N 222 N sing N 223 N sing N 224 N sing N 225 N sing N 226 N sing N 227 N sing N 228 N sing N 229 N sing N 230 N sing N 231 N sing N 232 N sing N 233 N sing N 234 N sing N 235 N sing N 236 N sing N 237 N sing N 238 N sing N 239 N sing N 240 N sing N 241 N sing N 242 N doub N 243 N sing N 244 N sing N 245 N sing N 246 N sing N 247 N sing N 248 N sing N 249 N sing N 250 N sing N 251 N sing N 252 N sing N 253 N sing N 254 N sing N 255 N sing N 256 N sing N 257 N sing N 258 N sing N 259 N sing N 260 N sing N 261 N sing N 262 N sing N 263 N sing N 264 N sing N 265 N sing N 266 N doub N 267 N sing N 268 N sing N 269 N sing N 270 N sing N 271 N sing N 272 N sing N 273 N sing N 274 N sing N 275 N sing N 276 N sing N 277 N sing N 278 N sing N 279 N sing N 280 N sing N 281 N sing N 282 N sing N 283 N sing N 284 N sing N 285 N doub N 286 N sing N 287 N sing N 288 N sing N 289 N 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DISORDERED. LINKER CONNECTING RESIDUES 707 TO 728 IS NOT IN THE MODEL. SUBMISSION BASED ON EXPERIMENTAL DATA FROM EMDB EMD-3297. (DEPOSITION ID: 14173). 5FTL SCORE MINIMIZATION 33882 3.3 POINT 25 MM TRIS, 150 MM NACL, 1 MM MGCL2, 1.0 MM TCEP 25 MM TRIS, 150 MM NACL, 1 MM MGCL2, 1.0 MM TCEP 8 EACH PARTICLE FULL-LENGTH HUMAN P97 BOUND TO ATPGS 0 COMPLEX PARTICLE 1 1 SINGLE PARTICLE 40 GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k) 5FTL 628 300 36980 2015-01-17 PARALLEL BEAM ILLUMINATION FIELD EMISSION GUN FLOOD BEAM FEI TITAN KRIOS BRIGHT FIELD 2.7 2700 950 105000 1 79.7 HOLEY CARBON 5FTL C6 RECONSTRUCTION 1 FREALIGN 0.9 NO NO NO YES ETHANE VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, HUMIDITY- 100, TEMPERATURE- 90.15, INSTRUMENT- FEI VITROBOT MARK IV, METHOD- BLOT FOR 2.5 SECONDS BEFORE PLUNGING. 5FTL FEI VITROBOT MARK IV 89436.820 TRANSITIONAL ENDOPLASMIC RETICULUM ATPASE 3.6.4.6 6 man polymer 427.201 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE 12 syn non-polymer TER ATPASE, 15S MG(2+)-ATPASE P97 SUBUNIT, VALOSIN-CONTAINING PROTEIN, VCP, P97 VCP TRANSITIONAL ENDOPLASMIC RETICULUM ATPASE no no MASGADSKGDDLSTAILKQKNRPNRLIVDEAINEDNSVVSLSQPKMDELQLFRGDTVLLKGKKRREAVCIVLSDDTCSDE KIRMNRVVRNNLRVRLGDVISIQPCPDVKYGKRIHVLPIDDTVEGITGNLFEVYLKPYFLEAYRPIRKGDIFLVRGGMRA VEFKVVETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEEESLNEVGYDDIGGCRKQLAQIKEMVELPLRHPALFKAIGVKPPRG ILLYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFFLINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEV ERRIVSQLLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVA NETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIG GLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVR EIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLD QLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKSPVAKDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAM EVEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGGAGPSQGSGGGTGGSVYTEDN DDDLYG MASGADSKGDDLSTAILKQKNRPNRLIVDEAINEDNSVVSLSQPKMDELQLFRGDTVLLKGKKRREAVCIVLSDDTCSDE KIRMNRVVRNNLRVRLGDVISIQPCPDVKYGKRIHVLPIDDTVEGITGNLFEVYLKPYFLEAYRPIRKGDIFLVRGGMRA VEFKVVETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEEESLNEVGYDDIGGCRKQLAQIKEMVELPLRHPALFKAIGVKPPRG ILLYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFFLINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEV ERRIVSQLLTLMDGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLEQVA NETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPSALRETVVEVPQVTWEDIG GLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLLAKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVR EIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGDGGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLD QLIYIPLPDEKSRVAILKANLRKSPVAKDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNPSAM EVEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGSFRFPSGNQGGAGPSQGSGGGTGGSVYTEDN DDDLYG A,B,C,D,E,F polypeptide(L) n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n HUMAN sample 9606 HOMO SAPIENS 469008 ESCHERICHIA COLI BL21(DE3) ROSETTA2 em_software chem_comp_atom chem_comp_bond database_2 struct_site repository Initial release Database references Other Database references Data collection Data collection Database references Derived calculations 1 0 2016-01-27 1 1 2016-02-10 1 2 2016-03-09 1 3 2018-10-03 1 4 2024-05-08 _em_software.image_processing_id _em_software.name _database_2.pdbx_DOI _database_2.pdbx_database_accession _struct_site.pdbx_auth_asym_id _struct_site.pdbx_auth_comp_id _struct_site.pdbx_auth_seq_id CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN P97 BOUND TO UPCDC30245 INHIBITOR CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN P97 BOUND TO ADP CRYO-EM STRUCTURE OF HUMAN P97 BOUND TO 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ASP PRO 169 170 -129.71 1 E E PRO TYR 172 173 140.17 1 E E LYS THR 315 316 149.62 1 F F PRO ASN 23 24 149.31 1 F F ASP PRO 169 170 -129.68 1 F F PRO TYR 172 173 140.18 1 F F LYS THR 315 316 149.58 1 A ARG 22 60.26 71.38 1 A PRO 23 -81.23 46.51 1 A GLN 50 56.88 72.85 1 A ARG 64 64.77 -4.43 1 A ASP 75 -123.51 -64.34 1 A THR 76 -58.29 -72.46 1 A CYS 77 43.90 -119.91 1 A SER 78 178.84 -178.78 1 A ASP 79 -47.35 -72.54 1 A LYS 81 178.28 160.07 1 A CYS 105 -119.49 69.11 1 A LYS 109 178.59 159.03 1 A LYS 112 -103.27 -60.93 1 A TYR 134 -126.86 -62.46 1 A GLU 141 56.97 18.33 1 A ARG 159 -171.15 -171.81 1 A VAL 166 -92.95 -74.34 1 A ASP 169 -68.58 -160.21 1 A PRO 170 -51.80 77.70 1 A TYR 173 34.16 72.89 1 A ARG 210 -127.99 -56.32 1 A GLU 221 -71.87 -71.40 1 A ALA 232 -102.29 -73.64 1 A ARG 239 -109.91 -64.22 1 A PRO 311 -92.94 46.89 1 A ARG 313 -134.20 -73.92 1 A LYS 315 -49.13 -75.91 1 A THR 316 39.04 67.00 1 A GLN 337 55.71 -126.06 1 A ALA 339 88.41 -133.20 1 A ARG 362 -111.16 -80.85 1 A LYS 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