1.000000
0.000000
0.000000
0.000000
1.000000
0.000000
0.000000
0.000000
1.000000
0.00000
0.00000
0.00000
Mattei, S.
Glass, B.
Hagen, W.J.H.
Kraeusslich, H.-G.
Briggs, J.A.G.
http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic
C3 H7 N O2
89.093
y
ALANINE
L-peptide linking
C6 H15 N4 O2 1
175.209
y
ARGININE
L-peptide linking
C4 H8 N2 O3
132.118
y
ASPARAGINE
L-peptide linking
C4 H7 N O4
133.103
y
ASPARTIC ACID
L-peptide linking
C3 H7 N O2 S
121.158
y
CYSTEINE
L-peptide linking
C5 H10 N2 O3
146.144
y
GLUTAMINE
L-peptide linking
C5 H9 N O4
147.129
y
GLUTAMIC ACID
L-peptide linking
C2 H5 N O2
75.067
y
GLYCINE
peptide linking
C6 H10 N3 O2 1
156.162
y
HISTIDINE
L-peptide linking
C6 H13 N O2
131.173
y
ISOLEUCINE
L-peptide linking
C6 H13 N O2
131.173
y
LEUCINE
L-peptide linking
C6 H15 N2 O2 1
147.195
y
LYSINE
L-peptide linking
C5 H11 N O2 S
149.211
y
METHIONINE
L-peptide linking
C9 H11 N O2
165.189
y
PHENYLALANINE
L-peptide linking
C5 H9 N O2
115.130
y
PROLINE
L-peptide linking
C3 H7 N O3
105.093
y
SERINE
L-peptide linking
C4 H9 N O3
119.119
y
THREONINE
L-peptide linking
C11 H12 N2 O2
204.225
y
TRYPTOPHAN
L-peptide linking
C9 H11 N O3
181.189
y
TYROSINE
L-peptide linking
C5 H11 N O2
117.146
y
VALINE
L-peptide linking
US
Science
SCIEAS
0038
1095-9203
354
1434
1437
10.1126/science.aah4972
27980210
The structure and flexibility of conical HIV-1 capsids determined within intact virions.
2016
RIGID BODY FIT
REAL
Cross-correlation coefficient
The final reconstruction is obtained by averaging, without further alignment, subtomograms that were selected based on the local curvature of the hexameric lattice. This reconstruction has hexamer-hexamer curvature parameters: tilt=29, twist=0.
5MDG
1
7445
8.7
FSC 0.143 CUT-OFF
POINT
7.4
PBS
CTF correction was performed using the ctfphaseflip program in IMOD prior to backprojection.
1
PHASE FLIPPING ONLY
HIV-1 particles were produced by infection of MT-4 cells with HIV-1 strain NL43 by coculture.
1, 2
Human immunodeficiency virus 1
0
NATURAL
VIRUS
11676
Human immunodeficiency virus 1
PARTICLE
1
1
SUBTOMOGRAM AVERAGING
Frames were aligned using MotionCorr.
Tilts in a tilt series were exposure filtered for cumulative electron dose. Tomograms were reconstructed using IMOD.
2.2
SUPER-RESOLUTION
GATAN K2 QUANTUM (4k x 4k)
1
3838
3710
5MDG
5
300
ZEMLIN TABLEAU
50
NITROGEN
Nanoprobe
FIELD EMISSION GUN
FLOOD BEAM
FEI TITAN KRIOS
BRIGHT FIELD
2.7
6500
2000
81000
FEI TITAN KRIOS AUTOGRID HOLDER
1
0
GIF Quantum LS
20
COPPER
300
C-flat
5MDG
C1
VOLUME SELECTION
1
IMAGE ACQUISITION
1
SerialEM
MASKING
CTF CORRECTION
1
IMOD
LAYERLINE INDEXING
DIFFRACTION INDEXING
MODEL FITTING
1
UCSF Chimera
MODEL FITTING
1
OTHER
MODEL REFINEMENT
1
INITIAL EULER ASSIGNMENT
1
FINAL EULER ASSIGNMENT
1
AV3
FINAL EULER ASSIGNMENT
1
TOM Toolbox
CLASSIFICATION
1
RECONSTRUCTION
1
AV3
RECONSTRUCTION
1
TOM Toolbox
Viral particles were purified from cell culture supernatant by iodixanol gradient centrifugation.
NO
NO
NO
YES
NO
YES
STRAIN
VIRION
9606
Homo sapiens
292
ETHANE
10nm colloidal gold was added to the sample prior to plunge freezing
5MDG
100
FEI VITROBOT MARK II
Subtomograms were extracted along the manually rendered core surface of each viral particle.
103
652618
reference free
8370.568
Gag protein
8
nat
polymer
16301.689
Gag protein
6
nat
polymer
Capsid protein p24 C-terminal domain
Capsid protein p24 N-terminal domain
no
no
TSILDIRQGPKEPFRDYVDRFYKTLRAEQASQEVKNWMTETLLVQNANPDCKTILKALGPGATLEEMMTACQGV
TSILDIRQGPKEPFRDYVDRFYKTLRAEQASQEVKNWMTETLLVQNANPDCKTILKALGPGATLEEMMTACQGV
A,B,F,W,C,D,E,G
polypeptide(L)
no
no
PIVQNLQGQMVHQAISPRTLNAWVKVVEEKAFSPEVIPMFSALSEGATPQDLNTMLNTVGGHQAAMQMLKETINEEAAEW
DRLHPVHAGPIAPGQMREPRGSDIAGTTSTLQEQIGWMTHNPPIPVGEIYKRWIILGLNKIVRMYSP
PIVQNLQGQMVHQAISPRTLNAWVKVVEEKAFSPEVIPMFSALSEGATPQDLNTMLNTVGGHQAAMQMLKETINEEAAEW
DRLHPVHAGPIAPGQMREPRGSDIAGTTSTLQEQIGWMTHNPPIPVGEIYKRWIILGLNKIVRMYSP
a,b,f,H,I,J
polypeptide(L)
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
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n
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n
n
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n
n
n
n
n
n
n
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n
n
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n
n
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n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
n
sample
1
MT-4
74
11676
Human immunodeficiency virus 1
NL43
sample
1
MT-4
147
11676
Human immunodeficiency virus 1
NL43
em_3d_fitting
em_imaging_optics
em_sample_support
em_software
pdbx_audit_support
repository
Initial release
Author supporting evidence
Data collection
Experimental preparation
Refinement description
1
0
2016-12-28
1
1
2017-08-30
_em_3d_fitting.target_criteria
_em_imaging_optics.energyfilter_name
_em_sample_support.grid_type
_em_software.name
_pdbx_audit_support.funding_organization
Germany
German Research Foundation
BR 3635/2-1
Germany
German Research Foundation
KR 906/7-1
The structure of the mature HIV-1 CA hexameric lattice with curvature parameters: tilt=29, twist=0
N
PDBE
Y
PDBE
2016-11-10
REL
THR
148
n
1
THR
148
A
SER
149
n
2
SER
149
A
ILE
150
n
3
ILE
150
A
LEU
151
n
4
LEU
151
A
ASP
152
n
5
ASP
152
A
ILE
153
n
6
ILE
153
A
ARG
154
n
7
ARG
154
A
GLN
155
n
8
GLN
155
A
GLY
156
n
9
GLY
156
A
PRO
157
n
10
PRO
157
A
LYS
158
n
11
LYS
158
A
GLU
159
n
12
GLU
159
A
PRO
160
n
13
PRO
160
A
PHE
161
n
14
PHE
161
A
ARG
162
n
15
ARG
162
A
ASP
163
n
16
ASP
163
A
TYR
164
n
17
TYR
164
A
VAL
165
n
18
VAL
165
A
ASP
166
n
19
ASP
166
A
ARG
167
n
20
ARG
167
A
PHE
168
n
21
PHE
168
A
TYR
169
n
22
TYR
169
A
LYS
170
n
23
LYS
170
A
THR
171
n
24
THR
171
A
LEU
172
n
25
LEU
172
A
ARG
173
n
26
ARG
173
A
ALA
174
n
27
ALA
174
A
GLU
175
n
28
GLU
175
A
GLN
176
n
29
GLN
176
A
ALA
177
n
30
ALA
177
A
SER
178
n
31
SER
178
A
GLN
179
n
32
GLN
179
A
GLU
180
n
33
GLU
180
A
VAL
181
n
34
VAL
181
A
LYS
182
n
35
LYS
182
A
ASN
183
n
36
ASN
183
A
TRP
184
n
37
TRP
184
A
MET
185
n
38
MET
185
A
THR
186
n
39
THR
186
A
GLU
187
n
40
GLU
187
A
THR
188
n
41
THR
188
A
LEU
189
n
42
LEU
189
A
LEU
190
n
43
LEU
190
A
VAL
191
n
44
VAL
191
A
GLN
192
n
45
GLN
192
A
ASN
193
n
46
ASN
193
A
ALA
194
n
47
ALA
194
A
ASN
195
n
48
ASN
195
A
PRO
196
n
49
PRO
196
A
ASP
197
n
50
ASP
197
A
CYS
198
n
51
CYS
198
A
LYS
199
n
52
LYS
199
A
THR
200
n
53
THR
200
A
ILE
201
n
54
ILE
201
A
LEU
202
n
55
LEU
202
A
LYS
203
n
56
LYS
203
A
ALA
204
n
57
ALA
204
A
LEU
205
n
58
LEU
205
A
GLY
206
n
59
GLY
206
A
PRO
207
n
60
PRO
207
A
GLY
208
n
61
GLY
208
A
ALA
209
n
62
ALA
209
A
THR
210
n
63
THR
210
A
LEU
211
n
64
LEU
211
A
GLU
212
n
65
GLU
212
A
GLU
213
n
66
GLU
213
A
MET
214
n
67
MET
214
A
MET
215
n
68
MET
215
A
THR
216
n
69
THR
216
A
ALA
217
n
70
ALA
217
A
CYS
218
n
71
CYS
218
A
GLN
219
n
72
GLN
219
A
GLY
220
n
73
GLY
220
A
VAL
221
n
74
VAL
221
A
THR
148
n
1
THR
148
B
SER
149
n
2
SER
149
B
ILE
150
n
3
ILE
150
B
LEU
151
n
4
LEU
151
B
ASP
152
n
5
ASP
152
B
ILE
153
n
6
ILE
153
B
ARG
154
n
7
ARG
154
B
GLN
155
n
8
GLN
155
B
GLY
156
n
9
GLY
156
B
PRO
157
n
10
PRO
157
B
LYS
158
n
11
LYS
158
B
GLU
159
n
12
GLU
159
B
PRO
160
n
13
PRO
160
B
PHE
161
n
14
PHE
161
B
ARG
162
n
15
ARG
162
B
ASP
163
n
16
ASP
163
B
TYR
164
n
17
TYR
164
B
VAL
165
n
18
VAL
165
B
ASP
166
n
19
ASP
166
B
ARG
167
n
20
ARG
167
B
PHE
168
n
21
PHE
168
B
TYR
169
n
22
TYR
169
B
LYS
170
n
23
LYS
170
B
THR
171
n
24
THR
171
B
LEU
172
n
25
LEU
172
B
ARG
173
n
26
ARG
173
B
ALA
174
n
27
ALA
174
B
GLU
175
n
28
GLU
175
B
GLN
176
n
29
GLN
176
B
ALA
177
n
30
ALA
177
B
SER
178
n
31
SER
178
B
GLN
179
n
32
GLN
179
B
GLU
180
n
33
GLU
180
B
VAL
181
n
34
VAL
181
B
LYS
182
n
35
LYS
182
B
ASN
183
n
36
ASN
183
B
TRP
184
n
37
TRP
184
B
MET
185
n
38
MET
185
B
THR
186
n
39
THR
186
B
GLU
187
n
40
GLU
187
B
THR
188
n
41
THR
188
B
LEU
189
n
42
LEU
189
B
LEU
190
n
43
LEU
190
B
VAL
191
n
44
VAL
191
B
GLN
192
n
45
GLN
192
B
ASN
193
n
46
ASN
193
B
ALA
194
n
47
ALA
194
B
ASN
195
n
48
ASN
195
B
PRO
196
n
49
PRO
196
B
ASP
197
n
50
ASP
197
B
CYS
198
n
51
CYS
198
B
LYS
199
n
52
LYS
199
B
THR
200
n
53
THR
200
B
ILE
201
n
54
ILE
201
B
LEU
202
n
55
LEU
202
B
LYS
203
n
56
LYS
203
B
ALA
204
n
57
ALA
204
B
LEU
205
n
58
LEU
205
B
GLY
206
n
59
GLY
206
B
PRO
207
n
60
PRO
207
B
GLY
208
n
61
GLY
208
B
ALA
209
n
62
ALA
209
B
THR
210
n
63
THR
210
B
LEU
211
n
64
LEU
211
B
GLU
212
n
65
GLU
212
B
GLU
213
n
66
GLU
213
B
MET
214
n
67
MET
214
B
MET
215
n
68
MET
215
B
THR
216
n
69
THR
216
B
ALA
217
n
70
ALA
217
B
CYS
218
n
71
CYS
218
B
GLN
219
n
72
GLN
219
B
GLY
220
n
73
GLY
220
B
VAL
221
n
74
VAL
221
B
THR
148
n
1
THR
148
F
SER
149
n
2
SER
149
F
ILE
150
n
3
ILE
150
F
LEU
151
n
4
LEU
151
F
ASP
152
n
5
ASP
152
F
ILE
153
n
6
ILE
153
F
ARG
154
n
7
ARG
154
F
GLN
155
n
8
GLN
155
F
GLY
156
n
9
GLY
156
F
PRO
157
n
10
PRO
157
F
LYS
158
n
11
LYS
158
F
GLU
159
n
12
GLU
159
F
PRO
160
n
13
PRO
160
F
PHE
161
n
14
PHE
161
F
ARG
162
n
15
ARG
162
F
ASP
163
n
16
ASP
163
F
TYR
164
n
17
TYR
164
F
VAL
165
n
18
VAL
165
F
ASP
166
n
19
ASP
166
F
ARG
167
n
20
ARG
167
F
PHE
168
n
21
PHE
168
F
TYR
169
n
22
TYR
169
F
LYS
170
n
23
LYS
170
F
THR
171
n
24
THR
171
F
LEU
172
n
25
LEU
172
F
ARG
173
n
26
ARG
173
F
ALA
174
n
27
ALA
174
F
GLU
175
n
28
GLU
175
F
GLN
176
n
29
GLN
176
F
ALA
177
n
30
ALA
177
F
SER
178
n
31
SER
178
F
GLN
179
n
32
GLN
179
F
GLU
180
n
33
GLU
180
F
VAL
181
n
34
VAL
181
F
LYS
182
n
35
LYS
182
F
ASN
183
n
36
ASN
183
F
TRP
184
n
37
TRP
184
F
MET
185
n
38
MET
185
F
THR
186
n
39
THR
186
F
GLU
187
n
40
GLU
187
F
THR
188
n
41
THR
188
F
LEU
189
n
42
LEU
189
F
LEU
190
n
43
LEU
190
F
VAL
191
n
44
VAL
191
F
GLN
192
n
45
GLN
192
F
ASN
193
n
46
ASN
193
F
ALA
194
n
47
ALA
194
F
ASN
195
n
48
ASN
195
F
PRO
196
n
49
PRO
196
F
ASP
197
n
50
ASP
197
F
CYS
198
n
51
CYS
198
F
LYS
199
n
52
LYS
199
F
THR
200
n
53
THR
200
F
ILE
201
n
54
ILE
201
F
LEU
202
n
55
LEU
202
F
LYS
203
n
56
LYS
203
F
ALA
204
n
57
ALA
204
F
LEU
205
n
58
LEU
205
F
GLY
206
n
59
GLY
206
F
PRO
207
n
60
PRO
207
F
GLY
208
n
61
GLY
208
F
ALA
209
n
62
ALA
209
F
THR
210
n
63
THR
210
F
LEU
211
n
64
LEU
211
F
GLU
212
n
65
GLU
212
F
GLU
213
n
66
GLU
213
F
MET
214
n
67
MET
214
F
MET
215
n
68
MET
215
F
THR
216
n
69
THR
216
F
ALA
217
n
70
ALA
217
F
CYS
218
n
71
CYS
218
F
GLN
219
n
72
GLN
219
F
GLY
220
n
73
GLY
220
F
VAL
221
n
74
VAL
221
F
THR
148
n
1
THR
148
W
SER
149
n
2
SER
149
W
ILE
150
n
3
ILE
150
W
LEU
151
n
4
LEU
151
W
ASP
152
n
5
ASP
152
W
ILE
153
n
6
ILE
153
W
ARG
154
n
7
ARG
154
W
GLN
155
n
8
GLN
155
W
GLY
156
n
9
GLY
156
W
PRO
157
n
10
PRO
157
W
LYS
158
n
11
LYS
158
W
GLU
159
n
12
GLU
159
W
PRO
160
n
13
PRO
160
W
PHE
161
n
14
PHE
161
W
ARG
162
n
15
ARG
162
W
ASP
163
n
16
ASP
163
W
TYR
164
n
17
TYR
164
W
VAL
165
n
18
VAL
165
W
ASP
166
n
19
ASP
166
W
ARG
167
n
20
ARG
167
W
PHE
168
n
21
PHE
168
W
TYR
169
n
22
TYR
169
W
LYS
170
n
23
LYS
170
W
THR
171
n
24
THR
171
W
LEU
172
n
25
LEU
172
W
ARG
173
n
26
ARG
173
W
ALA
174
n
27
ALA
174
W
GLU
175
n
28
GLU
175
W
GLN
176
n
29
GLN
176
W
ALA
177
n
30
ALA
177
W
SER
178
n
31
SER
178
W
GLN
179
n
32
GLN
179
W
GLU
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n
33
GLU
180
W
VAL
181
n
34
VAL
181
W
LYS
182
n
35
LYS
182
W
ASN
183
n
36
ASN
183
W
TRP
184
n
37
TRP
184
W
MET
185
n
38
MET
185
W
THR
186
n
39
THR
186
W
GLU
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n
40
GLU
187
W
THR
188
n
41
THR
188
W
LEU
189
n
42
LEU
189
W
LEU
190
n
43
LEU
190
W
VAL
191
n
44
VAL
191
W
GLN
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n
45
GLN
192
W
ASN
193
n
46
ASN
193
W
ALA
194
n
47
ALA
194
W
ASN
195
n
48
ASN
195
W
PRO
196
n
49
PRO
196
W
ASP
197
n
50
ASP
197
W
CYS
198
n
51
CYS
198
W
LYS
199
n
52
LYS
199
W
THR
200
n
53
THR
200
W
ILE
201
n
54
ILE
201
W
LEU
202
n
55
LEU
202
W
LYS
203
n
56
LYS
203
W
ALA
204
n
57
ALA
204
W
LEU
205
n
58
LEU
205
W
GLY
206
n
59
GLY
206
W
PRO
207
n
60
PRO
207
W
GLY
208
n
61
GLY
208
W
ALA
209
n
62
ALA
209
W
THR
210
n
63
THR
210
W
LEU
211
n
64
LEU
211
W
GLU
212
n
65
GLU
212
W
GLU
213
n
66
GLU
213
W
MET
214
n
67
MET
214
W
MET
215
n
68
MET
215
W
THR
216
n
69
THR
216
W
ALA
217
n
70
ALA
217
W
CYS
218
n
71
CYS
218
W
GLN
219
n
72
GLN
219
W
GLY
220
n
73
GLY
220
W
VAL
221
n
74
VAL
221
W
PRO
1
n
1
PRO
1
a
ILE
2
n
2
ILE
2
a
VAL
3
n
3
VAL
3
a
GLN
4
n
4
GLN
4
a
ASN
5
n
5
ASN
5
a
LEU
6
n
6
LEU
6
a
GLN
7
n
7
GLN
7
a
GLY
8
n
8
GLY
8
a
GLN
9
n
9
GLN
9
a
MET
10
n
10
MET
10
a
VAL
11
n
11
VAL
11
a
HIS
12
n
12
HIS
12
a
GLN
13
n
13
GLN
13
a
ALA
14
n
14
ALA
14
a
ILE
15
n
15
ILE
15
a
SER
16
n
16
SER
16
a
PRO
17
n
17
PRO
17
a
ARG
18
n
18
ARG
18
a
THR
19
n
19
THR
19
a
LEU
20
n
20
LEU
20
a
ASN
21
n
21
ASN
21
a
ALA
22
n
22
ALA
22
a
TRP
23
n
23
TRP
23
a
VAL
24
n
24
VAL
24
a
LYS
25
n
25
LYS
25
a
VAL
26
n
26
VAL
26
a
VAL
27
n
27
VAL
27
a
GLU
28
n
28
GLU
28
a
GLU
29
n
29
GLU
29
a
LYS
30
n
30
LYS
30
a
ALA
31
n
31
ALA
31
a
PHE
32
n
32
PHE
32
a
SER
33
n
33
SER
33
a
PRO
34
n
34
PRO
34
a
GLU
35
n
35
GLU
35
a
VAL
36
n
36
VAL
36
a
ILE
37
n
37
ILE
37
a
PRO
38
n
38
PRO
38
a
MET
39
n
39
MET
39
a
PHE
40
n
40
PHE
40
a
SER
41
n
41
SER
41
a
ALA
42
n
42
ALA
42
a
LEU
43
n
43
LEU
43
a
SER
44
n
44
SER
44
a
GLU
45
n
45
GLU
45
a
GLY
46
n
46
GLY
46
a
ALA
47
n
47
ALA
47
a
THR
48
n
48
THR
48
a
PRO
49
n
49
PRO
49
a
GLN
50
n
50
GLN
50
a
ASP
51
n
51
ASP
51
a
LEU
52
n
52
LEU
52
a
ASN
53
n
53
ASN
53
a
THR
54
n
54
THR
54
a
MET
55
n
55
MET
55
a
LEU
56
n
56
LEU
56
a
ASN
57
n
57
ASN
57
a
THR
58
n
58
THR
58
a
VAL
59
n
59
VAL
59
a
GLY
60
n
60
GLY
60
a
GLY
61
n
61
GLY
61
a
HIS
62
n
62
HIS
62
a
GLN
63
n
63
GLN
63
a
ALA
64
n
64
ALA
64
a
ALA
65
n
65
ALA
65
a
MET
66
n
66
MET
66
a
GLN
67
n
67
GLN
67
a
MET
68
n
68
MET
68
a
LEU
69
n
69
LEU
69
a
LYS
70
n
70
LYS
70
a
GLU
71
n
71
GLU
71
a
THR
72
n
72
THR
72
a
ILE
73
n
73
ILE
73
a
ASN
74
n
74
ASN
74
a
GLU
75
n
75
GLU
75
a
GLU
76
n
76
GLU
76
a
ALA
77
n
77
ALA
77
a
ALA
78
n
78
ALA
78
a
GLU
79
n
79
GLU
79
a
TRP
80
n
80
TRP
80
a
ASP
81
n
81
ASP
81
a
ARG
82
n
82
ARG
82
a
LEU
83
n
83
LEU
83
a
HIS
84
n
84
HIS
84
a
PRO
85
n
85
PRO
85
a
VAL
86
n
86
VAL
86
a
HIS
87
n
87
HIS
87
a
ALA
88
n
88
ALA
88
a
GLY
89
n
89
GLY
89
a
PRO
90
n
90
PRO
90
a
ILE
91
n
91
ILE
91
a
ALA
92
n
92
ALA
92
a
PRO
93
n
93
PRO
93
a
GLY
94
n
94
GLY
94
a
GLN
95
n
95
GLN
95
a
MET
96
n
96
MET
96
a
ARG
97
n
97
ARG
97
a
GLU
98
n
98
GLU
98
a
PRO
99
n
99
PRO
99
a
ARG
100
n
100
ARG
100
a
GLY
101
n
101
GLY
101
a
SER
102
n
102
SER
102
a
ASP
103
n
103
ASP
103
a
ILE
104
n
104
ILE
104
a
ALA
105
n
105
ALA
105
a
GLY
106
n
106
GLY
106
a
THR
107
n
107
THR
107
a
THR
108
n
108
THR
108
a
SER
109
n
109
SER
109
a
THR
110
n
110
THR
110
a
LEU
111
n
111
LEU
111
a
GLN
112
n
112
GLN
112
a
GLU
113
n
113
GLU
113
a
GLN
114
n
114
GLN
114
a
ILE
115
n
115
ILE
115
a
GLY
116
n
116
GLY
116
a
TRP
117
n
117
TRP
117
a
MET
118
n
118
MET
118
a
THR
119
n
119
THR
119
a
HIS
120
n
120
HIS
120
a
ASN
121
n
121
ASN
121
a
PRO
122
n
122
PRO
122
a
PRO
123
n
123
PRO
123
a
ILE
124
n
124
ILE
124
a
PRO
125
n
125
PRO
125
a
VAL
126
n
126
VAL
126
a
GLY
127
n
127
GLY
127
a
GLU
128
n
128
GLU
128
a
ILE
129
n
129
ILE
129
a
TYR
130
n
130
TYR
130
a
LYS
131
n
131
LYS
131
a
ARG
132
n
132
ARG
132
a
TRP
133
n
133
TRP
133
a
ILE
134
n
134
ILE
134
a
ILE
135
n
135
ILE
135
a
LEU
136
n
136
LEU
136
a
GLY
137
n
137
GLY
137
a
LEU
138
n
138
LEU
138
a
ASN
139
n
139
ASN
139
a
LYS
140
n
140
LYS
140
a
ILE
141
n
141
ILE
141
a
VAL
142
n
142
VAL
142
a
ARG
143
n
143
ARG
143
a
MET
144
n
144
MET
144
a
TYR
145
n
145
TYR
145
a
SER
146
n
146
SER
146
a
PRO
147
n
147
PRO
147
a
PRO
1
n
1
PRO
1
b
ILE
2
n
2
ILE
2
b
VAL
3
n
3
VAL
3
b
GLN
4
n
4
GLN
4
b
ASN
5
n
5
ASN
5
b
LEU
6
n
6
LEU
6
b
GLN
7
n
7
GLN
7
b
GLY
8
n
8
GLY
8
b
GLN
9
n
9
GLN
9
b
MET
10
n
10
MET
10
b
VAL
11
n
11
VAL
11
b
HIS
12
n
12
HIS
12
b
GLN
13
n
13
GLN
13
b
ALA
14
n
14
ALA
14
b
ILE
15
n
15
ILE
15
b
SER
16
n
16
SER
16
b
PRO
17
n
17
PRO
17
b
ARG
18
n
18
ARG
18
b
THR
19
n
19
THR
19
b
LEU
20
n
20
LEU
20
b
ASN
21
n
21
ASN
21
b
ALA
22
n
22
ALA
22
b
TRP
23
n
23
TRP
23
b
VAL
24
n
24
VAL
24
b
LYS
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n
25
LYS
25
b
VAL
26
n
26
VAL
26
b
VAL
27
n
27
VAL
27
b
GLU
28
n
28
GLU
28
b
GLU
29
n
29
GLU
29
b
LYS
30
n
30
LYS
30
b
ALA
31
n
31
ALA
31
b
PHE
32
n
32
PHE
32
b
SER
33
n
33
SER
33
b
PRO
34
n
34
PRO
34
b
GLU
35
n
35
GLU
35
b
VAL
36
n
36
VAL
36
b
ILE
37
n
37
ILE
37
b
PRO
38
n
38
PRO
38
b
MET
39
n
39
MET
39
b
PHE
40
n
40
PHE
40
b
SER
41
n
41
SER
41
b
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42
n
42
ALA
42
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n
43
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43
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44
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44
SER
44
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n
45
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45
b
GLY
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n
46
GLY
46
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n
47
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THR
48
n
48
THR
48
b
PRO
49
n
49
PRO
49
b
GLN
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n
50
GLN
50
b
ASP
51
n
51
ASP
51
b
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52
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52
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53
n
53
ASN
53
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THR
54
n
54
THR
54
b
MET
55
n
55
MET
55
b
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56
n
56
LEU
56
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ASN
57
n
57
ASN
57
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THR
58
n
58
THR
58
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59
n
59
VAL
59
b
GLY
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n
60
GLY
60
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GLY
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n
61
GLY
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62
n
62
HIS
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n
63
GLN
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64
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n
65
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n
66
MET
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67
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68
MET
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n
69
LEU
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n
70
LYS
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GLU
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n
71
GLU
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THR
72
n
72
THR
72
b
ILE
73
n
73
ILE
73
b
ASN
74
n
74
ASN
74
b
GLU
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n
75
GLU
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b
GLU
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n
76
GLU
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n
77
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ALA
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n
78
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GLU
79
n
79
GLU
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b
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n
80
TRP
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n
81
ASP
81
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82
n
82
ARG
82
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n
83
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84
n
84
HIS
84
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n
85
PRO
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86
n
86
VAL
86
b
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87
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88
ALA
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b
GLY
89
n
89
GLY
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b
PRO
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n
90
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90
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ILE
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n
91
ILE
91
b
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n
92
ALA
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n
93
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n
95
GLN
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n
96
MET
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n
97
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n
98
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n
99
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n
100
ARG
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n
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n
102
SER
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n
103
ASP
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n
104
ILE
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n
105
ALA
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n
106
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107
n
107
THR
107
b
THR
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n
108
THR
108
b
SER
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n
109
SER
109
b
THR
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n
110
THR
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b
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n
111
LEU
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112
GLN
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n
113
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b
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114
GLN
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n
115
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n
116
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117
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n
118
MET
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THR
119
n
119
THR
119
b
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120
n
120
HIS
120
b
ASN
121
n
121
ASN
121
b
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122
n
122
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122
b
PRO
123
n
123
PRO
123
b
ILE
124
n
124
ILE
124
b
PRO
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n
125
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125
b
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126
n
126
VAL
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127
n
127
GLY
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b
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n
128
GLU
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n
129
ILE
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b
TYR
130
n
130
TYR
130
b
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n
131
LYS
131
b
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132
n
132
ARG
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b
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133
n
133
TRP
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b
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134
n
134
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134
b
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n
135
ILE
135
b
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n
136
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b
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n
137
GLY
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n
138
LEU
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b
ASN
139
n
139
ASN
139
b
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140
n
140
LYS
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b
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n
141
ILE
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b
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n
142
VAL
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n
143
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143
b
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n
144
MET
144
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TYR
145
n
145
TYR
145
b
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146
n
146
SER
146
b
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147
n
147
PRO
147
b
PRO
1
n
1
PRO
1
f
ILE
2
n
2
ILE
2
f
VAL
3
n
3
VAL
3
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GLN
4
n
4
GLN
4
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ASN
5
n
5
ASN
5
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6
n
6
LEU
6
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GLN
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n
7
GLN
7
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8
n
8
GLY
8
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GLN
9
n
9
GLN
9
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MET
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n
10
MET
10
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n
11
VAL
11
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HIS
12
n
12
HIS
12
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GLN
13
n
13
GLN
13
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ALA
14
n
14
ALA
14
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15
n
15
ILE
15
f
SER
16
n
16
SER
16
f
PRO
17
n
17
PRO
17
f
ARG
18
n
18
ARG
18
f
THR
19
n
19
THR
19
f
LEU
20
n
20
LEU
20
f
ASN
21
n
21
ASN
21
f
ALA
22
n
22
ALA
22
f
TRP
23
n
23
TRP
23
f
VAL
24
n
24
VAL
24
f
LYS
25
n
25
LYS
25
f
VAL
26
n
26
VAL
26
f
VAL
27
n
27
VAL
27
f
GLU
28
n
28
GLU
28
f
GLU
29
n
29
GLU
29
f
LYS
30
n
30
LYS
30
f
ALA
31
n
31
ALA
31
f
PHE
32
n
32
PHE
32
f
SER
33
n
33
SER
33
f
PRO
34
n
34
PRO
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35
n
35
GLU
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36
n
36
VAL
36
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ILE
37
n
37
ILE
37
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PRO
38
n
38
PRO
38
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MET
39
n
39
MET
39
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PHE
40
n
40
PHE
40
f
SER
41
n
41
SER
41
f
ALA
42
n
42
ALA
42
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LEU
43
n
43
LEU
43
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SER
44
n
44
SER
44
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GLU
45
n
45
GLU
45
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GLY
46
n
46
GLY
46
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ALA
47
n
47
ALA
47
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THR
48
n
48
THR
48
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PRO
49
n
49
PRO
49
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GLN
50
n
50
GLN
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ASP
51
n
51
ASP
51
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52
n
52
LEU
52
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ASN
53
n
53
ASN
53
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THR
54
n
54
THR
54
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MET
55
n
55
MET
55
f
LEU
56
n
56
LEU
56
f
ASN
57
n
57
ASN
57
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THR
58
n
58
THR
58
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VAL
59
n
59
VAL
59
f
GLY
60
n
60
GLY
60
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GLY
61
n
61
GLY
61
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HIS
62
n
62
HIS
62
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GLN
63
n
63
GLN
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ALA
64
n
64
ALA
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ALA
65
n
65
ALA
65
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MET
66
n
66
MET
66
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GLN
67
n
67
GLN
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MET
68
n
68
MET
68
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LEU
69
n
69
LEU
69
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LYS
70
n
70
LYS
70
f
GLU
71
n
71
GLU
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f
THR
72
n
72
THR
72
f
ILE
73
n
73
ILE
73
f
ASN
74
n
74
ASN
74
f
GLU
75
n
75
GLU
75
f
GLU
76
n
76
GLU
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77
n
77
ALA
77
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ALA
78
n
78
ALA
78
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GLU
79
n
79
GLU
79
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TRP
80
n
80
TRP
80
f
ASP
81
n
81
ASP
81
f
ARG
82
n
82
ARG
82
f
LEU
83
n
83
LEU
83
f
HIS
84
n
84
HIS
84
f
PRO
85
n
85
PRO
85
f
VAL
86
n
86
VAL
86
f
HIS
87
n
87
HIS
87
f
ALA
88
n
88
ALA
88
f
GLY
89
n
89
GLY
89
f
PRO
90
n
90
PRO
90
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ILE
91
n
91
ILE
91
f
ALA
92
n
92
ALA
92
f
PRO
93
n
93
PRO
93
f
GLY
94
n
94
GLY
94
f
GLN
95
n
95
GLN
95
f
MET
96
n
96
MET
96
f
ARG
97
n
97
ARG
97
f
GLU
98
n
98
GLU
98
f
PRO
99
n
99
PRO
99
f
ARG
100
n
100
ARG
100
f
GLY
101
n
101
GLY
101
f
SER
102
n
102
SER
102
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ASP
103
n
103
ASP
103
f
ILE
104
n
104
ILE
104
f
ALA
105
n
105
ALA
105
f
GLY
106
n
106
GLY
106
f
THR
107
n
107
THR
107
f
THR
108
n
108
THR
108
f
SER
109
n
109
SER
109
f
THR
110
n
110
THR
110
f
LEU
111
n
111
LEU
111
f
GLN
112
n
112
GLN
112
f
GLU
113
n
113
GLU
113
f
GLN
114
n
114
GLN
114
f
ILE
115
n
115
ILE
115
f
GLY
116
n
116
GLY
116
f
TRP
117
n
117
TRP
117
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MET
118
n
118
MET
118
f
THR
119
n
119
THR
119
f
HIS
120
n
120
HIS
120
f
ASN
121
n
121
ASN
121
f
PRO
122
n
122
PRO
122
f
PRO
123
n
123
PRO
123
f
ILE
124
n
124
ILE
124
f
PRO
125
n
125
PRO
125
f
VAL
126
n
126
VAL
126
f
GLY
127
n
127
GLY
127
f
GLU
128
n
128
GLU
128
f
ILE
129
n
129
ILE
129
f
TYR
130
n
130
TYR
130
f
LYS
131
n
131
LYS
131
f
ARG
132
n
132
ARG
132
f
TRP
133
n
133
TRP
133
f
ILE
134
n
134
ILE
134
f
ILE
135
n
135
ILE
135
f
LEU
136
n
136
LEU
136
f
GLY
137
n
137
GLY
137
f
LEU
138
n
138
LEU
138
f
ASN
139
n
139
ASN
139
f
LYS
140
n
140
LYS
140
f
ILE
141
n
141
ILE
141
f
VAL
142
n
142
VAL
142
f
ARG
143
n
143
ARG
143
f
MET
144
n
144
MET
144
f
TYR
145
n
145
TYR
145
f
SER
146
n
146
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146
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n
147
PRO
147
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148
n
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148
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SER
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n
2
SER
149
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n
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n
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n
6
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n
7
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n
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155
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n
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n
10
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n
11
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n
12
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n
13
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n
14
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ARG
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n
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ASP
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n
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167
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n
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168
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22
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n
23
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n
25
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n
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n
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n
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ALA
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n
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n
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n
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n
49
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n
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n
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n
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n
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n
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n
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n
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ALA
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n
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n
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n
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n
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n
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D
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D
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n
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n
31
SER
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GLN
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n
32
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D
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33
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n
34
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D
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n
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MET
185
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n
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THR
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n
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ASN
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47
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n
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ASN
195
D
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n
49
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196
D
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n
50
ASP
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n
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52
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n
53
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n
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55
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n
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n
58
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n
59
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n
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n
61
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n
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n
63
THR
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n
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n
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n
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n
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ALA
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71
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n
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n
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n
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n
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E
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n
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E
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n
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E
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n
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ASP
152
E
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153
n
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ILE
153
E
ARG
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n
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E
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n
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n
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n
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n
11
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n
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n
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n
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ARG
162
n
15
ARG
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E
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n
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n
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n
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ASP
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n
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n
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n
37
TRP
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MET
185
E
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186
n
39
THR
186
E
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n
40
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n
41
THR
188
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43
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n
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E
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n
49
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n
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E
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n
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n
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n
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n
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n
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n
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n
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n
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n
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E
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n
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n
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n
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n
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n
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n
71
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n
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n
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n
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149
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n
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n
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n
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n
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G
ARG
154
n
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G
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n
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n
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n
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n
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n
14
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ARG
162
n
15
ARG
162
G
ASP
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n
16
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164
n
17
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n
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ASP
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n
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ASP
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n
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G
PHE
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n
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n
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n
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n
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G
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n
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n
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SER
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n
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n
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n
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MET
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n
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186
G
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187
n
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GLU
187
G
THR
188
n
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THR
188
G
LEU
189
n
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LEU
189
G
LEU
190
n
43
LEU
190
G
VAL
191
n
44
VAL
191
G
GLN
192
n
45
GLN
192
G
ASN
193
n
46
ASN
193
G
ALA
194
n
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ALA
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G
ASN
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n
48
ASN
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PRO
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n
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n
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CYS
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n
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CYS
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G
LYS
199
n
52
LYS
199
G
THR
200
n
53
THR
200
G
ILE
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n
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ILE
201
G
LEU
202
n
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LEU
202
G
LYS
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n
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LYS
203
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n
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LEU
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n
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205
G
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n
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GLY
206
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n
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PRO
207
G
GLY
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n
61
GLY
208
G
ALA
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n
62
ALA
209
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THR
210
n
63
THR
210
G
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n
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LEU
211
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GLU
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G
GLU
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n
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n
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MET
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MET
215
n
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MET
215
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THR
216
n
69
THR
216
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ALA
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n
70
ALA
217
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CYS
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n
71
CYS
218
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GLN
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n
72
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n
73
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n
74
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n
1
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n
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n
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ASN
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n
8
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n
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n
12
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n
13
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n
14
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n
15
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SER
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n
16
SER
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n
17
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n
18
ARG
18
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n
19
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n
21
ASN
21
H
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n
22
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n
23
TRP
23
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n
24
VAL
24
H
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n
25
LYS
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VAL
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n
26
VAL
26
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n
27
VAL
27
H
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n
28
GLU
28
H
GLU
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n
29
GLU
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H
LYS
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n
30
LYS
30
H
ALA
31
n
31
ALA
31
H
PHE
32
n
32
PHE
32
H
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33
n
33
SER
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H
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34
n
34
PRO
34
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n
35
GLU
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H
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n
36
VAL
36
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n
37
ILE
37
H
PRO
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n
38
PRO
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39
n
39
MET
39
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PHE
40
n
40
PHE
40
H
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n
41
SER
41
H
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n
42
ALA
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n
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n
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n
46
GLY
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n
48
THR
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PRO
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n
49
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n
50
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n
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ASP
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n
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THR
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55
MET
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n
59
VAL
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n
60
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61
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62
HIS
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n
66
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68
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n
69
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n
70
LYS
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n
71
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THR
72
n
72
THR
72
H
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n
73
ILE
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H
ASN
74
n
74
ASN
74
H
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n
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n
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n
80
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n
81
ASP
81
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n
82
ARG
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83
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84
HIS
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n
85
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n
86
VAL
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87
HIS
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89
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n
91
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96
MET
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n
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n
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n
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n
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n
105
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n
106
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n
107
THR
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THR
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n
108
THR
108
H
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n
109
SER
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H
THR
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110
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110
H
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n
111
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n
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n
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n
117
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n
118
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n
119
THR
119
H
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n
120
HIS
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ASN
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n
121
ASN
121
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n
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n
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n
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n
125
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n
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n
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n
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n
130
TYR
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n
131
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n
132
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n
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n
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n
135
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n
136
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H
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n
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H
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n
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n
139
ASN
139
H
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n
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H
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n
141
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n
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VAL
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n
143
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143
H
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n
144
MET
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H
TYR
145
n
145
TYR
145
H
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n
146
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146
H
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n
147
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PRO
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n
1
PRO
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I
ILE
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n
2
ILE
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n
3
VAL
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n
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GLN
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ASN
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n
5
ASN
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n
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GLN
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n
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n
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GLY
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GLN
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n
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GLN
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n
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MET
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n
11
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n
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n
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n
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n
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n
16
SER
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PRO
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n
17
PRO
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ARG
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n
18
ARG
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THR
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n
19
THR
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I
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n
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ASN
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n
21
ASN
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n
22
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n
23
TRP
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n
24
VAL
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n
25
LYS
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VAL
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n
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VAL
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VAL
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n
27
VAL
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I
GLU
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n
28
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n
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n
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ALA
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n
31
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n
32
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n
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n
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n
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VAL
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n
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n
39
MET
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PHE
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n
40
PHE
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SER
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n
41
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n
42
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n
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n
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n
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GLY
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n
46
GLY
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ALA
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n
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n
48
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n
49
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GLN
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n
50
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n
51
ASP
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n
52
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ASN
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n
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ASN
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n
54
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MET
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n
55
MET
55
I
LEU
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n
56
LEU
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ASN
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n
57
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VAL
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n
59
VAL
59
I
GLY
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n
60
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GLY
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n
61
GLY
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HIS
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n
62
HIS
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n
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n
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ALA
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n
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n
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68
MET
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n
69
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LYS
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n
70
LYS
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GLU
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n
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THR
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n
72
THR
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I
ILE
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n
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I
ASN
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n
74
ASN
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GLU
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n
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n
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n
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80
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ASP
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n
81
ASP
81
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ARG
82
n
82
ARG
82
I
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83
n
83
LEU
83
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HIS
84
n
84
HIS
84
I
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n
85
PRO
85
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n
86
VAL
86
I
HIS
87
n
87
HIS
87
I
ALA
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n
88
ALA
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I
GLY
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n
89
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I
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n
91
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n
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ALA
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n
93
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GLY
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n
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n
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MET
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n
96
MET
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I
ARG
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n
97
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n
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n
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n
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GLY
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n
101
GLY
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n
103
ASP
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n
104
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n
105
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105
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n
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THR
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SER
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n
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SER
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THR
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n
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THR
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I
LEU
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n
111
LEU
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I
GLN
112
n
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GLN
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GLU
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n
113
GLU
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I
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n
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n
116
GLY
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n
117
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1
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SG
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CE
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A
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A
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GLU
65
1
Y
1
A
CG
GLU
212
A
CG
GLU
65
1
Y
1
A
CD
GLU
212
A
CD
GLU
65
1
Y
1
A
OE1
GLU
212
A
OE1
GLU
65
1
Y
1
A
OE2
GLU
212
A
OE2
GLU
65
1
Y
1
A
CB
GLU
213
A
CB
GLU
66
1
Y
1
A
CG
GLU
213
A
CG
GLU
66
1
Y
1
A
CD
GLU
213
A
CD
GLU
66
1
Y
1
A
OE1
GLU
213
A
OE1
GLU
66
1
Y
1
A
OE2
GLU
213
A
OE2
GLU
66
1
Y
1
A
CB
MET
214
A
CB
MET
67
1
Y
1
A
CG
MET
214
A
CG
MET
67
1
Y
1
A
SD
MET
214
A
SD
MET
67
1
Y
1
A
CE
MET
214
A
CE
MET
67
1
Y
1
A
CB
MET
215
A
CB
MET
68
1
Y
1
A
CG
MET
215
A
CG
MET
68
1
Y
1
A
SD
MET
215
A
SD
MET
68
1
Y
1
A
CE
MET
215
A
CE
MET
68
1
Y
1
A
CB
THR
216
A
CB
THR
69
1
Y
1
A
OG1
THR
216
A
OG1
THR
69
1
Y
1
A
CG2
THR
216
A
CG2
THR
69
1
Y
1
A
CB
ALA
217
A
CB
ALA
70
1
Y
1
A
CB
CYS
218
A
CB
CYS
71
1
Y
1
A
SG
CYS
218
A
SG
CYS
71
1
Y
1
A
CB
GLN
219
A
CB
GLN
72
1
Y
1
A
CG
GLN
219
A
CG
GLN
72
1
Y
1
A
CD
GLN
219
A
CD
GLN
72
1
Y
1
A
OE1
GLN
219
A
OE1
GLN
72
1
Y
1
A
NE2
GLN
219
A
NE2
GLN
72
1
Y
1
A
O
VAL
221
A
O
VAL
74
1
Y
1
A
CB
VAL
221
A
CB
VAL
74
1
Y
1
A
CG1
VAL
221
A
CG1
VAL
74
1
Y
1
A
CG2
VAL
221
A
CG2
VAL
74
1
Y
1
B
CB
THR
148
B
CB
THR
1
1
Y
1
B
OG1
THR
148
B
OG1
THR
1
1
Y
1
B
CG2
THR
148
B
CG2
THR
1
1
Y
1
B
CB
SER
149
B
CB
SER
2
1
Y
1
B
OG
SER
149
B
OG
SER
2
1
Y
1
B
CB
ILE
150
B
CB
ILE
3
1
Y
1
B
CG1
ILE
150
B
CG1
ILE
3
1
Y
1
B
CG2
ILE
150
B
CG2
ILE
3
1
Y
1
B
CD1
ILE
150
B
CD1
ILE
3
1
Y
1
B
CB
LEU
151
B
CB
LEU
4
1
Y
1
B
CG
LEU
151
B
CG
LEU
4
1
Y
1
B
CD1
LEU
151
B
CD1
LEU
4
1
Y
1
B
CD2
LEU
151
B
CD2
LEU
4
1
Y
1
B
CB
ASP
152
B
CB
ASP
5
1
Y
1
B
CG
ASP
152
B
CG
ASP
5
1
Y
1
B
OD1
ASP
152
B
OD1
ASP
5
1
Y
1
B
OD2
ASP
152
B
OD2
ASP
5
1
Y
1
B
CB
ILE
153
B
CB
ILE
6
1
Y
1
B
CG1
ILE
153
B
CG1
ILE
6
1
Y
1
B
CG2
ILE
153
B
CG2
ILE
6
1
Y
1
B
CD1
ILE
153
B
CD1
ILE
6
1
Y
1
B
CB
ARG
154
B
CB
ARG
7
1
Y
1
B
CG
ARG
154
B
CG
ARG
7
1
Y
1
B
CD
ARG
154
B
CD
ARG
7
1
Y
1
B
NE
ARG
154
B
NE
ARG
7
1
Y
1
B
CZ
ARG
154
B
CZ
ARG
7
1
Y
1
B
NH1
ARG
154
B
NH1
ARG
7
1
Y
1
B
NH2
ARG
154
B
NH2
ARG
7
1
Y
1
B
CB
GLN
155
B
CB
GLN
8
1
Y
1
B
CG
GLN
155
B
CG
GLN
8
1
Y
1
B
CD
GLN
155
B
CD
GLN
8
1
Y
1
B
OE1
GLN
155
B
OE1
GLN
8
1
Y
1
B
NE2
GLN
155
B
NE2
GLN
8
1
Y
1
B
CB
PRO
157
B
CB
PRO
10
1
Y
1
B
CG
PRO
157
B
CG
PRO
10
1
Y
1
B
CD
PRO
157
B
CD
PRO
10
1
Y
1
B
CB
LYS
158
B
CB
LYS
11
1
Y
1
B
CG
LYS
158
B
CG
LYS
11
1
Y
1
B
CD
LYS
158
B
CD
LYS
11
1
Y
1
B
CE
LYS
158
B
CE
LYS
11
1
Y
1
B
NZ
LYS
158
B
NZ
LYS
11
1
Y
1
B
CB
GLU
159
B
CB
GLU
12
1
Y
1
B
CG
GLU
159
B
CG
GLU
12
1
Y
1
B
CD
GLU
159
B
CD
GLU
12
1
Y
1
B
OE1
GLU
159
B
OE1
GLU
12
1
Y
1
B
OE2
GLU
159
B
OE2
GLU
12
1
Y
1
B
CB
PRO
160
B
CB
PRO
13
1
Y
1
B
CG
PRO
160
B
CG
PRO
13
1
Y
1
B
CD
PRO
160
B
CD
PRO
13
1
Y
1
B
CB
PHE
161
B
CB
PHE
14
1
Y
1
B
CG
PHE
161
B
CG
PHE
14
1
Y
1
B
CD1
PHE
161
B
CD1
PHE
14
1
Y
1
B
CD2
PHE
161
B
CD2
PHE
14
1
Y
1
B
CE1
PHE
161
B
CE1
PHE
14
1
Y
1
B
CE2
PHE
161
B
CE2
PHE
14
1
Y
1
B
CZ
PHE
161
B
CZ
PHE
14
1
Y
1
B
CB
ARG
162
B
CB
ARG
15
1
Y
1
B
CG
ARG
162
B
CG
ARG
15
1
Y
1
B
CD
ARG
162
B
CD
ARG
15
1
Y
1
B
NE
ARG
162
B
NE
ARG
15
1
Y
1
B
CZ
ARG
162
B
CZ
ARG
15
1
Y
1
B
NH1
ARG
162
B
NH1
ARG
15
1
Y
1
B
NH2
ARG
162
B
NH2
ARG
15
1
Y
1
B
CB
ASP
163
B
CB
ASP
16
1
Y
1
B
CG
ASP
163
B
CG
ASP
16
1
Y
1
B
OD1
ASP
163
B
OD1
ASP
16
1
Y
1
B
OD2
ASP
163
B
OD2
ASP
16
1
Y
1
B
CB
TYR
164
B
CB
TYR
17
1
Y
1
B
CG
TYR
164
B
CG
TYR
17
1
Y
1
B
CD1
TYR
164
B
CD1
TYR
17
1
Y
1
B
CD2
TYR
164
B
CD2
TYR
17
1
Y
1
B
CE1
TYR
164
B
CE1
TYR
17
1
Y
1
B
CE2
TYR
164
B
CE2
TYR
17
1
Y
1
B
CZ
TYR
164
B
CZ
TYR
17
1
Y
1
B
OH
TYR
164
B
OH
TYR
17
1
Y
1
B
CB
VAL
165
B
CB
VAL
18
1
Y
1
B
CG1
VAL
165
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VAL
18
1
Y
1
B
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VAL
165
B
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VAL
18
1
Y
1
B
CB
ASP
166
B
CB
ASP
19
1
Y
1
B
CG
ASP
166
B
CG
ASP
19
1
Y
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B
OD1
ASP
166
B
OD1
ASP
19
1
Y
1
B
OD2
ASP
166
B
OD2
ASP
19
1
Y
1
B
CB
ARG
167
B
CB
ARG
20
1
Y
1
B
CG
ARG
167
B
CG
ARG
20
1
Y
1
B
CD
ARG
167
B
CD
ARG
20
1
Y
1
B
NE
ARG
167
B
NE
ARG
20
1
Y
1
B
CZ
ARG
167
B
CZ
ARG
20
1
Y
1
B
NH1
ARG
167
B
NH1
ARG
20
1
Y
1
B
NH2
ARG
167
B
NH2
ARG
20
1
Y
1
B
CB
PHE
168
B
CB
PHE
21
1
Y
1
B
CG
PHE
168
B
CG
PHE
21
1
Y
1
B
CD1
PHE
168
B
CD1
PHE
21
1
Y
1
B
CD2
PHE
168
B
CD2
PHE
21
1
Y
1
B
CE1
PHE
168
B
CE1
PHE
21
1
Y
1
B
CE2
PHE
168
B
CE2
PHE
21
1
Y
1
B
CZ
PHE
168
B
CZ
PHE
21
1
Y
1
B
CB
TYR
169
B
CB
TYR
22
1
Y
1
B
CG
TYR
169
B
CG
TYR
22
1
Y
1
B
CD1
TYR
169
B
CD1
TYR
22
1
Y
1
B
CD2
TYR
169
B
CD2
TYR
22
1
Y
1
B
CE1
TYR
169
B
CE1
TYR
22
1
Y
1
B
CE2
TYR
169
B
CE2
TYR
22
1
Y
1
B
CZ
TYR
169
B
CZ
TYR
22
1
Y
1
B
OH
TYR
169
B
OH
TYR
22
1
Y
1
B
CB
LYS
170
B
CB
LYS
23
1
Y
1
B
CG
LYS
170
B
CG
LYS
23
1
Y
1
B
CD
LYS
170
B
CD
LYS
23
1
Y
1
B
CE
LYS
170
B
CE
LYS
23
1
Y
1
B
NZ
LYS
170
B
NZ
LYS
23
1
Y
1
B
CB
THR
171
B
CB
THR
24
1
Y
1
B
OG1
THR
171
B
OG1
THR
24
1
Y
1
B
CG2
THR
171
B
CG2
THR
24
1
Y
1
B
CB
LEU
172
B
CB
LEU
25
1
Y
1
B
CG
LEU
172
B
CG
LEU
25
1
Y
1
B
CD1
LEU
172
B
CD1
LEU
25
1
Y
1
B
CD2
LEU
172
B
CD2
LEU
25
1
Y
1
B
CB
ARG
173
B
CB
ARG
26
1
Y
1
B
CG
ARG
173
B
CG
ARG
26
1
Y
1
B
CD
ARG
173
B
CD
ARG
26
1
Y
1
B
NE
ARG
173
B
NE
ARG
26
1
Y
1
B
CZ
ARG
173
B
CZ
ARG
26
1
Y
1
B
NH1
ARG
173
B
NH1
ARG
26
1
Y
1
B
NH2
ARG
173
B
NH2
ARG
26
1
Y
1
B
CB
ALA
174
B
CB
ALA
27
1
Y
1
B
CB
GLU
175
B
CB
GLU
28
1
Y
1
B
CG
GLU
175
B
CG
GLU
28
1
Y
1
B
CD
GLU
175
B
CD
GLU
28
1
Y
1
B
OE1
GLU
175
B
OE1
GLU
28
1
Y
1
B
OE2
GLU
175
B
OE2
GLU
28
1
Y
1
B
CB
GLN
176
B
CB
GLN
29
1
Y
1
B
CG
GLN
176
B
CG
GLN
29
1
Y
1
B
CD
GLN
176
B
CD
GLN
29
1
Y
1
B
OE1
GLN
176
B
OE1
GLN
29
1
Y
1
B
NE2
GLN
176
B
NE2
GLN
29
1
Y
1
B
CB
ALA
177
B
CB
ALA
30
1
Y
1
B
CB
SER
178
B
CB
SER
31
1
Y
1
B
OG
SER
178
B
OG
SER
31
1
Y
1
B
CB
GLN
179
B
CB
GLN
32
1
Y
1
B
CG
GLN
179
B
CG
GLN
32
1
Y
1
B
CD
GLN
179
B
CD
GLN
32
1
Y
1
B
OE1
GLN
179
B
OE1
GLN
32
1
Y
1
B
NE2
GLN
179
B
NE2
GLN
32
1
Y
1
B
CB
GLU
180
B
CB
GLU
33
1
Y
1
B
CG
GLU
180
B
CG
GLU
33
1
Y
1
B
CD
GLU
180
B
CD
GLU
33
1
Y
1
B
OE1
GLU
180
B
OE1
GLU
33
1
Y
1
B
OE2
GLU
180
B
OE2
GLU
33
1
Y
1
B
CB
VAL
181
B
CB
VAL
34
1
Y
1
B
CG1
VAL
181
B
CG1
VAL
34
1
Y
1
B
CG2
VAL
181
B
CG2
VAL
34
1
Y
1
B
CB
LYS
182
B
CB
LYS
35
1
Y
1
B
CG
LYS
182
B
CG
LYS
35
1
Y
1
B
CD
LYS
182
B
CD
LYS
35
1
Y
1
B
CE
LYS
182
B
CE
LYS
35
1
Y
1
B
NZ
LYS
182
B
NZ
LYS
35
1
Y
1
B
CB
ASN
183
B
CB
ASN
36
1
Y
1
B
CG
ASN
183
B
CG
ASN
36
1
Y
1
B
OD1
ASN
183
B
OD1
ASN
36
1
Y
1
B
ND2
ASN
183
B
ND2
ASN
36
1
Y
1
B
CB
TRP
184
B
CB
TRP
37
1
Y
1
B
CG
TRP
184
B
CG
TRP
37
1
Y
1
B
CD1
TRP
184
B
CD1
TRP
37
1
Y
1
B
CD2
TRP
184
B
CD2
TRP
37
1
Y
1
B
NE1
TRP
184
B
NE1
TRP
37
1
Y
1
B
CE2
TRP
184
B
CE2
TRP
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1
Y
1
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CE3
TRP
184
B
CE3
TRP
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1
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CZ2
TRP
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B
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TRP
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1
B
CZ3
TRP
184
B
CZ3
TRP
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1
B
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TRP
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B
CH2
TRP
37
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Y
1
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CB
MET
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B
CB
MET
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1
Y
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B
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MET
185
B
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MET
38
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Y
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SD
MET
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B
SD
MET
38
1
Y
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B
CE
MET
185
B
CE
MET
38
1
Y
1
B
CB
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186
B
CB
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1
Y
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B
OG1
THR
186
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OG1
THR
39
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THR
186
B
CG2
THR
39
1
Y
1
B
CB
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B
CB
GLU
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1
Y
1
B
CG
GLU
187
B
CG
GLU
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B
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GLU
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B
CD
GLU
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GLU
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OE1
GLU
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GLU
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OE2
GLU
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THR
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B
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THR
41
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Y
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THR
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THR
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THR
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THR
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LEU
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B
CB
LEU
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Y
1
B
CG
LEU
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B
CG
LEU
42
1
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CD1
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CD1
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B
CD2
LEU
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CB
LEU
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B
CB
LEU
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1
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LEU
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B
CG
LEU
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CD1
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VAL
44
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GLN
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GLN
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CD
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GLN
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OE1
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NE2
GLN
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CB
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Y
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ASN
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ASN
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ALA
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CB
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ND2
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CB
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B
CB
PRO
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Y
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PRO
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B
CG
PRO
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PRO
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CD
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B
CB
ASP
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1
Y
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B
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ASP
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ASP
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ASP
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ASP
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ASP
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B
OD2
ASP
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1
Y
1
B
CB
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B
CB
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1
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CYS
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B
SG
CYS
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1
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B
CB
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LYS
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B
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CD
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CE
LYS
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B
CE
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1
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NZ
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B
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201
B
CB
ILE
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Y
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B
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ILE
201
B
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Y
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B
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ILE
201
B
CG2
ILE
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B
CD1
ILE
201
B
CD1
ILE
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Y
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CB
LEU
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B
CB
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Y
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LEU
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B
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Y
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B
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B
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203
B
CB
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LYS
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B
CG
LYS
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Y
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B
CD
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203
B
CD
LYS
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B
CE
LYS
203
B
CE
LYS
56
1
Y
1
B
NZ
LYS
203
B
NZ
LYS
56
1
Y
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B
CB
ALA
204
B
CB
ALA
57
1
Y
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B
CB
LEU
205
B
CB
LEU
58
1
Y
1
B
CG
LEU
205
B
CG
LEU
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1
Y
1
B
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B
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1
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B
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PRO
207
B
CB
PRO
60
1
Y
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B
CG
PRO
207
B
CG
PRO
60
1
Y
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CD
PRO
207
B
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PRO
60
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209
B
CB
ALA
62
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B
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210
B
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63
1
Y
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B
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THR
210
B
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1
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THR
210
B
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THR
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1
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211
B
CB
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Y
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B
CG
LEU
211
B
CG
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1
Y
1
B
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LEU
211
B
CD1
LEU
64
1
Y
1
B
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211
B
CD2
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64
1
Y
1
B
CB
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212
B
CB
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1
Y
1
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GLU
212
B
CG
GLU
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1
Y
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B
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GLU
212
B
CD
GLU
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B
OE1
GLU
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Y
1
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212
B
OE2
GLU
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1
Y
1
B
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213
B
CB
GLU
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Y
1
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GLU
213
B
CG
GLU
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Y
1
B
CD
GLU
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B
CD
GLU
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Y
1
B
OE1
GLU
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B
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1
B
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GLU
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B
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GLU
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Y
1
B
CB
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214
B
CB
MET
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1
Y
1
B
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MET
214
B
CG
MET
67
1
Y
1
B
SD
MET
214
B
SD
MET
67
1
Y
1
B
CE
MET
214
B
CE
MET
67
1
Y
1
B
CB
MET
215
B
CB
MET
68
1
Y
1
B
CG
MET
215
B
CG
MET
68
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Y
1
B
SD
MET
215
B
SD
MET
68
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Y
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B
CE
MET
215
B
CE
MET
68
1
Y
1
B
CB
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216
B
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1
Y
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B
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THR
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B
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B
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217
B
CB
ALA
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Y
1
B
CB
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218
B
CB
CYS
71
1
Y
1
B
SG
CYS
218
B
SG
CYS
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1
Y
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B
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GLN
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B
CB
GLN
72
1
Y
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B
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GLN
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B
CG
GLN
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Y
1
B
CD
GLN
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B
CD
GLN
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1
Y
1
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GLN
219
B
OE1
GLN
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Y
1
B
NE2
GLN
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B
NE2
GLN
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1
Y
1
B
O
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221
B
O
VAL
74
1
Y
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B
CB
VAL
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B
CB
VAL
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Y
1
B
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VAL
221
B
CG1
VAL
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1
Y
1
B
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VAL
221
B
CG2
VAL
74
1
Y
1
F
CB
THR
148
C
CB
THR
1
1
Y
1
F
OG1
THR
148
C
OG1
THR
1
1
Y
1
F
CG2
THR
148
C
CG2
THR
1
1
Y
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F
CB
SER
149
C
CB
SER
2
1
Y
1
F
OG
SER
149
C
OG
SER
2
1
Y
1
F
CB
ILE
150
C
CB
ILE
3
1
Y
1
F
CG1
ILE
150
C
CG1
ILE
3
1
Y
1
F
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ILE
150
C
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ILE
3
1
Y
1
F
CD1
ILE
150
C
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3
1
Y
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F
CB
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151
C
CB
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1
Y
1
F
CG
LEU
151
C
CG
LEU
4
1
Y
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F
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C
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1
Y
1
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C
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F
CB
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C
CB
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5
1
Y
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F
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ASP
152
C
CG
ASP
5
1
Y
1
F
OD1
ASP
152
C
OD1
ASP
5
1
Y
1
F
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ASP
152
C
OD2
ASP
5
1
Y
1
F
CB
ILE
153
C
CB
ILE
6
1
Y
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F
CG1
ILE
153
C
CG1
ILE
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1
Y
1
F
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153
C
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ILE
6
1
Y
1
F
CD1
ILE
153
C
CD1
ILE
6
1
Y
1
F
CB
ARG
154
C
CB
ARG
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1
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1
F
CG
ARG
154
C
CG
ARG
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1
Y
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F
CD
ARG
154
C
CD
ARG
7
1
Y
1
F
NE
ARG
154
C
NE
ARG
7
1
Y
1
F
CZ
ARG
154
C
CZ
ARG
7
1
Y
1
F
NH1
ARG
154
C
NH1
ARG
7
1
Y
1
F
NH2
ARG
154
C
NH2
ARG
7
1
Y
1
F
CB
GLN
155
C
CB
GLN
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Y
1
F
CG
GLN
155
C
CG
GLN
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Y
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F
CD
GLN
155
C
CD
GLN
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Y
1
F
OE1
GLN
155
C
OE1
GLN
8
1
Y
1
F
NE2
GLN
155
C
NE2
GLN
8
1
Y
1
F
CB
PRO
157
C
CB
PRO
10
1
Y
1
F
CG
PRO
157
C
CG
PRO
10
1
Y
1
F
CD
PRO
157
C
CD
PRO
10
1
Y
1
F
CB
LYS
158
C
CB
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1
Y
1
F
CG
LYS
158
C
CG
LYS
11
1
Y
1
F
CD
LYS
158
C
CD
LYS
11
1
Y
1
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CE
LYS
158
C
CE
LYS
11
1
Y
1
F
NZ
LYS
158
C
NZ
LYS
11
1
Y
1
F
CB
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C
CB
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1
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1
F
CG
GLU
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C
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GLU
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GLU
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1
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C
OE2
GLU
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1
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CB
PRO
160
C
CB
PRO
13
1
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1
F
CG
PRO
160
C
CG
PRO
13
1
Y
1
F
CD
PRO
160
C
CD
PRO
13
1
Y
1
F
CB
PHE
161
C
CB
PHE
14
1
Y
1
F
CG
PHE
161
C
CG
PHE
14
1
Y
1
F
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PHE
161
C
CD1
PHE
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PHE
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C
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161
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1
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CZ
PHE
161
C
CZ
PHE
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1
Y
1
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CB
ARG
162
C
CB
ARG
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1
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ARG
162
C
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ARG
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1
Y
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F
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ARG
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C
CD
ARG
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1
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1
F
NE
ARG
162
C
NE
ARG
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1
Y
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CZ
ARG
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C
CZ
ARG
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1
Y
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F
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ARG
162
C
NH1
ARG
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1
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1
F
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ARG
162
C
NH2
ARG
15
1
Y
1
F
CB
ASP
163
C
CB
ASP
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1
Y
1
F
CG
ASP
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C
CG
ASP
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Y
1
F
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ASP
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C
OD1
ASP
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1
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ASP
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OD2
ASP
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1
Y
1
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TYR
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C
CB
TYR
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1
F
CG
TYR
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C
CG
TYR
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F
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TYR
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C
CD1
TYR
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TYR
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TYR
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1
F
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TYR
164
C
CE2
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17
1
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1
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1
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OH
TYR
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OH
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1
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NE
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NE
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OG
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CE
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CB
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ASN
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C
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THR
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THR
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CB
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VAL
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CB
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C
CB
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196
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PRO
196
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C
CB
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Y
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ASP
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C
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OD1
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ASP
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OD2
ASP
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C
CB
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198
C
SG
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Y
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CB
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CD
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LYS
199
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CE
LYS
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199
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NZ
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1
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CB
THR
200
C
CB
THR
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1
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THR
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C
OG1
THR
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1
Y
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THR
200
C
CG2
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ILE
201
C
CB
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Y
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F
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ILE
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C
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CB
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203
C
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203
C
CD
LYS
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CE
LYS
203
C
CE
LYS
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NZ
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203
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NZ
LYS
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CB
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204
C
CB
ALA
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C
CB
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LEU
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C
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PRO
207
C
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PRO
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CD
PRO
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C
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ALA
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210
C
CB
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1
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Y
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THR
210
C
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C
CB
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1
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1
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1
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GLU
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1
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OE1
GLU
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OE1
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1
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OE2
GLU
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OE2
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1
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GLU
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1
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CG
GLU
213
C
CG
GLU
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1
F
CD
GLU
213
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CD
GLU
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1
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OE1
GLU
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1
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1
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MET
214
C
CB
MET
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1
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CG
MET
214
C
CG
MET
67
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Y
1
F
SD
MET
214
C
SD
MET
67
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Y
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D
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MET
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MET
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186
D
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GLU
187
D
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32
1
Y
1
b
CB
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33
F
CB
SER
33
1
Y
1
b
OG
SER
33
F
OG
SER
33
1
Y
1
b
CB
PRO
34
F
CB
PRO
34
1
Y
1
b
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PRO
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F
CG
PRO
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Y
1
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CD
PRO
34
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CD
PRO
34
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1
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F
CB
GLU
35
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1
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GLU
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GLU
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GLU
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CD
GLU
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GLU
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1
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GLU
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OE2
GLU
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VAL
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VAL
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VAL
36
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VAL
36
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1
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F
CB
ILE
37
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ILE
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38
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PRO
38
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MET
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MET
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MET
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MET
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MET
39
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CE
MET
39
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CE
MET
39
1
Y
1
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CB
PHE
40
F
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PHE
40
1
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1
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PHE
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CZ
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40
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CB
SER
41
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OG
SER
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OG
SER
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CB
ALA
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CB
LEU
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LEU
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SER
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OG
SER
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OG
SER
44
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CB
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CD
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ALA
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OD1
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GLN
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ALA
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CE
MET
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MET
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NZ
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F
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NE
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CZ
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CZ
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CB
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F
CB
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1
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F
CB
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1
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HIS
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1
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CB
PRO
85
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1
b
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PRO
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CG
PRO
85
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1
b
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PRO
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CD
PRO
85
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1
b
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86
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1
b
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VAL
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VAL
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VAL
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Y
1
b
CB
HIS
87
F
CB
HIS
87
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Y
1
b
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ND1
HIS
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b
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NE2
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87
1
Y
1
b
CB
ALA
88
F
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ALA
88
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Y
1
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F
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90
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1
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PRO
90
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90
1
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1
b
CD
PRO
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F
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90
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1
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F
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F
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CD1
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1
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F
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CB
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F
CB
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93
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1
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CG
PRO
93
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93
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1
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CD
PRO
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F
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93
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F
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GLN
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1
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GLN
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MET
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MET
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96
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1
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97
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97
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97
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CZ
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CG2
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121
F
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ASN
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1
Y
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121
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ND2
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122
F
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F
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VAL
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CB
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129
F
CB
ILE
129
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F
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131
F
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131
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131
F
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131
F
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132
F
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132
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132
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ARG
132
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ARG
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ARG
132
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ARG
132
F
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132
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CZ
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132
F
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132
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F
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132
F
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ARG
132
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TRP
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F
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TRP
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TRP
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TRP
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TRP
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TRP
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TRP
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CZ3
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133
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1
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134
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CB
ILE
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ILE
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134
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ILE
135
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135
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F
CB
LEU
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CG
LEU
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LEU
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F
CB
LEU
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Y
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CG
LEU
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F
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LEU
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b
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Y
1
b
CB
ASN
139
F
CB
ASN
139
1
Y
1
b
CG
ASN
139
F
CG
ASN
139
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Y
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OD1
ASN
139
F
OD1
ASN
139
1
Y
1
b
ND2
ASN
139
F
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ASN
139
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Y
1
b
CB
LYS
140
F
CB
LYS
140
1
Y
1
b
CG
LYS
140
F
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LYS
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NE
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104
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ALA
105
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ASN
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ASN
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G
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G
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G
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G
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1
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146
G
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146
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1
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CB
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147
G
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1
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147
G
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147
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H
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149
H
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1
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149
H
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2
1
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H
CB
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NE2
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ALA
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CB
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OG
SER
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H
OG
SER
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GLN
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CE
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NZ
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ASN
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ASN
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ASN
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ASN
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ASN
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H
ND2
ASN
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CB
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H
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TRP
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1
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H
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H
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TRP
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MET
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MET
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SD
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MET
185
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MET
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1
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H
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THR
186
H
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THR
39
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THR
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THR
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CB
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H
CB
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Y
1
C
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GLU
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H
CG
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C
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GLU
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H
CD
GLU
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GLU
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H
OE1
GLU
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Y
1
C
OE2
GLU
187
H
OE2
GLU
40
1
Y
1
C
CB
THR
188
H
CB
THR
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Y
1
C
OG1
THR
188
H
OG1
THR
41
1
Y
1
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THR
188
H
CG2
THR
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Y
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CB
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H
CB
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Y
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LEU
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H
CG
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H
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Y
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H
CD2
LEU
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Y
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LEU
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H
CB
LEU
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Y
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LEU
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H
CG
LEU
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Y
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H
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LEU
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Y
1
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LEU
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H
CD2
LEU
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Y
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H
CB
VAL
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Y
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VAL
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H
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VAL
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1
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VAL
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Y
1
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GLN
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H
CB
GLN
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GLN
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H
CG
GLN
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CD
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GLN
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H
OE1
GLN
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Y
1
C
NE2
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MET
214
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MET
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H
CE
MET
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I
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THR
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I
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I
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I
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I
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D
CB
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I
CB
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I
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I
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I
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I
NE2
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I
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I
NZ
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D
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CB
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D
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I
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I
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I
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I
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I
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I
CB
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LYS
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I
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D
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I
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I
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THR
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I
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I
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LEU
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I
CB
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1
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1
D
CG
LEU
172
I
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I
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I
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ARG
173
I
NE
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26
1
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CZ
ARG
173
I
CZ
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1
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D
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ARG
173
I
NH1
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26
1
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D
NH2
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I
NH2
ARG
26
1
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D
CB
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I
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I
OG
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CB
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I
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SG
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I
NZ
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CB
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I
CB
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THR
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CB
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D
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ALA
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I
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CB
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I
CB
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MET
214
I
CG
MET
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MET
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I
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MET
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MET
214
I
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MET
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MET
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I
CB
MET
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Y
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MET
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I
CG
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I
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I
CE
MET
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Y
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D
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I
CB
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ALA
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D
CB
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I
CB
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Y
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D
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218
I
SG
CYS
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1
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I
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VAL
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I
O
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CB
VAL
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I
CB
VAL
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1
D
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VAL
221
I
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1
D
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221
I
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E
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THR
148
J
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THR
148
J
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THR
148
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149
J
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2
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1
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J
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3
1
Y
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J
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E
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J
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E
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J
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E
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J
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1
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LEU
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J
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4
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J
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J
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J
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Y
1
G
NH1
ARG
173
K
NH1
ARG
26
1
Y
1
G
NH2
ARG
173
K
NH2
ARG
26
1
Y
1
G
CB
ALA
174
K
CB
ALA
27
1
Y
1
G
CB
GLU
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K
CB
GLU
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1
Y
1
G
CG
GLU
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K
CG
GLU
28
1
Y
1
G
CD
GLU
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K
CD
GLU
28
1
Y
1
G
OE1
GLU
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K
OE1
GLU
28
1
Y
1
G
OE2
GLU
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K
OE2
GLU
28
1
Y
1
G
CB
GLN
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K
CB
GLN
29
1
Y
1
G
CG
GLN
176
K
CG
GLN
29
1
Y
1
G
CD
GLN
176
K
CD
GLN
29
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Y
1
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OE1
GLN
176
K
OE1
GLN
29
1
Y
1
G
NE2
GLN
176
K
NE2
GLN
29
1
Y
1
G
CB
ALA
177
K
CB
ALA
30
1
Y
1
G
CB
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178
K
CB
SER
31
1
Y
1
G
OG
SER
178
K
OG
SER
31
1
Y
1
G
CB
GLN
179
K
CB
GLN
32
1
Y
1
G
CG
GLN
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K
CG
GLN
32
1
Y
1
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GLN
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K
CD
GLN
32
1
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1
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OE1
GLN
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GLN
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1
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1
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NE2
GLN
179
K
NE2
GLN
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1
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1
G
CB
GLU
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K
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1
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1
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GLU
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K
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GLU
33
1
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1
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CD
GLU
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K
CD
GLU
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GLU
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GLU
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1
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GLU
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OE2
GLU
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1
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1
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K
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Y
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VAL
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1
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1
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VAL
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K
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VAL
34
1
Y
1
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CB
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182
K
CB
LYS
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Y
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G
CG
LYS
182
K
CG
LYS
35
1
Y
1
G
CD
LYS
182
K
CD
LYS
35
1
Y
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CE
LYS
182
K
CE
LYS
35
1
Y
1
G
NZ
LYS
182
K
NZ
LYS
35
1
Y
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ASN
183
K
CB
ASN
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1
Y
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ASN
183
K
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ASN
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Y
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ASN
183
K
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ASN
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K
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TRP
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K
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TRP
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MET
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MET
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MET
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SD
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CE
MET
185
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MET
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K
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K
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GLU
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GLU
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OE2
GLU
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K
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1
Y
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K
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THR
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THR
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K
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THR
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Y
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K
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VAL
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VAL
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Y
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GLN
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GLN
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GLN
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GLN
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CD
GLN
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GLN
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K
OE1
GLN
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GLN
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K
NE2
GLN
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Y
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ASN
193
K
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ASN
46
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Y
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ASN
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K
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ASN
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Y
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G
OD1
ASN
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K
OD1
ASN
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ND2
ASN
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K
ND2
ASN
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CB
ALA
194
K
CB
ALA
47
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Y
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CB
ASN
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K
CB
ASN
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Y
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ASN
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K
CG
ASN
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Y
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G
OD1
ASN
195
K
OD1
ASN
48
1
Y
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G
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ASN
195
K
ND2
ASN
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1
Y
1
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CB
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196
K
CB
PRO
49
1
Y
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PRO
196
K
CG
PRO
49
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Y
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CD
PRO
196
K
CD
PRO
49
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Y
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197
K
CB
ASP
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1
Y
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G
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ASP
197
K
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ASP
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Y
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ASP
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K
OD1
ASP
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ASP
197
K
OD2
ASP
50
1
Y
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198
K
CB
CYS
51
1
Y
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CYS
198
K
SG
CYS
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1
Y
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LYS
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K
CB
LYS
52
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Y
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LYS
199
K
CG
LYS
52
1
Y
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CD
LYS
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K
CD
LYS
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CE
LYS
199
K
CE
LYS
52
1
Y
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NZ
LYS
199
K
NZ
LYS
52
1
Y
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G
CB
THR
200
K
CB
THR
53
1
Y
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G
OG1
THR
200
K
OG1
THR
53
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200
K
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ILE
201
K
CB
ILE
54
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Y
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ILE
201
K
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ILE
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Y
1
G
CG2
ILE
201
K
CG2
ILE
54
1
Y
1
G
CD1
ILE
201
K
CD1
ILE
54
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Y
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G
CB
LEU
202
K
CB
LEU
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Y
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CG
LEU
202
K
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LEU
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1
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K
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K
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CB
LYS
203
K
CB
LYS
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1
Y
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G
CG
LYS
203
K
CG
LYS
56
1
Y
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G
CD
LYS
203
K
CD
LYS
56
1
Y
1
G
CE
LYS
203
K
CE
LYS
56
1
Y
1
G
NZ
LYS
203
K
NZ
LYS
56
1
Y
1
G
CB
ALA
204
K
CB
ALA
57
1
Y
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G
CB
LEU
205
K
CB
LEU
58
1
Y
1
G
CG
LEU
205
K
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LEU
58
1
Y
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K
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1
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207
K
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1
Y
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PRO
207
K
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PRO
60
1
Y
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PRO
207
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PRO
60
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ALA
209
K
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ALA
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Y
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CB
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210
K
CB
THR
63
1
Y
1
G
OG1
THR
210
K
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THR
63
1
Y
1
G
CG2
THR
210
K
CG2
THR
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Y
1
G
CB
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K
CB
LEU
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Y
1
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K
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K
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K
CB
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GLU
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K
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GLU
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GLU
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K
OE1
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1
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G
OE2
GLU
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K
OE2
GLU
65
1
Y
1
G
CB
GLU
213
K
CB
GLU
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1
Y
1
G
CG
GLU
213
K
CG
GLU
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1
G
CD
GLU
213
K
CD
GLU
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Y
1
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OE1
GLU
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K
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GLU
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G
OE2
GLU
213
K
OE2
GLU
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Y
1
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CB
MET
214
K
CB
MET
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Y
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G
CG
MET
214
K
CG
MET
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Y
1
G
SD
MET
214
K
SD
MET
67
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Y
1
G
CE
MET
214
K
CE
MET
67
1
Y
1
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CB
MET
215
K
CB
MET
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Y
1
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CG
MET
215
K
CG
MET
68
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Y
1
G
SD
MET
215
K
SD
MET
68
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Y
1
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CE
MET
215
K
CE
MET
68
1
Y
1
G
CB
THR
216
K
CB
THR
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Y
1
G
OG1
THR
216
K
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THR
216
K
CG2
THR
69
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Y
1
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CB
ALA
217
K
CB
ALA
70
1
Y
1
G
CB
CYS
218
K
CB
CYS
71
1
Y
1
G
SG
CYS
218
K
SG
CYS
71
1
Y
1
G
CB
GLN
219
K
CB
GLN
72
1
Y
1
G
CG
GLN
219
K
CG
GLN
72
1
Y
1
G
CD
GLN
219
K
CD
GLN
72
1
Y
1
G
OE1
GLN
219
K
OE1
GLN
72
1
Y
1
G
NE2
GLN
219
K
NE2
GLN
72
1
Y
1
G
O
VAL
221
K
O
VAL
74
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1
G
CB
VAL
221
K
CB
VAL
74
1
Y
1
G
CG1
VAL
221
K
CG1
VAL
74
1
Y
1
G
CG2
VAL
221
K
CG2
VAL
74
1
Y
1
H
CB
PRO
1
L
CB
PRO
1
1
Y
1
H
CG
PRO
1
L
CG
PRO
1
1
Y
1
H
CD
PRO
1
L
CD
PRO
1
1
Y
1
H
CB
ILE
2
L
CB
ILE
2
1
Y
1
H
CG1
ILE
2
L
CG1
ILE
2
1
Y
1
H
CG2
ILE
2
L
CG2
ILE
2
1
Y
1
H
CD1
ILE
2
L
CD1
ILE
2
1
Y
1
H
CB
VAL
3
L
CB
VAL
3
1
Y
1
H
CG1
VAL
3
L
CG1
VAL
3
1
Y
1
H
CG2
VAL
3
L
CG2
VAL
3
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Y
1
H
CB
GLN
4
L
CB
GLN
4
1
Y
1
H
CG
GLN
4
L
CG
GLN
4
1
Y
1
H
CD
GLN
4
L
CD
GLN
4
1
Y
1
H
OE1
GLN
4
L
OE1
GLN
4
1
Y
1
H
NE2
GLN
4
L
NE2
GLN
4
1
Y
1
H
CB
ASN
5
L
CB
ASN
5
1
Y
1
H
CG
ASN
5
L
CG
ASN
5
1
Y
1
H
OD1
ASN
5
L
OD1
ASN
5
1
Y
1
H
ND2
ASN
5
L
ND2
ASN
5
1
Y
1
H
CB
LEU
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L
CB
LEU
6
1
Y
1
H
CG
LEU
6
L
CG
LEU
6
1
Y
1
H
CD1
LEU
6
L
CD1
LEU
6
1
Y
1
H
CD2
LEU
6
L
CD2
LEU
6
1
Y
1
H
CB
GLN
7
L
CB
GLN
7
1
Y
1
H
CG
GLN
7
L
CG
GLN
7
1
Y
1
H
CD
GLN
7
L
CD
GLN
7
1
Y
1
H
OE1
GLN
7
L
OE1
GLN
7
1
Y
1
H
NE2
GLN
7
L
NE2
GLN
7
1
Y
1
H
CB
GLN
9
L
CB
GLN
9
1
Y
1
H
CG
GLN
9
L
CG
GLN
9
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Y
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SD
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1
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CE
MET
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CE
MET
66
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1
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1
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GLN
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GLN
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CD
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MET
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MET
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MET
68
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H
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L
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69
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ND2
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HIS
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ALA
88
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MET
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L
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MET
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OG
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OE2
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GLN
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GLN
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TRP
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TRP
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TRP
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TRP
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TRP
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TRP
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L
CB
MET
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MET
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MET
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1
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1
Y
1
J
CG1
ILE
135
N
CG1
ILE
135
1
Y
1
J
CG2
ILE
135
N
CG2
ILE
135
1
Y
1
J
CD1
ILE
135
N
CD1
ILE
135
1
Y
1
J
CB
LEU
136
N
CB
LEU
136
1
Y
1
J
CG
LEU
136
N
CG
LEU
136
1
Y
1
J
CD1
LEU
136
N
CD1
LEU
136
1
Y
1
J
CD2
LEU
136
N
CD2
LEU
136
1
Y
1
J
CB
LEU
138
N
CB
LEU
138
1
Y
1
J
CG
LEU
138
N
CG
LEU
138
1
Y
1
J
CD1
LEU
138
N
CD1
LEU
138
1
Y
1
J
CD2
LEU
138
N
CD2
LEU
138
1
Y
1
J
CB
ASN
139
N
CB
ASN
139
1
Y
1
J
CG
ASN
139
N
CG
ASN
139
1
Y
1
J
OD1
ASN
139
N
OD1
ASN
139
1
Y
1
J
ND2
ASN
139
N
ND2
ASN
139
1
Y
1
J
CB
LYS
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N
CB
LYS
140
1
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1
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LYS
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N
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LYS
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1
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LYS
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N
CD
LYS
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1
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1
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CE
LYS
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N
CE
LYS
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1
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1
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NZ
LYS
140
N
NZ
LYS
140
1
Y
1
J
CB
ILE
141
N
CB
ILE
141
1
Y
1
J
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ILE
141
N
CG1
ILE
141
1
Y
1
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ILE
141
N
CG2
ILE
141
1
Y
1
J
CD1
ILE
141
N
CD1
ILE
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1
Y
1
J
CB
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142
N
CB
VAL
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1
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1
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VAL
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N
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VAL
142
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1
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VAL
142
N
CG2
VAL
142
1
Y
1
J
CB
ARG
143
N
CB
ARG
143
1
Y
1
J
CG
ARG
143
N
CG
ARG
143
1
Y
1
J
CD
ARG
143
N
CD
ARG
143
1
Y
1
J
NE
ARG
143
N
NE
ARG
143
1
Y
1
J
CZ
ARG
143
N
CZ
ARG
143
1
Y
1
J
NH1
ARG
143
N
NH1
ARG
143
1
Y
1
J
NH2
ARG
143
N
NH2
ARG
143
1
Y
1
J
CB
MET
144
N
CB
MET
144
1
Y
1
J
CG
MET
144
N
CG
MET
144
1
Y
1
J
SD
MET
144
N
SD
MET
144
1
Y
1
J
CE
MET
144
N
CE
MET
144
1
Y
1
J
CB
TYR
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N
CB
TYR
145
1
Y
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J
CG
TYR
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TYR
145
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Y
1
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N
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1
Y
1
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CD2
TYR
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N
CD2
TYR
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1
Y
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CE1
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N
CE1
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Y
1
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145
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1
Y
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J
CZ
TYR
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N
CZ
TYR
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1
Y
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J
OH
TYR
145
N
OH
TYR
145
1
Y
1
J
CB
SER
146
N
CB
SER
146
1
Y
1
J
OG
SER
146
N
OG
SER
146
1
Y
1
J
CB
PRO
147
N
CB
PRO
147
1
Y
1
J
CG
PRO
147
N
CG
PRO
147
1
Y
1
J
CD
PRO
147
N
CD
PRO
147
1
Y
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B
b
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PRO
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1
D
I
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148
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1.61
1
C
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C
THR
PRO
148
147
1.62
1
A
a
N
C
THR
PRO
148
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1.62
1
E
J
N
C
THR
PRO
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147
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F
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C
THR
PRO
148
147
1.65
1
a
a
CA
C
GLY
GLY
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60
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N
1
a
a
N
CA
GLY
GLY
127
127
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N
1
b
b
CA
C
GLY
GLY
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N
1
b
b
N
CA
GLY
GLY
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127
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N
1
f
f
CA
C
GLY
GLY
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N
1
f
f
N
CA
GLY
GLY
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127
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N
1
H
H
CA
C
GLY
GLY
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-0.105
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1.514
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N
1
H
H
N
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GLY
GLY
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127
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1.549
N
1
I
I
CA
C
GLY
GLY
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60
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1.410
N
1
I
I
N
CA
GLY
GLY
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127
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N
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J
J
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C
GLY
GLY
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-0.106
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1.408
N
1
J
J
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GLY
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127
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N
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A
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B
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B
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ALA
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F
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W
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b
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f
ALA
31
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C
ALA
177
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C
THR
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D
ALA
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E
ALA
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E
THR
188
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G
ALA
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1
G
THR
188
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H
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31
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-110.96
1
I
ALA
31
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-111.09
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J
ALA
31
44.75
-111.05
N
Gag protein
The structure of the mature HIV-1 CA hexameric lattice with curvature parameters: tilt=29, twist=0
1
N
N
1
N
N
1
N
N
1
N
N
2
N
N
2
N
N
2
N
N
1
N
N
1
N
N
1
N
N
1
N
N
2
N
N
2
N
N
2
N
N
A
SER
149
A
SER
2
HELX_P
A
ILE
153
A
ILE
6
5
AA1
5
A
PRO
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A
PRO
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A
GLU
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A
GLU
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AA2
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A
SER
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A
SER
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A
ASN
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A
ASN
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1
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A
ASN
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A
ASN
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A
LEU
205
A
LEU
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AA4
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A
THR
210
A
THR
63
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A
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218
A
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1
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B
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B
SER
2
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B
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153
B
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5
AA6
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B
PRO
160
B
PRO
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B
GLU
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B
GLU
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B
SER
178
B
SER
31
HELX_P
B
ASN
193
B
ASN
46
1
AA8
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B
ASN
195
B
ASN
48
HELX_P
B
LEU
205
B
LEU
58
1
AA9
11
B
THR
210
B
THR
63
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B
CYS
218
B
CYS
71
1
AB1
9
F
SER
149
C
SER
2
HELX_P
F
ILE
153
C
ILE
6
5
AB2
5
F
PRO
160
C
PRO
13
HELX_P
F
GLU
175
C
GLU
28
1
AB3
16
F
SER
178
C
SER
31
HELX_P
F
ASN
193
C
ASN
46
1
AB4
16
F
ASN
195
C
ASN
48
HELX_P
F
LEU
205
C
LEU
58
1
AB5
11
F
THR
210
C
THR
63
HELX_P
F
CYS
218
C
CYS
71
1
AB6
9
W
SER
149
D
SER
2
HELX_P
W
ILE
153
D
ILE
6
5
AB7
5
W
PRO
160
D
PRO
13
HELX_P
W
GLU
175
D
GLU
28
1
AB8
16
W
SER
178
D
SER
31
HELX_P
W
ASN
193
D
ASN
46
1
AB9
16
W
ASN
195
D
ASN
48
HELX_P
W
LEU
205
D
LEU
58
1
AC1
11
W
THR
210
D
THR
63
HELX_P
W
CYS
218
D
CYS
71
1
AC2
9
a
SER
16
E
SER
16
HELX_P
a
ALA
31
E
ALA
31
1
AC3
16
a
GLU
35
E
GLU
35
HELX_P
a
SER
44
E
SER
44
1
AC4
10
a
THR
48
E
THR
48
HELX_P
a
THR
58
E
THR
58
1
AC5
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a
HIS
62
E
HIS
62
HELX_P
a
HIS
84
E
HIS
84
1
AC6
23
a
ARG
100
E
ARG
100
HELX_P
a
ALA
105
E
ALA
105
1
AC7
6
a
THR
110
E
THR
110
HELX_P
a
HIS
120
E
HIS
120
1
AC8
11
a
PRO
125
E
PRO
125
HELX_P
a
SER
146
E
SER
146
1
AC9
22
b
SER
16
F
SER
16
HELX_P
b
ALA
31
F
ALA
31
1
AD1
16
b
GLU
35
F
GLU
35
HELX_P
b
SER
44
F
SER
44
1
AD2
10
b
THR
48
F
THR
48
HELX_P
b
THR
58
F
THR
58
1
AD3
11
b
HIS
62
F
HIS
62
HELX_P
b
HIS
84
F
HIS
84
1
AD4
23
b
ARG
100
F
ARG
100
HELX_P
b
ALA
105
F
ALA
105
1
AD5
6
b
THR
110
F
THR
110
HELX_P
b
HIS
120
F
HIS
120
1
AD6
11
b
PRO
125
F
PRO
125
HELX_P
b
SER
146
F
SER
146
1
AD7
22
f
SER
16
G
SER
16
HELX_P
f
ALA
31
G
ALA
31
1
AD8
16
f
GLU
35
G
GLU
35
HELX_P
f
SER
44
G
SER
44
1
AD9
10
f
THR
48
G
THR
48
HELX_P
f
THR
58
G
THR
58
1
AE1
11
f
HIS
62
G
HIS
62
HELX_P
f
HIS
84
G
HIS
84
1
AE2
23
f
ARG
100
G
ARG
100
HELX_P
f
ALA
105
G
ALA
105
1
AE3
6
f
THR
110
G
THR
110
HELX_P
f
HIS
120
G
HIS
120
1
AE4
11
f
PRO
125
G
PRO
125
HELX_P
f
SER
146
G
SER
146
1
AE5
22
C
SER
149
H
SER
2
HELX_P
C
ILE
153
H
ILE
6
5
AE6
5
C
PRO
160
H
PRO
13
HELX_P
C
GLU
175
H
GLU
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1
AE7
16
C
SER
178
H
SER
31
HELX_P
C
ASN
193
H
ASN
46
1
AE8
16
C
ASN
195
H
ASN
48
HELX_P
C
LEU
205
H
LEU
58
1
AE9
11
C
THR
210
H
THR
63
HELX_P
C
CYS
218
H
CYS
71
1
AF1
9
D
SER
149
I
SER
2
HELX_P
D
ILE
153
I
ILE
6
5
AF2
5
D
PRO
160
I
PRO
13
HELX_P
D
GLU
175
I
GLU
28
1
AF3
16
D
SER
178
I
SER
31
HELX_P
D
ASN
193
I
ASN
46
1
AF4
16
D
ASN
195
I
ASN
48
HELX_P
D
LEU
205
I
LEU
58
1
AF5
11
D
THR
210
I
THR
63
HELX_P
D
CYS
218
I
CYS
71
1
AF6
9
E
SER
149
J
SER
2
HELX_P
E
ILE
153
J
ILE
6
5
AF7
5
E
PRO
160
J
PRO
13
HELX_P
E
GLU
175
J
GLU
28
1
AF8
16
E
SER
178
J
SER
31
HELX_P
E
ASN
193
J
ASN
46
1
AF9
16
E
ASN
195
J
ASN
48
HELX_P
E
LEU
205
J
LEU
58
1
AG1
11
E
THR
210
J
THR
63
HELX_P
E
CYS
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J
CYS
71
1
AG2
9
G
SER
149
K
SER
2
HELX_P
G
ILE
153
K
ILE
6
5
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5
G
PRO
160
K
PRO
13
HELX_P
G
GLU
175
K
GLU
28
1
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16
G
SER
178
K
SER
31
HELX_P
G
ASN
193
K
ASN
46
1
AG5
16
G
ASN
195
K
ASN
48
HELX_P
G
LEU
205
K
LEU
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1
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11
G
THR
210
K
THR
63
HELX_P
G
CYS
218
K
CYS
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1
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H
SER
16
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