1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.000000 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 0.00000 0.00000 Montoya, G. Mesa, P. http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic 1 90.000 90.000 90.000 1.0 1.0 1.0 7961661.407 C10 H14 N5 O7 P 347.221 y ADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE RNA linking C3 H7 N O2 89.093 y ALANINE L-peptide linking C6 H15 N4 O2 1 175.209 y ARGININE L-peptide linking C4 H8 N2 O3 132.118 y ASPARAGINE L-peptide linking C4 H7 N O4 133.103 y ASPARTIC ACID L-peptide linking C9 H14 N3 O8 P 323.197 y CYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE RNA linking C3 H7 N O2 S 121.158 y CYSTEINE L-peptide linking C10 H14 N5 O6 P 331.222 y 2'-DEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE DNA linking C9 H14 N3 O7 P 307.197 y 2'-DEOXYCYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE DNA linking C10 H14 N5 O7 P 347.221 y 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE DNA linking C10 H15 N2 O8 P 322.208 y THYMIDINE-5'-MONOPHOSPHATE DNA linking C10 H14 N5 O8 P 363.221 y GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE RNA linking C5 H10 N2 O3 146.144 y GLUTAMINE L-peptide linking C5 H9 N O4 147.129 y GLUTAMIC ACID L-peptide linking C2 H5 N O2 75.067 y GLYCINE peptide linking C6 H10 N3 O2 1 156.162 y HISTIDINE L-peptide linking C6 H13 N O2 131.173 y ISOLEUCINE L-peptide linking C6 H13 N O2 131.173 y LEUCINE L-peptide linking C6 H15 N2 O2 1 147.195 y LYSINE L-peptide linking C5 H11 N O2 S 149.211 y METHIONINE L-peptide linking C9 H11 N O2 165.189 y PHENYLALANINE L-peptide linking C5 H9 N O2 115.130 y PROLINE L-peptide linking C3 H7 N O3 105.093 y SERINE L-peptide linking C4 H9 N O3 119.119 y THREONINE L-peptide linking C11 H12 N2 O2 204.225 y TRYPTOPHAN L-peptide linking C9 H11 N O3 181.189 y TYROSINE L-peptide linking C9 H13 N2 O9 P 324.181 y URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE RNA linking C5 H11 N O2 117.146 y VALINE L-peptide linking Cell 1097-4172 175 1856 1871.e21 10.1016/j.cell.2018.10.045 30503205 Conformational Activation Promotes CRISPR-Cas12a Catalysis and Resetting of the Endonuclease Activity. 2018 6GTD 124000 4.24 FSC 0.143 CUT-OFF POINT 7 1 PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION 1, 2, 3, 4 TRansition state complex I2 conformation 0 MULTIPLE SOURCES COMPLEX 1 CRISPR-associated endonuclease Cas12a 1 RECOMBINANT COMPLEX 2,3,4 Nucleic acids 1 RECOMBINANT COMPLEX YES MEGADALTONS 0.180 401614 Francisella tularensis subsp. novicida U112 401614 Francisella tularensis subsp. novicida U112 511693 Escherichia coli BL21 32630 synthetic construct PARTICLE 1 1 SINGLE PARTICLE 40 COUNTING FEI FALCON III (4k x 4k) 300 FIELD EMISSION GUN SPOT SCAN FEI TITAN KRIOS BRIGHT FIELD 1 COPPER C-flat-1.2/1.3 4C 6GTD C1 CRYSTALLOGRAPHY MERGING 1 1 IMAGE ACQUISITION 1 EPU MASKING CTF CORRECTION 1 MotionCorr2 LAYERLINE INDEXING DIFFRACTION INDEXING MODEL FITTING MODEL REFINEMENT OTHER INITIAL EULER ASSIGNMENT 1 FINAL EULER ASSIGNMENT 1 CLASSIFICATION 1 RECONSTRUCTION 1 NO NO NO YES ETHANE 6GTD FEI VITROBOT MARK III 155639.828 CRISPR-associated endonuclease Cas12a 3.1.21.1,3.1.27.2 1 man polymer 13749.146 RNA (28-MER) 1 syn polymer 16898.826 DNA (5'-D(P*TP*GP*AP*CP*TP*TP*CP*TP*CP*TP*AP*AP*CP*AP*AP*GP*CP*TP*CP*G)-3') 1 syn polymer 16992.936 DNA (5'-D(P*CP*GP*AP*GP*CP*TP*CP*GP*TP*TP*AP*GP*AP*GP*AP*AP*GP*T)-3') 1 syn polymer CRISPR-associated endonuclease Cpf1,FnCas12a,FnCpf1 no no MSIYQEFVNKYSLSKTLRFELIPQGKTLENIKARGLILDDEKRAKDYKKAKQIIDKYHQFFIEEILSSVCISEDLLQNYS DVYFKLKKSDDDNLQKDFKSAKDTIKKQISEYIKDSEKFKNLFNQNLIDAKKGQESDLILWLKQSKDNGIELFKANSDIT DIDEALEIIKSFKGWTTYFKGFHENRKNVYSSNDIPTSIIYRIVDDNLPKFLENKAKYESLKDKAPEAINYEQIKKDLAE ELTFDIDYKTSEVNQRVFSLDEVFEIANFNNYLNQSGITKFNTIIGGKFVNGENTKRKGINEYINLYSQQINDKTLKKYK MSVLFKQILSDTESKSFVIDKLEDDSDVVTTMQSFYEQIAAFKTVEEKSIKETLSLLFDDLKAQKLDLSKIYFKNDKSLT DLSQQVFDDYSVIGTAVLEYITQQIAPKNLDNPSKKEQELIAKKTEKAKYLSLETIKLALEEFNKHRDIDKQCRFEEILA NFAAIPMIFDEIAQNKDNLAQISIKYQNQGKKDLLQASAEDDVKAIKDLLDQTNNLLHKLKIFHISQSEDKANILDKDEH FYLVFEECYFELANIVPLYNKIRNYITQKPYSDEKFKLNFENSTLANGWDKNKEPDNTAILFIKDDKYYLGVMNKKNNKI FDDKAIKENKGEGYKKIVYKLLPGANKMLPKVFFSAKSIKFYNPSEDILRIRNHSTHTKNGSPQKGYEKFEFNIEDCRKF IDFYKQSISKHPEWKDFGFRFSDTQRYNSIDEFYREVENQGYKLTFENISESYIDSVVNQGKLYLFQIYNKDFSAYSKGR 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AAUUUCUACUGUUGUAGAUGAGAAGUCAUUUAAUAAGGCCACU AAUUUCUACUGUUGUAGAUGAGAAGUCAUUUAAUAAGGCCACU B polyribonucleotide no no (DA)(DT)(DT)(DG)(DC)(DT)(DT)(DG)(DC)(DT)(DC)(DG)(DA)(DT)(DG)(DC)(DA)(DT)(DG)(DC) (DA)(DG)(DT)(DG)(DG)(DC)(DC)(DT)(DT)(DA)(DT)(DT)(DA)(DA)(DA)(DT)(DG)(DA)(DC)(DT) (DT)(DC)(DT)(DC)(DT)(DA)(DA)(DC)(DG)(DA)(DG)(DC)(DT)(DC)(DG) ATTGCTTGCTCGATGCATGCAGTGGCCTTATTAAATGACTTCTCTAACGAGCTCG C polydeoxyribonucleotide no no (DC)(DG)(DA)(DG)(DC)(DT)(DC)(DG)(DT)(DT)(DA)(DG)(DA)(DG)(DA)(DA)(DG)(DT)(DC)(DA) (DT)(DT)(DT)(DA)(DA)(DT)(DA)(DA)(DG)(DG)(DC)(DC)(DA)(DC)(DT)(DG)(DC)(DA)(DT)(DG) (DC)(DA)(DT)(DC)(DG)(DA)(DG)(DC)(DA)(DA)(DG)(DC)(DA)(DA)(DT) CGAGCTCGTTAGAGAAGTCATTTAATAAGGCCACTGCATGCATCGAGCAAGCAAT D polydeoxyribonucleotide n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n U112 sample 1 1329 cas12a, cpf1, FTN_1397 401614 Francisella tularensis subsp. novicida (strain U112) 511693 Escherichia coli BL21 Biological sequence -0.897 1 B -14 B -2 -11.386 B_C-14:A-2_B 1 -46.105 -2.134 1.904 -0.935 -2.828 1 B -13 B -3 -14.511 B_U-13:G-3_B 2 -20.811 -1.392 1.020 -0.329 40.475 B -17 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