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Southworth, D.R. http://mmcif.pdb.org/dictionaries/ascii/mmcif_pdbx.dic 90.00 90.00 90.00 1.00 1.00 1.00 C10 H15 N5 O10 P2 427.201 n ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE non-polymer C10 H16 N5 O12 P3 S 523.247 PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER ATP-GAMMA-S; ADENOSINE 5'-(3-THIOTRIPHOSPHATE); ADENOSINE 5'-(GAMMA-THIOTRIPHOSPHATE); ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE MONOTHIOPHOSPHATE non-polymer C3 H7 N O2 89.093 y ALANINE L-peptide linking C6 H15 N4 O2 1 175.209 y ARGININE L-peptide linking C4 H8 N2 O3 132.118 y ASPARAGINE L-peptide linking C4 H7 N O4 133.103 y ASPARTIC ACID L-peptide linking C3 H7 N O2 S 121.158 y CYSTEINE L-peptide linking C5 H10 N2 O3 146.144 y GLUTAMINE L-peptide linking C5 H9 N O4 147.129 y GLUTAMIC ACID L-peptide linking C2 H5 N O2 75.067 y GLYCINE peptide linking C6 H10 N3 O2 1 156.162 y HISTIDINE L-peptide linking C6 H13 N O2 131.173 y ISOLEUCINE L-peptide linking C6 H13 N O2 131.173 y LEUCINE L-peptide linking C6 H15 N2 O2 1 147.195 y LYSINE L-peptide linking C5 H11 N O2 S 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N 465 N sing N 466 N sing UK Nat Commun 2041-1723 10 2393 2393 10.1038/s41467-019-10150-y 31160557 Structural basis for substrate gripping and translocation by the ClpB AAA+ disaggregase. 2019 10.2210/pdb6oay/pdb pdb_00006oay RIGID BODY FIT 6OAY 213059 3.3 FSC 0.143 CUT-OFF POINT 7.50 1 PHASE FLIPPING AND AMPLITUDE CORRECTION 1, 2 hyperactive ClpB mutant K476C bound to casein 0 MULTIPLE SOURCES COMPLEX 1 hyperactive ClpB mutant K476C 1 RECOMBINANT COMPLEX Protein was purchased from Sigma-Aldrich. Purified from bovine milk. 2 alpha-s1-casein 1 NATURAL COMPLEX YES 83333 Escherichia coli K-12 9913 Bos taurus 562 Escherichia coli PARTICLE 1 1 SINGLE PARTICLE 56 SUPER-RESOLUTION GATAN K2 SUMMIT (4k x 4k) 300 FIELD EMISSION GUN FLOOD BEAM FEI TITAN KRIOS BRIGHT FIELD 2.6 1 unspecified 6OAY C1 SYMMETRY DETERMINATION 1 1 1 IMAGE ACQUISITION 1 MASKING 1 1 CTF CORRECTION 1 LAYERLINE INDEXING 1 1 DIFFRACTION INDEXING 1 1 MODEL FITTING 1 1 OTHER 1 1 MODEL REFINEMENT 1 1 INITIAL EULER ASSIGNMENT 1 FINAL EULER ASSIGNMENT 1 CLASSIFICATION 1 RECONSTRUCTION 1 1.5 NO NO NO YES ETHANE 6OAY 97018.469 Hyperactive disaggregase ClpB K476C 6 man polymer 2230.741 Alpha-S1-casein 1 nat polymer 523.247 PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER 7 syn non-polymer 427.201 ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE 4 syn non-polymer no no MRLDRLTNKFQLALADAQSLALGHDNQFIEPLHLMSALLNQEGGSVSPLLTSAGINAGQLRTDINQALNRLPQVEGTGGD VQPSQDLVRVLNLCDNVAQKRGDNFISSELFVLAALESRGTVADILKAAGATTANITQAIEQMRGGESVNDQGAEDQRQA 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n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n n sample 1 867 83333 Escherichia coli K-12 562 Escherichia coli Biological sequence Bovine sample 1 26 9913 Bos taurus citation chem_comp_atom chem_comp_bond database_2 struct_sheet repository Initial release Data collection Database references Data collection Database references Derived calculations 1 0 2019-06-12 1 1 2019-06-19 1 2 2024-03-20 _citation.journal_volume _citation.page_first _citation.page_last _citation.pdbx_database_id_PubMed _citation.title _database_2.pdbx_DOI _database_2.pdbx_database_accession _struct_sheet.number_strands EM Structure of the hyperactive ClpB mutant K476C, bound to casein, state_2 HELIX DETERMINATION METHOD: AUTHOR SHEET DETERMINATION METHOD: AUTHOR N RCSB Y RCSB 2019-03-18 REL AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE AGS 901 3 AGS AGS 901 C AGS 902 3 AGS AGS 902 C ADP 901 4 ADP ADP 901 F AGS 901 3 AGS AGS 901 E AGS 902 3 AGS AGS 902 E AGS 901 3 AGS AGS 901 D AGS 902 3 AGS AGS 902 D AGS 901 3 AGS AGS 901 B ADP 902 4 ADP ADP 902 B ADP 901 4 ADP ADP 901 A ADP 902 4 ADP ADP 902 A n 1 1 C n 2 2 C n 3 3 C n 4 4 C n 5 5 C n 6 6 C n 7 7 C n 8 8 C n 9 9 C n 10 10 C n 11 11 C n 12 12 C n 13 13 C n 14 14 C n 15 15 C n 16 16 C n 17 17 C n 18 18 C n 19 19 C n 20 20 C n 21 21 C n 22 22 C n 23 23 C n 24 24 C n 25 25 C n 26 26 C n 27 27 C n 28 28 C n 29 29 C n 30 30 C n 31 31 C n 32 32 C n 33 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GLN 195 1 2 13 C LEU 219 A LEU 219 HELX_P C ILE 224 A ILE 224 1 3 6 C PHE 255 A PHE 255 HELX_P C GLN 269 A GLN 269 1 4 15 C LEU 329 A LEU 329 HELX_P C PHE 333 A PHE 333 1 5 5 C SER 342 A SER 342 HELX_P C HIS 362 A HIS 362 1 6 21 C THR 366 A THR 366 HELX_P C SER 377 A SER 377 1 7 12 C GLN 385 A GLN 385 HELX_P C ASP 406 A ASP 406 1 8 22 C THR 532 A THR 532 HELX_P C THR 544 A THR 544 1 9 13 C GLU 555 A GLU 555 HELX_P C HIS 567 A HIS 567 1 10 13 C ALA 576 A ALA 576 HELX_P C ALA 589 A ALA 589 1 11 14 C LYS 611 A LYS 611 HELX_P C PHE 623 A PHE 623 1 12 13 C GLY 655 A GLY 655 HELX_P C GLY 659 A GLY 659 1 13 5 C THR 663 A THR 663 HELX_P C ARG 668 A ARG 668 1 14 6 C VAL 679 A VAL 679 HELX_P C ASP 696 A ASP 696 1 15 18 C SER 722 A SER 722 HELX_P C ARG 728 A ARG 728 1 16 7 C TYR 734 A TYR 734 HELX_P C ASN 748 A ASN 748 1 17 15 C PHE 753 A PHE 753 HELX_P C ILE 757 A ILE 757 1 18 5 C GLY 767 A GLY 767 HELX_P C ARG 785 A ARG 785 1 19 19 C ASP 797 A ASP 797 HELX_P C GLY 807 A GLY 807 1 20 11 C ILE 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